Q9NXE4  NSMA3_HUMAN

Gene name: SMPD4   Description: Sphingomyelin phosphodiesterase 4

Length: 866    GTS: 2.454e-06   GTS percentile: 0.795     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1            gnomAD_SAV: 481      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MTTFGAVAEWRLPSLRRATLWIPQWFAKKAIFNSPLEAAMAFPHLQQPSFLLASLKADSINKPFAQQCQDLVKVIEDFPAKELHTIFPWLVESIFGSLDG 100
gnomAD_SAV:    VK SS    *WFLA  LGM  VLEL  RN V #ALP   V  SY  P NL R       V  S    *       KG A R  Y#V S  G       G 
Conservation:  2222222222222222222222222222222222222223001101021112338525113544142635603255542465721486764835777888
SS_PSIPRED:          EEEEE      HHHH  HHHH        HHH         HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:       E  EEEEE     EEEEE HHHHHHH      HHHH         HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:          EEEEE     HHHHH HHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDD               D DDDDDDDDDDD DDDD                                                    
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VLVGWNLRCLQGRVNPVEYSIVMEFLDPGGPMMKLVYKLQAEDYKFDFPVSYLPGPVKASIQECILPDSPLYHNKVQFTPTGGLGLNLALNPFEYYIFFF 200
gnomAD_SAV:    D I    H  E CM  M  GVM    #T SAV T  SR   G C  N    C    M V      VS N    ST     I # D   D  L KS L   
Conservation:  4319848226315226256225458929496676888888676554646533893657357443556655765655444239212334255456442726
SS_PSIPRED:          HHHH     HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH    EEE  HHH  HHHHHHHH       HHH                   HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:          E E      HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH    EEEE  HHH  HHHHHHHHH        H   EEE             HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                   HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH     EE       HHHHHHHHH                        E   HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                                                                          S                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ALSLITQKPLPVSLHVRTSDCAYFILVDRYLSWFLPTEGSVPPPLSSSPGGTSPSPPPRTPAIPFASYGLHHTSLLKRHISHQTSVNADPASHEIWRSET 300
PathogenicSAV:                               P                                                                     
gnomAD_SAV:      N  AE   #L  YIHI HG    PLE   #    I    HL      A   A LSL A  M  # H F     RM*  C  M M  E#T  Q     A
Conservation:  7136424521512122425536873874186358863783555342121332244436944125426442423665556645824565763543586545
SS_PSIPRED:    HHHHH                HHHHHHHHHHHHH                                                          HHHH HHH
SS_SPIDER3:    HHHHH                HHHHHHHHHHHH                                           H               HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHH                HHHHHHHHHHHHHH                                                            HHHHHH
DO_DISOPRED3:                   D                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         
DO_SPOTD:                                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDD       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          
DO_IUPRED2A:                                              DDDDDDDDDDDDDDDD                                         
MODRES_P:                                                                                          S               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLQVFVEMWLHHYSLEMYQKMQSPHAKLEVLHYRLSVSSALYSPAQPSLQALHAYQESFTPTEEHVLVVRLLLKHLHAFANSLKPEQASPSAHSHATSPL 400
gnomAD_SAV:       G  *I    C   RF    CLP N GL YHLF   GT   LV      FRT KQL MA *     AP  V                  T  QT  # 
Conservation:  4855866465365734355345363348446555833531233222321344334652818646535243234445335435443432253344443344
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH  HHHHHH       EEEEE                HHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH                    H
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH    HHHH      HHHHH EEEE             HHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHH                    H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH               HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH                    
DO_DISOPRED3:                  DDDDDDDDDDD                     DD                                    DDDDDDDDDDDDD 
DO_SPOTD:                                                                                           DDDDDDDDDDDD   
DO_IUPRED2A:                                                                                           DDDD DDD    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EEFKRAAVPRFVQQKLYLFLQHCFGHWPLDASFRAVLEMWLSYLQPWRYAPDKQAPGSDSQPRCVSEKWAPFVQENLLMYTKLFVGFLNRALRTDLVSPK 500
gnomAD_SAV:    D#L W T L  I    CF SE   SQ S GT I    Q C     LR#CVL RE RD NYHLQRMLK GV             #MD   CT #A     N
Conservation:  4436425334433354547853553357443344246648785568968424431211302132323562254446653555542376343342563333
SS_PSIPRED:    HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH HHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HH
SS_SPIDER3:    HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH  E                 HHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH      HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HH
DO_DISOPRED3:                                                      DDDDDDDDDDD                                     
DO_SPOTD:                                                         DDDDDDDDDDD                                      
DO_IUPRED2A:                                                            D DD                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HALMVFRVAKVFAQPNLAEMIQKGEQLFLEPELVIPHRQHRLFTAPTFTGSFLSPWPPAVTDASFKVKSHVYSLEGQDCKYTPMFGPEARTLVLRLAQLI 600
gnomAD_SAV:    YT    P     P SS #K    V        VA   C  * IRVR    R PL * SV     L  #N ISR#    S  SL#L SK HI   C #*FV
Conservation:  4458756546654563624453244245523332322853713347224333453432114524768546454686653141355626362263363433
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH                                   HHHHHHHHH       EE     HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH  H HHHHHHHHHH                                 HHHH HHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH                                HHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                DBDBBBDDDDDDDDDDDDDDDDD D                                             
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TQAKHTAKSISDQCAESPAGHSFLSWLGFSSMDTNGSYTANDLDEMGQDSVRKTDEYLEKALEYLRQIFRLSEAQLRQFTLALGTTQDENGKKQLPDCIV 700
gnomAD_SAV:     # NY  M  FNH VD LV    VLR  I CINAH  CI  N EKT     Q IGG #       H  CWPGKVH  E  FT V   N  # Q*   YMM
Conservation:  1344445322522313133405663532311141321423373452733234654446455543642454441376364314232235522324478642
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHH            HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH                EEE
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH         HHHH                HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH          E      E
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH                                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH                  
DO_DISOPRED3:            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDD                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                         DDDDDDDDDDD      
DO_IUPRED2A:             DD                          DDDDDDDD  DDD                                          D      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GEDGLILTPLGRYQIINGLRRFEIEYQGDPELQPIRSYEIASLVRTLFRLSSAINHRFAGQMAALCSRDDFLGSFCRYHLTEPGLASRHLLSPVGRRQVA 800
gnomAD_SAV:       *H  ML  Q*   S  *     *HEHL  * SQ    T S HAF   L     GVV RTG P YW G  S  #C   I T   # #  C  EGKK P
Conservation:  3426437423963956555666452536524755575553306752432142235134322510553315466334434521200002011450110021
SS_PSIPRED:         EE                 EEE  HHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH     HHHH           
SS_SPIDER3:         E E  EE       EEEEEEEE           HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH     HHHHHHHHH   HHHHH   E     EEE 
SS_PSSPRED:                         EEEEEE         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH  HHHHHHHH          
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDD                                                                                       
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:             T                                                                                   S        

                       10        20        30        40        50        60      
AA:            GHTRGPRLSLRFLGSYRTLVSLLLAFFVASLFCVGPLPCTLLLTLGYVLYASAMTLLTERGKLHQP 866
gnomAD_SAV:    S NCS     #  SR*WM  L   T  A    SIRLF   P  N S    VA   P  KWER  H 
Conservation:  110117443652566644522333242222332344224223422223554223233022143310
STMI:                               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                        
SS_PSIPRED:           EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:          EEEEEEHHHHH HHHHHHHHHHHH H   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH       
SS_PSSPRED:          EEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                          DDDDDD D  DDDDDDDDDDDDDDD    DDDDDD DDDDDB
DO_SPOTD:                                                                DDDDDDDD
DO_IUPRED2A: