Q9HBG4  VPP4_HUMAN

Gene name: ATP6V0A4   Description: V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 4

Length: 840    GTS: 2.663e-06   GTS percentile: 0.844     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 9      BenignSAV: 11      gnomAD_SAV: 416      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCESLERILRFLEDEMQNEIVVQLLEKSPLTPLPREMITLETVL 100
BenignSAV:      A                                                                                                  
gnomAD_SAV:     A   *#K #     I *M#G C  A QIRK RFFL     IS   L  *L     SY#    M C    K #          G  NL  W   S  IG 
Conservation:  9222688858492857674856648647895785576578721442678788587778625675656652552214121012312135476555265214
SS_PSIPRED:             EEEEEEEE HHHHHHHHHHHHH   EEEEE          HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH          HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        E    EEEEEEEE HHHHHHHHHHHHH   EEEEE     HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       EE     HHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DD                                                                                                  
DO_SPOTD:      DD                                                                                                  
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EKLEGELQEANQNQQALKQSFLELTELKYLLKKTQDFFETETNLADDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAGVINRERMASFERLLWRICRGNVYLK 200
PathogenicSAV:                                                                           D                         
gnomAD_SAV:        A  R   *   G QRN         V Q IH    M  D T NL   VA   PD     V#T R  EVV VM SSD ID S W   L  #RILH R
Conservation:  4456175263616333842544464553365426458744422523325254351344121222012246464486614664228755767455785456
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHH     HHH    EEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH                  HHH           EEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH    EEEE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                             EEEEEEEE HHHHHHHHHHHHHHH   EEEE
DO_DISOPRED3:                                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                   
DO_SPOTD:                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                       
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKIKKICDGFRATVYPCPEPAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSWLIKVQ 300
BenignSAV:                                                        R                                                
gnomAD_SAV:     G V PLPQH  M  KVE  T VT  H  R GH  R N G SQ  D     RVM L   F* ID   Q IN      D YC C     T T DF  M  #
Conservation:  3225312264321130327347456478654316535684865643769652306634430362256578137416454451148135512311803794
SS_PSIPRED:    EEE                EEEEEEE HHHHHHHHHHHHHH   EEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEE     E      EEEEEEEEEEE  HHHHHHHHHHHH    EEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    E                  EEEEEEE  HHHHHHHHHHHHH   EEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRALEQGMELSGSSMAPIMTTVQSKTAPPTFNRTNKFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIIT 400
BenignSAV:                                                 I                                                       
gnomAD_SAV:           #  TG  NI  K I T       AV C R S    V I # PV# F  I * Q      K  ST    L  #  #CD V  W*    L AVV 
Conservation:  9598797599398797866747994967438202741691383335864416556242322288679758388189946776996538495684555568
STMI:                                                                                                    MMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH   EE    EEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHH                 HHHHHHHHHH             HHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH H  E     EEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEE                HHHHHHHHHHH      E    HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH        EEEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH                     EEEE               EEEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FPFLFAVMFGDCGHGTVMLLAALWMILNERRLLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLNIFGSSWSVQPMFRNGTWNTHVMEES 500
PathogenicSAV:           Y                                     #                                                   
BenignSAV:                                                                                                        G
gnomAD_SAV:      L LT T  YRSR* M    T    Q DGCW  E I I F Y   YRH    #TVV  N M       L NF     F  NI ST  SD    YGV  G
Conservation:  8896787989939993553235234512420312340268423433177645447625736673677667465553567654514740012730125111
STMI:          MMMMMMMMM  MMMMMMMMMMMMMMMMM               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                           
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH HH HHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             EEE            HHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH  HHH         EEE E  EEEEEHH HHHHHHHHHH              EE        EEE       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH   HHH     HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH               EEE                 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPIWNLASNKLTFLNSYKMKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILCLFGYLVFMIIFKWCC 600
PathogenicSAV:                        L                                                                            
BenignSAV:                                                          L                                              
gnomAD_SAV:           S T LHV   CL  V LTRTWD K  I   L     LL P  GH I D F   I Q    I F  V  Y SQI  M   #     IT   R  
Conservation:  0164767121585222774477875643516663858679665664485345384425643662594311462439698458625888984567467821
STMI:                                                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM   
SS_PSIPRED:      EE             EEE   HHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     E              EEEEE  HHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH     HHHHHHHHHHHHHHH  H HHHHH HH   
SS_PSSPRED:                                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVVMALISVPWMLLIKPFILRASHRKSQLQASRIQEDATENIEGDSSSPSSRSGQRTS 700
BenignSAV:        Q                         T                                                Y                     
gnomAD_SAV:     HIRI   T RN LR V T   H  Y# KT##H   R  H   A  T   AS##F   L   I  RW  R  T     Y  D T DN  N   CY     
Conservation:  6230032067859637969348231211001550171248345642943469469437634543243314223100100001121221100100111110
STMI:                                                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                      
SS_PSIPRED:              HHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHH HHHHH HHHHHHHHHHHHHH                              
SS_SPIDER3:              HHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHH  HHHHH   HHHHHHH HH HH                             
SS_PSSPRED:              HHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                           
DO_DISOPRED3:                                                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ADTHGALDDHGEEFNFGDVFVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVMNSGLQTRGWGGIVGVFIIFAVFAVLTVAILLIMEGLS 800
BenignSAV:                                                                         M      I                        
gnomAD_SAV:       NRV#NHR        I    T    D*Y   V  # F  #F* V    T*R  A #IT R GSF*M*S    IR L   VI   P  G    I    
Conservation:  2212221230144446452262435686756886578769997999979975484559825452156111212723242345115537533596566634
STMI:                                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:                   HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                   HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                    HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDD                                                                                       
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDD                                                                                         
DO_IUPRED2A:   DDDDD                                                                                               

                       10        20        30        40
AA:            AFLHALRLHWVEFQNKFYVGDGYKFSPFSFKHILDGTAEE 840
PathogenicSAV:       Q         L  R                    
gnomAD_SAV:     C  T Q       D    R S R   LA   L     K 
Conservation:  4565434344545445440527325155241022121042
STMI:          MMMMMMMMMMMM                            
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH                HHHHH      
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH HH      E      HHHHH      
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHH      
DO_DISOPRED3:                                     DDDDD
DO_SPOTD:                                          DDDD
DO_IUPRED2A: