Q9NQC3  RTN4_HUMAN

Gene name: RTN4   Description: Reticulon-4

Length: 1192    GTS: 9.63e-07   GTS percentile: 0.208     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 9      gnomAD_SAV: 647      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEDLDQSPLVSSSDSPPRPQPAFKYQFVREPEDEEEEEEEEEEDEDEDLEELEVLERKPAAGLSAAPVPTAPAAGAPLMDFGNDFVPPAPRGPLPAAPPV 100
gnomAD_SAV:    V # E  TV W     S S   L N Y#   QN*  KKKQK   DHAE   V M G   T RP   A   T     A L          SQ      SL 
Conservation:  7121361111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:                             EEE     HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH                                           
SS_SPIDER3:                            HE E                   HHHHHHHH                                             
SS_PSSPRED:                          HHHH         HHHHHHH     HHHHHHHHH                                            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:            S       S                                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            APERQPSWDPSPVSSTVPAPSPLSAAAVSPSKLPEDDEPPARPPPPPPASVSPQAEPVWTPPAPAPAAPPSTPAAPKRRGSSGSVDETLFALPAASEPVI 200
gnomAD_SAV:              R                                                          R        GSF    #  V  P   P AG 
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111165765664454654
SS_PSIPRED:                                                                                          HHH           
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:            S                                            S                            SS S                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RSSAENMDLKEQPGNTISAGQEDFPSVLLETAASLPSLSPLSAASFKEHEYLGNLSTVLPTEGTLQENVSEASKEVSEKAKTLLIDRDLTEFSELEYSEM 300
gnomAD_SAV:    C CG ITV#  #    LW  #        DIDP FLFP R# STA  D#K  DK P#  S G   HD I  # #    *TE VFTH G A          
Conservation:  3234634544655342242357554453545554657565484345832313414423324323122111522221132335464332122242133633
SS_PSIPRED:       HH   HH               HHHHH                  HHHH                HHHHHHHHHHH          HHHH   EEE 
SS_SPIDER3:         H                    HH H H               HHHH                 HHHHHHHHHHH           H    EEEEE
SS_PSSPRED:                              HHHHH                 HHHH                 HHHHHHHHHH            HHHHH    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D   DD             D  DDDDDDDDDDDDDDDDDD D                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GSSFSVSPKAESAVIVANPREEIIVKNKDEEEKLVSNNILHNQQELPTALTKLVKEDEVVSSEKAKDSFNEKRVAVEAPMREEYADFKPFERVWEVKDSK 400
BenignSAV:                                                             V                                           
gnomAD_SAV:      L # CT P   I##P T KD NMQ    #D  AN TMR  PP     VS   T G AL    G    DK TL AA STTD    II LG*L    VN 
Conservation:  2243132533624112211142211212340023130013012332412123431330111213103101221111211147366355553334324311
SS_PSIPRED:              HH EEE     EEEE    HHH     HHHH      HHHHH          HHHH              HHHH       EEEEE    
SS_SPIDER3:                EEEE      EEE  HHHHHH     H        HHHH   HHH     HH H    H  H       H         EEEEE    
SS_PSSPRED:                EEEE      EE                       HHHHH                   HHHHH               EEEEE    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDD                     D DDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:     D                       DDD    DDDDDDDDD   DDD  DDDD  DD  D  DDDD  DDDDDDD                        
MODRES_P:                                                                  S                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EDSDMLAAGGKIESNLESKVDKKCFADSLEQTNHEKDSESSNDDTSFPSTPEGIKDRSGAYITCAPFNPAATESIATNIFPLLGDPTSENKTDEKKIEEK 500
BenignSAV:                                            N         M                                                  
gnomAD_SAV:    K GGV VPA      W  EEA I        IDQ#    T   ESA  R# D L HH E C  R    A ES  M A    FS G IL     G NL   
Conservation:  1020121112123223530212321132303210434344425518383696322315338445434131233212112343343034464689866582
SS_PSIPRED:         HHH   HHHHHHHH  HHH    HH                              EEEE                             HHHHHHH
SS_SPIDER3:        HHH           H                                 H       EEEE E                           HHHHHHH
SS_PSSPRED:         HHH                                                                                      HHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     DD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D  DDDDDDDDDD         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D DDDD              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                   S   T                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KAQIVTEKNTSTKTSNPFLVAAQDSETDYVTTDNLTKVTEEVVANMPEGLTPDLVQEACESELNEVTGTKIAYETKMDLVQTSEVMQESLYPAAQLCPSF 600
gnomAD_SAV:        #  NTA  E   #     RG   Y IAIV         M  ##    A   ED SG     IA A M CG ETG I   D K   FNSG R  S  
Conservation:  3552244432221121213222322335424232230121312555598589979989587844743259235955599976664187342523945556
SS_PSIPRED:    HHHEEE           HH                    HHHHH       HHHHHHHHH           HH     HHH  HHHH     HHH     
SS_SPIDER3:    H                 HE                   HHHH        HHHHHHHHH            E     HHHH HHH       H      
SS_PSSPRED:    HHH                                    HHH          HHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHH HHHH     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDD DDD DD DDD  DDDD     DDDD DDDDD
MODRES_P:                S                                                                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EESEATPSPVLPDIVMEAPLNSAVPSAGASVIQPSSSPLEASSVNYESIKHEPENPPPYEEAMSVSLKKVSGIKEEIKEPENINAALQETEAPYISIACD 700
gnomAD_SAV:    VQ      L  S T V   M C     C  MVER PP  GG  L    V R#L  #STH# #V I          GM   G MI S PV  TLCV VT A
Conservation:  7335447474585766679744122233323333224433213223521214333452657534332222232332032430112224527458788899
SS_PSIPRED:                                                               HHHH   HHHHHHHHHHH         HHH      HHHHH
SS_SPIDER3:                 EE                               HH          HHHHH   HHH  HHHHHH         HH        HHHH
SS_PSSPRED:                                                                      HHH   HHHHH         HHHH     HHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDD DDDDDDDDDDDD      DDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDD D D DDDDDDDDDDDDD          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LIKETKLSAEPAPDFSDYSEMAKVEQPVPDHSELVEDSSPDSEPVDLFSDDSIPDVPQKQDETVMLVKESLTETSFESMIEYENKEKLSALPPEGGKPYL 800
gnomAD_SAV:    FV  R  FV  GLG     G  T KE M  #  VA # L N  RL   INYLVS#I PRRNQ E  GED V     K  MA  SEVN  #   D    #M
Conservation:  9776883536334153257421012312432062163265254224453333223322221332221322212131112120201321122113147488
SS_PSIPRED:    HH                                                             HHH          HHH     HHHH           H
SS_SPIDER3:    HH                 HH                                           H          HHHHHH H H               
SS_PSSPRED:    H                                                                                                   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDD       DDD  DDDDDDDDDDDDD      
MODRES_P:                                                      S                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ESFKLSLDNTKDTLLPDEVSTLSKKEKIPLQMEELSTAVYSNDDLFISKEAQIRETETFSDSSPIEIIDEFPTLISSKTDSFSKLAREYTDLEVSHKSEI 900
BenignSAV:                  M                                                                                    Q 
gnomAD_SAV:    K    R G   N M L  A  F EQG  A *  V  S F LDNE  TCE V  T   ML HTF V  VGK#A  #  N V   EF# KC NI G   NQ 
Conservation:  5754302123312123131212112553465775431224422522333321127221433366334356552221232532223114122131002131
SS_PSIPRED:    HH              HHHHHHHH       HHH                               EEE               HHHHH            
SS_SPIDER3:    HH                 HHH         HHH           EE                  EHHE            HHHHHHH     HH     
SS_PSSPRED:                        HHH         HHH                                                                 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDD       D  DDDDDDDDDDDDDDD    DD                         D                                   DDDDD
MODRES_P:                                                               T                      S                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ANAPDGAGSLPCTELPHDLSLKNIQPKVEEKISFSDDFSKNGSATSKVLLLPPDVSALATQAEIESIVKPKVLVKEAEKKLPSDTEKEDRSPSAIFSAEL 1000
BenignSAV:                        C                    H                   E                                       
gnomAD_SAV:      VLV VEL S# KWL   CS  T L I K  I P     HR VI  M#  TLG FT  SL  R NT  S# F     T FH HIQ  E# T#SV   Q 
Conservation:  1311211112332334134214241021541101332115312221122223232323232132432245233154342112423346154444355436
SS_PSIPRED:                               HHH     HHH                      HHHHH        HHHHH               HHH HHH
SS_SPIDER3:                                                                HHHHHH        HHH                       
SS_PSSPRED:                                                                              HHHH                  HHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDD       D                                                         DD DDDDD              
MODRES_P:                                                                                                S         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SKTSVVDLLYWRDIKKTGVVFGASLFLLLSLTVFSIVSVTAYIALALLSVTISFRIYKGVIQAIQKSDEGHPFRAYLESEVAISEELVQKYSNSALGHVN 1100
BenignSAV:                                                                          A                              
gnomAD_SAV:    CR#  I P          EM D C  P    I LN  R# GC#V SV #  M C VC A S   R  E A    T  #P IVV  Q  #      F   I
Conservation:  4227547765799465794999747776497674776672597597997677579697975797999679999536742466574557697733474649
STMI:                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                             
SS_PSIPRED:        HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        HHHEEEH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          H        HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:        HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH HHH  HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                    DDDDDDD                                                                           
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90  
AA:            CTIKELRRLFLVDDLVDSLKFAVLMWVFTYVGALFNGLTLLILALISLFSVPVIYERHQAQIDHYLGLANKNVKDAMAKIQAKIPGLKRKAE 1192
gnomAD_SAV:     M   FSH L #E  A C #LT F * L C      VQR# T   S I     V DQD  ELY H   # N G   #  V G V   QC  Q
Conservation:  34336865999779996966776999579779999997774454635544444676665366775446437445443466759696663635
STMI:                                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                      
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH   HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                                          DDDDDD                DDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                            DDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                               
MODRES_A:         K