Q9HC29  NOD2_HUMAN

Gene name: NOD2   Description: Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2

Length: 1040    GTS: 2.729e-06   GTS percentile: 0.857     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 16      BenignSAV: 34      gnomAD_SAV: 636      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGEEGGSASHDEEERASVLLGHSPGCEMCSQEAFQAQRSQLVELLVSGSLEGFESVLDWLLSWEVLSWEDYEGFHLLGQPLSHLARRLLDTVWNKGTWAC 100
BenignSAV:                                                                                     V                   
gnomAD_SAV:    VEQDR  SF V    TI    R LAR V W  D   RMNPM KPP L  P*V KN   *       #R   KALPFP  TV    KH QV#I*  #AR  
Conservation:  2222222222222222222222222227232314325923551272446260573548176434351676643423334363135919874411672136
SS_PSIPRED:               HHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH     HHHH        HHHHHHHHHHHHHH   HHHH
SS_SPIDER3:               HHHH  EEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH     HHH     E   HHHHHHHHHHHHH      HH
SS_PSSPRED:               HHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH   EE           HHHHHHHHHHHHHH    HHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDD                                                                                     
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDD                                                                                     
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDD                                                                                     
MOTIF:                                                                       WEVLSWEDYEGFHLL                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QKLIAAAQEAQADSQSPKLHGCWDPHSLHPARDLQSHRPAIVRRLHSHVENMLDLAWERGFVSQYECDEIRLPIFTPSQRARRLLDLATVKANGLAAFLL 200
BenignSAV:                             L              T                                                M           
gnomAD_SAV:    H V V    T*VN   SR   Y  LDL  # *  K  QST  G RYN  #   NQPR WDSINR DG    FS   LF KEG  FG  M  V   PDC P
Conservation:  2263274223212020100000111010123216422761661362245334822521162451173537388648447657388754215241351277
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH HH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH                  HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHH       HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD               
DO_SPOTD:                  DDDDDDDD                                                                                
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QHVQELPVPLALPLEAATCKKYMAKLRTTVSAQSRFLSTYDGAETLCLEDIYTENVLEVWADVGMAGPPQKSPATLGLEELFSTPGHLNDDADTVLVVGE 300
BenignSAV:                                                 M  R                   S                    S           
gnomAD_SAV:          AGSFT      A  N  V    M   * L F  C E  MVFRK VH    R         RSLKN L  V  AGF  AA Y S GV SM   S*
Conservation:  2333202121212011123226148934454664236356463324286578763286610313021101121113382464300412614985474494
SS_PSIPRED:    HHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE        HHH    HHEEHHHHHHH             HHHHH           EEEEE  
SS_SPIDER3:    HHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHH  E EE          HHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHH           EEEEEE  
SS_PSSPRED:    HHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHH            EEEEE E
DO_DISOPRED3:        DDDD DDDDDDDDDDDD       DDD                               DD    DDD    D                      
DO_SPOTD:                                                                        DDDDD                             
DO_IUPRED2A:                                                                               D                       
NP_BIND:                                                                                                         GE

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AGSGKSTLLQRLHLLWAAGQDFQEFLFVFPFSCRQLQCMAKPLSVRTLLFEHCCWPDVGQEDIFQLLLDHPDRVLLTFDGFDEFKFRFTDRERHCSPTDP 400
PathogenicSAV:                                  #              F                                EK                 
BenignSAV:                                                        R                                      #         
gnomAD_SAV:    V    NS P*Q N   V #RE        SL Y H    G  P APS V  R F*LE  E AF *   EYA #A FSV    *Y    MVCKC S L NH
Conservation:  8838965558455369523226322266967888484230335643385845798781143366547554922466689979976328362244957213
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHH       EEEEEEE HHHHHH      HHHHHHH           HHHHHH    EEEEEE               EE     
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHH        EEEEE  HHHHH     E HHHHHHHH        HHHHHHH     EEEEEE    E E        EE     
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE   HHHHHHHHHHH HHHHHHHH       HHHHHHHHH    EEEEEE              E       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:       AGSGKS                                                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TSVQTLLFNLLQGNLLKNARKVVTSRPAAVSAFLRKYIRTEFNLKGFSEQGIELYLRKRHHEPGVADRLIRLLQETSALHGLCHLPVFSWMVSKCHQELL 500
PathogenicSAV:                                                                     F                          L    
BenignSAV:                               L                                   AW      C                             
gnomAD_SAV:     F *    I    TV    C GM  CL T LV  GM  HIKS    L  L  K     C Q  R V C  H  R  *        SI          D F
Conservation:  5652265688568587654185467852543308644532930559944157217555442431351364135335546268962874466664973886
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHH        EEEEE  HHHHHHHHHHH  EEEEE    HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH   HHHH    HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHH         EEEE  HHHHH   HHHE  EEEE    HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH   HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHH       EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LQEGGSPKTTTDMYLLILQHFLLHATPPDSASQGLGPSLLRGRLPTLLHLGRLALWGLGMCCYVFSAQQLQAAQVSPDDISLGFLVRAKGVVPGSTAPLE 600
PathogenicSAV:       S     T                                                                         C             
BenignSAV:                                                                                                M        
gnomAD_SAV:      AVW  E  AG H    PR  PR   T LV *V ES   W#C L #    G #    S Y  ML V  F  T*  T# T      H  CIM   MVT  
Conservation:  1121215383764745453675341121100022130232222212434862683175113375851045212142127513788523221101101138
SS_PSIPRED:    HH     HHHHHHHHHHHHHHHHH            HHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEHHHHHH    HHH EEEEEEEEEEEE      EE
SS_SPIDER3:    HH       HHHHHHHHHHHHH              H HH   HHHHHHHHHHHHHHH    E E HHHHHH    HHH EEEEEEEEE E      EEE
SS_PSSPRED:    HH       HHHHHHHHHHHHHHH            HHH    HHHHHHHHHHHHHHHH  EEEE HHHHHHH   HHHHHEEEEEEE  E       EE
DO_DISOPRED3:                            DDDDDDDDDDD                                                         DDDD  
DO_SPOTD:                                DDDDDDDD                                                                  
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FLHITFQCFFAAFYLALSADVPPALLRHLFNCGRPGNSPMARLLPTMCIQASEGKDSSVAALLQKAEPHNLQITAAFLAGLLSREHWGLLAECQTSEKAL 700
PathogenicSAV:     #                                                                K                              
BenignSAV:                T                                                                     F #                
gnomAD_SAV:    L    SR LV V C VH          R   Y        T H TM#WN  LKR  G MGPF    KLY R M V LP R FYQ P*    K      P 
Conservation:  7884838887754533531211023512781000101112011330153110002100111111137128465471634876734521545212122112
SS_PSIPRED:    EEHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH         HHHHH HH   HH    HHHHHHHH        HHHHHHHHH  HHHHHHHHHH   HHHH
SS_SPIDER3:    EEE  HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH         HHHHH  HHH H       HHHHHH         HHHHHHHH   HHHHHHHHHH   HHHH
SS_PSSPRED:    EHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH         HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH     HHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH HHHH
DO_DISOPRED3:                                 DDDDD  DDDDDDD DD                                  D                 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LRRQACARWCLARSLRKHFHSIPPAAPGEAKSVHAMPGFIWLIRSLYEMQEERLARKAARGLNVGHLKLTFCSVGPTECAALAFVLQHLRRPVALQLDYN 800
PathogenicSAV:  W                              L                                                                   
BenignSAV:            H                G                             V                                  Q#         
gnomAD_SAV:    FQG#SSGC*   C  CN  Y  L GVAV V NMPVILR #* #QIP K#E  Q VW VTC  KIR F F   N  #NKY      V RFQQ MT *    
Conservation:  4230114125643354389337636525948869968285675456585542149425434525485847784599277488575955732655768949
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHH      HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHH    HHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHH    HHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH    E       HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                          DDDDDDDD                                                                    
DO_SPOTD:                               DDDDDDD                                                                    
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SVGDIGVEQLLPCLGVCKALYLRDNNISDRGICKLIECALHCEQLQKLALFNNKLTDGCAHSMAKLLACRQNFLALRLGNNYITAAGAQVLAEGLRGNTS 900
BenignSAV:                            NK                       V             V                         H           
gnomAD_SAV:        T MQ   S    Y#V   HN#S   LVF   T RS RYKR    VP SY    S TR V#  FV#K S    G R   #AP#  H V K  *V IF
Conservation:  4898394869588423827658858565727432944344143263756887848792751245088115248567767773454275218737740506
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHH   EE       HHHHHHHHHHHH      EE        HHHHHHHHHHH       EEE       HHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHHH  EEEE      HHHHHHHHHHH     E EEE        HHHHHHHHHH     EEEEE       HHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHH HHHHH       HHHHHHHHHHHH   HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH     HHH       HHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                            D DD DDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LQFLGFWGNRVGDEGAQALAEALGDHQSLRWLSLVGNNIGSVGAQALALMLAKNVMLEELCLEENHLQDEGVCSLAEGLKKNSSLKILKLSNNCITYLGA 1000
PathogenicSAV:        R                                                                                            
BenignSAV:      K               D                                    I                                             
gnomAD_SAV:     H   YRR   AEK P*T  K  DGP N     VME SV   D## # RV  E I  GK     SR   GDI F VDE N Y          D VN  ET
Conservation:  5367879981765195386717612524537588757475318515550463341374487866824175742155245336455448553241330073
SS_PSIPRED:      EEE       HHHHHHHHHHH       EEE       HHHHHHHHHHH       EEE       HHHHHHHHHHH       EEE       HHHH
SS_SPIDER3:    E EEE       HHHHHHHHHHH      HEEEE      HHHHHHHHHHH       E E       HHHHHHHHHH    EEEEEEEEE     HHHH
SS_PSSPRED:    EEEE        HHHHHHHHHHHH    HHHHHH      HHHHHHHHHHH H     HHH       HHHHHHHHHHH        EE       HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40
AA:            EALLQALERNDTILEVWLRGNTFSLEEVDKLGCRDTRLLL 1040
gnomAD_SAV:    D FV TF #S       RL K    *D   HS   A I I
Conservation:  2133134207124235672640341332212111417423
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH      EEE       HHHHHHH         
SS_SPIDER3:    HHHHHHH       EEE       HHHHHHHH        
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH     EEE       HHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                               DDDDDD D  D
DO_SPOTD:                                              
DO_IUPRED2A: