Q9NYL5  CP39A_HUMAN

Gene name: CYP39A1   Description: 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase

Length: 469    GTS: 2.073e-06   GTS percentile: 0.679     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 248      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MELISPTVIIILGCLALFLLLQRKNLRRPPCIKGWIPWIGVGFEFGKAPLEFIEKARIKYGPIFTVFAMGNRMTFVTEEEGINVFLKSKKVDFELAVQNI 100
BenignSAV:                           P                                                                             
gnomAD_SAV:    KK  FRK  T V#SF VL   #P D PKSRYV# RT #TA  L   EDL   #   I  HE V  AL I  * A    QD             DP ALS 
Conservation:  7123212212222102221211322111886426667636635346535936642760659776742348343653332553226638524483266612
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                             
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHH   HHHHHHHHHHHH  EEEEEE  EEEEEE  HHHHHHHH     HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHHH                     HHHH   HHHHHHHHHHHH  EEEEEE  EEEEEE  HHHHHHHH     HHEHHHHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHH   HHHHHHHHHHHH  EEEEEE   EEEEEE   H HHHH       EEHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDBBBB                                                                         
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                             
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VYRTASIPKNVFLALHEKLYIMLKGKMGTVNLHQFTGQLTEELHEQLENLGTHGTMDLNNLVRHLLYPVTVNMLFNKSLFSTNKKKIKEFHQYFQVYDED 200
BenignSAV:       H                                                                                                 
gnomAD_SAV:    I HS LVR D  S      CNT    TE   RY S E*      GKRV     EIT   ISLK      A SI#V R W PA  NNV   RHC EI    
Conservation:  4124566433182125103203442542113311511142244123410530163138117461146843352673521341210222371228225845
SS_PSIPRED:    HH           HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    EE            HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      E HHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    H           HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FEYGSQLPECLLRNWSKSKKWFLELFEKNIPDIKACKSAKDNSMTLLQATLDIVETETSKENSPNYGLLLLWASLSNAVPVAFWTLAYVLSHPDIHKAIM 300
BenignSAV:                                                                                            H            
gnomAD_SAV:    V ##    DS  K   #   CL K   RS S M  R C     IR*  #M   E K  # *H S #AH    #    V  AVSGI  HA   L  Q   V
Conservation:  5525474631654274267275623522131122011323122173361423151112031015352643778655832434374525444141463244
STMI:                                                                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM             
SS_PSIPRED:       HH   HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH
SS_SPIDER3:       H H  HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH H  HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH
SS_PSSPRED:            HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH      HHH HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EGISSVFGKAGKDKIKVSEDDLENLLLIKWCVLETIRLKAPGVITRKVVKPVEILNYIIPSGDLLMLSPFWLHRNPKYFPEPELFKPERWKKANLEKHSF 400
BenignSAV:                            K    Q                                                                       
gnomAD_SAV:      L   S   C NNV#    #  HF   Q#     VHSNS V  I      L    HV A D   L   VC   SR*  L#A    TKH*  V    P L
Conservation:  4250554513430131422218324134538356534823883746664375232442693684633547826844236457418285983364526323
STMI:                                                             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                            
SS_PSIPRED:    HHHHHHH           HHHHH  HHHHHHHHHHHH       EEEE   EEE  EEE    EEEE HHHHH              HHH          
SS_SPIDER3:    HHHHHHH           HHHHH  HHHHHHHHHHH     H   EEE   EEE  EEE    EEEE HHHH           H                
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH         HHHHH  HHHHHHHHHHHH       HHH    EEE  EEE    EEEE HHHHH                           
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        7
AA:            LDCFMAFGSGKFQCPARWFALLEVQMCIILILYKYDCSLLDPLPKQSYLHLVGVPQPEGQCRIEYKQRI 469
gnomAD_SAV:        L    R  H SP R     A VR       H Y  P           ADI *L R*W* K E   
Conservation:  631633662522466673324343432313252342403323272220222232124020314131030
STMI:                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                     
SS_PSIPRED:                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                           EEEEEE  
SS_SPIDER3:                    HHHHHHHHHHHHHHHHHH EEEE          H  EE      EEEEEEE  
SS_PSSPRED:                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                          EEEEEE  
DO_DISOPRED3:                                                                       
DO_SPOTD:                                                                           
DO_IUPRED2A:                                                                        
METAL:                      C