Q9Y210  TRPC6_HUMAN

Gene name: TRPC6   Description: Short transient receptor potential channel 6

Length: 931    GTS: 1.436e-06   GTS percentile: 0.419     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 17      BenignSAV: 8      gnomAD_SAV: 364      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSQSPAFGPRRGSSPRGAAGAAARRNESQDYLLMDSELGEDGCPQAPLPCYGYYPCFRGSDNRLAHRRQTVLREKGRRLANRGPAYMFSDRSTSLSIEEE 100
PathogenicSAV:                                                                                         I           
BenignSAV:                   S                                          W                                          
gnomAD_SAV:    LTR     SW   #S D #  GTP YQ#     K  Q EV C  RVA S  D *  LW CHS  DQWW A  H R  K# SQ    V  NCFA P #V  
Conservation:  3333333333333333333333333333333333333333333333333333333300000100101212312122352424444445222213551276
SS_PSIPRED:                                       HHH                          HHHHHHHHHHH HHHHH    EE         HHHH
SS_SPIDER3:                                     E H                           HHHHHHHHHHH           EE         HHHH
SS_PSSPRED:                          HHH                                      HHHHHHHHH    HHHHH               HHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                          
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D      D  D                               DDD D  DD                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RFLDAAEYGNIPVVRKMLEECHSLNVNCVDYMGQNALQLAVANEHLEITELLLKKENLSRVGDALLLAISKGYVRIVEAILSHPAFAEGKRLATSPSQSE 200
PathogenicSAV:         S  Q                              S R                           C Q                         
BenignSAV:                                                             T                                           
gnomAD_SAV:    HS        L   QET    Y  #F S   I  DV    L S  V    F V    F *  Y  I   R   I  M  NVNRT    VES       CD
Conservation:  3885877788583756664521255694775576759989845886763548914224465997988896995458694684834612316640552424
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH  HHHHHHHHHH            HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH   HHHHHHHH  HHHH             
SS_SPIDER3:    HHHHHHH   HHHHHHHHHH               HHHHHHH   HHHHHHHH       HHHHHHHHHH   HHHHHHHH  HHH              
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH  HHHHHHHHHH       EE     HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH HHHH             
DO_DISOPRED3:                                                                                                   D  
DO_SPOTD:                                                                                                D DDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                               DD      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LQQDDFYAYDEDGTRFSHDVTPIILAAHCQEYEIVHTLLRKGARIERPHDYFCKCNDCNQKQKHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVMTALEL 300
PathogenicSAV:               G  L                                                   T                              
gnomAD_SAV:     #H N   #E V  W  L    V V T   Q * L    QN #K  Q  YC Y  S       R     C  #   S SV  L   * CNK    A    
Conservation:  2245577659558659826789559867834786653982585383499555919119123521858598568656856989658868545685436835
SS_PSIPRED:                        HHHHHHHH   HHHHHHHHH                              HHHHHHHHHH  HHHHHH    HHHHHHHH
SS_SPIDER3:           EE     E      HHHHHHH   HHHHHHHHH               HHH       HHH  HHHHHHHHH H HHHHHH    HHHHHHHH
SS_PSSPRED:                         HHHHHHHH  HHHHHHHHHH              HHHHH         HHHHHHHHHH   HHHHHH    HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:      D                                                                                               
DO_SPOTD:      DD                                                                                                  
DO_IUPRED2A:      DD                                                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SNELAVLANIEKEFKNDYKKLSMQCKDFVVGLLDLCRNTEEVEAILNGDVETLQSGDHGRPNLSRLKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLSIWYENLSGLRQ 400
gnomAD_SAV:                   SE Q  LVRG N   VP     S     D       MF R   SH   RC    V  KL N I      R      CGI P  Q 
Conservation:  8588526855858865692299399867598799698675994876694111000110152452655558886597568988888685458865653756
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH         
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH       HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HH
DO_DISOPRED3:                                                    DDD                                               
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QTMAVKFLVVLAVAIGLPFLALIYWFAPCSKMGKIMRGPFMKFVAHAASFTIFLGLLVMNAADRFEGTKLLPNETSTDNAKQLFRMKTSCFSWMEMLIIS 500
BenignSAV:        V                                                                                                
gnomAD_SAV:     AIV   VA F I V         *S   G T  M CR#    A    A  VL               E    K # H     L  T           L 
Conservation:  6325463437446337584762144347355373363578468757436723764575365467729422354241122224549346616576847842
STMI:                                                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                            MMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHH        HHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHH       HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHH     HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                              N                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            WVIGMIWAECKEIWTQGPKEYLFELWNMLDFGMLAIFAASFIARFMAFWHASKAQSIIDANDTLKDLTKVTLGDNVKYYNLARIKWDPSDPQIISEGLYA 600
BenignSAV:                                                                                                  V      
gnomAD_SAV:         T   R  M    LR  F D C      KS V T    #            TV  T NS  E M AI   #   CS   L  EA     V      
Conservation:  7649668377646925644884355984998668559356735755633562089146513111034113382144196435722828696865886877
STMI:          MMMMMMMM             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                  MMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HH            HH HHHH     HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                     HHHHHHH     HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHH      HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                  N                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVIFIMVFVAFMIGMFNLYSYYIGAKQNEAFTTVEESFKTLFWAIFGLSEVKSVVINYNHKFI 700
gnomAD_SAV:      L         V L      S   L ET I           T   T    I     CCV         I         *     P     ITSC   CT
Conservation:  7779578576556888675679977779976777669776956776977496749694728451525545499999796769777777367554437797
STMI:          MMMMMMMMMMMMM                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                           
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH HH   HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH      HHHHHHHHHHHHH     HHEE     HHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH H        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHH  EEEEEEE E EEEE     HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH     EEEEE    HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ENIGYVLYGVYNVTMVIVLLNMLIAMINSSFQEIEDDADVEWKFARAKLWFSYFEEGRTLPVPFNLVPSPKSLFYLLLKLKKWISELFQGHKKGFQEDAE 800
PathogenicSAV:                                                         D    I                                      
BenignSAV:                                                                       M                              H  
gnomAD_SAV:     DV  FP     IM       #                      S SE    H KA   R#   SVML      H   NP I   D     R#C   H K
Conservation:  7957767776766657669866666756576799748799999888798955795363476576744857342212221371250012111100011426
STMI:                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                         
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                           D DDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                 DDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                     D 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MNKINEEKKLGILGSHEDLSKLSLDKKQVGHNKQPSIRSSEDFHLNSFNNPPRQYQKIMKRLIKRYVLQAQIDKESDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLE 900
PathogenicSAV:                                             R                                            N    # K   
gnomAD_SAV:      R S    I  *E Y   PN   E   IRYD  SR G PD    SILSK L      R   VR*  P   T     A K      N   T         
Conservation:  4333333333333333333333333333111010111312211101322114446635533657677454525443344566765466588768667876
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH     HHHHHH    HHH             HH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH     HHHH  H                  H          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH     HHH  HHH HHHHH                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                              D  DDDDDDDDDDDD  DDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      DDD                  DDDDDD 
DO_IUPRED2A:                          DDD   DDDDDDDD  DDDDDD                                DDDDDDDD            D  
MODRES_P:                    S                                                                                     

                       10        20        30 
AA:            EKSQNTEDLAELIRELGEKLSMEPNQEETNR 931
BenignSAV:                            S       
gnomAD_SAV:    KIFR   E  G T       P#KR   D S 
Conservation:  3332222242154226221100000311033
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
SS_SPIDER3:    HHHH HHHHHHHHHHHHHH            
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD