Q9UL62  TRPC5_HUMAN

Gene name: TRPC5   Description: Short transient receptor potential channel 5

Length: 973    GTS: 5.648e-07   GTS percentile: 0.062     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 198      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAQLYYKKVNYSPYRDRIPLQIVRAETELSAEEKAFLNAVEKGDYATVKQALQEAEIYYNVNINCMDPLGRSALLIAIENENLEIMELLLNHSVYVGDAL 100
gnomAD_SAV:          Q  S LLH  C       G     ED          R         K   M   F    L    W               K     R#      
Conservation:  7233453421231123442534464627891284348155447753565236357448644766737768645756564554553455741336335555
SS_PSIPRED:                       HHH        HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH         EEE     HHHHHHHH   HHHHHHHHH    HHHHH
SS_SPIDER3:                       HHH        HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH        E        EHHHHHHH   HHHHHHHH     HHHHH
SS_PSSPRED:      HHH                         HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH      EEE       HHHHHHHH  HHHHHHHHHH   HHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDD                                                                                     
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LYAIRKEVVGAVELLLSYRRPSGEKQVPTLMMDTQFSEFTPDITPIMLAAHTNNYEIIKLLVQKRVTIPRPHQIRCNCVECVSSSEVDSLRHSRSRLNIY 200
gnomAD_SAV:     H       D#        W  RQ # S# I #M  C        #     I   K       RW I  Q           #        #  #   S  
Conservation:  4444544664455846346444333367325543669577799997697756767756756644495494772669493693644769499397777969
SS_PSIPRED:    HHHHH   HHHHHHHHH            EEE            HHHHHHHH  HHHHHHHHH                         HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH   HHHHHHHH             EE             HHHHHHH   HHHHHHHHH                          HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH  HHHHHHHHHHHH                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                         HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KALASPSLIALSSEDPILTAFRLGWELKELSKVENEFKAEYEELSQQCKLFAKDLLDQARSSRELEIILNHRDDHSEELDPQKYHDLAKLKVAIKYHQKE 300
gnomAD_SAV:                         H          M                          Q  K    T     N#        CR   R           
Conservation:  6777677957699999777794979963999359697537989792486297757787798959953798647412352422114697697798882897
SS_PSIPRED:    HHH  HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH           HHH   HHHHHHHHHH HHH
SS_SPIDER3:    HHH  HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH                 HHHHHHHHH   HH
SS_PSSPRED:    HHHH HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FVAQPNCQQLLATLWYDGFPGWRRKHWVVKLLTCMTIGFLFPMLSIAYLISPRSNLGLFIKKPFIKFICHTASYLTFLFMLLLASQHIVRTDLHVQGPPP 400
gnomAD_SAV:                           W   I  F N  ST                 KF      R                  F                  
Conservation:  7666677766754457456879974563354356435653572552265338341351564586456568856766974467577554101210034726
STMI:                                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                               MM
SS_PSIPRED:    HH  HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               
SS_SPIDER3:    H   HHHHHHHHHHHH     HHHH HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     E          
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TVVEWMILPWVLGFIWGEIKEMWDGGFTEYIHDWWNLMDFAMNSLYLATISLKIVAYVKYNGSRPREEWEMWHPTLIAEALFAISNILSSLRLISLFTAN 500
gnomAD_SAV:    A      S   P   L  V    HD   K    R              IV        EC     #             S  TT     L          
Conservation:  4276848699667569377766945973394699995779577696756769746642431201072193357958466536566666755756577769
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMMM                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         H   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                  N                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYFYYETRAIDEPNNCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSVFGLLNLYVTNVKARHEFTEFV 600
gnomAD_SAV:               C          T       V         C    D     D      Q       M                      ME   K     
Conservation:  6799997799967667799967675797467667657675462215123000559777117766775565656696766969538457461427287475
STMI:                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                   
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                          HHHHHHHHHHHHH     EE       HHHHHH
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                          HHHHHHHHH  H      EE       HHHHHH
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHH HHHHHHHHHHHH       EEEE     HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFDEGGTLPPPFNIIPSPKSFLYLGNWFNNTFCPKRDPDGRRRRRNLRSFT 700
gnomAD_SAV:       V    S             T                                   L         T  H    L    G E    C W  H VT   
Conservation:  7569996765779776777766665666646557775779999999979797997967598946697853386108321134120022220221343254
STMI:             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                            
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEHHHHHHHHHHHHH        EE    HHHHHHHHHHHHHHH                   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HEHHHHHHHHHHHHH         EE    HHHHHHHHHHHHHH                  H 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          EE   HHHHHHHHHHHHH                   HH
DO_DISOPRED3:                                                                                      DDDBBBDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                          DDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                         DD   DDDDDD   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ERNADSLIQNQHYQEVIRNLVKRYVAAMIRNSKTHEGLTEENFKELKQDISSFRYEVLDLLGNRKHPRSFSTSSTELSQRDDNNDGSGGARAKSKSVSFN 800
BenignSAV:      H                                                                                                  
gnomAD_SAV:     H                                   I             I          K  QA    AC  DQCEG     D  R ##  R     
Conservation:  1646334324237758456758757763663384335668686977779979867775565532112010112121111132001110010201110121
SS_PSIPRED:    HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HH                       
SS_SPIDER3:    HH   HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                      
SS_PSSPRED:    HHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                      
DO_DISOPRED3:  DDDDD                       DD   DDDDDD                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                        DDDDD                       D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LGCKKKTCHGPPLIRTMPRSSGAQGKSKAESSSKRSFMGPSLKKLGLLFSKFNGHMSEPSSEPMYTISDGIVQQHCMWQDIRYSQMEKGKAEACSQSEIN 900
gnomAD_SAV:        E   #      II   R       VV   NCP VD       F                V       AH  YI      F T     KT      K
Conservation:  1222222222324120131110001101011212222223222123133230211010022003234133211110111001000011012210100101
SS_PSIPRED:                                           HHHHHH   HHHH            EE       HHHHH     HHHHH    HHHH    
SS_SPIDER3:                                           HHHHH   HHHH             E          H         HH             
SS_PSSPRED:                                           HHHHHH  HHHHH             E       HHH  HHHH       HHHHH      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                       DD DDD                                   

                       10        20        30        40        50        60        70   
AA:            LSEVELGEVQGAAQSSECPLACSSSLHCASSICSSNSKLLDSSEDVFETWGEACDLLMHKWGDGQEEQVTTRL 973
gnomAD_SAV:      D    K E T E       RF P  WT       FE   #  EAS      SG  L           A # 
Conservation:  1101100000000000002222211211111011110210111121102222222221201011245232321
SS_PSIPRED:                                 HH             HHH    HH               EE   
SS_SPIDER3:            H                                 HH HHH    HHHHHHHH       HEE   
SS_PSSPRED:                                                                        EEE  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDD               
DO_IUPRED2A:       DDD                                                            DDDDDD
REGION:                                                                              TRL