Q9Y223  GLCNE_HUMAN

Gene name: GNE   Description: Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase

Length: 722    GTS: 1.618e-06   GTS percentile: 0.500     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 50      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 261      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEKNGNNRKLRVCVATCNRADYSKLAPIMFGIKTEPEFFELDVVVLGSHLIDDYGNTYRMIEQDDFDINTRLHTIVRGEDEAAMVESVGLALVKLPDVLN 100
PathogenicSAV:  G        W S             #        L                                                                
gnomAD_SAV:     *     *  Q               S     *SKH  Y   I               *#T         K R      YA T           M   P 
Conservation:  2320001376579799799999999799969693374095736577777677676796979999496925699999999999796997999999999973
SS_PSIPRED:             EEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEEE HHH      HHHHHHH       EEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:              EEEEEE   HHHHH HHHHHHHH     EEEEEEEE H   HH   HHHHHHH      EEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:             EEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEEE          HHHHHHHH      EEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  BBBBBBDD                                                                                            
DO_SPOTD:      DDDDDDD                                                                                             
DO_IUPRED2A:   D                                                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RLKPDIMIVHGDRFDALALATSAALMNIRILHIEGGEVSGTIDDSIRHAITKLAHYHVCCTRSAEQHLISMCEDHDRILLAGCPSYDKLLSAKNKDYMSI 200
PathogenicSAV:                             Q  Q                S            C        V    VC                      F
gnomAD_SAV:    HPN HTI       N P           Q   T  E            D#   S H   RPGGV       SK  V#     S  CN F        TRF
Conservation:  9929654679999997977976999997976749977799999979997967979797799439737977999992599769999996992311465164
SS_PSIPRED:    HH   EEEEE  HHHHHHHHHHHHH   EEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHH EE   HHHHHHHHH    HHHEEEE   HHHHHH      HHHH
SS_SPIDER3:    HH   EEEEE  HHHHHHHHHHHHH    EEEE          HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH    H  EEEEE  HHHHHH      HHHH
SS_PSSPRED:    HH   EEEEE  HHHHHHHHHHHHHH   EEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH      EEE     HHHHHH     HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IRMWLGDDVKSKDYIVALQHPVTTDIKHSIKMFELTLDALISFNKRTLVLFPNIDAGSKEMVRVMRKKGIEHHPNFRAVKHVPFDQFIQLVAHAGCMIGN 300
PathogenicSAV:      S         A        N                    #                L  #          C                    T  
BenignSAV:            E                                                                                            
gnomAD_SAV:    V###VS A   E   A  * S  I     V TL     V LT   W   M   T T      *          T LH  * I     V*      STT  
Conservation:  5329664364114866797999977764947576779697369494997979979799967997797777945479674777996994756479755799
SS_PSIPRED:    HHHHH        EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE       HHHHHHHHHHHHHHH   EEEE    HHHHHHHHHH  EEEE 
SS_SPIDER3:    HHHHH        EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHH     EEEE       HHHHHHHHHHHHHH    EEEE    HHHHHHHHH   EEEE 
SS_PSSPRED:    HHHH         EEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHH    EEEE       HHHHHHHHHHHHHH    EEEEE   HHHHHHHHHHHH EEEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                   D                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSCGVREVGAFGTPVINLGTRQIGRETGENVLHVRDADTQDKILQALHLQFGKQYPCSKIYGDGNAVPRILKFLKSIDLQEPLQKKFCFPPVKENISQDI 400
PathogenicSAV:   V  Q                        A                              E               Y                      
gnomAD_SAV:    G  R #              H     I G    AQ   I*E      Y * # H #     EHR    S W #  CVN               K      
Conservation:  9999999799997975977777677977477777766643387567946796756455779979667567556633545057677396973665249677
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHH    EEE  HHH        EEE   HHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHH                        H
SS_SPIDER3:      HHHHHHHH    EEE             EEE   HHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHH        E EE             
SS_PSSPRED:        EEE       EEE             EE       HHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHH    HHH                 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                               DDDD                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DHILETLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTGGRVNPREGIVLHSTKLIQEWNSVDL 500
PathogenicSAV:                     A                                      V           T             P              
gnomAD_SAV:     NT AAV    IY  R  V*  T  L S     C *SI T CK T   V *V M   V T     K   LDV    H   Q    P      H #     
Conservation:  7567966575356689677967764349245664461994875495065535813621554048884886779799997635957967969739934777
SS_PSIPRED:    HHHHHH EEEEEEE   EEEEEEE    EEEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEEE          EEEE             
SS_SPIDER3:           EEEEEEE   EEEEEEE     EEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE      E    EEEE             
SS_PSSPRED:       H H  EEEEEE   EEEEEEE    EEEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEE           EEEE             
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                 AVDLGGTNLR                                                                                
BINDING:                                                                                   R           T           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLDGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREA 600
PathogenicSAV:        SY         S    V   C                            T              L   E          T            T
gnomAD_SAV:     NR   I R # *A         V   C   EEV     FT    VS   V  #A   R A    Q DY# L   E H  F  Y  T   T  TT   # 
Conservation:  7696934759779578667964777776969664657454576696779656446666664797797976396559959377439969656772577799
SS_PSIPRED:     HHHHHHH   EEEE HHHHHHHHHHHH        EEEEEE      EEEE  EEE            EEE               HHH  HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH   EEEEEHHHHHHHHHHHH        EEEEEE    EEEEEE  EEEE       EEEEEEE              EHEE  HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH    EEEE HHHHHHHHHHHH        EEEEEE      EEEE                 EEE              EEEE  HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                                                 GTGIGGGIIH                                                
BINDING:                       D                                                E  H                  E            
METAL:                                                                             H         C C    C              
ACT_SITE:                      D                                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KKLHDEDLLLVEGMSVPKDEAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSD 700
PathogenicSAV:                              T#                                           H                    M    
gnomAD_SAV:     NFR K PF     *M     G VH FM TV  S V  *      AR        M Q  S       EF  N H R G  I S K  F M #M L  L 
Conservation:  9475767393266544521717492895296429816912562674397947749779446945779997962263128533603665154414263263
SS_PSIPRED:    HHHHH     HH           HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHH        EEEE  
SS_SPIDER3:    HHHHH    HHH           HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE HHHHHHHHHHHHHHHHH HH    EEEEEE 
SS_PSSPRED:    HHHHHH   HHHHHH        HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20  
AA:            LVDPALLGAASMVLDYTTRRIY 722
PathogenicSAV:        S   T          
gnomAD_SAV:     #E T     NT    P C   
Conservation:  8158886888876888589853
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                     DDD
DO_SPOTD:                            
DO_IUPRED2A: