Q9HCS7  SYF1_HUMAN

Gene name: XAB2   Description: Pre-mRNA-splicing factor SYF1

Length: 855    GTS: 3.015e-06   GTS percentile: 0.904     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 476      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MVVMARLSRPERPDLVFEEEDLPYEEEIMRNQFSVKCWLRYIEFKQGAPKPRLNQLYERALKLLPCSYKLWYRYLKARRAQVKHRCVTDPAYEDVNNCHE 100
gnomAD_SAV:    T AL## WLHG QN   KKDE  HV   TW RS    G C V LRR SL  S  R  K SV P   R     QHV TCW    L#   NSTC   S    
Conservation:  3233200121222322454564358665454534533725433232233211342445345324654666763776664243413532551375344437
SS_PSIPRED:                      HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                      HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                         HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDD                                                                                        
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDD                                                                                      
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RAFVFMHKMPRLWLDYCQFLMDQGRVTHTRRTFDRALRALPITQHSRIWPLYLRFLRSHPLPETAVRGYRRFLKLSPESAEEYIEYLKSSDRLDEAAQRL 200
BenignSAV:                              I                                                                          
gnomAD_SAV:      LA      H    H       VCI YNHCA N#T W   VM Q Q    C C  SLQ  S I  QA  CY      C  KDT C RL HW    S H 
Conservation:  6546545547646456756331643555473556756666756851659526635551466666448558644574843484542663433274454146
SS_PSIPRED:    HHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  H HHHHHHHHHH   HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ATVVNDERFVSKAGKSNYQLWHELCDLISQNPDKVQSLNVDAIIRGGLTRFTDQLGKLWCSLADYYIRSGHFEKARDVYEEAIRTVMTVRDFTQVFDSYA 300
gnomAD_SAV:    V M  A H L   S  D*       N     L    C S NTVSH D SH A#    R #  PNC VCGS L  V# A K   Q  T MQ      H CT
Conservation:  4134434134542444335654665343545543527533434456664465665847755653465656676675966996766957769755665545
SS_PSIPRED:    HHHH  HHHHH     HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH  HHHH H     HHHHHHHHHHHHH HHHH   HHHHHHHH HHH  HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHH   HHH      HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QFEESMIAAKMETASELGREEEDDVDLELRLARFEQLISRRPLLLNSVLLRQNPHHVHEWHKRVALHQGRPREIINTYTEAVQTVDPFKATGKPHTLWVA 400
gnomAD_SAV:    H K  VV#S L  TL  E#K  N M    H  C K    QQ   FYG#  C SLY M K   H T RRSHR#     CR G  ML  VED    Y     
Conservation:  4654436653455243352234341353454454314324694444556556666456555555353351824653535454434251343548426663
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH  HHHH   HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH     H  HHHHHHHHHHHHHHH   HHH HHHHHH    HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH  HHHH   HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:               DD   D                                          DDD             D        D              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FAKFYEDNGQLDDARVILEKATKVNFKQVDDLASVWCQCGELELRHENYDEALRLLRKATALPARRAEYFDGSEPVQNRVYKSLKVWSMLADLEESLGTF 500
BenignSAV:                                                          Q                                              
gnomAD_SAV:         K  A   N C     V     #RAG    L YH R  V * K  N G W  Q GMV ASHW#K  VSLQLM  HM   P    T#PHVQ RFS L
Conservation:  6759564546656453662654363434553442385426645554324344823744555484534435343664646456655965474556555946
SS_PSIPRED:    HHHHHHH   HHHHHHHHHHHH      HH HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH     HHHH      HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH  H
SS_SPIDER3:    HHHHHHH   HHHHHHHHHHHH      H HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH   H HHHH      HHHHH   HHHHHHHHHHHHHH  H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_A:                         K                                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QSTKAVYDRILDLRIATPQIVINYAMFLEEHKYFEESFKAYERGISLFKWPNVSDIWSTYLTKFIARYGGRKLERARDLFEQALDGCPPKYAKTLYLLYA 600
gnomAD_SAV:    *    M N# P  HVTA *VG SCTT  K R    AG  G  HS LPL RRS   V NA     VVH#  H   WV   C R  YS S  H        T
Conservation:  6554555466579675679767765567576355656654354533443384325453467657434475346464644344354346342333334433
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QLEEEWGLARHAMAVYERATRAVEPAQQYDMFNIYIKRAAEIYGVTHTRGIYQKAIEVLSDEHAREMCLRFADMECKLGEIDRARAIYSFCSQICDPRTT 700
gnomAD_SAV:        D D G     M KG        RKH        QVGK C     HS CKE V   L KRTC IR QL       R   HVQVFC         WM 
Conservation:  2733126666565555565635633254335556366466564656556275544434638545555655767766679556645554347543536436
SS_PSIPRED:    HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:    HHHHH   HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GAFWQTWKDFEVRHGNEDTIKEMLRIRRSVQATYNTQVNFMASQMLKVSGSATGTVSDLAPGQSGMDDMKLLEQRAEQLAAEAERDQPLRAQSKILFVRS 800
BenignSAV:      T                                                                                                  
gnomAD_SAV:     S   #  E  AW DS       P F#H M  M         L      V  M IMP   S    VEN        D VV  T H  RSCTEGR   #  
Conservation:  1146535556645664565563485435565535443344433434531242353243336331535554464545224434443445343535556586
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH                   HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHEEE  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH        H          HHHHHHHHHHHHHHHHHH          EEEE 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH  EE  
DO_DISOPRED3:                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D
DO_IUPRED2A:                                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD              

                       10        20        30        40        50     
AA:            DASREELAELAQQVNPEEIQLGEDEDEDEMDLEPNEVRLEQQSVPAAVFGSLKED 855
gnomAD_SAV:     TTW    D       D VH SKYKG Y V     K Q A R    TLL    KN
Conservation:  4665388558446489688566665435423246454364432463554548333
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHH HHHH                   HHH    HHHHH     
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHH HHH                     HE E  HHHH      
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHH                        HHHH   HHHHH      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDD D D DD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D         DDDDDD
DO_IUPRED2A:         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDD  D
MODRES_P:                                                        S