Q9Y2B5  VP9D1_HUMAN

Gene name: VPS9D1   Description: VPS9 domain-containing protein 1

Length: 631    GTS: 2.024e-06   GTS percentile: 0.662     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 368      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAAAAGDGTVKPLQSAMKLANGAIELDTGNRPREAYTEYLRSIHYISQVLLEEVETTKEAGETVPPDTSKMLKLAQQCLERAQSTAAKLGKTRLKPTMPA 100
gnomAD_SAV:     P   A D       V            S LT  TNM HPKN  CTF# I Q A            N        L Y Q  #LK T  VER# R  I  
Conservation:  4111111111112111201110111111120116881675567256443844542021110312124127855654798584433212122000100120
SS_PSIPRED:               HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
SS_SPIDER3:                HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
SS_PSSPRED:                HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDD                                                                                DDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDD DD                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDD              DDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:    D DDDDD   DD D     DDDDDDDDDDDD                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      D DDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AAPIPQPAGRHRRVYSDEGGKLSPFLPPEIFQKLQGAESQSCKKELTPLEEASLQNQKLKAAYEARMARLDPSQAMQKTSLTLSLQRQMMENLVIAKARE 200
gnomAD_SAV:      S LKLVS*QCHI   G E  Y  # RK Y NPHWS     * K # VQ#V M T     T*  #  Q   R TVE K   F# R # V#SP       
Conservation:  1110312122566427653411348569648744622322215646776657734655945345776566262551899796977997769653795996
SS_PSIPRED:                               HHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                  E             HHHHHH             HHHHH HHHHHHHHHHHHHHH   HH  H        HHHH HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                HHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     D          DD  DDDDDDDDDDDDDD  DD    DDDDDDDDDD DDDDDDDDDD            D    
MODRES_P:                     S                                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ETLQRKMEERRLRLQEAANRRFCSQVALTPEEREQRALYAAILEYEQDHDWPKHWKAKLKRNPGDLSLVTSLVSHLLSLPDHPIAQLLRRLQCSVYSALY 300
gnomAD_SAV:        K LKK    VRD  I M   E    S  P *WT   T M *#  #N*R P* S     S YQ   IG         N RVV   KWV  F CG   
Conservation:  3774973556778746345786432223526469651466446855666598627714673393722584264345761554841466433732681256
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH       HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHH        HHHHHHHHHH      HHHHHHHHH HHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHH         HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                              
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDD           DDD
DO_IUPRED2A:   D    DDDDDD             DD                          DDDDDD                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PAVSRAAAPAPGCCPPTPNPGSRRLRPSQSLHCMLSPPEPSAAPRPQDSPPTPPLQPGPVGSPSPLGDTASGLPDKDSSFEDLEQFLGTSERQGRGRGVQ 400
gnomAD_SAV:      #  G ST# SF# T      *W           T  KA  T  SRE    #R     M# S LR  S AAM NMA *  Y   L RMT W# LDC   
Conservation:  4365211132131232433423314445372444111231201110110011011022201001101000101112546778863443132122011111
SS_PSIPRED:     HH                                                                            HHHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:       H                                                                           HHHHHHHHH  H         
SS_PSSPRED:     HHHH                                                                        HHHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:   DD       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  DDD  
DO_IUPRED2A:          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PEPQLQQLKTAVEEIHNAVDRLLSLTLLAFEGLNTAASKDRCLACIEEPFFSPLWPLLLALYRSVHRAREAALSRSMELYRNAPPTAIGIPTKLLPQNPE 500
gnomAD_SAV:    L # VR V  T D    SLEW  L  I # #S TR   E HY#   #DSL #L CLV  T S  # L QVT   G   F   TL  TT     F  KKH 
Conservation:  3122232842455657363525454245464253230255255454563442637234544482541158235113524321326234744139492211
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH   HHH    HHH      
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH H     HHHHHHHHHHHHH     HHHH   HHH      
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH                   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDD                                                                              DD        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AKGATGYPYCAAAQELGLLVLESCPQKKLECIVRTLRIICVCAEDYCPTPEATPQAGPPPIAAAAIGADDLLPILSFVVLRSGLPQLVSECAALEEFIHE 600
gnomAD_SAV:    S  VA C   EVD#  V   V TRLKQ  # VAW  L   IGVK    SR   S VR LT#TT  V# N   L   SM M NS  * MLD*T P AV  #
Conservation:  1032412861274477246214248456536646457247156533102231011111231123557977969664484444135574668468566566
SS_PSIPRED:           HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HH    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH H
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                      HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH   H
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                        HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                  DDDDDDDDDDDDD                                       
DO_SPOTD:                                                       DDDDDDDDDDDDDD                                     
DO_IUPRED2A:                                                        D   D D                                        

                       10        20        30 
AA:            GYLIGEEGYCLTSLQSALSYVELLPRGGLAK 631
gnomAD_SAV:    W  #RD S  F   LNT N M   AQ     
Conservation:  5253753437546535382342242121012
SS_PSIPRED:    HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:    HH   HHHHHHHHHHHHHHHHH         
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                              DDD
DO_SPOTD:                                DDDDD
DO_IUPRED2A: