Q9HD40  SPCS_HUMAN

Gene name: SEPSECS   Description: O-phosphoseryl-tRNA(Sec) selenium transferase

Length: 501    GTS: 2.264e-06   GTS percentile: 0.741     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 5      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 273      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MNRESFAAGERLVSPAYVRQGCEARRSHEHLIRLLLEKGKCPENGWDESTLELFLHELAIMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYRFIHGIGRSGD 100
gnomAD_SAV:    VIL*      P   LSSMPRC  VHH#R R V    Q    T  #     P V S   GVV   S   S   R TKR   CS#  CHQHGV # V #ACG
Conservation:  3101000021100111011110112001102201132367984336454736466366745666777667697966677461574366677699999999
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHH  HH               EE HHHHHHH            
SS_SPIDER3:      HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHH                EHHHHHEE E EE          
SS_PSSPRED:      HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHH H             HHHHHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:  DDDD                                                                                                
DO_SPOTD:      DDD                                                                                                 
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                                                 R                     RS  
REGION:                                                                                                       GRSGD
MODRES_P:                   S                                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ISAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLDIIKLAGVHTVANCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMITAGFEPVVIENVLEGDELRT 200
PathogenicSAV:                   D                                                                                 
gnomAD_SAV:      S H ETT# NF  EM IP I AL E  DA    #     T   VR        Q   R S # MR## HR   L  V    L   L      D #PC 
Conservation:  7796999977976676667553976571697344439767969799795767659654872636757999999989969577774666557245668648
SS_PSIPRED:               HHHHHHHHHHHHHHHHHH        EEE   HHHHHHHHHHHHHHH     EEEEE    HHHHHHHHH   EEEEE  EE       
SS_SPIDER3:     H         HHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEE    HHHHHHHHH   EEEEE           
SS_PSSPRED:              HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEE   HHHHHHHHHHHHHH     EEEEE  HHHHHHHHHHH    EEEEE          
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:           Q                                                                                               
REGION:        ISAVQP                                                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DLKAVEAKVQELGPDCILCIHSTTSCFAPRVPDRLEELAVICANYDIPHIVNNAYGVQSSKCMHLIQQGARVGRIDAFVQSLDKNFMVPVGGAIIAGFND 300
PathogenicSAV:                                       T                                                             
gnomAD_SAV:       TA T  #D#  V        I   SS    S K  T V        #   T V R   S #     #*  KVHT     N       #  L V L Y
Conservation:  7414562461266453599699997989996966686861484344699799999959377999975653639979797996977757779796799943
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHH    EEEEEE            HHHHHHHHHH    EEEE       HHHHHHHHHHHH     EEEE           HHHEEE  H
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHH HHHEEEEEE           HHHHHHHHHHH    EEEE          HHHHHHHHH     EEEE        EEE EEEEE  H
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHH    EEEEEE            HHHHHHHHHHH   EEEE           HHHHHHHH     EEEE           EEEEEE  H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                                             R                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SFIQEISKMYPGRASASPSLDVLITLLSLGSNGYKKLLKERKEMFSYLSNQIKKLSEAYNERLLHTPHNPISLAMTLKTLDEHRDKAVTQLGSMLFTRQV 400
PathogenicSAV:                         S        C                                                                  
BenignSAV:           G                                                                                             
gnomAD_SAV:      VHD R    RG  V R     VS    RT#D         K            L*D D    RIA D T S IIP    KYH  T I    TR  G* 
Conservation:  1763577659796774676695669896692399327943896452284135428630328769295898798747810522011144749989898968
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             EEEE           HHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             EEEEE HHHHH HHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH        EEEE           HHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                   R                                                                                    R  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SGARVVPLGSMQTVSGYTFRGFMSHTNNYPCAYLNAASAIGMKMQDVDLFIKRLDRCLKAVRKERSKESDDNYDKTEDVDIEEMALKLDNVLLDTYQDAS 500
PathogenicSAV:                                                                                         V           
BenignSAV:                                   G                    N            Q                                   
gnomAD_SAV:     EPS     C#P  NSCILGDSI  A  * Y  FS  LDVRIR R  E  VNT      TGT *QT GNN SF  S # NV*  TF VGS PPNI #VGA
Conservation:  9878886361273567649289869341956698867677854228644645795585532282111213100111001331100002111003333333
SS_PSIPRED:      EEEE     EEE  EEE            HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHH HHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    EEEEEEE    EE   EEEE           HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHH   H HHH H      
SS_PSSPRED:       EEE     EEEEEEEE            HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHH   HHHHHH      
DO_DISOPRED3:                                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDD    D D  DDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                D  DDDDDDDDDDD                         
BINDING:                                                                     K                                     
REGION:                                                                                 DKTEDVDIEEMALKLDNVLL       

                
AA:            S 501
Conservation:  3
SS_PSIPRED:     
SS_SPIDER3:     
SS_PSSPRED:     
DO_DISOPRED3:  D
DO_SPOTD:      D
DO_IUPRED2A: