Q9UJ41  RABX5_HUMAN

Gene name: RABGEF1   Description: Rab5 GDP/GTP exchange factor

Length: 491    GTS: 1.113e-06   GTS percentile: 0.274     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 212      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSLKSERRGIHVDQSDLLCKKGCGYYGNPAWQGFCSKCWREEYHKARQKQIQEDWELAERLQREEEEAFASSQSSQGAQSLTFSKFEEKKTNEKTRKVTT 100
gnomAD_SAV:    K     H*      L           S  G                     R     V *  Q  QK      T HR  PV  F   G   SKTAC II 
Conservation:  9210132434354434448544877899238375895656421411211222033323445112425444422112212111425354432132232224
SS_PSIPRED:                 HHHHH          HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                         EEHH
SS_SPIDER3:                 HHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               H             EE
SS_PSSPRED:       HHH       HHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHH   HHH  HHH
DO_DISOPRED3:  BBBBBBBBB                                                          BBBBBBBBBBBB    DD               
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDD                                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:        D                                                  DD       DDDDDDD          D  D              
ZN_FING:                   DQSDLLCKKGCGYYGNPAWQGFCSKCWREEYHKAR                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VKKFFSASSRVGSKKEIQEAKAPSPSINRQTSIETDRVSKEFIEFLKTFHKTGQEIYKQTKLFLEGMHYKRDLSIEEQSECAQDFYHNVAERMQTRGKVP 200
gnomAD_SAV:         IT P      AMR  EV   FR # #GV MHG         RP R   # #C R  V S E R   VV       R *       # LE HW AS
Conservation:  5456622423222254112111323201211112132123471378613351422434352173114013222133324514645542332232113423
SS_PSIPRED:    HHHHHH       HHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:    EEEEE        HHHHHH                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHH       HHHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:              BBBBB BBDDBBBBBB                                                                        
DO_SPOTD:      DDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                  
DO_IUPRED2A:                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                          DD  DDDDD
MODRES_P:                             S       S                                                                    
MODRES_A:                                                        K                  K                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PERVEKIMDQIEKYIMTRLYKYVFCPETTDDEKKDLAIQKRIRALRWVTPQMLCVPVNEDIPEVSDMVVKAITDIIEMDSKRVPRDKLACITKCSKHIFN 300
BenignSAV:                                                                                                        S
gnomAD_SAV:    S #IG V   T  CN  HF  C                  T  # H  M  L   LIDKYM D  GT   V  AT     R   *   TG P     V T
Conservation:  3223102473585446455520477442346825882462567473764225623622211211241241747545448443484587265436732552
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHH    HHEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH      EEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDD                                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AIKITKNEPASADDFLPTLIYIVLKGNPPRLQSNIQYITRFCNPSRLMTGEDGYYFTNLCCAVAFIEKLDAQSLNLSQEDFDRYMSGQTSPRKQEAESWS 400
gnomAD_SAV:      R      S   V   NV       S  C   S    MC   R       G             V    T      *    HC#  E FSG      CF
Conservation:  3621431455379567638785465657647379459549753834654982694776846635896576427946424562126243123001010111
SS_PSIPRED:    HHH        HHHHH HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH  HHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH       HHHHHH  
SS_SPIDER3:    HH           H   EEEEEEE       H  HHHHHHH  HHHEEE     EHHHHHHHHHHHHH   H     HHHHHHHH      HHH H    
SS_PSSPRED:    HHHH        HHHHHHHHHEHH     HHHHHHHHHHHH             EEHHHHHHHHHHHHH H      HHHHHHHH      HHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                       DDDDDDDDDDDDDDD 
MODRES_P:                                                                              S   S            S         S

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90 
AA:            PDACLGVKQMYKNLDLLSQLNERQERIMNEAKKLEKDLIDWTDGIAREVQDIVEKYPLEIKPPNQPLAAIDSENVENDKLPPPLQPQVYAG 491
gnomAD_SAV:    S GYS I HTC K VRF    KQ  S VS## E G G T   E T#G   N#IQRCSP N  L EL PPV    I  N    LP    HS 
Conservation:  1102111112103312511400445161123206214701812241035223212222120000110123314202121242222233222
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                    
SS_SPIDER3:    H HHH HHHHHH  HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH    H HHHHHHHHHHHH            EEE                     
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                    
DO_DISOPRED3:                                                                                BBD DD D    B
DO_SPOTD:                                                                               DDDDDDD   DDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                             DD                           DD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD