Q9Y3Q4  HCN4_HUMAN

Gene name: HCN4   Description: Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4

Length: 1203    GTS: 9.899e-07   GTS percentile: 0.218     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 6      BenignSAV: 19      gnomAD_SAV: 486      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDKLPPSMRKRLYSLPQQVGAKAWIMDEEEDAEEEGAGGRQDPSRRSIRLRPLPSPSPSAAAGGTESRSSALGAADSEGPARGAGKSSTNGDCRRFRGSL 100
BenignSAV:                                        E                                                                
gnomAD_SAV:      T  L T                    GK     E     HL L NM        FL    S M  G L       K                  C   
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:         HHHHHHHH              HHH HHH             EE                                                   
SS_SPIDER3:         HHHHHHHH         H    HHHHHHH                                   H                              
SS_PSSPRED:         HHHHHHHH                  HHH                                                                  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ASLGSRGGGSGGTGSGSSHGHLHDSAEERRLIAEGDASPGEDRTPPGLAAEPERPGASAQPAASPPPPQQPPQPASASCEQPSVDTAIKVEGGAAAGDQI 200
BenignSAV:                 M                                                                                       
gnomAD_SAV:    V         SS        N  E       L    T  S            G       T   SL  P QR S  V  A L    DVRA R VV  NH 
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111100000111111111111111111111111110011110
SS_PSIPRED:                             HHHH HH                                                       EEE          
SS_SPIDER3:                            HHHHHH                                                          EEE         
SS_PSSPRED:                             HHHHH                                                         EEE          
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D    D
MODRES_P:                                           S                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LPEAEVRLGQAGFMQRQFGAMLQPGVNKFSLRMFGSQKAVEREQERVKSAGFWIIHPYSDFRFYWDLTMLLLMVGNLIIIPVGITFFKDENTTPWIVFNV 300
gnomAD_SAV:         AH S    #  H A V  LRI     ML      M CQ    R            L            M                   R    T 
Conservation:  0000000001111002011001021010001001010021000111101000111010010354652344244335544573463542452223433563
STMI:                                                                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMM
SS_PSIPRED:      HHH        HHHH          HHHHHHH  HHHHHHHHHHHH   EEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHH
SS_SPIDER3:      H         HHHHHH HH      HHHHHH    HHHHHHHHHHHHH  EEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HEHHHHH
SS_PSSPRED:                HHHHHHHH       HHHHHHH   HHHHHHHHHHHH   EEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE         EEEHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                            
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                              
DO_IUPRED2A:   DD                                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VSDTFFLIDLVLNFRTGIVVEDNTEIILDPQRIKMKYLKSWFMVDFISSIPVDYIFLIVETRIDSEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQ 400
BenignSAV:                                       I                                                                 
gnomAD_SAV:      G L  V      C  #M     D   ELKQ #I   R   V        M  V VT  I VNL      Q  #VAC        H             
Conservation:  3444345245344463723143333425442143024333442354564484655533532224343534443353252323435443234332323333
STMI:          MMMMMMMMMMMMMM                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH          EEEE HHHHHHHHH  HHHHHHHHH    EEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH   EEE     EEE  HHHHHHHHHH  HHHHHHH   HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH           EE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            WEEIFHMTYDLASAVVRIVNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPDDCWVSINNMVNNSWGKQYSYALFKAMSHMLCIGYGRQAPVGMSDVWLTMLSMI 500
PathogenicSAV:              G                                                                 R R  V               
BenignSAV:                   M                                                                                     
gnomAD_SAV:                 TM GV              S P   LSV      N    V        E     #            * Q V M    I   V    
Conservation:  5224443244436543342456644656658575435355254445033332331425233213543535543545484536224725234556543544
STMI:                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                       IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII          MMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        EE        HHHHHHHHHHHHHHHHH HH        HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                               N                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPPDTRQRIHDYYEHRYQGKMFDEESILGELSEPLREEIINFNCRKLVASMPLFANAD 600
PathogenicSAV:                                                     N                                               
gnomAD_SAV:                   F       QHE R     E   VY Q  LSN   H  NC K H #    N#KT  C      W K      WN         SV 
Conservation:  4654744444334345555555345554344423222233223522124336344434246334433323234425223685554563853458564456
