Q9NTI5  PDS5B_HUMAN

Gene name: PDS5B   Description: Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B

Length: 1447    GTS: 6.155e-07   GTS percentile: 0.077     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 405      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAHSKTRTNDGKITYPPGVKEISDKISKEEMVRRLKMVVKTFMDMDQDSEEEKELYLNLALHLASDFFLKHPDKDVRLLVACCLADIFRIYAPEAPYTSP 100
gnomAD_SAV:       A      AN I  L        V          L          E         S     G   V    #   C  I              T     
Conservation:  2332413227464379777666655764695679975456654644776555644793555666556575564644657666576769777696777777
SS_PSIPRED:                               HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH  HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH        H
SS_SPIDER3:                               HHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH HHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH        H
SS_PSSPRED:                               HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH        H
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                       DDDDDDDDDDD                                             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDD                                                                                         
DO_IUPRED2A:   DDDD  DD DD DDD                                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DKLKDIFMFITRQLKGLEDTKSPQFNRYFYLLENIAWVKSYNICFELEDSNEIFTQLYRTLFSVINNGHNQKVHMHMVDLMSSIICEGDTVSQELLDTVL 200
gnomAD_SAV:             V   V      #    S                       N               SS                 V            MA 
Conservation:  7977677777679979999979697767977974546548545454969564675566779745546697499769956775776377756555556546
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHH  EEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHH   EEEHEE    HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VNLVPAHKNLNKQAYDLAKALLKRTAQAIEPYITNFFNQVLMLGKTSISDLSEHVFDLILELYNIDSHLLLSVLPQLEFKLKSNDNEERLQVVKLLAKMF 300
gnomAD_SAV:        S R              M         F               V N   R#    V      N     L          S                
Conservation:  5863433436666557967369866674674566679759976755766679996777767655674276556564645566755556775754665767
SS_PSIPRED:    HHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH  HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GAKDSELASQNKPLWQCYLGRFNDIHVPIRLECVKFASHCLMNHPDLAKDLTEYLKVRSHDPEEAIRHDVIVSIVTAAKKDILLVNDHLLNFVRERTLDK 400
gnomAD_SAV:    R              P     L      VC       ## VV    S TY     IM  R    V   #      I TE    QAS R            
Conservation:  7566657635644575569499777777677767776767647776654677634567777777777767797976967797297972974666575665
SS_PSIPRED:        HHHHHH HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:          HHHH HHHHHHHH H     HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH  H
SS_PSSPRED:    H   HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHH  HHHHHHHHHHHH H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RWRVRKEAMMGLAQIYKKYALQSAAGKDAAKQIAWIKDKLLHIYYQNSIDDRLLVERIFAQYMVPHNLETTERMKCLYYLYATLDLNAVKALNEMWKCQN 500
BenignSAV:                                                                           A                             
gnomAD_SAV:       A    LL  VH       L     GVT      EE    M   S         WT       YS   A Q  #   F     IS       V     
Conservation:  3656779799797746699595467976442364776679777777766665799967956247865534366567666966287169575553455965
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H  HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLRHQVKDLLDLIKQPKTDASVKAIFSKVMVITRNLPDPGKAQDFMKKFTQVLEDDEKIRKQLEVLVSPTCSCKQAEGCVREITKKLGNPKQPTNPFLEM 600
gnomAD_SAV:                V     E     L P  K           V   V              R   A  R A F  H DA  HD     CSL E       V
Conservation:  4762255487773534267532355359662767999769656765887495937967661697177994996786415666666743465754777666
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                      DDD              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IKFLLERIAPVHIDTESISALIKQVNKSIDGTADDEDEGVPTDQAIRAGLELLKVLSFTHPISFHSAETFESLLACLKMDDEKVAEAALQIFKNTGSKIE 700
gnomAD_SAV:     R            NK V   V  M   V            AEE   V           Y      #  CQ          G G  S    LR   N V 
Conservation:  4467767797976647566696663657659777767777566276945557566576696466584575566638545467667666577666662555
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH HH  HHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH  HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH    H
SS_SPIDER3:    HHHHHHH  HH   HHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH   HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH    H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH    H
DO_DISOPRED3:                             DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                        
DO_SPOTD:                                   DDDDDDDDDD                                                             
DO_IUPRED2A:                                  DDDDDDDDDDD                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EDFPHIRSALLPVLHHKSKKGPPRQAKYAIHCIHAIFSSKETQFAQIFEPLHKSLDPSNLEHLITPLVTIGHIALLAPDQFAAPLKSLVATFIVKDLLMN 800
gnomAD_SAV:    D     S      V#RT T    C     VY  RV   G# I         LN   L  VGY VAS   V    V VS    P                 
Conservation:  3462374346565773975665367774674975467556545666566776545732357797679666697757675775577765995967977996
SS_PSIPRED:    HH HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH      HH HHHHHHHHHHHHHH HHHH   HHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:     H HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH  HH    HHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HH   HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHH HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                     D
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DRLPGKKTTKLWVPDEEVSPETMVKIQAIKMMVRWLLGMKNNHSKSGTSTLRLLTTILHSDGDLTEQGKISKPDMSRLRLAAGSAIVKLAQEPCYHEIIT 900
gnomAD_SAV:     WFT E  #    SH  IA   V    S     Q  F     Y    S       AV  G        N     T         GV         Y VV 
Conservation:  9623735345853466665355346577595767995956653668769797676767356999976675456777969533444454665535534655
SS_PSIPRED:                   HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHH    HHH   
SS_SPIDER3:                   H   HHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HH    
SS_PSSPRED:                  HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                   
DO_SPOTD:       DDDDDDDD                                                                                           
DO_IUPRED2A:            DDD                                                        D                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LEQYQLCALAINDECYQVRQVFAQKLHKGLSRLRLPLEYMAICALCAKDPVKERRAHARQCLVKNINVRREYLKQHAAVSEKLLSLLPEYVVPYTIHLLA 1000
gnomAD_SAV:     G       SVDG  C    L          # #       M       T                 I # C         R         I   V    
Conservation:  5465388465469776777715577553693692969776666699976666666775776556754476655666523247629677767776466575
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHEEHHEEHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                           DDDDDDDDDDD                
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HDPDYVKVQDIEQLKDVKECLWFVLEILMAKNENNSHAFIRKMVENIKQTKDAQGPDDAKMNEKLYTVCDVAMNIIMSKSTTYSLESPKDPVLPARFFTQ 1100
gnomAD_SAV:     V    R   L   E I D        I    D  TYT      Q T  R        V       #   I TS V           SE  L   C   H
Conservation:  7799666267369964566674647657747577668564565364675666572436162688655695685154245553453633646264134421
SS_PSIPRED:    H         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH         HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH               HHH   
SS_SPIDER3:    H         HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH           H  HHHHHHHHHHHHHHHHH               HHH   
SS_PSSPRED:    H         HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                     
DO_DISOPRED3:                                                                                           DDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                            D                            DDDDDDDDDDDDDD DD
DO_IUPRED2A:                                                    DDDDDDDDDDD                                 D DDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PDKNFSNTKNYLPPEMKSFFTPGKPKTTNVLGAVNKPLSSAGKQSQTKSSRMETVSNASSSSNPSSPGRIKGRLDSSEMDHSENEDYTMSSPLPGKKSDK 1200
gnomAD_SAV:    #   V  S           CS     A S       S P   RK HPR   KG      N        I  E             E  TC S L E NER
Conservation:  3563515363742163511534779633278554664434357423072213522331323435153251411121141213533333333333333333
SS_PSIPRED:                 HHHHHH                                                                                 
SS_SPIDER3:                   HHHH                                                                                 
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:      DDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                             S                     S   S         S     S        S         
MODRES_A:                                         K                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RDDSDLVRSELEKPRGRKKTPVTEQEEKLGMDDLTKLVQEQKPKGSQRSRKRGHTASESDEQQWPEEKRLKEDILENEDEQNSPPKKGKRGRPPKPLGGG 1300
gnomAD_SAV:      NF  A T FA T   R M A    G SRR N  E L G     RKQNQ    M  V    R A  NSP   T   D       E S    T   I RS
Conservation:  3333333333343531211312112152200131141111111022232122110011132003132243333331013322143323588522621131
SS_PSIPRED:        HH                 HHHHH    HHHHHHH                         HHHHHHHHHHHH HHH                    
SS_SPIDER3:           HH               HHHH     HHHHHH                          HHHHHHH     HHH                    
SS_PSSPRED:                                                                     HHHH                               
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DNA_BIND:                                                      SRKRGHTASESDE                         KGKRGRPPKPLGG 
MODRES_P:                                                            T S S                       S                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TPKEEPTMKTSKKGSKKKSGPPAPEEEEEEERQSGNTEQKSKSKQHRVSRRAQQRAESPESSAIESTQSTPQKGRGRPSKTPSPSQPKKNVRVGRSKQAA 1400
gnomAD_SAV:      EA   T      R   C LLVL      G R  SR    QR *R   K      QF V N VK I CA    #  A  A  S  Q   IC  H RRT 
Conservation:  2111310122125528622312203333333310420122243333333333333333333333331221316322125523233333333100111012
SS_PSIPRED:                            HHHHHHHHH    HHHHHH      HHHHH                                          HH  
SS_SPIDER3:                            HHHHHHHH                HHHHH                                             H 
SS_PSSPRED:                                HHH                  HHHH                                               
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DNA_BIND:                                                                             QKGRGRPSKTPSP                
MODRES_P:                        S              S                       S       ST ST          T S                 

                       10        20        30        40       
AA:            TKENDSSEEVDVFQGSSPVDDIPQEETEEEEVSTVNVRRRSAKRERR 1447
gnomAD_SAV:    PR D  R  # A   # S N VS       D  A  IQ#*     W 
Conservation:  03113422333301110233333333321000000133333333333
SS_PSIPRED:               HH          HHH HHH            HHH  
SS_SPIDER3:              HH               H                   
SS_PSSPRED:                                                   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                      S