Q9Y625  GPC6_HUMAN

Gene name: GPC6   Description: Glypican-6

Length: 555    GTS: 1.123e-06   GTS percentile: 0.278     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 279      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MPSWIGAVILPLLGLLLSLPAGADVKARSCGEVRQAYGAKGFSLADIPYQEIAGEHLRICPQEYTCCTTEMEDKLSQQSKLEFENLVEETSHFVRTTFVS 100
BenignSAV:        R                 R                                                               F              
gnomAD_SAV:       RS D VI#     I  SSRE   VP  ED H V*  Q YT E## D     GP    H G    S D  #N T  G  K  YF  G GY  HA  L 
Conservation:  0000000000000000000000000001110101000010100000010001022143353331567311353251014102320130212104102501
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                             
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHH    HHH                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHH    HHH          H           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHH                            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                             
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RHKKFDEFFRELLENAEKSLNDMFVRTYGMLYMQNSEVFQDLFTELKRYYTGGNVNLEEMLNDFWARLLERMFQLINPQYHFSEDYLECVSKYTDQLKPF 200
gnomAD_SAV:    G     *V *   G      S   AQ   V# T      R   PG  M N##D  S Q IPS   DQ   QL H   LR   I         F #H   S
Conservation:  1211211231235104102510131122603513320341266137225511322263334156722748536211122102334555743312312254
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GDVPRKLKIQVTRAFIAARTFVQGLTVGREVANRVSKVSPTPGCIRALMKMLYCPYCRGLPTVRPCNNYCLNVMKGCLANQADLDTEWNLFIDAMLLVAE 300
gnomAD_SAV:      M Q    R S#T V  TA AH     #  V *  R  TAAE MH   M       QV L  GA DD  VSI      H VEPNP  S   #GVI    
Conservation:  4313112112213333345333266122132311312412111712413441474271511122480257156336963224553157205353420532
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHH  HHH  HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH     H          H HHHHHHHH H  HHH  HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RLEGPFNIESVMDPIDVKISEAIMNMQENSMQVSAKVFQGCGQPKPAPALRSARSAPENFNTRFRPYNPEERPTTAAGTSLDRLVTDIKEKLKLSKKVWS 400
BenignSAV:                                   L                                                                     
gnomAD_SAV:    Q     T  L L     Q       T    L M     L    SEL L     C V  S   H    #  G APS TDK   WPI  M      Y N R 
Conservation:  3512223251331342125345501624311042143231750511000120131011141022212112212112231131144023102220131363
SS_PSIPRED:    HH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH                                        HHHHHHHHHHHHHHH  HHH
SS_SPIDER3:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH                                          HHHHHHHHHHHHHH  HHHH
SS_PSSPRED:    HH     HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                 DDDDDDDDDDDD                                         
DO_SPOTD:                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                  DDDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ALPYTICKDESVTAGTSNEEECWNGHSKARYLPEIMNDGLTNQINNPEVDVDITRPDTFIRQQIMALRVMTNKLKNAYNGNDVNFQDTSDESSGSGSGSG 500
BenignSAV:                M                                                                                        
gnomAD_SAV:        AV   K MRT M KKK      # V  #   ITGRFN   T  KMG#  SQ NSL   H    H  I       #DS #     N    AL   NR
Conservation:  0750135111112120102317637021327222322253326127845123232351046223306523323431510605221131232233223313
SS_PSIPRED:    H HHHHH              HH          HH                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                      
SS_SPIDER3:    HH HHH                            H                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                       
SS_PSSPRED:    HHHHHH                                                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                       
DO_DISOPRED3:               DD                                                                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:             D     DDDDD DDD  D    DDDDDDDDDDDDDDDDD DDD D                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDD 

                       10        20        30        40        50     
AA:            CMDDVCPTEFEFVTTEAPAVDPDRREVDSSAAQRGHSLLSWSLTCIVLALQRLCR 555
gnomAD_SAV:    F# YL      C      V YSNQ V N   GLC R R FS PS   P     WG
Conservation:  1011020010000010020010110010000000001101111111001100002
SS_PSIPRED:                                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:                EE         H      HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:                                         HHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                  DDDDDDDDDDDDDDDDD                       
PROPEP:                                     SAAQRGHSLLSWSLTCIVLALQRLCR
LIPID:                                     S