Q9NPC8  SIX2_HUMAN

Gene name: SIX2   Description: Homeobox protein SIX2

Length: 291    GTS: 1.136e-06   GTS percentile: 0.284     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 147      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSMLPTFGFTQEQVACVCEVLQQGGNIERLGRFLWSLPACEHLHKNESVLKAKAVVAFHRGNFRELYKILESHQFSPHNHAKLQQLWLKAHYIEAEKLRG 100
BenignSAV:                                               F                                                         
gnomAD_SAV:     AV                A   SC MAW S         KQFR#   L     L    G  IH FC        LL  Y# M L       VQT  M  
Conservation:  9100122113122334344452554022244123242433314321633456463432423050465145432060425632663645487617761485
SS_PSIPRED:              HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH    HHHH    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:              HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH    HHHH   HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH        HHHHHHHHH H HHHHHHH  
SS_PSSPRED:              HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH   HHHH    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                                                                                              
DO_SPOTD:      DDDDD                                                                                            DDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RPLGAVGKYRVRRKFPLPRSIWDGEETSYCFKEKSRSVLREWYAHNPYPSPREKRELAEATGLTTTQVSNWFKNRRQRDRAAEAKERENNENSNSNSHNP 200
gnomAD_SAV:                           R D I   M E  RL  Q  VD S   L#Q  Q  G  V  I PIR  L       WP K R G  S##  TS  SL
Conservation:  4396363623645245381436244433274422440383335003327241335243122253234232632132355621010333422322113120
SS_PSIPRED:           HHHHHH                   HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH   HHH       HHHHHHHHHHHHHHHH          
SS_SPIDER3:              E                     HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH   HHHH      H HHHHHHHHHHHH            
SS_PSSPRED:            HHHH                    HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHH          
DO_DISOPRED3:                                                                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                            DDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DNA_BIND:                             GEETSYCFKEKSRSVLREWYAHNPYPSPREKRELAEATGLTTTQVSNWFKNRRQRDRAAE                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90 
AA:            LNGSGKSVLGSSEDEKTPSGTPDHSSSSPALLLSPPPPGLPSLHSLGHPPGPSAVPVPVPGGGGADPLQHHHGLQDSILNPMSANLVDLGS 291
PathogenicSAV:                                                      T                                     
BenignSAV:                                             L                                  N               
gnomAD_SAV:    P   S L SA PK K ALLVMT   L   T## GSAS E L   G  QSL#  TALMQ  SR E#A  PQ  D  NT VS V VS LVQRF
Conservation:  1121202122434310231243133435545331433233412414413131321222212123320123111134245363231122512
SS_PSIPRED:                                 HHH                                                           
SS_SPIDER3:                                   H                                                           
SS_PSSPRED:                                                                                               
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD