Q9Y259  CHKB_HUMAN

Gene name: CHKB   Description: Choline/ethanolamine kinase

Length: 395    GTS: 2.283e-06   GTS percentile: 0.747     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 3      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 240      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAAEATAVAGSGAVGGCLAKDGLQQSKCPDTTPKRRRASSLSRDAERRAYQWCREYLGGAWRRVQPEELRVYPVSGGLSNLLFRCSLPDHLPSVGEEPRE 100
BenignSAV:         V       V                                    C                                                  
gnomAD_SAV:    L  KV    V ET#       V    #YRYAI EWQ   L#L# #DH  CLRSQG*W    CLG#T A KAH #  S N  F     A  QL   GKL D
Conservation:  5100000011100111111111111111111110012011220122022101111121310201110110202146665345434343202121228742
SS_PSIPRED:                                        HHH   HHHHHHHHHHHHHHH   HH   HHH EEEEE      EEEEEE             E
SS_SPIDER3:           E                         HHH H    HHHHHHHHHHHHHH    H    HHHEEEEEE      EEEEEE             E
SS_PSSPRED:                                              HHHHHHHHHHHHHHH           EEEEEE     EEEEEEE             E
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                           
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                            
DO_IUPRED2A:                           DD DDDDDDDDDDDDDD                                                           
NP_BIND:                                                                                 SGGLSNL                   
REGION:                                                                                    GLS                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VLLRLYGAILQGVDSLVLESVMFAILAERSLGPQLYGVFPEGRLEQYIPSRPLKTQELREPVLSAAIATKMAQFHGMEMPFTKEPHWLFGTMERYLKQIQ 200
gnomAD_SAV:    A      V   R    MVGGGT TV E WL   *V R L DSP  HC  RQ    E  QKL     M M #V   AK IL     #  L    QH    R
Conservation:  5445546356343444435565656668626694845666365774446543818157115135356827563892829966869388937654963662
SS_PSIPRED:    EEEEEE         HHHHHHHHHHHHH      EEEE    EEEEEE      HHHH  HHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    EEEEEE         HHHHHHHHHHHHH     EEEEE     EEEEE   E  HHHHH HHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    EEEEE          HHHHHHHHHHHHHH     EEEE    EEEEE       HHHH  HHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                     D                                                 
NP_BIND:                                                    QYIPSRP                                                
BINDING:          R                                                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DLPPTGLPEMNLLEMYSLKDEMGNLRKLLESTPSPVVFCHNDIQEGNILLLSEPENADSLMLVDFEYSSYNYRGFDIGNHFCEWVYDYTHEEWPFYKARP 300
PathogenicSAV:                                                                                   K                 
gnomAD_SAV:     P  A    I QQD   P   TDKF  S QCI LL A   S     T   F*  AD  RHI    # # * C    VV   Y *FDY  QK  R   V H
Conservation:  1522121212335215393175118515923528776888885989869392110113389979998876579888467678893768333239562122
SS_PSIPRED:           HHH       HHHHHHHHHHHHH     EEEE        EEE         EEEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHH         EE  H
SS_SPIDER3:           HH      H HHHHHHHHHHHHH     EEEE       EEEEE        EEEEEEE        HHHHHHHHHH H         EE   
SS_PSSPRED:    H       HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH    EEEE        EE          EEEEEE                EHHHH              
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                  Q                   D                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TDYPTQEQQLHFIRHYLAEAKKGETLSQEEQRKLEEDLLVEVSRYALASHFFWGLWSILQASMSTIEFGYLDYAQSRFQFYFQQKGQLTSVHSSS 395
PathogenicSAV:                                                                             #                  
BenignSAV:     I                          R                                                                   
gnomAD_SAV:    AVH  #  P YLVCR QV  E  ##VFRDQ T # D F LK  WCVP Y  L R   #  V V # *   MH V  ##       E  PN N #C
Conservation:  02674314652541254030011000112230124313326446333454255555535533453333644223114222131142021111111
SS_PSIPRED:    HH   HHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    H    HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:                                                                                              DDD
DO_SPOTD:                                                                                               DDDDDD
DO_IUPRED2A:                             DD