Q9UBN4  TRPC4_HUMAN

Gene name: TRPC4   Description: Short transient receptor potential channel 4

Length: 977    GTS: 1.188e-06   GTS percentile: 0.305     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 354      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFKININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDAL 100
gnomAD_SAV:     V   H  # H AF EHV IGTI      # T    #    N  H R   C   TD                  HL           V  #   C    V
Conservation:  7233453421231123442534464627891284348155447753565236357448644766737768645756564554553455741336335555
SS_PSIPRED:        EEE             EE        HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH          EE     HHHHHHHH   HHHHHHHHH    HHHHH
SS_SPIDER3:        EE              EEE       HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH                   HHHHHHH   HHHHHHHH     HHHHH
SS_PSSPRED:       EEE            EEEE        HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH     EEEEE      HHHHHHHHH  HHHHHHHHHH   HHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                             
DO_SPOTD:      D                                                                                                   
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LHAIRKEVVGAVELLLNHKKPSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVECVSSSDVDSLRHSRSRLNIY 200
gnomAD_SAV:     Y      #R  KV S  T  R    MS TV       LP           #  HG M F  LE    SQ Q  P      MCI V       C   S  
Conservation:  4444544664455846346444333367325543669577799997697756767756756644495494772669493693644769499397777969
SS_PSIPRED:    HHHHH   HHHHHHHH    HH       EE             HHHHHHHH  HHHHHHHHH                         HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH   HHHHHHHH             E              HHHHHHH   HHHHHHHHH               HHH       HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH  HHHHHHHHH                           HHHHHHHH  HHHHHHHHHH                        HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQELSKVENEFKSEYEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYRDDNSLIEEQSGNDLARLKLAIKYRQKEF 300
gnomAD_SAV:      VT       A      AG                   G     Q #    N     S   #  Q     Q    I        FT  T  V  C    
Conservation:  6777677957699999777794979963999359697537989792486297757787798959953798648412352421146976977988828977
SS_PSIPRED:    HHHH HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH     HHH       HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH  HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH        HHH     HHHHHHHHHHH  H 
SS_PSSPRED:    HHHH HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPVFSVCYLIAPKSPLGLFIRKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPT 400
gnomAD_SAV:         F   PS H  N IS     Y T  I  YV T        L    S   # RQ      M          I      F    M          Q  
Conservation:  6666777667544574568799745633543564356535725522653383413515646864565688567669744675775541012101347264
STMI:                                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                 
SS_PSIPRED:    H  HHHHHHHHHHHH     HH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHH       
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       H         
SS_PSSPRED:    HH HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IVEWMILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEALFAIANIFSSLRLISLFTANS 500
gnomAD_SAV:    VI#  M       T         D     M         I      #    RM   A  G   T D   V   I      L F                 
Conservation:  2768486996675693777669459734946999957795776967567697466424312010721933579584665365666667557565777696
STMI:                                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM          
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYFYYEETKGLTCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEFTEFVGATM 600
gnomAD_SAV:    Y  S            V          P  V      S CCKA#   #  ST  V   KT  M   A           V   A            A   I
Conservation:  7999977999676677999676757974676676576754632130005597771177667755656566967669695384574614272874757569
STMI:                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                   M
SS_PSIPRED:    H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EE              HHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EE   E          HHHHHHHHHHHHH    EEE       HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH     EEEE     HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFEEGGTLPTPFNVIPSPKSLWYLIKWIWTHLCKKKMRRKPESFGTIGRRAADNL 700
gnomAD_SAV:    L #                I   * MT           L    I     RSN                     RA  W  NK   #  L  R  QVTG W
Conservation:  9967657797767777666656666465577757799999999797979979675989566978534861083211341100022123432541646334
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                                
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHH        HHHH   HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH          E    HHHHHHHHHHHHHHH        HHHH      H  H 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHH         EE   HHHHHHHHHHHHHHH        HHH     HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                DDDDDDDDDDDDDDDDD     
DO_SPOTD:                                                                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                           D           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RRHHQYQEVMRNLVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLLRGSKLSTIQSANASKESSNSADSDEKSDSEGNSKDKKKNFSLFDLT 800
gnomAD_SAV:      Q   R  L K   Q A SVVT  N#  VVNK  #          H     S    QFFAT  V  L G ASL V H  N #QS N ## N     YF 
Conservation:  3242377584567587677636633843356686869777799798677755655321222212101011121111132000111001001111013112
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH                                 
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HH                        H          
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHH                      HHH         
DO_DISOPRED3:                            DDD DD  D                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                  DD                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TLIHPRSAAIASERHNISNGSALVVQEPPREKQRKVNFVTDIKNFGLFHRRSKQNAAEQNANQIFSVSEEVARQQAAGPLERNIQLESRGLASRGDLSIP 900
gnomAD_SAV:            #  P #R          RDL              E   I   #    V Q  PS  VF  K #SH  PS Q K  TH  CL   A#DN    
Conservation:  3231201211101101212221102211111000101121221122232431000222211103244232201100110010000110012010010111
SS_PSIPRED:                                  HH       HHHHHH           HHH    EE HHHHHHHHHH    HH   HHHH           
SS_SPIDER3:    H         E                           H HHHH       HH    HH       H HHHHHHH                      E  
SS_PSSPRED:                                           HHHHH            HHHH       HHHHHHHHHH                       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:            DDDDD    DDDDDDDDDDDDD  D D             DDDDD D DDDDDDDDDDDD  DD DDDDDD DDDDD D            

                       10        20        30        40        50        60        70       
AA:            GLSEQCVLVDHRERNTDTLGLQVGKRVCPFKSEKVVVEDTVPIIPKEKHAKEEDSSIDYDLNLPDTVTHEDYVTTRL 977
gnomAD_SAV:    SIRQ# ES  NKKK M S#E R  NT#W  RT      N AAVT  K #VE D#CGVVCH     R IL   LS   
Conservation:  01100001010122102112100122222222222222222222222222220111030020101122222131331
SS_PSIPRED:                                     EEE                                HH  EE   
SS_SPIDER3:         E               EE  EE      EEEE          H                  E E  EEEEE 
SS_PSSPRED:                                     EEEE                                  EEEE  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD       
DO_IUPRED2A:          D D        D                      DDDDDDDDD D DDDDDDDDD         D D   
REGION:                                                                                  TRL
MODRES_P:                                                                Y            Y