Q9ULQ1  TPC1_HUMAN

Gene name: TPCN1   Description: Two pore calcium channel protein 1

Length: 816    GTS: 1.817e-06   GTS percentile: 0.585     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 364      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAVSLDDDVPLILTLDEGGSAPLAPSNGLGQEELPSKNGGSYAIHDSQAPSLSSGGESSPSSPAHNWEMNYQEAAIYLQEGENNDKFFTHPKDAKALAAY 100
gnomAD_SAV:    V M    NMR  RS  K  G     CKS      HT   S       HS R  F    Y# GS  S  I  L     VR  K  N   S LE   V V  
Conservation:  8100011102211223211200025111020001311363221102301212211010110111138564666545566573567672667343257479
SS_PSIPRED:                                                                          HHHHHHHHHHHH           HHHHHHH
SS_SPIDER3:              E                                                     H     HHHHHHHHHH             HHHHHHH
SS_PSSPRED:                                                                   HHH   HHHHHHHHHH              HHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                  
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                  
DO_IUPRED2A:                  D     DDDDDDDDDDDDDDDDD DD   D DD DDDDDDDDDDD  DDD                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LFAHNHLFYLMELATALLLLLLSLCEAPAVPALRLGIYVHATLELFALMVVVFELCMKLRWLGLHTFIRHKRTMVKTSVLVVQFVEAIVVLVRQMSHVRV 200
gnomAD_SAV:    VLV SYF   K   MS V      *K#  I TVQ  TF  TI      LM  S  #   L   FQA  WQRQA#F  L  AL VL  #A#  Q #    M
Conservation:  6979693996699257679739777979997275956769769996793374797577579694357679799779639935975975997799799497
STMI:                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM  
SS_PSIPRED:    HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH
SS_SPIDER3:    HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TRALRCIFLVDCRYCGGVRRNLRQIFQSLPPFMDILLLLLFFMIIFAILGFYLFSPNPSDPYFSTLENSIVSLFVLLTTANFPDVMMPSYSRNPWSCVFF 300
gnomAD_SAV:     *  C            I CT         S VN F    L T     F  CF F#  P #  N      I   A              F W     IV 
Conservation:  9999979999997979777947554546667646773675565367336965667251475693759694766976677799999999797674979699
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII        MMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH      HH       HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH H    HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH      EE       HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHH                 HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IVYLSIELYFIMNLLLAVVFDTFNDIEKRKFKSLLLHKRTAIQHAYRLLISQRRPAGISYRQFEGLMRFYKPRMSARERYLTFKALNQNNTPLLSLKDFY 400
gnomAD_SAV:    #    V     VS          S #  C  R   #Y     R D C   I G   S     L   IHLC  G   S CH  S SV## SR#     HLH
Conservation:  9799979799697967966979975697397667696754754645296242735185355566976658395633363674755953423226643654
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMM                                                                                     
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH        HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHH      HHHHHHHHHHH         HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH       HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DIYEVAALKWKAKKNREHWFDELPRTALLIFKGINILVKSKAFQYFMYLVVAVNGVWILVETFMLKGGNFFSKHVPWSYLVFLTIYGVELFLKVAGLGPV 500
gnomAD_SAV:    NTH L    G  R   AL  N    MVF V E #  I  T   *  # F   AY     M  Y    EDS F YM     I  ITNAG  LV IVS    
Conservation:  2664332545656345559866894845587876556659328782662766486485854842312322133097675548856674866894496992
STMI:                                                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH    HHH    HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDD DD                                                                                
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EYLSSGWNLFDFSVTVFAFLGLLALALNMEPFYFIVVLRPLQLLRLFKLKERYRNVLDTMFELLPRMASLGLTLLIFYYSFAIVGMEFFCGIVFPNCCNT 600
gnomAD_SAV:      # YR H    T  A T     E  V V   C  M  S V          HHH M  #I    LQ  R          Y T M    L A I      M
Conservation:  3966889856864993587597564474569997767995699994874839654666545675986568668856677566756567624153366742
STMI:             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMM                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      
SS_PSIPRED:    HH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EE       
SS_SPIDER3:    HH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    E       
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EE       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                                                        N 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            STVADAYRWRNHTVGNRTVVEEGYYYLNNFDNILNSFVTLFELTVVNNWYIIMEGVTSQTSHWSRLYFMTFYIVTMVVMTIIVAFILEAFVFRMNYSRKN 700
gnomAD_SAV:    G    T C H P MS G M        S S    S    P    A          IA  I Q  C   #   T      M TIT      I Q   R E 
Conservation:  9598468631828175291344898898996559489688888688868865866554355695665985668686986889886997686865763956
STMI:                                       IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         
SS_PSIPRED:      HHHHH           HHH   HHH     HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHH         EE   EEE      HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:       HHHH            E           HHHHHHHHHHHHHEE  HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                     DDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                N    N                                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QDSEVDGGITLEKEISKEELVAVLELYREARGASSDVTRLLETLSQMERYQQHSMVFLGRRSRTKSDLSLKMYQEEIQEWYEEHAREQEQQRQLSSSAAP 800
BenignSAV:                                   W                                                                     
gnomAD_SAV:      L        K   F D  IVI K  W VQWVPL  A   #NFF*I G     V    Q L I C     LH   T Q#      K GH *   N    
Conservation:  5454372964452533527211233325101221222227223232534144023474999879869983799699845542543211011011100001
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH   EE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:            H H HH  HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHH     EHHHH HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH   EEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:      DDDDDD               D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:          DD                                                                         DDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10      
AA:            AAQQPPGSRQRSQTVT 816
gnomAD_SAV:    TTL    RHLCF  F 
Conservation:  0101210142222443
SS_PSIPRED:                    
SS_SPIDER3:                  E 
SS_PSSPRED:                    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDD