Q9HD20  AT131_HUMAN

Gene name: ATP13A1   Description: Manganese-transporting ATPase 13A1

Length: 1204    GTS: 2.056e-06   GTS percentile: 0.673     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 530      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAAAAAVGNAVPCGARPCGVRPDGQPKPGPQPRALLAAGPALIANGDELVAAVWPYRRLALLRRLTVLPFAGLLYPAWLGAAAAGCWGWGSSWVQIPEAA 100
gnomAD_SAV:             T S    L A      LNS   L T    V S      D     C     V FW  P   LV P   S   T#GVASC   NR #      
Conservation:  3333333333333333113111130102011100020211333300333523323235432333324444332443233233333232133211103423
STMI:                                                                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMM
SS_PSIPRED:      HHHH                                             EEEEE    HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH
SS_SPIDER3:        HH       E                           E       EEEEEEE    HHHH  HHHHHH HHHHHHHHHHHHHH H      HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH                         HHH     E      HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                    
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                             
DO_IUPRED2A:                      DDDDDDDD DDDD                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLVLATICLAHALTVLSGHWSVHAHCALTCTPEYDPSKATFVKVVPTPNNGSTELVALHRNEGEDGLEVLSFEFQKIKYSYDALEKKQFLPVAFPVGNAF 200
BenignSAV:                                                                      R                                  
gnomAD_SAV:    VVL    YFG      LR CC Q L    YSA FN  RV   R #    S  M     ##S CKYE KM A K    R  C T GE K I M   M  V 
Conservation:  2302223222222113222412211112110252320365458758689866486937354247390236386999657244015561726447732225
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMM                                                                                    
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH  EE   HHH EEEEEEE        EEEEEE       EEEEEEEEEEEEEEEHHH  EEEE       HH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEEEE   H H EEEEEE         EEEEEEEE     EEEEEEE  EEEEEE     EEEEE      HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH          EEEEEE         EEEEEE       EEEEEEEEEEEEE   HHH  EE        HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                         DD                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SYYQSNRGFQEDSEIRAAEKKFGSNKAEMVVPDFSELFKERATAPFFVFQVFCVGLWCLDEYWYYSVFTLSMLVAFEASLVQQQMRNMSEIRKMGNKPHM 300
BenignSAV:                            R                                                                            
gnomAD_SAV:    LD       R YL  QEV     R   K  L   L F          I     L        G   I  V V      L L    QS L MQ VVK S V
Conservation:  1378227943571573167747617567735957447767675797979797777997776697795967797676776676976667597959967763
STMI:                                                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                    
SS_PSIPRED:    HHHHHH     HHHHHHHHHHH   EEEEE   HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     E
SS_SPIDER3:    HHHHHH     HHHHHHHHHHH   EEEEE   HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     E
SS_PSSPRED:    HHHHHH     HHHHHHHHHHH   EEEE   HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                                            N             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IQVYRSRKWRPIASDEIVPGDIVSIGRSPQENLVPCDVLLLRGRCIVDEAMLTGESVPQMKEPIEDLSPDRVLDLQADSRLHVIFGGTKVVQHIPPQKAT 400
gnomAD_SAV:      G QGH   TV  H VI   VI L H SR    L      #SH VL     M  C        KE  R QM  HR   #  I  E  N #   LQ    
Conservation:  6767777997362756667796696557635676999577756566667769699979667585545361237433233355432866454533582535
SS_PSIPRED:    EEEEE   EEEEE        EEEE       EEE  EEEEE EEEEEE                                EEEE   EEEEE       
SS_SPIDER3:    EEEEE  EEEEEE        EEEE       E    EEEEE EEEE HHHH   E                        EEEEE   EEEEE       
SS_PSSPRED:    EEEEE   EEEE        EEEEE            EEEE   EEE                                 EEEEE   EEEEE       
DO_DISOPRED3:                                                    D  DDD D   D                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TGLKPVDSGCVAYVLRTGFNTSQGKLLRTILFGVKRVTANNLETFIFILFLLVFAIAAAAYVWIEGTKDPSRNRYKLFLECTLILTSVVPPELPIELSLA 500
gnomAD_SAV:    M   SA  # M  I   R H       H V  R Q       Q L   F  VM  T  T H    C     Q CC    K S  # L M  K   K    
Conservation:  3643547696575666797567976979777777799776769776997999799779739975696542363354556595797999997999689779
STMI:                                                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                    
SS_PSIPRED:             EEEEEEE         EEEEE         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHH        HHHHHH
SS_SPIDER3:             EEEEEEEE        EEEEEE          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH        HHHHHH
SS_PSSPRED:             EEEEEEE      HHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                         N                                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VNTSLIALAKLYMYCTEPFRIPFAGKVEVCCFDKTGTLTSDSLVVRGVAGLRDGKEVTPVSSIPVETHRALASCHSLMQLDDGTLVGDPLEKAMLTAVDW 600
BenignSAV:                                                            K                                            
gnomAD_SAV:    I S FTS  EF #C     WV   A  D               LLH   ER N# K   L  T     #V     L  H  N      S   TI M MA 
Conservation:  9979979999775677767667967675577677554445537543646563356443555349347675554868563667746777767775746757
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH   EE    EE    EEEEEEE          EEEEEEEE     EE  HHH  HHHHHHHHH   EEEE    EEE HHHHHHHHH  E
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH   EE    E       EEEEE     EE    EEEEEE     EEE  HHH  HHHHHHHH     EEEE  EEEE HHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHEE     EE   EEEEEEE          EEEEEEEE              HHHHHHHHHHH   EE    E   HHHHHHHHHH E
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
ACT_SITE:                                      D                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TLTKDEKVFPRSIKTQGLKIHQRFHFASALKRMSVLASYEKLGSTDLCYIAAVKGAPETLHSMFSQCPPDYHHIHTEISREGARVLALGYKELGHLTHQQ 700
gnomAD_SAV:    M   G     LR         R  R         E  L      AN   VV       APR    #   HCR   IK  Q  THI   #  #  L  R H
Conservation:  4766666675656766666976997938579976776947426546534466679999774167434613940583566569686899857658466848
SS_PSIPRED:    EEE              EEEEEEE   HHH   EEEEEE        EEEEEE   HHHHHHHH      HHHHHHHHHH   EEEEEEEEE     HHH
SS_SPIDER3:    EE    E          EEEEEE    HHHHE  EEEEEE       EEEEEE   HHHHHHHHH     HHHHHHHHHH   EEEEEEEEE     HHH
SS_PSSPRED:    EE               EEEEEE  HHHHHHHHHEEEEE        EEEEEEE  HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH    EEE         HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AREVKREALECSLKFVGFIVVSCPLKADSKAVIREIQNASHRVVMITGDNPLTACHVAQELHFIEKAHTLILQPPSEKGRQCEWRSIDGSIVLPLARGSP 800
gnomAD_SAV:     QDF Q        L   T           VM Q V Y   WL V    SL  T  M  K R # N ##   HLS K  WH K H T R  M  VVWCFL
Conservation:  5863395189639383994686788839863687866589958489988668896999598383343248795310114005192625523014201031
SS_PSIPRED:    HHH  HHHHHH  EE EEEEEE      HHHHHHHHHH    EEEE    HHHHHHHHHH        EEEE          EEEE    EEE      H
SS_SPIDER3:    HHH  HHHHHH  EE EEEEEE      HHHHHHHHH    EEEEE    HHHHHHHHHH        EEEEE        EEEE     EEEE     H
SS_PSSPRED:    HHH  HHHHHHH HHEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHH   EEEEE  HHHHHHHHHHHH       EEEE         EEEE              H
DO_DISOPRED3:                                                                                            DDD D DDD 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KALALEYALCLTGDGLAHLQATDPQQLLRLIPHVQVFARVAPKQKEFVITSLKELGYVTLMCGDGTNDVGALKHADVGVALLANAPERVVERRRRPRDSP 900
gnomAD_SAV:    ET T  CT     NSF      N RLP C V R R LTH       L VI   * SCM H FW  S  M T      A    VS S W  KQ#QQ  NR 
Conservation:  1151014378489566235310211253055635366555386757476766765753779979777777797764576588869895435677617611
SS_PSIPRED:    HHHH  EEEEEEHHHHHHHHHH HHHHHHHH  EEEEE   HHHHHHHHHHHHH   EEEE    HHHHHHH     EEEE    HHHHHHH        
SS_SPIDER3:    HHHH   EEEE HHHHHHHHHH HHHHHHHEEEEEEEEE  HHHHHHHHHHHHH   EEEEE     HHHHHH    EEEEE   HHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHH EEEE HHHHHHHHHH HHHHHHHHHEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHH  EEEE    HHHHH        E       HHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                                                        DDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                DDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                          D DDDDDDDDDDD
METAL:                                                                        D   D                                
MODRES_P:                                                                                                        S 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TLSNSGIRATSRTAKQRSGLPPSEEQPTSQRDRLSQVLRDLEDESTPIVKLGDASIAAPFTSKLSSIQCICHVIKQGRCTLVTTLQMFKILALNALILAY 1000
gnomAD_SAV:    A RDG#   I  IVR QL FL  KDR A #S # N   Q FKAK MAV I    G V       L     S M R    M   M   #            
Conservation:  1322322723682365633352276423267476597976665642756779779967997666555367979799999999999999979999997999
STMI:                                                                                                   MMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:                 HHH           HHHHHHHHHHHHH                          HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                               HHHHHHHHHHHHHH      EEE    HHE         HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                 HHHHHHHHHHHHH             EE         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                       
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                              
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                               
MODRES_P:          S                                                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SQSVLYLEGVKFSDFQATLQGLLLAGCFLFISRSKPLKTLSRERPLPNIFNLYTILTVMLQFFVHFLSLVYLYREAQARSPEKQEQFVDLYKEFEPSLVN 1100
BenignSAV:                                                                   L                      E              
gnomAD_SAV:      CI   #  #    *        GSS F   H    R F Q Q   SV S C MF IIV  L YL N  C  H  R QT K   E M   E      A 
Conservation:  7999979699999979997999999999999997777657756997967776774977337937774696598339527612415255855647495667
STMI:          MMMMMMMMMM MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                        MMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   HHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                    HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                     H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            STVYIMAMAMQMATFAINYKGPPFMESLPENKPLVWSLAVSLLAIIGLLLGSSPDFNSQFGLVDIPVEFKLVIAQVLLLDFCLALLADRVLQFFLGTPKL 1200
gnomAD_SAV:      I V V    VT  PV    L    T SK    LG   # F   T V  SFL NLS         G          FV  S      HI  Y    #  
Conservation:  9999577586756776699664986568156575466534832853488385655451356665763544224213521442273244436425551324
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMM               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM             
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH     H   HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                   
AA:            KVPS 1204
gnomAD_SAV:    Q   
Conservation:  2462
SS_PSIPRED:        
SS_SPIDER3:        
SS_PSSPRED:        
DO_DISOPRED3:     D
DO_SPOTD:        DD
DO_IUPRED2A: