Q9UBB6  NCDN_HUMAN

Gene name: NCDN   Description: Neurochondrin

Length: 729    GTS: 5.778e-07   GTS percentile: 0.065     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 235      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSCCDLAAAGQLGKASIMASDCEPALNQAEGRNPTLERYLGALREAKNDSEQFAALLLVTKAVKAGDIDAKTRRRIFDAVGFTFPNRLLTTKEAPDGCPD 100
gnomAD_SAV:     #  GPV V   D  R      K TP   DS#    DH   V H                 V     V  N PWQ  N I         #A  VL#   E
Conservation:  8111111111113220100000010122112100253444123215235431334553665434614471144546648786377487716201212661
SS_PSIPRED:                   HHH               HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH   HHHHHH          H
SS_SPIDER3:           H       HH                HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH   HHHHHH          H
SS_PSSPRED:      HHHHH                          HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH    HHHHH          H
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                    
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                    
DO_IUPRED2A:                              D                                                                        
LIPID:           CC                                                                                                
MODRES_P:       S                                                                                                  
MODRES_M:                                                                                R                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HVLRALGVALLACFCSDPELAAHPQVLNKIPILSTFLTARGDPDDAARRSMIDDTYQCLTAVAGTPRGPRHLIAGGTVSALCQAYLGHGYGFDQALALLV 200
gnomAD_SAV:       #  S       SN A  TT S             I#P EL    HH     P    M I S #K  # I    IM          #C         M
Conservation:  1243575269854754442560448453566262246211000110101443284544804433232932183337452499382133234124551781
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH  HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHH   HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH   HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHH     HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH  HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEE  HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GLLAAAETQCWKEAEPDLLAVLRGLSEDFQKAEDASKFELCQLLPLFLPPTTVPPECYRDLQAGLARILGSKLSSWQRNPALKLAARLAHACGSDWIPAG 300
gnomAD_SAV:         TK R  N  DSN   L W  I      A                L AMH  SHW   V   HV         C T      C   TGSF#  LV 
Conservation:  0884022133813212392279015403723225015524721531647410021222004222812453475221634248663725335274294235
SS_PSIPRED:    HHHHH  HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH     E  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSGSKFLALLVNLACVEVRLALEETGTEVKEDVVTACYALMELGIQECTRCEQSLLKEPQKVQLVSVMKEAIGAVIHYLLQVGSEKQKEPFVFASVRILG 400
gnomAD_SAV:    NPR               QM V  M M    #LL S    T        C  E    K        I   T#ES  Q   L#     R  LE    W   
Conservation:  3346665696597999978629966312134234579935593652573012032722185196325538945645446363211121678567669395
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HH    HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AWLAEETSSLRKEVCQLLPFLVRYAKTLYEEAEEANDLSQQVANLAISPTTPGPTWPGDALRLLLPGWCHLTVEDGPREILIKEGAPSLLCKYFLQQWEL 500
gnomAD_SAV:        K     C          IH     C   K  S V    V   M  I  R     HT W    V     I   #W L    R  L   N        
Conservation:  5979998658634631899395193603321100202222122024310231111432266959986589977972993496235453792176122710
SS_PSIPRED:    HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHH      HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                              
DO_SPOTD:                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                               
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                                                     S                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TSPGHDTSVLPDSVEIGLQTCCHIFLNLVVTAPGLIKRDACFTSLMNTLMTSLPALVQQQGRLLLAANVATLGLLMARLLSTSPALQGTPASRGFFAAAI 600
gnomAD_SAV:     A   N L     L TA           M        HET          #     L  E G  RS          T     P G              V
Conservation:  3121004211100372566838447895478572275161471283117313873741411363739723869766453200122331301332771366
SS_PSIPRED:                 HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH   HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                  HHHHHHHHHHHHHHH     H    HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     H    HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    H             HHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:      DDDDDDDDD                                                                                       
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LFLSQSHVARATPGSDQAVLALSPEYEGIWADLQELWFLGMQAFTGCVPLLPWLAPAALRSRWPQELLQLLGSVSPNSVKPEMVAAYQGVLVELARANRL 700
gnomAD_SAV:           MV#  L A K      SG                          H    T  # H L       R      I SA#M T              
Conservation:  1872254120113221112306411611093431898486577654631336461024532276113302711222045412321545335143511411
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH         EEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH   HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHH HH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH         EEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH    HHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH           EEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH   HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHH HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        3
AA:            CREAMRLQAGEETASHYRMAALEQCLSEP 729
gnomAD_SAV:            V K M R  L           
Conservation:  85115110020214340252162113011
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                              D
DO_SPOTD:                                DDD
DO_IUPRED2A: