Q9NVV0  TM38B_HUMAN

Gene name: TMEM38B   Description: Trimeric intracellular cation channel type B

Length: 291    GTS: 2.468e-06   GTS percentile: 0.798     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 163      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDSPWDELALAFSRTSMFPFFDIAHYLVSVMAVKRQPGAAALAWKNPISSWFTAMLHCFGGGILSCLLLAEPPLKFLANHTNILLASSIWYITFFCPHDL 100
gnomAD_SAV:    T F#      # CGP V    AF QH  L VE  S  R    VR D      SSV R   R  V Y  F D        #  L        V    SR  
Conservation:  1111200110012111112123122111311021011542225115835563456539667445434465243312413313333552364436568043
STMI:                             MMMMMMMMMMMMMM                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            MMMMMMMMMMMMMMMMM 
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH   HHHHHHHHHHHHH   HHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HH
DO_DISOPRED3:  DD                                                                                                  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VSQGYSYLPVQLLASGMKEVTRTWKIVGGVTHANSYYKNGWIVMIAIGWARGAGGTIITNFERLVKGDWKPEGDEWLKMSYPAKVTLLGSVIFTFQHTQH 200
BenignSAV:                                                       Q                                                 
gnomAD_SAV:    L  V  CI   P PL    A    Q #  G   S CC  # M   V   VQS#D  TTM   S#L  A* L SGKRV  LCHP  N      CAL DI  
Conservation:  4412222374443445788849569633962482127244345643485457694255334837469183741443626634454583765485563111
STMI:              MMMMMMMMMMMMMMMMM                  MMMMMMMMMMMMMMMMM                       MMMMMMMMMMMMMMMM     
SS_PSIPRED:    HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH         HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH          HH    HHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH       HHH      HHHHHHHHHHHHE     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                        K   R                                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90 
AA:            LAISKHNLMFLYTIFIVATKITMMTTQTSTMTFAPFEDTLSWMLFGWQQPFSSCEKKSEAKSPSNGVGSLASKPVDVASDNVKKKHTKKNE 291
BenignSAV:                                                      S   S            IE                       
gnomAD_SAV:      V TYY #  *IM   # #T      A IT  GAL Y   S  CDR  SL  SD# NQ   T S#IA   LRL GISTG      AR   
Conservation:  6332321844266274422541432212102352147114102352011111000000000000010010010101100110012113613
STMI:                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH                                        HH    
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH                                              
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH                                        HHHH  
DO_DISOPRED3:                                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                          D DD  DDDDD              DDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                   S