Q9NR82  KCNQ5_HUMAN

Gene name: KCNQ5   Description: Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 5

Length: 932    GTS: 4.106e-07   GTS percentile: 0.025     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 5      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 283      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MPRHHAGGEEGGAAGLWVKSGAAAAAAGGGRLGSGMKDVESGRGRVLLNSAAARGDGLLLLGTRAATLGGGGGGLRESRRGKQGARMSLLGKPLSYTSSQ 100
gnomAD_SAV:           R        C            V    D       #DS         S  R     L          R D#L             R  H#N  
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111110000101101001111111111111111111111111111111111121120000111
SS_PSIPRED:                   EEE   HH                            HH    EEEE  HH                                   
SS_SPIDER3:                     E       H                  E                                                       
SS_PSSPRED:                   EEE                                        E                                         
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDD                      D                                    DDD D                        
MODRES_P:                                                                                             S            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SCRRNVKYRRVQNYLYNVLERPRGWAFIYHAFVFLLVFGCLILSVFSTIPEHTKLASSCLLILEFVMIVVFGLEFIIRIWSAGCCCRYRGWQGRLRFARK 200
PathogenicSAV:                                             G                                                       
gnomAD_SAV:      G K      E    K     C    T  V                      # S G      IM   I     V              *    K SQ 
Conservation:  0100000011010011121102011221020016284435433323333413010531253325243344252423222331442443344143344233
STMI:                                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                       
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHH  
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH EEEEEEE        HHHHHHHH  
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHH      EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEE         HHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:      DDD                                                                                                 
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PFCVIDTIVLIASIAVVSAKTQGNIFATSALRSLRFLQILRMVRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELITAWYIGFLVLIFSSFLVYLVEKDANKEFSTYAD 300
gnomAD_SAV:       A       T        I           G       H       A      A  I            L               G  T         
Conservation:  6454342355546353344655343334334333555433334435464344455556534453443676767665756666656667760814916766
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           II
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH  HHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHHHHH H    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH         HHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ALWWGTITLTTIGYGDKTPLTWLGRLLSAGFALLGISFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAANLIQCVWRSYAADEKSVSIATWKPHLKAL 400
PathogenicSAV:                                         I                           #                               
gnomAD_SAV:        S                                  V       P      P H              H   Y  CR T     I T     P  D 
Conservation:  6566636544854543725244254454727664658654655977977967679999997975452385327486798586691323426981452534
STMI:          IIIIIIIIIIIIIIIIIII      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                      
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HH  HHHHHHHHHHHHH        HHH HHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHH H  HEE          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH           E E       
SS_PSSPRED:    HHHHHHH EEEE         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH              HHH  
DO_DISOPRED3:                                                             DDDD DDD                                D
DO_SPOTD:                                                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                DD D                                   
MOTIF:                   TIGYGD                                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HTCSPTKKEQGEASSSQKLSFKERVRMASPRGQSIKSRQASVGDRRSPSTDITAEGSPTKVQKSWSFNDRTRFRPSLRLKSSQPKPVIDADTALGTDDVY 500
PathogenicSAV:                             I                                                                       
gnomAD_SAV:       N I   HE   G        Q L T  K HTN  G GL  N  F G N  T               *         R   LR   G  I      G 
Conservation:  4442314452212113173567794543455242251552422021863251211298388699899989666958865633114321225234315410
SS_PSIPRED:                        HHHHHHH                                                                         
SS_SPIDER3:                     HHHHHHHH                                                                           
SS_PSSPRED:                         HHHHH                                                                          
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD         DDDDDDD DD DDDDDDDD      
MODRES_P:                                                    S                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DEKGCQCDVSVEDLTPPLKTVIRAIRIMKFHVAKRKFKETLRPYDVKDVIEQYSAGHLDMLCRIKSLQTRVDQILGKGQITSDKKSREKITAEHETTDDL 600
gnomAD_SAV:    G  A          I#S     Q           W      C                   Y      #CA           H  NQQ TI  #V     
Conservation:  4643234434256426357347765665575777667797999999999999999977679597766426777659753321666165511211511643
SS_PSIPRED:              HHH  HHHHHHHHHHHH HHHH    HHH      HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH                         
SS_SPIDER3:              HHH   H H EHEEEEEE EE              HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH                         
SS_PSSPRED:              HHH       EEEHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHH HHHHHHHHH HHHHHHHH                          
DO_DISOPRED3:  DDDDD                                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                D      DDDDDDDDDDD     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SMLGRVVKVEKQVQSIESKLDCLLDIYQQVLRKGSASALALASFQIPPFECEQTSDYQSPVDSKDLSGSAQNSGCLSRSTSANISRGLQFILTPNEFSAQ 700
gnomAD_SAV:    T #SQ        K V         V     W D P  FTS    N T  S  A      AG    L  T K     T N  S LSD     M  KVN  
Conservation:  6568773696598444415472464243237326423122433342322423124452353111413231103211124011222235333535331212
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHH                                                          
SS_SPIDER3:       HHHHHHHH HH HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHH                                                 E        
SS_PSSPRED:          EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH                                                           
DO_DISOPRED3:                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                         D DDDDDDDDD  DDDDDD   D                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TFYALSPTMHSQATQVPISQSDGSAVAATNTIANQINTAPKPAAPTTLQIPPPLPAIKHLPRPETLHPNPAGLQESISDVTTCLVASKENVQVAQSNLTK 800
gnomAD_SAV:    A  V I A  G E  L     N      S ITVK   MGL  VDT AV     I TV R  GL NRY    SS D  CNI N  A  NK       Y   
Conservation:  4223345323112223511111123121131121211111111251311415313101111111111111011010022111111210111101322212
SS_PSIPRED:                                                                                HHH        HHHHHHHH     
SS_SPIDER3:                                                                                H H  HHH   HHHHHHH      
SS_PSSPRED:                                                                                           HHH          
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:               DDDDDDDDDD DD D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                   DDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DRSMRKSFDMGGETLLSVCPMVPKDLGKSLSVQNLIRSTEELNIQLSGSESSGSRGSQDFYPKWRESKLFITDEEVGPEETETDTFDAAPQPAREAAFAS 900
gnomAD_SAV:    YH V     VRR  PW A#L#A    DNCF       LIK   V*F E KLNDF            YE L N    R KK   EN  DTL  ## TG V 
Conservation:  3133553253423321210311111445426454512221101012121223132211111216233254423242211111110232222220110122
SS_PSIPRED:                          HHH       HHH                                 EEEE                            
SS_SPIDER3:           E              HHHH       H                             H     EE                             
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDD DD       D          DD D       DDDDDDDDDDDDD DDDDD            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                    S                                                                     

                       10        20        30  
AA:            DSLRTGRSRSSQSICKAGESTDALSLPHVKLK 932
BenignSAV:                                Q    
gnomAD_SAV:    V P  VS Q     Y  RGG H F F Q RQN
Conservation:  31343302111111111032232332122231
SS_PSIPRED:                                    
SS_SPIDER3:                                EE  
SS_PSSPRED:                                    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDD    DDDDDDD DD       DDD