Q9UBN7  HDAC6_HUMAN

Gene name: HDAC6   Description: Histone deacetylase 6

Length: 1215    GTS: 6.481e-07   GTS percentile: 0.086     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 8      gnomAD_SAV: 289      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MTSTGQDSTTTRQRRSRQNPQSPPQDSSVTSKRNIKKGAVPRSIPNLAEVKKKGKMKKLGQAMEEDLIVGLQGMDLNLEAEALAGTGLVLDEQLNEFHCL 100
gnomAD_SAV:        S          NSK SL       D L Q    E   CC  S V       V  P   I    L    A          #   F          Y 
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111123111111111111111111111111111111111113534423213201222
SS_PSIPRED:                                 HH               HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH       HHHH   EEEEE HHHHHEE  
SS_SPIDER3:                                                  HHHHHH        HHH  HHH                 EEEEE HHHHH E  
SS_PSSPRED:                                                  HHHHHHHH         HHHHHHH        HHH    EEEEE HHHHHH   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                   
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD  D   DD                                            
MODRES_P:                           S                                                                              
MODRES_M:                                      R                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            WDDSFPEGPERLHAIKEQLIQEGLLDRCVSFQARFAEKEELMLVHSLEYIDLMETTQYMNEGELRVLADTYDSVYLHPNSYSCACLASGSVLRLVDAVLG 200
gnomAD_SAV:       R L  L   R   K                Q                    A   L     C    A           P #                
Conservation:  5313125263751231215110141246213134242325614363125422331621422136213311443443452461541373953838671542
SS_PSIPRED:            HHHHHHHHHHHHH  HHHH EEE      HHHHHHH  HHHHHHHH      HHHHHHHHHH   EE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:             HHHHHHHHHHHH   HHH EE E EE  HHHHHH   HHHHHHHH      HHHHHHHH    EEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHHHHH  HHH EEE      HHHHHHH  HHHHHHHHH     HHHHHHHHHH  EEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AEIRNGMAIIRPPGHHAQHSLMDGYCMFNHVAVAARYAQQKHRIRRVLIVDWDVHHGQGTQFTFDQDPSVLYFSIHRYEQGRFWPHLKASNWSTTGFGQG 300
gnomAD_SAV:      VQ                PI S                  C Q    I              N           # K    R R  S  R        
Conservation:  2133764653676666441214456759945654524531341317586877556585547228326735575847653220379192464211380307
SS_PSIPRED:         EEEEE                  HHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE       HHHHHH     EEEEEEEEE                      
SS_SPIDER3:          EEEE                  H HHHHHHHHHHH    EEEEEE        HHHHH     EEEEEEEE     E                 
SS_PSSPRED:      HHHEEEEE                  HHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE                  EEEEEEEE                       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
ACT_SITE:                     H                                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QGYTINVPWNQVGMRDADYIAAFLHVLLPVALEFQPQLVLVAAGFDALQGDPKGEMAATPAGFAQLTHLLMGLAGGKLILSLEGGYNLRALAEGVSASLH 400
gnomAD_SAV:         S   K         V     I    TR      I   T       N   DK     V T    Q # VG             VCT P VI  L  
Conservation:  1836586695424423256444623365834158184454656666432673592715483464386358326627454335766432133424332342
SS_PSIPRED:      EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE                 HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE     HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      EEEEE        HHHHHHHHHH HHHHHHHH   EEEEE  HHHH       EE  HHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE      HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       EEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE                 HHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEEE    HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TLLGDPCPMLESPGAPCRSAQASVSCALEALEPFWEVLVRSTETVERDNMEEDNVEESEEEGPWEPPVLPILTWPVLQSRTGLVYDQNMMNHCNLWDSHH 500
gnomAD_SAV:               L  T  Q      T      K      G    NM        S   NK       AG        P  H         IH  S      
Conservation:  3766352514100016405421542132134014811511111111100111000000001011111101001000100021111111422200011110
SS_PSIPRED:    HHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                              HHHHHHH       
SS_SPIDER3:    HH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                           EE HHHHH         
SS_PSSPRED:    HHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                               HHHHH         
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                     
DO_IUPRED2A:                                                DDDDDDDDDDDDDDDDDD                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PEVPQRILRIMCRLEELGLAGRCLTLTPRPATEAELLTCHSAEYVGHLRATEKMKTRELHRESSNFDSIYICPSTFACAQLATGAACRLVEAVLSGEVLN 600
gnomAD_SAV:           SW T C    R  R    VP   V A             L QP      W  RH           S   T       S  #            
Conservation:  4113242213100111112111111121121111220011012211121111111111111111111111010021011212322221332242023314
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHH       EE       HHHHHH   HHHHHHHHH     HHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     E
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHHH     H EE       HHHH     HHHHHHHHH     HHHHHH       EE  H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     E
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHH      E        HHHHHH   HHHHHHHHH     HHHHHHHH     EEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                         D D                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GAAVVRPPGHHAEQDAACGFCFFNSVAVAARHAQTISGHALRILIVDWDVHHGNGTQHMFEDDPSVLYVSLHRYDHGTFFPMGDEGASSQIGRAAGTGFT 700
gnomAD_SAV:                Q                          S         I                         R     V NQ       W      I
Conservation:  4232123212121111111111112212332321002101234544147111111111111111112111121023211311211220111101001121
SS_PSIPRED:    EEEEE                  HHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE                  EEEEEEEE              HHH         E
SS_SPIDER3:    EEEEE                HHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE           HH     EEEEEEEE     EEE       HH        EE
SS_PSSPRED:    EEEEE      HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE                  EEEEEEE               HHHH        E
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:       DD                                                                                              
ACT_SITE:                H                                                                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VNVAWNGPRMGDADYLAAWHRLVLPIAYEFNPELVLVSAGFDAARGDPLGGCQVSPEGYAHLTHLLMGLASGRIILILEGGYNLTSISESMAACTRSLLG 800
gnomAD_SAV:    I  T                     V    Y             W               Q   P       H           K          H    
Conservation:  3131421200112331022214458452442424442323121221111111111110124432262344154332443311212111112112211615
SS_PSIPRED:    EEE         HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE                 HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    EEE         HHHHHHHHH HHHHHHHH   EEEE   H HH        E  HHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE     HHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    EEE         HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE                 HHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DPPPLLTLPRPPLSGALASITETIQVHRRYWRSLRVMKVEDREGPSSSKLVTKKAPQPAKPRLAERMTTREKKVLEAGMGKVTSASFGEESTPGQTNSET 900
gnomAD_SAV:          S SQ         VI   R  C H C  W   A    RA R        S A    I  QL  Q      V   N  L        AVH   GI
Conservation:  1334012010121111201410320031116125311111111111111111111001001011001001010010111110111100101001111111
SS_PSIPRED:                 HHHHHHHHHHHHHHHHH  HH                          HHHHHHH  HHHHHHH                        
SS_SPIDER3:                 HHHHHHHHHHHHHHHHH H  EEE                        HHHHHH HHHHHHHH                        
SS_PSSPRED:                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                          HHHHHHH  HHHHHHH                        
DO_DISOPRED3:                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:       DD            D                 DD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AVVALTQDQPSEAATGGATLAQTISEAAIGGAMLGQTTSEEAVGGATPDQTTSEETVGGAILDQTTSEDAVGGATLGQTTSEEAVGGATLAQTTSEAAME 1000
BenignSAV:                                 TR                                                               I      
gnomAD_SAV:         A VHHP  TRV      IV    TA  V  H      IRA A N                    VA   M S A               L V V 
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:     EEEEE    HHH          HHHHH           HHH           HHH                         HHHH        HHHHH  
SS_SPIDER3:     EEEEE     HH          H HH    H                               E                  H H         HHHHH 
SS_PSSPRED:     EEEE                   HHHHH                                                    HHHH               
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GATLDQTTSEEAPGGTELIQTPLASSTDHQTPPTSPVQGTTPQISPSTLIGSLRTLELGSESQGASESQAPGEENLLGEAAGGQDMADSMLMQGSRGLTD 1100
BenignSAV:                             L                  M       N                              D                 
gnomAD_SAV:           M       #G    L  L I     SALL R    HLPTN    N K     RG     K  V R    P K P D     W V   FS  I 
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:                                                 HHHHHHHHH                                HHHHH         
SS_SPIDER3:                                                 H H   HH                                HHHHHHH        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDD        
MODRES_P:                     T    T     T   T  TS    T                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QAIFYAVTPLPWCPHLVAVCPIPAAGLDVTQPCGDCGTIQENWVCLSCYQVYCGRYINGHMLQHHGNSGHPLVLSYIDLSAWCYYCQAYVHHQALLDVKN 1200
BenignSAV:                                                                                                        D
gnomAD_SAV:      V       #C      I    S  VGM    E  E                 H      V  Y           VN  T   H  SNI #       D
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:       EEEE                                   EEEEE  EEE  HHHHHHHHHHHHH    EEEE     HHH     EEEHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       EEEEE       HHHE                       EEEEE EEE   HHHHHHHHHHHHH    EEEEH   EEEEEE   EE  HHHHHHHH
SS_PSSPRED:       EEEEE                                EEEEEEE EEEHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEHHHHHHHE   EEEHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                     C H                 C  C        C  C    C      H   H     H            C  C              
ZN_FING:                                     QPCGDCGTIQENWVCLSCYQVYCGRYINGHMLQHHGNSGHPLVLSYIDLSAWCYYCQAYVHH        
REGION:                                                             GRY                         WCYYCQAY           

                       10     
AA:            IAHQNKFGEDMPHPH 1215
gnomAD_SAV:     T   E  A   Q  
Conservation:  111111111111111
SS_PSIPRED:    HHHHHHH        
SS_SPIDER3:    HHHHHHH        
SS_PSSPRED:    HHHHH          
DO_DISOPRED3:                B
DO_SPOTD:                 DDDD
DO_IUPRED2A:               DDD