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                                   
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH  HHHHHHHHHHH HHHHHH        
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH   HH    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PNFVTSMLTKLRFEVFQPGDYIIREGTIGKKMYFIQHGVVSVLTKGNKETKLADGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYSLSVDNFNEVLEEYPMMR 700
PathogenicSAV:                                                                        R                            
BenignSAV:                                              M                                                          
gnomAD_SAV:       M  V    CLK   L  DV Q     T I      M  M  RD E     E           Q Q    M TN C H       S S       V  
Conservation:  6389644745845657571425556742645658568834154432213327379587744645446345435344555654686642545656546236
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH   EEE    EEEE       EEEEEE EEEEEE    EEE          HH        EEEE   EE EEEEHHHHHHHHHH HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH   EE     EEEEE       EEEE  EEEEEE  EEEEEE      HHHHH        EEEEEEEEEEEEE HHHHHHHHHH HHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHH EE     EEEE      EEEEEE EEEEEEE   EEEE                   EEEEEEEEEEEEEE HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                                                                 GEIC      RT                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RAFETVALDRLDRIGKKNSILLHKVQHDLNSGVFNYQENEIIQQIVQHDREMAHCAHRVQAAASATPTPTPVIWTPLIQAPLQAAAATTSVAIALTHHPR 800
gnomAD_SAV:         M      CF  N Y  F  I  N   SA  HH KK     A # # T R #YHI S V GA IHMSIS  T       T T     SL   Q  H
Conservation:  4455333334423222201332321322423622411332544444447334421100111111111111211111111111122213321212212111
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                           HHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH          H          HHHHHHHHHHH H HHHHHHHHHHHHH                     H       HHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                             HHH      
DO_DISOPRED3:                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                           DDDDDD   D                                  
NP_BIND:                RLDR                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LPAAIFRPPPGSGLGNLGAGQTPRHLKRLQSLIPSALGSASPASSPSQVDTPSSSSFHIQQLAGFSAPAGLSPLLPSSSSSPPPGACGSPSAPTPSAGVA 900
BenignSAV:                          M                  L                                         R  V   SL         
gnomAD_SAV:      TT  HL S# R VS S RRMS Y  Q   P # V   TL T# L  MG L PP      PT     PEMR   #  R P TSRVYDFSW S     I 
Conservation:  1111110121311112011111210121111122121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:                           HHHHHHHH                           HHH                                       
SS_SPIDER3:      HHH                  HHHHHH                             HHH                                       
SS_PSSPRED:                                                               HHH                                      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD DDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ATTIAGFGHFHKALGGSLSSSDSPLLTPLQPGARSPQAAQPSPAPPGARGGLGLPEHFLPPPPSSRSPSSSPGQLGQPPGELSLGLATGPLSTPETPPRQ 1000
BenignSAV:                                                #    W                                           M       
gnomAD_SAV:    TA   #   L  VVD   C  N  P  LP   THY#      HSS R WR    #      S     S  NS#      #         L IM   HAW 
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111010110110111112100201101111111111111
SS_PSIPRED:           HHHHH                                                                                        
SS_SPIDER3:            HH                                                                                          
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PEPPSLVAGASGGASPVGFTPRGGLSPPGHSPGPPRTFPSAPPRASGSHGSLLLPPASSPPPPQVPQRRGTPPLTPGRLTQDLKLISASQPALPQDGAQT 1100
BenignSAV:                                                                   T                                     
gnomAD_SAV:      LS    ET #  CHI    * VI  A  R  RAG  L    QV    R     TV  S  T  H H#D  LFA S      MV AV        RV  
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111110121111231132111111011111111101111121112110111120002112121111
SS_PSIPRED:                                                                                                    HHH 
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LRRASPHSSGESMAAFPLFPRAGGGSGGSGSSGGLGPPGRPYGAIPGQHVTLPRKTSSGSLPPPLSLFGARATSSGGPPLTAGPQREPGARPEPVRSKLP 1200
BenignSAV:                 V   L                                                                              H    
gnomAD_SAV:     C T LR     V V LPL  V DSRRV RN R FS A  SC      LI   G    C   #AP F ATI     E   P#R  K   TSLQLLH# QQ
Conservation:  0111011101011111111111111111111112111201211201111101111111111111111111111111111122101112101111110202
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:          S  S                                                                                            

                  
AA:            SNL 1203
gnomAD_SAV:     S 
Conservation:  110
SS_PSIPRED:       
SS_SPIDER3:       
SS_PSSPRED:       
DO_DISOPRED3:  DDD
DO_SPOTD:      DDD
DO_IUPRED2A:   DDD