Q9NP66  HM20A_HUMAN

Gene name: HMG20A   Description: High mobility group protein 20A

Length: 347    GTS: 1.058e-06   GTS percentile: 0.249     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 151      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MENLMTSSTLPPLFADEDGSKESNDLATTGLNHPEVPYSSGATSSTNNPEFVEDLSQGQLLQSESSNAAEGNEQRHEDEQRSKRGGWSKGRKRKKPLRDS 100
BenignSAV:             I                                                                                           
gnomAD_SAV:    V Y* IN IIL I  YV S  K   V AA      IAH#N VA         QY    R  R V  S    S  SY GA QG Q S   E     #  EG
Conservation:  3222222222222222222222222222222222222101201111121322222221112103112112111121232331674594967879623222
SS_PSIPRED:                                                    HHHHHHH HHHHHH     HH   HH  HHHHHH                  
SS_SPIDER3:                                                      HHHH     H              H HHHH                    
SS_PSSPRED:                                                         H HHHHHHHHH           HHHHHH                   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NAPKSPLTGYVRFMNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQA 200
gnomAD_SAV:    K   F V    Q    H  H      K       K#I         D TR#  E  E    H R    R          #  AH HH D FRW    W T
Conservation:  6789695697777676876346333844547767746958663833045646668656573673679445437666423324344556122131423332
SS_PSIPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH 
SS_SPIDER3:            HHHHHHHH HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH   H     HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                                                                             DDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DD                                                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DNA_BIND:        PKSPLTGYVRFMNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQ                             
MODRES_P:          S                                                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            THDHEKETEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMP 300
gnomAD_SAV:     NV        KQC                 Q    H FH  IV     S      M T C#  G  V   L  QTC R      D VWEA  R# T  #
Conservation:  3232723011112324345585856555544585879566535335676645957963362274454516623520431254234123221422221224
SS_PSIPRED:         HH HHH        HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    H  HHHHHHH         E  HHH  HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:       HHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDD                                                                                       
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    D   D   DDDD DDDD                                                           
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDD                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         DD          D  DDD          DDDDD

                       10        20        30        40       
AA:            LPGSGETPTVDTIDSYMNRLHSIILANPQDNENFIATVREVVNRLDR 347
gnomAD_SAV:      R R A   GI  PCV      V      # TL D  Q A    YH
Conservation:  24444524321344133133222321340123044012133212114
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:             HHHHHHHHHHHHHHHHH  H  HHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:                HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                D
DO_SPOTD:                                                     
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDD