Q9Y239  NOD1_HUMAN

Gene name: NOD1   Description: Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1

Length: 953    GTS: 2.653e-06   GTS percentile: 0.842     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 6      gnomAD_SAV: 572      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEEQGHSEMEIIPSESHPHIQLLKSNRELLVTHIRNTQCLVDNLLKNDYFSAEDAEIVCACPTQPDKVRKILDLVQSKGEEVSEFFLYLLQQLADAYVDL 100
gnomAD_SAV:    V#D   N  KVN L #YHD   V   Q       LH  R A      V  LV* V   * W  *  N CI    L #  K LTQY FC  HE TH  MNF
Conservation:  8200000100101112023213631496287116364386557521246541983845142183336794487455389564656642554340656257
SS_PSIPRED:                     HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:                     HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH      HHHHHHHHHHHH H HHHHHHHHHHHHHH      H
SS_PSSPRED:                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                    
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDD                                                                                          
DO_IUPRED2A:   D DDDDDDDDDD                                                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RPWLLEIGFSPSLLTQSKVVVNTDPVSRYTQQLRHHLGRDSKFVLCYAQKEELLLEEIYMDTIMELVGFSNESLGSLNSLACLLDHTTGILNEQGETIFI 200
gnomAD_SAV:     L*    #   F FAL R MGS#NSL SC K R* R  HE RLLP #V  DK    K  VG  #AMID  S  QAG     Y     IS  S H    L 
Conservation:  3686135260641041041725485644723766244136538326945556238543933334844421452480311421673202654633696445
SS_PSIPRED:     HHHHH    HHHH         HHHHHHHHHHHHHH     EEEE      EEHHHHHHHHHHHH            HHHHHH            EEEE
SS_SPIDER3:    HHHHHHH    HHH          HHHHHHHHHHHH      EEEE     E  HHHEHH HHEEE EE          HHHHH           EEEEE
SS_PSSPRED:     HHHHHH                 HHHHHHHHHHHHH    EEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHH           EEEE
DO_DISOPRED3:      DDDDDDDDDDDDDDD                                                     D                           
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LGDAGVGKSMLLQRLQSLWATGRLDAGVKFFFHFRCRMFSCFKESDRLCLQDLLFKHYCYPERDPEEVFAFLLRFPHVALFTFDGLDELHSDLDLSRVPD 300
BenignSAV:                  Q                                                   K                                  
gnomAD_SAV:    V ET M  PVP EQ HN SPMRQ #EV  VL R HRGT  Y   T K     RR     H  W RK L    PC SNGVFVN ND   VQL     HMS 
Conservation:  1979959974687656449723240223386839598484174225144846979474849616337782654458335687899699631336312275
SS_PSIPRED:    E      HHHHHHHHHHHHH        EEEEEEEHHHHH         HHHHHHHH       HHHHHHHHHH   EEEEEE  HHHH           
SS_SPIDER3:    E      HHHHHHHHHHHHH        EEEEE  HHHH          HHHHHHHH       HHHHHHHHH    EEEEEE   HH EE         
SS_PSSPRED:    E      HHHHHHHHHHHHHH      EEEEEE  HH HH      HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH  EEEEEEEE                
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:        GDAGVGKS                                                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSCPWEPAHPLVLLANLLSGKLLKGASKLLTARTGIEVPRQFLRKKVLLRGFSPSHLRAYARRMFPERALQDRLLSQLEANPNLCSLCSVPLFCWIIFRC 400
BenignSAV:                                                                            N                            
gnomAD_SAV:    G  #     S    TD   W   R TG   I H    IL##C W  MPFQV CR Y HTCG  VLS*W  ENH   *  TSLSI NV    V R T  W 
Conservation:  2378121336536923893957937519577695733432346487718699612573183112743111412621584766373599459997884856
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHH         EEEE        HHH  EEEEE    HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH HHHHHHH    HHHHHHHH
SS_SPIDER3:             HHHHHHHHH         EEEE     E   HHE  EEEE    HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH HHHHHH   HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:             HHHHHHHHHH     HHHEEEE        HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FQHFRAAFEGSPQLPDCTMTLTDVFLLVTEVHLNRMQPSSLVQRNTRSPVETLHAGRDTLCSLGQVAHRGMEKSLFVFTQEEVQASGLQERDMQLGFLRA 500
BenignSAV:                                                   H                                                     
gnomAD_SAV:    L  LC  S D  #  GYM N AGA P  I I      L  V  W  #  M N QTSQ S  #  R   Q L   FL   *    G RM K   K   PQT
Conservation:  6245122142113453125888567864394564421322443222463354622321291346348207423318451243412224152442587673
SS_PSIPRED:    HHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHH   HH         HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEHHHHHH    HHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHH               HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH   E E HHHHHH    HHHHHH HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHH               HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH  EE  HHHHHHH   HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                        DDDDDDDDDDD                                                   
DO_SPOTD:                                            DDDDDDDDDD                                                    
DO_IUPRED2A:                                            D D                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LPELGPGGDQQSYEFFHLTLQAFFTAFFLVLDDRVGTQELLRFFQEWMPPAGAATTSCYPPFLPFQCLQGSGPAREDLFKNKDHFQFTNLFLCGLLSKAK 600
gnomAD_SAV:    SLG  LRV    F     I #   I L  MP NK  IK  FS YH   SAV  V M Y  T  L   R*S CLVW Y      Q *# SR  W#  C T 
Conservation:  3112310211134986929886967973863622211114716813310010111024022231224211101020244223474575469789987424
SS_PSIPRED:               EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH                   HHHH    HHHHHH      HHHHHHHHH    HHH
SS_SPIDER3:    HH         EEEE EHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH                       H     HHHHHH      HHHHHHHH     HHH
SS_PSSPRED:    HH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH                 HHHH                 HHHHHHHHH   HHH
DO_DISOPRED3:                                               DDDDDDDDDDDDDD                                         
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QKLLRHLVPAAALRRKRKALWAHLFSSLRGYLKSLPRVQVESFNQVQAMPTFIWMLRCIYETQSQKVGQLAARGICANYLKLTYCNACSADCSALSFVLH 700
BenignSAV:         W    T                                                                                          
gnomAD_SAV:     Q QQY   VV   I C # R     T PC R R  CIHIKTIS L  L M T#  C V K    R    V     T #   N#S T L YYT# F I P
Conservation:  1164125441116438623912572124625523452111113145643638594496659447334633674352435586468644559948657653
SS_PSIPRED:    HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        H          HHHHHHHHHH    HHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHH       HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                 DDDDD                
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HFPKRLALDLDNNNLNDYGVRELQPCFSRLTVLRLSVNQITDGGVKVLSEELTKYKIVTYLGLYNNQITDVGARYVTKILDECKGLTHLKLGKNKITSEG 800
gnomAD_SAV:    L H Q T #   K   N#VM#    G  CRN  T  IK#   SE  M  QG I *   I W   K    N RVS LSR  Y Y AFS    RR   IG  
Conservation:  7133145657888664969547736554373567666846581644582576284445339788393568497326534543932822564918256239
SS_PSIPRED:    H    HHH        HHHHHHHHHHHH   EEE       HHHHHHHHHHHH      EEE       HHHHHHHHHHHHH     EEE       HHH
SS_SPIDER3:    H               HHHHHHHHHHHH   EEEE      HHHHHHHHHHH       EEE        HHHHHHHHHHHH     EEEE      HHH
SS_PSSPRED:    H   HHHH        HHHHHHHHHHHHH  HHEH        HHHHHHHHHH    EEEE        HHHHHHHHHHHHH     EEE       HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GKYLALAVKNSKSISEVGMWGNQVGDEGAKAFAEALRNHPSLTTLSLASNGISTEGGKSLARALQQNTSLEILWLTQNELNDEVAESLAEMLKVNQTLKH 900
gnomAD_SAV:        # D  D   V QDR *S     AR    TDG W YLN N   VV SST    ANR V   L IMP  V       PS   G    VL    *M   
Conservation:  6426808643844515585989168939916974874484382167953848742985177267219226265964383539558214524444733813
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH      EE       HHHHHHHHHHHHH      EEE       HHHHHHHHHHH       EEE       HHHHHHHHHHH       E
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH      E         HHHHHHHHHHH       EEEE      HHHHHHHHHHH       EEEEE     HHHHHHHHHHH       E
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHH       EE        HHHHHHHHHHH    HHHHHHH     HHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                                  DDDDDDDD                            
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50   
AA:            LWLIQNQITAKGTAQLADALQSNTGITEICLNGNLIKPEEAKVYEDEKRIICF 953
gnomAD_SAV:      P    #    S RRT V *N SDVR        K T AV FC*V  W VF 
Conservation:  55643826631831162357118214286643471321352105114165232
SS_PSIPRED:    EE       HHHHHHHHHHHH      EEE       HHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:    EEEE     HHHHHHHHHHH       EEE       HHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    EE       HHHHHHHHHHHH       EE       HHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                       
DO_SPOTD:                                                           
DO_IUPRED2A: