Q9P2J5  SYLC_HUMAN

Gene name: LARS1   Description: Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic

Length: 1176    GTS: 2.123e-06   GTS percentile: 0.696     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 4      BenignSAV: 15      gnomAD_SAV: 522      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAERKGTAKVDFLKKIEKEIQQKWDTERVFEVNASNLEKQTSKGKYFVTFPYPYMNGRLHLGHTFSLSKCEFAVGYQRLKGKCCLFPFGLHCTGMPIKAC 100
BenignSAV:                                         V                                            R                  
gnomAD_SAV:     S   V  R N    T EG RK  YA S   GS FHVGNRS         AC     C   E M    T        Q R R Y           LV  S
Conservation:  4157656575868438824572693144385044110012123295556977999996997974766665664267637775079678767999777697
SS_PSIPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   EEEEE            HHHHH HHHHHHHHHHH    EEE   EE     HHHH
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EE  H           EEEE         E   HHHHHHHHHHHHHHHH     EE           HHHH
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EE              EEEEE                HHHHHHHHHHHHHH   E           HHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                                                                                              
DO_SPOTD:      DDDDDDD                                                                                             
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                                             PYMNGRLHLGH                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ADKLKREIELYGCPPDFPDEEEEEEETSVKTEDIIIKDKAKGKKSKAAAKAGSSKYQWGIMKSLGLSDEEIVKFSEAEHWLDYFPPLAIQDLKRMGLKVD 200
BenignSAV:            T                                                                                            
gnomAD_SAV:    T RF KVTQR D TL   V  * K  AG   GGK   A  E E   S V         DV N  V  N        SD   G  L   MR  Q TA    
Conservation:  9998799476795993897655544301120431355775767779738945343689299558951605531962735993999638638861596759
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH        HHH HH                  HHHHHHH    HHHHHHHHHH   HHHHHH   HHHHHHH HHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH         HHHH         H  H   H    HHHHHH    HHHHHHHHH    HHHHH    HHHHHH  HHHHHHHHHH    E 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH                           HHH HHHHHHHHH   HHHHHHHHHH   HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EE
DO_DISOPRED3:                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                            
DO_SPOTD:                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                
DO_IUPRED2A:                       DDDDD  DDD                                                                      
MODRES_P:                                                                        S                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            WRRSFITTDVNPYYDSFVRWQFLTLRERNKIKFGKRYTIYSPKDGQPCMDHDRQTGEGVGPQEYTLLKLKVLEPYPSKLSGLKGKNIFLVAATLRPETMF 300
gnomAD_SAV:    L H  T  E   CC            KK     W W  V  L      L QV         EV  S T  AF L S        R V     A    S  
Conservation:  9999979966996787977976349765476556476977796979996579967997656776675666645947277734466337969996999957
SS_PSIPRED:        EEE    HHHHHHHHHHHH HHH   EEE    EEEE                     EEEEEEEEE     HHH       EEEEEEE       
SS_SPIDER3:         EE E  HHHHHHHHHHHHHH     EEE   EEEE      EHHHHHHH         EEEEEEEEE      H      EEEEEEEE      E
SS_PSSPRED:        EEE    HHHHHHHHHHHHHHHHH        EEEE                      HHHHHHH       HHHH      EEEEEEE     EE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                  D DDDDDDD                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GQTNCWVRPDMKYIGFETVNGDIFICTQKAARNMSYQGFTKDNGVVPVVKELMGEEILGASLSAPLTSYKVIYVLPMLTIKEDKGTGVVTSVPSDSPDDI 400
PathogenicSAV:                                                                         C                           
BenignSAV:            H                                                                                            
gnomAD_SAV:    R KD  AC  T      M  D T L   R  G #  K I  #D M SA    R    F #    R  TSN  C   V     G SSD F G   VF G  
Conservation:  9989796595359647841146476542679696568567735745645445494646633535665253534478665743469995946886657793
SS_PSIPRED:      EEEEE     EEEEEEE  EEEEEEHHHHHHHHH           EEEEEE  EE   EEE       EEEEEE           EEEE     HHHH
SS_SPIDER3:    E  EEEE    EEEEEEEE  EEEEE HHHHHHHHHHH         EEEEE   EEEEEEEE       EEEEEE H       EEEEEEE    HHHH
SS_PSSPRED:      EEEEE     EEEEEE   EEEEE HHHHHHHHHH          EEEEE   EEE  EE        EEEEE           EEEEE     HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                           D DD        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AALRDLKKKQALRAKYGIRDDMVLPFEPVPVIEIPGFGNLSAVTICDELKIQSQNDREKLAEAKEKIYLKGFYEGIMLVDGFKGQKVQDVKKTIQKKMID 500
PathogenicSAV:                                    S                                                                
gnomAD_SAV:     TR   R R V   EC   G II Q KLE D   AA  #  #AIL  K  F G  NW   #Q E #T# ER C C I M V  RKMF  L    E   TA
Conservation:  4776977694568167473636655555776665763726592257559977999767993999454966776795966356495677469818633746
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH                         HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH HHHHHH    HHH                   HHHHHHH        HHHHHHHHHHHH H     EEE        HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH                         HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH   EEEEE         HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                             D                                                        
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AGDALIYMEPEKQVMSRSSDECVVALCDQWYLDYGEENWKKQTSQCLKNLETFCEETRRNFEATLGWLQEHACSRTYGLGTHLPWDEQWLIESLSDSTIY 600
BenignSAV:                   I                                                                                     
gnomAD_SAV:    TR T T        I TL    L   #E   * C Q D  *         GIL  D  K     *D   Q    GAD   S Q C   G V       V 
Conservation:  1258138698884838682989999888899889951187325013820655767968688984638873899997899866588864697688896668
SS_PSIPRED:        EEEE             EEEEEE         HHHHHHHHHHHHH  HH HHHHHHHHHHHHHHHHH                  EEEE      E
SS_SPIDER3:       EEEE EE   EE      EEEEEE  HH     HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                EE        
SS_PSSPRED:    H  HHHH              EEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 EEE        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAFYTVAHLLQGGNLHGQAESPLGIRPQQMTKEVWDYVFFKEAPFPKTQIAKEKLDQLKQEFEFWYPVDLRVSGKDLVPNHLSYYLYNHVAMWPEQSDKW 700
BenignSAV:                                                                            I                            
gnomAD_SAV:    V     VY   R#  Q P   L    L   I DIL     T VS  #      TS   N G         #I              C    # L    R*
Conservation:  6668544658654352864185538462574448977696425449371745317257719956999795959999977999776697979563233267
SS_PSIPRED:    E    HHHH                 HHH      EEEE            HHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:    E    HHHHH                HHH     EEEEEE           HHHHHHHHHHH     EEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:      HHHHHHH                        HHHEE             HHHHHHHHHHHHH    EEE     HHHHHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                       DDD                                                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PTAVRANGHLLLNSEKMSKSTGNFLTLTQAIDKFSADGMRLALADAGDTVEDANFVEAMADAGILRLYTWVEWVKEMVANWDSLRSGPASTFNDRVFASE 800
gnomAD_SAV:    S  L       VH         S V   E VE      T#   G   E     K  KTV GG#  H  S*I  LE   G# G       GA SG  LS  
Conservation:  9146737666677767999999996691475267797767649999997779779764577966889667579667554623488284226568688267
SS_PSIPRED:       EEE  EEEE              HHHHHHHH   HHHHHHHH    HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH       HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      EEEE  EE E              HHHHHHH  HHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH        HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      EEEEEEE                 HHHHHHHH  HHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                         K                                                                                 
MOTIF:                        KMSKS                                                                                
MODRES_P:                         S                                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LNAGIIKTDQNYEKMMFKEALKTGFFEFQAAKDKYRELAVEGMHRELVFRFIEVQTLLLAPFCPHLCEHIWTLLGKPDSIMNASWPVAGPVNEVLIHSSQ 900
BenignSAV:                                                                T                            D  D        
gnomAD_SAV:     HSV   I    KRIV  AVSE        #  MCCD T  RI GKV  W N    H  TA#    RD NR V    H  VSD   # D  D ISMY P 
Conservation:  6535626865575657677799469775764676977655676535845387518745548687646665626848325641629822634854945888
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH       E E         HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH                  HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YLMEVTHDLRLRLKNYMMPAKGKKTDKQPLQKPSHCTIYVAKNYPPWQHTTLSVLRKHFEANNGKLPDNKVIASELGSMPELKKYMKKVMPFVAMIKENL 1000
PathogenicSAV:                                       C                                                             
BenignSAV:                                                                  S         T                            
gnomAD_SAV:    C L        Q  DC         N      A R   CE   C   RR    F H    VSDR  L KE#T      T Q   *  TAV# I #S    
Conservation:  9867568569545635324384982212312686886769563684985169439426531425169688375299326566865596486966548764
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH                  EEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH                  EEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH                 EEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                  DDDDDDDDDDDDD                                                                       
DO_SPOTD:                        DDDDDDDDDD                                                                        
DO_IUPRED2A:                        DDDDDDDD                                                                       
MODRES_A:                                                                           K                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EKMGPRILDLQLEFDEKAVLMENIVYLTNSLELEHIEVKFASEAEDKIREDCCPGKPLNVFRIEPGVSVSLVNPQPSNGHFSTKIEIRQGDNCDSIIRRL 1100
PathogenicSAV:                      Q                                                                              
BenignSAV:                              C                                          I                  K            
gnomAD_SAV:         HV Y     H   LP DSL *#  W     T  RS PK K   G   YLR   K   TQT   LF   ##  S    I T  K  ETR  MV C 
Conservation:  4529345969667969339635947676679697256644667567665779797585256925655242549899349497335475689335264988
SS_PSIPRED:    HHH HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE     HHHHHH      EEEEE     EEEEE        EEEEEEEE    HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH HHHH       HHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE  H  HHHHH       EEEEE     EEEEE       EEEEEEE EE   HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE    HHHHHHH      EEEEE    EEEEEE        EEEEEEEE    HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                            D       DDDD               
MODRES_A:                                                    K                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70      
AA:            MKMNRGIKDLSKVKLMRFDDPLLGPRRVPVLGKEYTEKTPISEHAVFNVDLMSKKIHLTENGIRVDIGDTIIYLVH 1176
BenignSAV:                                         K                                       
gnomAD_SAV:      VSG#L    EL    S    S  *Q#S       GRAAVA LTA T GFV EEV   K EL M T NKVVC  R
Conservation:  2735936764358466975893398956976938204931733243835660142725375741256856446441
SS_PSIPRED:    HHH      HHH EEEEE                    EE      EEEE    EEEEEE  EEEE   EEEEEE 
SS_SPIDER3:    HHH      HHHEEEEEE        E            E     EEEEE    EEEEEE  EEEE   EEEEEEE
SS_PSSPRED:    HHHH         EEEE                            EEEEE    EEEEEE   EEE   EEEEEE 
DO_DISOPRED3:                                                                              
DO_SPOTD:                                                                                  
DO_IUPRED2A:                                    D