Q9P1Q0  VPS54_HUMAN

Gene name: VPS54   Description: Vacuolar protein sorting-associated protein 54

Length: 977    GTS: 1.349e-06   GTS percentile: 0.378     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 429      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MASSHSSSPVPQGSSSDVFFKIEVDPSKHIRPVPSLPDVCPKEPTGDSHSLYVAPSLVTDQHRWTVYHSKVNLPAALNDPRLAKRESDFFTKTWGLDFVD 100
gnomAD_SAV:        DNP S   RN    SCR#KA L  YF#A L   N            FC  S V IE  G  L   R            P       IE      A 
Conservation:  7444326333321122333325301132213232568676946935322283348976267357976596996777777977457667777767946937
SS_PSIPRED:                                                                     HHH    HHHHH                       
SS_SPIDER3:                              HH                                     H      HHHHH              HH       
SS_PSSPRED:                                                                           HHHHHHH                      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                                       
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDD                       DDDDDDDDD         DDD                        D                      
MODRES_P:             S                                                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TEVIPSFYLPQISKEHFTVYQQEISQREKIHERCKNICPPKDTFERTLLHTHDKSRTDLEQVPKIFMKPDFALDDSLTFNSVLPWSHFNTAGGKGNRDAA 200
gnomAD_SAV:    A  R A C    GR   IIH   VC  # #D    #VRLSE NLKKNF LAD     H    S        VW            C#   V  RE C V 
Conservation:  3773743496255373921943643477649563635522642342423322664725766774575665767567269437999677324665456936
SS_PSIPRED:                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                        HHH                 HHHH                HH
SS_SPIDER3:                 HHHHHHHHHHH  HHHHHHHH           HHH          HHH   EEE           HHH                 HH
SS_PSSPRED:                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                       HHH                                     HH
DO_DISOPRED3:                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                              DDDDDDDDDDDD  
DO_SPOTD:                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                           
DO_IUPRED2A:                                 DD               DD                                                 D 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSKLLQEKLSHYLDIVEVNIAHQISLRSEAFFHAMTSQHELQDYLRKTSQAVKMLRDKIAQIDKVMCEGSLHILRLALTRNNCVKVYNKLKLMATVHQTQ 300
gnomAD_SAV:        V    N       A       VHPQ    GV   YK         H  QK Q    HF   I GR*    T   S    D   S V      Q   
Conservation:  7977977777799977996995999799799977969669667472374167227925532753666296914731554549746445767777677979
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PTVQVLLSTSEFVGALDLIATTQEVLQQELQGIHSFRHLGSQLCELEKLIDKMMIAEFSTYSHSDLNRPLEDDCQVLEEERLISLVFGLLKQRKLNFLEI 400
gnomAD_SAV:     #  MS #      #   T A  D  H KFPDT R W#      #       V   D  A   C   KS   N EI  QG  V# I     RTTPD    
Conservation:  9699799976779999799599699997999956697996999997979979977579549444676726466065596699379599797777769565
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH    E      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     H    HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YGEKMVITAKNIIKQCVINKVSQTEEIDTDVVVKLADQMRMLNFPQWFDLLKDIFSKFTIFLQRVKATLNIIHSVVLSVLDKNQRTRELEEISQQKNAAK 500
gnomAD_SAV:     A   FV       E  M      G V AV L     H  T #   G # FREV  EL V   K      T Q GD     EIR SG # DTL HRS VE
Conservation:  9347640697437375833263245555364438437666463926865883368325337738684842574367536735357233220121111102
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                        DDDDDDDDDDDD                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                           DDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                          D DDDDDDDDD  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DNSLDTEVAYLIHEGMFISDAFGEGELTPIAVDTTSQRNASPNSEPCSSDSVSEPECTTDSSSSKEHTSSSAIPGGVDIMVSEDMKLTDSELGKLANNIQ 600
BenignSAV:                                                                 C                                       
gnomAD_SAV:     K*PE#QM H    VK VNYGLC VGPI#V#A AICE  V RHR  R R YICK AS  EC CRR RIT F  R R   IA   TIF   V     D V 
Conservation:  0101348788977684979975232321112132132811121053343533334874464634574322313433333223643346619823644448
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHH              HH                                                          HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:         HHHHHHHH   HH  H          E                                                        HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHH                                                                         HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDD DDDD     D   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD               
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        
DO_IUPRED2A:                               D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ELLYSASDICHDRAVKFLMSRAKDGFLEKLNSMEFITLSRLMETFILDTEQICGRKSTSLLGALQSQAIKFVNRFHEERKTKLSLLLDNERWKQADVPAE 700
gnomAD_SAV:        N L   R L# RS TLKGE        #V  #  #    AL #H #EM  KN M    VF    VN     QG      GF   S H N  GI   
Conservation:  7845299836798688683467567786686838973795358295169725747474894969948836995998789779866754645756667537
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HH HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH           HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HH
DO_DISOPRED3:                                                                                           D      D  D
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FQDLVDSLSDGKIALPEKKSGATEERKPAEVLIVEGQQYAVVGTVLLLIRIILEYCQCVDNIPSVTTDMLTRLSDLLKYFNSRSCQLVLGAGALQVVGLK 800
gnomAD_SAV:    L # L F     T V #N              TIKE   TIA  A           R   SVS     VF H  A     #   *          L    
Conservation:  9969575433638276553023134658335917386385678999799776799947955768636775899564667997759776796965967997
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH                     EEEE  EEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH       H             EEEE  EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH                      EEEE   EEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
DO_DISOPRED3:    D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                       
DO_SPOTD:                 DDDDDDDDDDDDDDD                                                                          
DO_IUPRED2A:                     DD                                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TITTKNLALSSRCLQLIVHYIPVIRAHFEARLPPKQYSMLRHFDHITKDYHDHIAEISAKLVAIMDSLFDKLLSKYEVKAPVPSACFRNICKQMTKMHEA 900
gnomAD_SAV:    M            S   LR V   W Y   #  S R T   N  #  #  R      *V F TL#    A   C            L      IA    T
Conservation:  7779699996999999666999369399745635763749779599699967975974597757775567635367995754561679457564377977
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70       
AA:            IFDLLPEEQTQMLFLRINASYKLHLKKQLSHLNVINDGGPQNGLVTADVAFYTGNLQALKGLKDLDLNMAEIWEQKR 977
BenignSAV:                I                                                                 
gnomAD_SAV:    V Y     E  I    V G   PY RN     T     #   A FIV L   #  VEV       E    K      
Conservation:  72567747954368879934462364477356473697676574534633544334335535215664525485574
SS_PSIPRED:    HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHH HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           EHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                              D
DO_SPOTD:                                                                                DDD
DO_IUPRED2A: