Q9UPQ0  LIMC1_HUMAN

Gene name: LIMCH1   Description: LIM and calponin homology domains-containing protein 1

Length: 1083    GTS: 1.234e-06   GTS percentile: 0.325     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 575      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MACPALGLEALQPLQPEPPPEPAFSEAQKWIEQVTGRSFGDKDFRTGLENGILLCELLNAIKPGLVKKINRLPTPIAGLDNIILFLRGCKELGLKESQLF 100
gnomAD_SAV:      RL F            S  S S  #H    RL  K# D QN WKR GS V   K  KTV     E  ST           V  F V E  S  D    
Conservation:  6111111111111111111111111111132134544243233542263433443355323355553534464444434884336545654455545655
SS_PSIPRED:           HHHH          HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHH HHHHHHHHHH      EE          HHHHHHHHHHHH    HHH  
SS_SPIDER3:             H           HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH                     HHHHHHHHHH    HHHHE
SS_PSSPRED:           HHHHH         HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHH   HHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                    
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                 
DO_IUPRED2A:             DDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DPSDLQDTSNRVTVKSLDYSRKLKNVLVTIYWLGKAANSCTSYSGTTLNLKEFEGLLAQMRKDTDDIESPKRSIRDSGYIDCWDSERSDSLSPPRHGRDD 200
gnomAD_SAV:     L  # GA   I I G N T        N   PE    N #   RM P   # VR  P TQ  I NVGN #PG #    V  R  KH N    A# SG N
Conservation:  5434443331322241152355466664454866545524325384385657855644243242520245133486775663655856469865483866
SS_PSIPRED:                EE   HH HHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHH                                        
SS_SPIDER3:                  H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHH                                       
SS_PSSPRED:                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHH                                        
DO_DISOPRED3:                                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                               DDDDD   DDD DDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                               DDDDDDDDDDD              DDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                          S       S              S        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SFDSLDSFGSRSRQTPSPDVVLRGSSDGRGSDSESDLPHRKLPDVKKDDMSARRTSHGEPKSAVPFNQYLPNKSNQTAYVPAPLRKKKAEREEYRKSWST 300
gnomAD_SAV:      N      PLCG        F  GRN#   N   N  YQ    M  V    #W  #  L L LR H   L   # MT*I TL  TR TKIG  C  CTS
Conservation:  8667888568664365585431443455333436241213525842688633663413435223566455655343425442335321142412423113
SS_PSIPRED:                                                       HH             HH                HHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:                                                     HHHH                                  HHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:                                                                                        HHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:      S  S  S       T S        S    S S                                                               S   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ATSPLGGERPFRYGPRTPVSDDAESTSMFDMRCEEEAAVQPHSRARQEQLQLINNQLREEDDKWQDDLARWKSRRRSVSQDLIKKEEERKKMEKLLAGED 400
gnomAD_SAV:    T  AQA Q  LGHSS  LM   TK   V ET   K TTL   G  H  K  P #KR W   #    GMTH  NH     #  M     KE I R  V G 
Conservation:  2326422244322322223335136355185222552112434326242330333123764327335843643577647577766758753464242121
SS_PSIPRED:                                    HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH   HHHH HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:                                    HHHHHH  H HHHHHHHHHH  HH HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:                                    HHHHHH    HHHHHHHHHHHHH     H HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    D                 DDDD   DDDDDDDDDDDD
MODRES_P:        S         Y                                                               S                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GTSERRKSIKTYREIVQEKERRERELHEAYKNARSQEEAEGILQQYIERFTISEAVLERLEMPKILERSHSTEPNLSSFLNDPNPMKYLRQQSLPPPKFT 500
gnomAD_SAV:    R R LT NV P  *      WTD G RAVCR SWT   V       T K  V  S  KH  TLEV    R    D  C Q   SR#   W H      LA
Conservation:  1031677668776776466958825942373273544882169437355646544444263473241230114311220201513221223132424222
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH                         HHHHH           
SS_SPIDER3:       HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH       HHHHH                           HH             
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH                                         
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:       T                                                                    ST                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ATVETTIARASVLDTSMSAGSGSPSKTVTPKAVPMLTPKPYSQPKNSQDVLKTFKVDGKVSVNGETVHREEEKERECPTVAPAHSLTKSQMFEGVARVHG 600
gnomAD_SAV:    GAI  I TCTG         # # CEIIIS T LI  #NS F   TFR G      GET NL   M RGKG   TD  MM S Y F  C   KS VK  R
Conservation:  3222222011200011010111332211223444342644413320121105225054232354310010022101111102022511101121111111
SS_PSIPRED:                                                               EEE                                      
SS_SPIDER3:                                                           E   E          HHHH                          
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                     S S    S     T       T                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SPLELKQDNGSIEINIKKPNSVPQELAATTEKTEPNSQEDKNDGGKSRKGNIELASSEPQHFTTTVTRCSPTVAFVEFPSSPQLKNDVSEEKDQKKPENE 700
gnomAD_SAV:        PI  SS MK SV   D#AR   S IA  M    EG   VDERP RE T  PL  L     P  Q RLIM  MKL P SP  SE LG NEHNI# SK
Conservation:  1101021100010001002010121010112101100010202121110111100221000011210101213101201211001111221111201100
SS_PSIPRED:                           HHHH                                     EE EE   EEEEE    HHH              HH
SS_SPIDER3:                           HHHH                                             E EE                     H  
SS_PSSPRED:                           HHH                                               EEE                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     D   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:      S                                                                    S          S                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSGKVELVLSQKVVKPKSPEPEATLTFPFLDKMPEANQLHLPNLNSQVDSPSSEKSPVMTPQFKFWAWDPEEERRRQEKWQQEQERLLQERYQKEQDKLK 800
BenignSAV:                                                               T                                         
gnomAD_SAV:    TN R G M          S RG M  LL   QK   S R         VYTNRD    T S   L  R  #  C Q   *   R #F RK  *E   R  
Conservation:  0111210111110001121001011111121101300210212101133112141012123132133555232323213242335534366642642565
SS_PSIPRED:        EEEE                     HH    HH                                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:          E                                                              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                      HHH                                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDD    D    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDD
MODRES_P:                       S     T                         S     S                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EEWEKAQKEVEEEERRYYEEERKIIEDTVVPFTVSSSSADQLSTSSSMTEGSGTMNKIDLGNCQDEKQDRRWKKSFQGDDSDLLLKTRESDRLEEKGSLT 900
gnomAD_SAV:      C     D  G #LK CG# C  TGGI  AL  PP  T#R AS PPV    R  S L R KYHE N   KG     R   VF PN  A  QP       
Conservation:  3465465386355646428583462233234323323425323112011011110111202111121211121222221111000211212211213101
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                              HHHH  HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                         HHHHHHH           HHHH H HHHH      
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                         HHHHHHHH          HHH      H H      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDD  DDDDDDDDDD D       DDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                S                        T

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EGALAHSGNPVSKGVHEDHQLDTEAGAPHCGTNPQLAQDPSQNQQTSNPTHSSEDVKPKTLPLDKSINHQIESPSERRKKSPREHFQAGPFSPCSPTPPG 1000
gnomAD_SAV:     E   Y  S #  R Q YN  G KV V RYEK S I       PR    MQTL E    I #V E  #   #    MW  N * P      FRR   HHV
Conservation:  1100101110111201111211120112012013422141200131111210132011222123221221112300145132041201111421431122
SS_PSIPRED:      HH           HHHHH                                                                                
SS_SPIDER3:       H                                                                              HHH               
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                       S      S                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80   
AA:            QSPNRSISGKKLCSSCGLPLGKGAAMIIETLNLYFHIQCFRCGICKGQLGDAVSGTDVRIRNGLLNCNDCYMRSRSAGQPTTL 1083
gnomAD_SAV:    PL  WYV ATE           VTTTF   F  C       S       VN    M I# Q  P    N  ##    W  AA 
Conservation:  24444443456596463246768547365683736532562353724577563376686444535441254324322334212
SS_PSIPRED:                           HHHHHH              EE           EEEEE  EE  HH              
SS_SPIDER3:                E          HHHHHHH       E EEEEEEE EE       EEEEE  EE  HHHHHH          
SS_PSSPRED:                            HHHHHHHH                        EEEEE                      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                           DDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDD                                                                    DDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDD                                                                         DDD