Q9Y5W8  SNX13_HUMAN

Gene name: SNX13   Description: Sorting nexin-13

Length: 968    GTS: 1.515e-06   GTS percentile: 0.455     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 346      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MLTEASLSIWGWGSLGIVLFLITFGPFVIFYLTFYILCFVGGGLVVTLLFGKTNSEKYLEQCEHSFLPPTSPGVPKCLEEMKREARTIKIDRRLTGANII 100
gnomAD_SAV:      S     V  R    V F  V S TL VL     V Y         V L         K         AL       D   Q  K #  H      S  
Conservation:  4000425848686684455563588684544566654655498758669796469874984896978443537616447765391636699996997559
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH           HHHHHHHHH                 
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH             HHHHHHHHH H             H
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH            HHHHHHHH               H
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD DDDDDDDDDDDDDDDDDD          
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D     
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DEPLQQVIQFSLRDYVQYWYYTLSDDESFLLEIRQTLQNALIQFATRSKEIDWQPYFTTRIVDDFGTHLRVFRKAQQKITEKDDQVKGTAEDLVDTFFEV 200
gnomAD_SAV:       V       M  F  C      N#             T# R  S      R  # A C   Y A  #Q    TR   AK # E NVP  EFIHI L  
Conservation:  9999796557667776999996997676966779566969775953657657977977996776967996697779373246545236137565549976
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHH HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                  DDDDDDDDDDD         
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EVEMEKEVCRDLVCTSPKDEEGFLRDLCEVLLYLLLPPGDFQNKIMRYFVREILARGILLPLINQLSDPDYINQYVIWMIRDSNCNYEAFMNIIKLSDNI 300
gnomAD_SAV:      KL     H VA    R  Q     M         S     SN   #      VQ  FF     HNE#    R I #  H FT  C    Y M M    
Conservation:  9777762599946757267997696969969997799777977759795776656376677973586777757746767657346797797676977643
SS_PSIPRED:    HHHHH    HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH    H
SS_SPIDER3:    HHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHH HHHHHH      HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH   H
SS_PSSPRED:    HH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH    H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GELEAVRDKAAEELQYLRSLDTAGDDINTIKNQINSLLFVKKVCDSRIQRLQSGKEINTVKLAANFGKLCTVPLDSILVDNVALQFFMDYMQQTGGQAHL 400
gnomAD_SAV:    V      E# T                          V  Q   H         T V         E  # G  G   G SI        #   EDK   
Conservation:  3999777966277976999999666797377697676777364766767964679656557766345769677963774597999976779824969859
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHH         HHHHH  HHHHHHHHHHHHH   HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH HHHHHHHHHH HHHH       HHHHH          HHHHH  HHHHHHHHHHHHH     HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH
DO_DISOPRED3:              D  D DDD        D                DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                    
DO_SPOTD:                                                        DDDDDDDDD                                         
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FFWMTVEGYRVTAQQQLEVLLSRQRDGKHQTNQTKGLLRAAAVGIYEQYLSEKASPRVTVDDYLVAKLADTLNHEDPTPEIFDDIQRKVYELMLRDERFY 500
BenignSAV:                                                                            S                            
gnomAD_SAV:          D  WA VE  VG I GC G  R    E#   * V  A V DH      F     G CSITR   # SLGA   Q   GVPKQ     IQ     
Conservation:  8996999888899869947723235885463248589965995977799997866574244204514833553245468455556543774656546377
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH HH  
DO_DISOPRED3:               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     D  DD           DD   DDD                                 
DO_SPOTD:                            DDDDDDDDDDD                                                                   
DO_IUPRED2A:                          DD      D                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PSFRQNALYVRMLAELDMLKDPSFRGSDDGDGESFNGSPTGSINLSLDDLSNVSSDDSVQLHAYISDTVYADYDPYAVAGVCNDHGKTYALYAITVHRRN 600
gnomAD_SAV:     C    V HL V         H    FE        V     V      V YI FV       C       NCGTC AT I  E#D        S QQH 
Conservation:  9797654997676599777767754765565364576766465578686546342672265484999952533354566879977876889875882864
SS_PSIPRED:    HHH   HHHHHHHHHHHH                                        HHHHHH            EE EEE     EEEEEEEEEEE  
SS_SPIDER3:    H HH   HHHHHHHHHHH                                       HHHHHH E    EE     EEEEEE     EEEEEEEEEEEE 
SS_PSSPRED:      HHH HHHHHHHHHHHH                                        HHHHHH                       EEEEEEEEEEE  
DO_DISOPRED3:               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                            
DO_SPOTD:                          DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                               
DO_IUPRED2A:                          D  DDDDDDDDDDDDD                                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LNSEEMWKTYRRYSDFHDFHMRITEQFESLSSILKLPGKKTFNNMDRDFLEKRKKDLNAYLQLLLAPEMMKASPALAHYVYDFLENKAYSKGKGDFARKM 700
gnomAD_SAV:           ES   FG  RE  V  I R   V  VM      A   T            S       V  V   F                     G    V
Conservation:  2334628589998889999969855566563469799776796666657776665979597766558844544628224636986884868887698865
SS_PSIPRED:         EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH   HHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH  HHHHHHHHHHH                
SS_SPIDER3:        EEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH H HHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH  HHHHHHHHHH             HHH 
SS_PSSPRED:        H HEHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH HHHHHHHHHHH            HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                          DDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                 DDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                  R S                        K             R                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DTFVNPLRNSMRNVSNAVKSLPDSLAEGMTKMSDNMGKMSERLGQDIKQSFFKVPPLIPKTDSDPEHRRVSAQLDDNVDDNIPLRVMLLLMDEVFDLKER 800
gnomAD_SAV:     A  H  C  V S    F C    V     T  E #  L G *      P       TR AVL   RH  L  V GD             V    N R  
Conservation:  9779799979779795799569977779767667779767676766677547757764595426456397664578465755967679997766979777
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHHH     HHH          HHHH     HHHHHH            HHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:    H         HH H                       HHHHHH   HHHH              HHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    H         HHHHHH       HHHH           HHHH    HHHHH             HHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                     
DO_IUPRED2A:                DD  D      D   DDDDDDDDDDDD                 DD  DDDDDDDDDDDDDD                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NQWLRRNIKNLLQQLIRATYGDTINRKIVDHVDWMTSPEQVADSVKRFRDAFWPNGILAEAVPCRDKSIRMRTRVAGKTKLLAIMPDELKHIIGAETTRK 900
gnomAD_SAV:     K  *  T     H    A  V          N  S  GE  # M             G  GL T E FQ T G    M     TA#    VT     W 
Conservation:  9799797977999979796697979799878953667769977498599766998888994253864345666869798386356976666546668898
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH HHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH    HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH  HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        
AA:            GILRVFEMFQHNQLNRRMVYVFLEGFLETLFPQYKFRELFNKLHSRSKQMQKYKQKLQTTQAPSLQKR 968
gnomAD_SAV:       H S   R  HFS   F  LS S S    S CE CDV  R  *W REIR   * ## SPV  WK S
Conservation:  88856746664264949545546547766465445644662577747353236246332263632245
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH    HHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH   HHHHHHHHHH           
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
DO_DISOPRED3:                                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                     DDDDDDDDDDDD DDDDD