Q9HCG8  CWC22_HUMAN

Gene name: CWC22   Description: Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog

Length: 908    GTS: 1.388e-06   GTS percentile: 0.397     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 393      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKSSVAQIKPSSGHDRRENLNSYQRNSSPEDRYEEQERSPRDRDYFDYSRSDYEHSRRGRSYDSSMESRNRDREKRRERERDTDRKRSRKSPSPGRRNPE 100
gnomAD_SAV:     E   V MQLP CD   KK   C K   A   F   KLFTWN  C        KR KG #FN  R#  P G Q  HK  D NMNW   Q   ##W     
Conservation:  9222111131142123120122121214443210112436424422322243142432223231112033153251275533142532242436225223
SS_PSIPRED:                                HHHHHHHH                                   HHHHHHHHH   HHHHH            
SS_SPIDER3:                                    H                                       HHHHHHH                     
SS_PSSPRED:                                HHH HHHH                                   HHHHHHHHH   HHHH             
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                            S                     S                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TSVTQSSSAQDEPATKKKKDELDPLLTRTGGAYIPPAKLRMMQEQITDKNSLAYQRMSWEALKKSINGLINKVNISNISIIIQELLQENIVRGRGLLSRS 200
gnomAD_SAV:         NT  L  LS   R NKPA F #CA     A            E          R     T#       S P   S  K     HT#K     Y  
Conservation:  1210243213652117766434976955597667976566667477499797779979999999977997997777962799397969994999975797
SS_PSIPRED:                                       HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                H                      HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH
SS_PSSPRED:                                       HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  DDDDDDDDDD                                                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                       
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D  DDD DDDDD   DD                                                      
MODRES_P:            S                                                                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VLQAQSASPIFTHVYAALVAIINSKFPQIGELILKRLILNFRKGYRRNDKQLCLTASKFVAHLINQNVAHEVLCLEMLTLLLERPTDDSVEVAIGFLKEC 300
gnomAD_SAV:          T     R         T   SR#AA   RT T     ##G S  R  V    C    T         YI IF S    AA VCI L #  FE  
Conservation:  4479736979799776777799999994497977799969979997997777996669977794775769799497797999979677979777597976
SS_PSIPRED:    HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH     HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH   H HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GLKLTQVSPRGINAIFERLRNILHESEIDKRVQYMIEVMFAVRKDGFKDHPIILEGLDLVEEDDQFTHMLPLEDDYNPEDVLNVFKMDPNFMENEEKYKA 400
gnomAD_SAV:     F   #LT     TT  CFQ      GV R  LHVL  #  LW  R R R  T KV    Q   #  YVFR # YC          VGS           
Conservation:  9779977797767999697777799966949997799977979997999996554799999777799966799779647747679767559469969973
SS_PSIPRED:    HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHH              HHHH   HHH   HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH                      EEEE         H HHHH   HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH                HHHH                          HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                      DDDDDD             D             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IKKEILDEGDTDSNTDQDAGSSEEDEEEEEEEGEEDEEGQKVTIHDKTEINLVSFRRTIYLAIQSSLDFEECAHKLLKMEFPESQTKELCNMILDCCAQQ 500
gnomAD_SAV:    V   TFY  HAEL     T  N K K  A #   K#   R    R   AV     H  V   L L S                 H   I H         
Conservation:  7767796995669424343354654635343734345697656737676456657655477576667576694665576665656567977766579777
SS_PSIPRED:    HHHHH                     HHHHHH    HHHHH  HHHHH   HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHH                    HH                   H    HHH HEEEEEEEE   HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHH                                      HHH   H HHHHHHHHEEEEE    HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                           
DO_SPOTD:            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                     
DO_IUPRED2A:    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RTYEKFFGLLAGRFCMLKKEYMESFEGIFKEQYDTIHRLETNKLRNVAKMFAHLLYTDSLPWSVLECIKLSEETTTSSSRIFVKIFFQELCEYMGLPKLN 600
gnomAD_SAV:                P  V R   #    R#VR   V#V C      Q    I  RI C   F#     Y        A  N  Y           V   R S
Conservation:  7677779699695794757595769626657765679799797979796679999699966977737526997779999796666567976675676394
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH  EEE         HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH     HHH EEEE  HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH        EEE          HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ARLKDETLQPFFEGLLPRDNPRNTRFAINFFTSIGLGGLTDELREHLKNTPKVIVAQKPDVEQNKSSPSSSSSASSSSESDSSDSDSDSSDSSSESSSEE 700
BenignSAV:                                                            V                                            
gnomAD_SAV:     T       R   A  SQ    II   V     V   D M#  Q   R K   T VP  N DRS  F#     VF   V    NC C NG  N K  N G
Conservation:  3766729974777996767696999799999797779697599979976596543676463733454459773347564634539335532244325522
SS_PSIPRED:    HHH    HHHHH        HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHH  HHHHH     HHH                                     
SS_SPIDER3:    HHH  H HHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHH    HH                                              
SS_PSSPRED:    HHH  HHHHHHHH        HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH                                                  
DO_DISOPRED3:                                                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                DD                          DD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SDSSSISSHSSASANDVRKKGHGKTRSKEVDKLIRNQQTNDRKQKERRQEHGHQETRTERERRSEKHRDQNSSGSNWRDPITKYTSDKDVPSERNNYSRV 800
BenignSAV:                                             V                                                    Q      
gnomAD_SAV:         V NRI #   G    ER  A  E AE    K #A VK R      QRREQAK K DK  *  *    R  #*   VKN     GFR  QD  NK 
Conservation:  3363536235524411134322120524102411322311332103320212113011302213351122213410253111510234311123522312
SS_PSIPRED:                               HHHHHHHHH    HH HHHHHH                                                   
SS_SPIDER3:                               HHH HHH       HHHHHH            HHH                                      
SS_PSSPRED:                                HHH         HHHHHHH                                                     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                           S              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ANDRDQEMHIDLENKHGDPKKKRGERRNSFSENEKHTHRIKDSENFRRKDRSKSKEMNRKHSGSRSDEDRYQNGAERRWEKSSRYSEQSRESKKNQDRRR 900
gnomAD_SAV:      G  *  LM V   RA   N  E     S G   RI * *E  H G RN     # S  N*A  NV  G* S PK#*#  CI           SR QQ 
Conservation:  1443123111322123123323224441113535214032351210334245383741322322432423338636702552332222265235134525
SS_PSIPRED:         HH                                                           HHHH        HHH     HH HHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:                                                                          H     HHH                  H  
SS_PSSPRED:                                                                      HHH     HHHHHHH     HHHHHHH       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                  S                                                                       

                       
AA:            EKSPAKQK 908
gnomAD_SAV:    G  AV   
Conservation:  52561543
SS_PSIPRED:            
SS_SPIDER3:            
SS_PSSPRED:            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDD