Q9NRW7  VPS45_HUMAN

Gene name: VPS45   Description: Vacuolar protein sorting-associated protein 45

Length: 570    GTS: 2.191e-06   GTS percentile: 0.719     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 3      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 232      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MNVVFAVKQYISKMIEDSGPGMKVLLMDKETTGIVSMVYTQSEILQKEVYLFERIDSQNREIMKHLKAICFLRPTKENVDYIIQELRRPKYTIYFIYFSN 100
BenignSAV:                                                                                      M                  
gnomAD_SAV:    #     MR  V RT  GGR SV  H VG  S   # VINI W      AS    VVY  G MVR V  V    SAE   # M  DP* SR AM      K
Conservation:  9553577457547967269467979999799453665675699997679997995770474267767549556654364115477764769327652476
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE HHHHHHH HH  HHHHHH   EEEE             EEEEEE   HHHHHHHHHHHH     EEEEEE  
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHH     EEEEEEE    HHHHHHH EHHHHHH  EEEEEE            EEEEEE   HHHHHHHHHHH      EEEEEE  
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE      HHHHE  HHHHHHH   EEEE             EEEEE   HHHHHHHHHHHH     EEEEEEE 
DO_DISOPRED3:  D                                                                                                   
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VISKSDVKSLAEADEQEVVAEVQEFYGDYIAVNPHLFSLNILGCCQGRNWDPAQLSRTTQGLTALLLSLKKCPMIRYQLSSEAAKRLAECVKQVITKEYE 200
gnomAD_SAV:    M    #E     G A  AE          V    #F P S FS   VQ    T  AG A R A        R T #         T  K I  M  E S 
Conservation:  6767957939996999999675979997779479979977726525764944219193779997799799779576657666355575939964977999
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHH  HHHHHHEEEEEE  EEEE    EEE            HHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:       HHHHHHHH    HHHE EEEEEEEEEEE    EEEEE           HHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHH H
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEEE    EEE            HHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LFEFRRTEVPPLLLILDRCDDAITPLLNQWTYQAMVHELLGINNNRIDLSRVPGISKDLREVVLSAENDEFYANNMYLNFAEIGSNIKNLMEDFQKKKPK 300
PathogenicSAV:                        N             K                                                              
BenignSAV:             F                                           L                                               
gnomAD_SAV:       LHQ  F SW  V  H     A    HG  H    KIVS    QV P G L   E  G A         S         D   S   VT    N  #E
Conservation:  7979759797967757995674447543679767777957754756457577797555559999797477774554345557773754594667744486
SS_PSIPRED:               EEEEEE      HHH  HHHHHHHHHHHH     EEEEE         EEEEE     HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH HH
SS_SPIDER3:               EEEEEE        H  HHHHHHHHHHH      EEEEEE         EEEE     HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH HHH
SS_PSSPRED:               EEEEEE           HHHHHHHHHHHH     EEEEE          EEE      HHHHHHH H HHHHHHHHHHHHHHHHHH HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                D      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EQQKLESIADMKAFVENYPQFKKMSGTVSKHVTVVGELSRLVSERNLLEVSEVEQELACQNDHSSALQNIKRLLQNPKVTEFDAARLVMLYALHYERHSS 400
BenignSAV:                                                                                                       R 
gnomAD_SAV:         D  # I                I  R  G     Q L# W      K#   MT RS   #V H        TR      VH  I  T  H * NG
Conservation:  4356759535559997799997997947579577797995975741977979499577775975372925585785475462663669376577634645
SS_PSIPRED:    HHH    HHHHHHHHHH HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:    HH     HHHHHHHHH  HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH     H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:    D                                                                                                  
MODRES_P:            S                                                                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NSLPGLMMDLRNKGVSEKYRKLVSAVVEYGGKRVRGSDLFSPKDAVAITKQFLKGLKGVENVYTQHQPFLHETLDHLIKGRLKENLYPYLGPSTLRDRPQ 500
PathogenicSAV:                                                                    L                                
gnomAD_SAV:        E V   G       CQ #M V#  CD  QLK     R R G S      R       I A  R L # S  R    K E   CR V      E   
Conservation:  4153562055214843643465624457899895658796344666678859799769799996996776477994767669664379759564779858
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHH        HHH    HHHHHHHHHH                      
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHH       E HH    HHHHHHHHHH     HHH              
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHH       EEEE    HHHHHHHHHHH                     
DO_DISOPRED3:                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                                       
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                                              S                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70
AA:            DIIVFVIGGATYEEALTVYNLNRTTPGVRIVLGGTTVHNTKSFLEEVLASGLHSRSKESSQVTSRSASRR 570
BenignSAV:                       C                                                   
gnomAD_SAV:             T H KV   C   L #   S  P S    HM      F    #  P   T  I  G EN  
Conservation:  5643735675656654466545421763634534415567432234212142011000011102100031
SS_PSIPRED:    EEEEEEE    HHHHHHHHHHHH    EEEEEE      HHHHHHHHHH                     
SS_SPIDER3:    EEEEEEE    HHHHHHHHHHH      EEEEEE     HHHHHHHHHHH                    
SS_PSSPRED:    EEEEEEE    HHHHHHHHHHHH    EEEEEE      HHHHHHHHHHH                    
DO_DISOPRED3:                                                       DDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                  D                      DD DDDDDDDDDDDDD