Q9NP91  S6A20_HUMAN

Gene name: SLC6A20   Description: Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3

Length: 592    GTS: 3.037e-06   GTS percentile: 0.907     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 339      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPYLCQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLYLELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVVVSFFLSM 100
BenignSAV:             G                                                                                           
gnomAD_SAV:    VKTTWS  P  P*# L  T  V AVDDL** T*    HC# R    HLT   MK  L          HVQR  VST*  VGL*RG  R V M FY    I
Conservation:  2211531522214333364632546745434743632164645344434452346256322483365245385457633667673849245233425322
STMI:               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:         HH  HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH      HHHHH HHH HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:              HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHH    HHHHHHHHHH H     HHHHHH H     HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:             HHHHHHHHHHHHHH    EEEHHHHH      EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH HH     EEEEEEHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDD                                                                                                
DO_SPOTD:      DDDD                                                                                                
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YYNVINAWAFWYLFHSFQDPLPWSVCPLNGNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKTLNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLVVYLCILRGTESTGKVVYFTA 200
BenignSAV:                                                                                                       M 
gnomAD_SAV:    D  I  T*D R   Q     PL  L  V    M CY   KEV  S *   K I S LL VR  RD    LV FH   *  A*    H  K IVNAG  MT
Conservation:  5353434432654424433288850893618264213683247565574694657745543128123342347637582348555455433455648596
STMI:                                                                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH           HHH      HHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH      HHH           HHH     HHHHHHHHH            E HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   E   HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH                    HHHHH   HHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                    N                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SLPYCVLIIYLIRGLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKAWINAATQIFFSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQKHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGF 300
BenignSAV:                                                     S                                                   
gnomAD_SAV:      S SLFMF   KV M RRTID  TCL I   Q VVKR    S    VI  V  CLS   T G #H AFD    NTTVM F D  A V V  D   VC  
Conservation:  3496398377865646849616951677595535924714955665555567577395779569672235645275536436642667965569977797
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMM                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM   
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH   HHHHH HHHHHHHHHHHHH HHH  HHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     H HHHHHHHHHHH      HHHHHHH    HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH   HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KATFNYENCLKKVSLLLTNTFDLEDGFLTASNLEQVKGYLASAYPSKYSEMFPQIKNCSLESELDTAVQGTGLAFIVYTEAIKNMEVSQLWSVLYFFMLL 400
BenignSAV:                                                         L                                               
gnomAD_SAV:     T  S Q        R     E A A   G     AES F YVS  T RKL L  R R  KL   M I  A V  VI  K T HV  F# SW FS   M 
Conservation:  6793676385243355546384626625313651142019224371352151224229584178358659387576465988358335845854483566
STMI:                                                                                                   MMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHH HHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHH HHHHHHH        HHHHHHH      HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH   H HHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHH HHHHHHH        HHHHHHH      HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHH   HHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHH  HHHHHHH        HHHHHHHHH    EEEEEHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                              N                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MLGIGSMLGNTAAILTPLTDSKIISSHLPKEAISGLVCLVNCAIGMVFTMEAGNYWFDIFNDYAATLSLLLIVLVETIAVCYVYGLRRFESDLKAMTGRA 500
gnomAD_SAV:    L     T  # V VF LPR   V     S  TN    W  K DT V  P# P   * HVV N V  P   PVM  DM TM  MCR  ILA  FR V S# 
Conservation:  2594766764235536551513124223324234624832342274265216858853586583565459565434332444355427632441142642
STMI:          MMMMMMMMMM                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              
SS_PSIPRED:    HH HHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90  
AA:            VSWYWKVMWAGVSPLLIVSLFVFYLSDYILTGTLKYQAWDASQGQLVTKDYPAYALAVIGLLVASSTMCIPLAALGTFVQRRLKRGDADPVA 592
BenignSAV:                                 V                                                               
gnomAD_SAV:      G   L    A   VT G S I# NE VPM  R   T  T     M R  LV   VAMR    A II  AVV    S #CHF TA T LL 
Conservation:  44455433823348454324433552364137344847842237334124561344325245344321545217411410230200000000
STMI:              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                 
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:      HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH        EE E         E   HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                              D     DDD               DDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                          DDDDDDDD
DO_IUPRED2A: