Q9NSD5  S6A13_HUMAN

Gene name: SLC6A13   Description: Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2

Length: 602    GTS: 2.762e-06   GTS percentile: 0.863     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 348      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDSRVSGTTSNGETKPVYPVMEKKEEDGTLERGHWNNKMEFVLSVAGEIIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFFIPYLVFLFTCGIPVFLLETALGQYTSQGG 100
gnomAD_SAV:     GNK   I   #KA  ACTIT   KK     WRN* K   L  L SR  V    I#  S PS  SER        I   SYD       #    NSN  S
Conservation:  1000001100112220000001100111102442414523434533634364433422543323354467658835653266453335644467545575
STMI:                                                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            
SS_PSIPRED:                                        HHHHHHHHHHHHH                      HHHHHHHHH   HHHHHHHHH HHH   H
SS_SPIDER3:                                      H  HHEHHHHEHHH     H EE  HEE          HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH    H
SS_PSSPRED:                                         HHHHHHHHHHH      EE    EEE      EEHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                                                                     
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                     
DO_IUPRED2A:   DDDDDDD D      DDDD                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VTAWRKICPIFEGIGYASQMIVILLNVYYIIVLAWALFYLFSSFTIDLPWGGCYHEWNTEHCMEFQKTNGSLNGTSENATSPVIEFWERRVLKISDGIQH 200
gnomAD_SAV:    I# CK   L    V C C       DICCSTA T T V    T IV    R  #D *K  P KA    SSP   A  S IYLI K G QQ   V # N N
Conservation:  5658333353527453544452044436865676774775236741257634715177530822311110100000122336444664455634528642
STMI:                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                           
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHH             HHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:    HHHHHH  HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                H HHHHHH              HHHHHHH   HH       
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                        HHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                                                          C        C                                      
CARBOHYD:                                                                              N                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LGALRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVYFTATFPYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQVWMDAGTQIFFSFAICLGCLTAL 300
gnomAD_SAV:      # C  V VY     F#    L  #      M  LMS #RCFI AI S#* MM ##ED R *    AHRKHP  L  * VS  K L   T   EF AS 
Conservation:  3825365843673469446599699958457687978787963562597576336776116615643553157164477567787656865654734654
STMI:                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHH  HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH   HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHHHHHHH           EEEEE     HHHHHHHH          EEEEEEE  HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEEEHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHE            EE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                          N                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGFMSQEQGVPISEVAESGPGLAFIAYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESLVT 400
gnomAD_SAV:     NHS     Y   R TF   S RIRS  S  V    SY  *Q  M V  M K  T    VT#RWG         *T Y  CV IPP      LRI I LI
Conservation:  6565152566555332452746377525655686588886255245433663467784866573563548254354365735545486547886595356
STMI:          MM                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              
SS_PSIPRED:    HH       HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH HH   EEEEE HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    H        HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH   EEEEEE HHHHH      HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH   EEEEE HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ALVDMYPHVFRKKNRREVLILGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLFVAIFESLCVAWVYGAKRFYDNIEDMIGYRPWPLIKYCWLFLT 500
BenignSAV:                   Q          I                                                                          
gnomAD_SAV:    VMM VH #M C  SQ GI  # A  IF I    VRI SR# M       T #SR I LMV  K FR S   R  CL H VK K  H L SF   R   PA
Conservation:  5338448126543338626542343235338634366885655856535437946575452464346563595348726557989659113463591347
STMI:                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                MMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHH HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  E EEEEEEEHHH  H HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH  H
SS_PSSPRED:    HHHHH HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PAVCTATFLFSLIKYTPLTYNKKYTYPWWGDALGWLLALSSMVCIPAWSLYRLGTLKGPFRERIRQLMCPAEDLPQRNPAGPSAPATPRTSLLRLTELES 600
gnomAD_SAV:             L     AS NC EE K*L#*D VP# F  V  #GYT  C  C IR # CA  KI HR I  GKE H QI  ATW HT L     K#  I F
Conservation:  9448334837553542863673062691773148626634542636322221311226331522103113112310012212220112101100101122
STMI:          MMMMMMMMMM                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                    
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH                                 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH      EE  E    HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH     HHHHHHHH                            H    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH                                 
DO_DISOPRED3:                                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                 DDDD                  
MODRES_P:                                                                                            T   S         

                 
AA:            HC 602
Conservation:  02
SS_PSIPRED:      
SS_SPIDER3:    EE
SS_PSSPRED:      
DO_DISOPRED3:  DD
DO_SPOTD:      D 
DO_IUPRED2A: