Q9UHC9  NPCL1_HUMAN

Gene name: NPC1L1   Description: NPC1-like intracellular cholesterol transporter 1

Length: 1359    GTS: 3.058e-06   GTS percentile: 0.910     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 10      gnomAD_SAV: 742      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAEAGLRGWLLWALLLRLAQSEPYTTIHQPGYCAFYDECGKNPELSGSLMTLSNVSCLSNTPARKITGDHLILLQKICPRLYTGPNTQACCSAKQLVSLE 100
BenignSAV:                                                           L                                             
gnomAD_SAV:     V#    D        C  #  RHI    S CF    KF   A   RT R P SEFY F RL C SI    L  K V  H  ASRK * Y  TR      
Conservation:  6001211123323443232141123224335294585487189242246319315794444382131313611732598174172273498611980574
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                               
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHH            EEEEE                               HHHHHHHHHH HHHH          HHHHHHHH
SS_SPIDER3:       H HHHHHHHHHHHHHHH           EEEE                                HHHHHHHHHH  HH           HHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHH            EEEE                               HHHHHHHHHH H             HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                             
DO_SPOTD:      DDDD                                                                                                
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                                      C     C                 C                    C           CC         
CARBOHYD:                                                           N                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ASLSITKALLTRCPACSDNFVNLHCHNTCSPNQSLFINVTRVAQLGAGQLPAVVAYEAFYQHSFAEQSYDSCSRVRVPAAATLAVGTMCGVYGSALCNAQ 200
BenignSAV:                                                                                 I                       
gnomAD_SAV:    V  W     FIH L    SS       MYRLSHNF# SMACL   RV  H TA  H G N   L#QP      HMCI   #M    A  #M  P P  V#
Conservation:  1842454365289969338743479144867577424587541101020114955633542217541372882286586654474447884873249658
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH     HHHEEEEEEEEE       EEEEEEEEE HHHHHHHHHHHH          HHHH           HH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH          EEEEEEEEE       EEEEEEEEE HHHHHHHHHHHH          HEEEE          HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH          EEEEEEEE      EEEEEEEEEE HHHHHHHHHHH         HHHHHHH          HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                  C  C        C   C                                          C                C       C   
CARBOHYD:                                     N     N                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RWLNFQGDTGNGLAPLDITFHLLEPGQAVGSGIQPLNEGVARCNESQGDDVATCSCQDCAASCPAIARPQALDSTFYLGQMPGSLVLIIILCSVFAVVTI 300
BenignSAV:                                                                             Y                           
gnomAD_SAV:    CL  S#    SS VL H  LY   T  VM NR  #   EI H S     #LV    P        V CH VPY IV#  HILD    LN   P IT FPN
Conservation:  6967799734985675352515122311241342453302129321221221387858812586142271122136244132614453435323222522
STMI:                                                                                              MMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHH           EEEEEE           EE                       HHH              EEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH           EEEEEE            E                        H               EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH           EEEEE                                                     EEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                               
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                                                C          C C  C   C                                     
CARBOHYD:                                                 N                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLVGFRVAPARDKSKMVDPKKGTSLSDKLSFSTHTLLGQFFQGWGTWVASWPLTILVLSVIPVVALAAGLVFTELTTDPVELWSAPNSQARSEKAFHDQH 400
gnomAD_SAV:         C # S H G # N  #DSR  N VN F  I   #  HSLSM   L         I#L A#F V  FSR  SMETMK RLD SNKVW DRVLRN  
Conservation:  2310010000011021121111121114151225126211840983157248126724432353354285114484758669986528576289477834
STMI:          MMMMM                                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                            
SS_PSIPRED:    HHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHH      HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHH                     HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H   HHHHHE    HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHEEEE                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH   EEEE             HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                DDDDDDDDD D                                                                           
DO_SPOTD:              DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                         
DO_IUPRED2A:                    D                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FGPFFRTNQVILTAPNRSSYRYDSLLLGPKNFSGILDLDLLLELLELQERLRHLQVWSPEAQRNISLQDICYAPLNPDNTSLYDCCINSLLQYFQNNRTL 500
gnomAD_SAV:     D  LQ SE   MSAS# T G  PV      #I* P              PW R  #LLK RSKT    #  VLF LE    *GYY        R# H#F
Conservation:  8359588594756521223109395469238865663234624581993353132474212352648285978885812432399467953989976232
SS_PSIPRED:            EEEEE                        HHHHHHHHHHHHHHH            EEHHHH               EE  HHHHH   HHH
SS_SPIDER3:       H  EEEEEEE        EE EE           HHHHHHHHHHHHHHH  E         E HHH EE             EEE HHHHH   H H
SS_PSSPRED:            EEEEE                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHH                   HHHHH    HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                                                                            C             C               
CARBOHYD:                     N              N                                N              N                 N   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLLTANQTLMGQTSQVDWKDHFLYCANAPLTFKDGTALALSCMADYGAPVFPFLAIGGYKGKDYSEAEALIMTFSLNNYPAGDPRLAQAKLWEEAFLEEM 600
BenignSAV:              I                                                                                          
gnomAD_SAV:      #  SR  I    * N    S  R S L IL H  D   RF#  FRT    S #TA *TR GC *  T  VK C Y  L RE H     P*    V K#
Conservation:  6233616311423326696984467356744435362726794534755665555488513135426485547476666232424331632981286335
SS_PSIPRED:    HHH              HHHHHHHH           HH              HH         HHH EEEEEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH              HHHHH H              H   E     EE  EEEEE E    HHH  EEEEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HH H             HHHHHHHH                             E        HHHHHHHHHHEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                              C                C                                                          
CARBOHYD:           N                                                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RAFQRRMAGMFQVTFMAERSLEDEINRTTAEDLPIFATSYIVIFLYISLALGSYSSWSRVMVDSKATLGLGGVAVVLGAVMAAMGFFSYLGIRSSLVILQ 700
gnomAD_SAV:    QV *HWI AIL* M VD LC   *T HI TK P      CT  VP NAVG  G     * T    VK   SR SM       D #   S SMH F IV  
Conservation:  3365112212425454676788786765423645453366345537555666253232332754834666975369347636669555454444666646
STMI:                                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         MMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHH   EEEEEEEEE HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH H   EEEEEEEEE  HHHHHH   H  HHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH  EEEEEEEE   HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                               N                                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VVPFLVLSVGADNIFIFVLEYQRLPRRPGEPREVHIGRALGRVAPSMLLCSLSEAICFFLGALTPMPAVRTFALTSGLAVILDFLLQMSAFVALLSLDSK 800
gnomAD_SAV:       L    MESE   VLF G  SM Q S  LQQ  T *GV SAV  I     F   S    V   V T Q  V  CR     VI  KLTV LD    H  
Conservation:  7696656567677596778659521512341442348645515465434573664486458466157854458634545523453644525465354524
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMM                         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM   
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH     HHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH   EEEEEEEE          HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHEEE   EEEHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RQEASRLDVCCCVKPQELPPPGQGEGLLLGFFQKAYAPFLLHWITRGVVLLLFLALFGVSLYSMCHISVGLDQELALPKDSYLLDYFLFLNRYFEVGAPV 900
gnomAD_SAV:    K *#CQ  I      R   LLD R    FD    SFSH PM R A# AM     T LR     T  VI   #E      NL    C H # HC KMAVL 
Conservation:  5632231423342211101201112434222232142525331125225433622343244534224145644445393599651571342264339485
STMI:                                                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                 
SS_PSIPRED:    HHHH    EEEE            HHHHHHHHHH HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHH      HHHHHHHHHHHHHH    E
SS_SPIDER3:    HHH     EEEEE           HHHHHHHHHH HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HH      HHHHHHHHHHHH  H  EE
SS_PSSPRED:    HHHH                    HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHH      HHHHHHHHHHHHHHH  EE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YFVTTLGYNFSSEAGMNAICSSAGCNNFSFTQKIQYATEFPEQSYLAIPASSWVDDFIDWLTPSSCCRLYISGPNKDKFCPSTVNSLNCLKNCMSITMGS 1000
BenignSAV:                                                                              S                          
gnomAD_SAV:    N  N    I #RKV           SI F     *      G  H T    A  G      SLFFYYH CM SSS     SL D    *  D V SMID 
Conservation:  6655529657421174545877488323843545639524522554555445765644586354289553116321528655422211911293100131
SS_PSIPRED:    EEEEE       HHHHHHHHHH       HHHHHHHHH            HHHHHHHHHHH       EE                              
SS_SPIDER3:    EEEEE       HHHHHHHH         HHHHHHHHH      EE      HHHHHHHH        EEE                      E      
SS_PSSPRED:    EEEEE       HHHHHHHHH       HHHHHHHHHH            HHHHHHHHHH       EE                               
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                         C    C                                        C             C        C           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VRPSVEQFHKYLPWFLNDRPNIKCPKGGLAAYSTSVNLTSDGQVLDTVAILSPRLEYSGTISAHCNLYLLDSTSRFMAYHKPLKNSQDYTEALRAARELA 1100
BenignSAV:                                                                                                  Q      
gnomAD_SAV:    M SL  K P    R   NW  SR    S ST#NI   WI  D  S  I M LT    C I       *        L            #   WG *   
Conservation:  2684233722586168151834265576666533681130162622222222222222222222222222227664654433623733573572235265
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHH                  EEE     EE                             EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHH                   EEE     EE  H  E                   EEEEEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHH                  EEE     EEE                               EE      HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                       D DDDD                                         
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                             C                                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ANITADLRKVPGTDPAFEVFPYTITNVFYEQYLTILPEGLFMLSLCLVPTFAVSCLLLGLDLRSGLLNLLSIVMILVDTVGFMALWGISYNAVSLINLVS 1200
BenignSAV:                  H                H                                                                     
gnomAD_SAV:     S A   Q M A YL S I  CRV S    H     S   L PNF P    T  G    RH H S  S F VIL  LVA S I   S      P     L
Conservation:  1278116525377242627646555487666853540393323338537774854487755335624553463674357383733434458656766794
STMI:                                                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM  MMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH         EEEEEE HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH          EEEE  HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH        EEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AVGMSVEFVSHITRSFAISTKPTWLERAKEATISMGSAVFAGVAMTNLPGILVLGLAKAQLIQIFFFRLNLLITLLGLLHGLVFLPVILSYVGPDVNPAL 1300
BenignSAV:                                     N                                                                   
gnomAD_SAV:    V  V M L     HCC   P            N   GV  T   V S   F I   SNV    LL  H  V  S       F  P I    A  NISLP 
Conservation:  6795888866627348524222344465266641689596679876758554583583677765865665645833846877558663985377233121
STMI:          MMMMMMMMMMMM                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH HHHH HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH     HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                                                                                    DD
DO_SPOTD:                                                                                                        DD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        6
AA:            ALEQKRAEEAVAAVMVASCPNHPSRVSTADNIYVNHSFEGSIKGAGAISNFLPNNGRQF 1359
BenignSAV:            K                                                   
gnomAD_SAV:      DK Q KKVLV  TM   S Y F*  A ED  G   L # L   C  N   ##  Q  
Conservation:  21101011110200011110114122222221113012210111101000002011102
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH                                           
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH                 EE                         
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH                                            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDBBB
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: