Q9P0L9  PK2L1_HUMAN

Gene name: PKD2L1   Description: Polycystic kidney disease 2-like 1 protein

Length: 805    GTS: 3.289e-06   GTS percentile: 0.936     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 11      gnomAD_SAV: 463      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MNAVGSPEGQELQKLGSGAWDNPAYSGPPSPHGTLRVCTISSTGPLQPQPKKPEDEPQETAYRTQVSSCCLHICQGIRGLWGTTLTENTAENRELYIKTT 100
BenignSAV:                                                                                C                        
gnomAD_SAV:       L   VA       RES*G TT C TLALQRM K  NV IM   *R  RN K  TE M  G  L T  IR   D S R R I  AYI K#Q     AI
Conservation:  9111212212332122124824224323223112115255321121121101120122220012102256213124346485846687444545454555
SS_PSIPRED:             HHHHH                     EEEE                   HHHHH     HHHHH               HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:            H HHHH        H H          EEEE                  HHHH          EE              HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:              HHHH                      EEE                 HHHHHH      HHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                  
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                              
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          D      DDDDDDDDDDDDDDDD                                        
LIPID:                                              C                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LRELLVYIVFLVDICLLTYGMTSSSAYYYTKVMSELFLHTPSDTGVSFQAISSMADFWDFAQGPLLDSLYWTKWYNNQSLGHGSHSFIYYENMLLGVPRL 200
gnomAD_SAV:    V K    TM   GN   I    T RTH*    I  PV*YS   A   L   RN VN #  SPS  R    * Q H  R VD# CYF TN K TP A L  
Conservation:  8698557438857468799967654589685675497515322355283474462789173668684699865899535611313959898958996795
STMI:             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                            
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH          HHH   HHHHHHHHH   HHHH                  EE   EEE   EE
SS_SPIDER3:    HHHHHH   HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH           HHH   HHHHHHHHH  H  H      E          EEEEEEEEEE  EEE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH          HHH   HHHHHHHHH                             EEEE HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                                  N                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RQLKVRNDSCVVHEDFREDILSCYDVYSPDKEEQLPFGPFNGTAWTYHSQDELGGFSHWGRLTSYSGGGYYLDLPGSRQGSAEALRALQEGLWLDRGTRV 300
BenignSAV:                                                                                  Q                      
gnomAD_SAV:    Q    C#  F G    Q NV   C        QPV     S  V# *QL N   D F       HRRS *DVNF   LR   GD W# **  *     PA
Conservation:  6966626598285269326713965583234852116833755794855624539644973654857686639811532262127226233497758877
SS_PSIPRED:    EEEEE        HHHHHH           HH             EEE HHH    EEEEEEEEEE  EEEEE    HHHHHHHHHHHHH         E
SS_SPIDER3:    EEEE         HHHHHHH                        EE   HHHH  EEEEEEEEEE    EEEE    HHHHHHHHHHHH         EE
SS_PSSPRED:    HHH          HHHHHHHH                       EEEE         EEE  EEE    EEEE    HHHHHHHHHHHHHH       EE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:               C            C                                                                             
CARBOHYD:            N                                 N                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VFIDFSVYNANINLFCVLRLVVEFPATGGAIPSWQIRTVKLIRYVSNWDFFIVGCEVIFCVFIFYYVVEEILELHIHRLRYLSSIWNILDLVVILLSIVA 400
BenignSAV:                                                                                  W              I       
gnomAD_SAV:    LIV    H VS SF  A     A            MC  E  CCD   A   IA D L W   YCC    M#   MRWVH  G N    G MIN  P   
Conservation:  4958764888869688656654886646965585967696866664199485348633696874884896266533735265245885484466597446
STMI:                                                                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    EEEEEEE       EEEEEEEEEE     EE EEEEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEEEEEE     EEEEEEEEEEE    EEEEEEEEEEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    EEEEEEEE      EEEEEEEEEE     EEEEEEEEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VGFHIFRTLEVNRLMGKLLQQPNTYADFEFLAFWQTQYNNMNAVNLFFAWIKIFKYISFNKTMTQLSSTLARCAKDILGFAVMFFIVFFAYAQLGYLLFG 500
BenignSAV:                                                             V                                           
gnomAD_SAV:          G RA  Q  E   P S MC YS   T #    S# HT     V M     VT # IIN P AMMSH  Q # V TI  CF   S V* S    R
Conservation:  5496568945951764289338329599489997968478689797999988769796777774797666669749947977777559977797679799
STMI:          MMMMM                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM 
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TQVENFSTFIKCIFTQFRIILGDFDYNAIDNANRILGPAYFVTYVFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKEELAGQKDELQLSDLLKQGYNKTLLRLRLRKE 600
BenignSAV:                                                           I                                             
gnomAD_SAV:     E   L A   S# I LW N RA# HD  EK SCT SS H  A A  IS M   ISPD  S I*   R D  #   K KF      S #N VIK CM   
Conservation:  6793597591677677967999796634953766659949757779979869788888899989789948963545588646566868255525845486
STMI:                     IIIIIIIIIIIIIII          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                           
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHH  HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                                                                                                  D  D
DO_SPOTD:                                                                                                       DDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:          N                                                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RVSDVQKVLQGGEQEIQFEDFTNTLRELGHAEHEITELTATFTKFDRDGNRILDEKEQEKMRQDLEEERVALNTEIEKLGRSIVSSPQGKSGPEAARAGG 700
BenignSAV:                                                       C      L                      L                   
gnomAD_SAV:    S L   RIP* #KK T S NC        #TQ   N #RT     GS   C   KE L   #  P  K  D  PDT    Q      *S LC  V  V  
Conservation:  4665565463343235254784347535552524322244584467295724863258125313734453562355335412211111211001121121
SS_PSIPRED:        HHHHH        HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHH   
SS_SPIDER3:        HHHHH        HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH       E   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHH    
SS_PSSPRED:        HHHH         HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHH     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDBBBBDD                                                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDD                                                                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD 
DO_IUPRED2A:                                                       DD DDDDDD DDDDDD             DDDDDDDDDDDDDDDDDD 
CA_BIND:                                                    DRDGNRILDEKE                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            WVSGEEFYMLTRRVLQLETVLEGVVSQIDAVGSKLKMLERKGWLAPSPGVKEQAIWKHPQPAPAVTPDPWGVQGGQESEVPYKREEEALEERRLSRGEIP 800
BenignSAV:                                                                                            D       H    
gnomAD_SAV:       # *  V    F # QIIP  A   TNG  PN Q#V SNR*    S M Q  M   L  V  M SVHRAA  RRKCK SH     GSKD##IFH  MR
Conservation:  2421535114223423341241141223322103411122120001012111101120200010012001110111100120101221010110022220
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHH                           HHHHHHHHH HH     
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHH                E          HHHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHH                          HHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD DDDDD  D

                    
AA:            TLQRS 805
gnomAD_SAV:    M E#T
Conservation:  01000
SS_PSIPRED:         
SS_SPIDER3:         
SS_PSSPRED:         
DO_DISOPRED3:  DDDDD
DO_SPOTD:      DDDDD
DO_IUPRED2A:   DD  D