Q9Y6C5  PTC2_HUMAN

Gene name: PTCH2   Description: Protein patched homolog 2

Length: 1203    GTS: 2.518e-06   GTS percentile: 0.811     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 32      gnomAD_SAV: 644      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MTRSPPLRELPPSYTPPARTAAPQILAGSLKAPLWLRAYFQGLLFSLGCGIQRHCGKVLFLGLLAFGALALGLRMAIIETNLEQLWVEVGSRVSQELHYT 100
BenignSAV:         L         I                                                                                     
gnomAD_SAV:      * L V    R  I     T  EL  R   #  S H #  C P     R  K    L L RR V RD     CV VT   WK  L  A  WL  V Y A
Conservation:  2222012222012010201022222222221234223213203321363122323421221232122333322233153333314222377875389287
STMI:                                                                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                      
SS_PSIPRED:          HHH       HHHH  HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH     HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                    HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H    HHHHH     HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                    HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH     HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDD DDDDDDDD                                           D                                  
DO_SPOTD:      DDDDDDDD                                                                                            
DO_IUPRED2A:   DDD  DDDDDDDDDD                                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KEKLGEEAAYTSQMLIQTARQEGENILTPEALGLHLQAALTASKVQVSLYGKSWDLNKICYKSGVPLIENGMIERMIEKLFPCVILTPLDCFWEGAKLQG 200
BenignSAV:        P                                                                                                
gnomAD_SAV:    RK P      SFRT T  TC A     PL  P F F      RE   LF    * W  M C    L     #T WR     L M   RVH        R 
Conservation:  6474967537449478966322326697156612762464287563857747484964575769445573223232331346554447555643655442
SS_PSIPRED:    HHHH       EEEEEE           HHHHHHHHHHHHHHH  EEEE  EEEEHHHHHH          HHHHHHHHH    EE HHHH         
SS_SPIDER3:    HHHH      EEEEEEEEE         HHHHHHHHHHHHHHH  EEEE   EEEHEHEEEE         HHHHHHHHH   EEE   HH      E  
SS_PSSPRED:    HHH   HHHHHHHHHHE           HHHHHHHHHHHHHHH EEEE    EE HHHHHHH        HHHHHHHHHH   EEE HHH          
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GSAYLPGRPDIQWTNLDPEQLLEELGPFASLEGFRELLDKAQVGQAYVGRPCLHPDDLHCPPSAPNHHSRQAPNVAHELSGGCHGFSHKFMHWQEELLLG 300
BenignSAV:            C                                    H                                                       
gnomAD_SAV:      #  L#HL  *  H  T   RG  D  T  D  W     T*# H *M WSY  AH     SN T  Q KPDSS  YK    FR Y  E T#     P  
Conservation:  8226426211248355572265247211224535446617547556854766526051268044463111222344016155557342344375565547
SS_PSIPRED:               EEE   HHHHHHHHHHH     HHHHHHH                                  HHHH       HHHH     HHHH  
SS_SPIDER3:               EEEE  HHHHHHHHHHH     HHHHHHH      EE  E                       HHHHH        H       HEEE 
SS_PSSPRED:                     HHHHHHHHH       HHHHHHHH                                                   HHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                            DDDDDDDDDDDDDDDDDD                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GMARDPQGELLRAEALQSTFLLMSPRQLYEHFRGDYQTHDIGWSEEQASTVLQAWQRRFVQLAQEALPENASQQIHAFSSTTLDDILHAFSEVSAARVVG 400
BenignSAV:                                           R      Q           H                           F              
gnomAD_SAV:    #R        M    P N    I  H R KY W  C  R   *# G* N    GSEWH L* GE*#  G P R  R S      V#  V  K #P C   
Conservation:  4225311304337385844446555366655445331433549563483368548582535223144306434154485465747543589467336565
STMI:                                                                                                      MMMMMMMM
SS_PSIPRED:                    EEEEE   HHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEE   HHHHHHHH   HHHHHHH
SS_SPIDER3:     E       EEE EEEEEEEEE  HHHHHHHH   H        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEE   HHHHHHH    HHHHHHH
SS_PSSPRED:              HHHHHHHEEEE    HHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEE H HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                           N                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GYLLMLAYACVTMLRWDCAQSQGSVGLAGVLLVALAVASGLGLCALLGITFNAATTQVLPFLALGIGVDDVFLLAHAFTEALPGTPLQERMGECLQRTGT 500
BenignSAV:                                        V                                                        K    M  
gnomAD_SAV:       F#M C WA TVW NYT   S M   WI  #VPELT#   F*   #     T N L    P   SM  IL  E T           #C  QR  CA  
Conservation:  6777554446356655953666657765853546546856686766554498535574665656635564466467473422123532433727633243
STMI:          MMMMMMMMMMMMM               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                      
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HH HHHHHHHH      HHHHH  HH      HHHHHHHHHHHH H
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH      H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHH H  EEEEE    EEEEE E HHH      HHHHHHHHHHH HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHH   HHHHH     EEEEEH HHHH     HHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SVVLTSINNMAAFLMAALVPIPALRAFSLQAAIVVGCTFVAVMLVFPAILSLDLRRRHCQRLDVLCCFSSPCSAQVIQILPQELGDGTVPVGIAHLTATV 600
BenignSAV:       I                             T                                                     E      T      
gnomAD_SAV:    RFI   V    # F V  I  #V *T F *GSV     L #M  I  V RI   WWH S HR M       RFS ## V  E R NRIATLASTY N A 
Conservation:  2344443442444526474856365554274654546563365547864555563864148686657726553257454263321311242226458466
STMI:           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEE        HH   HHH        HHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE      EEE   HH         HHHHH HE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE                          E    HH
DO_DISOPRED3:                                                                            DDDDDDDDDDDDDDD           
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QAFTHCEASSQHVVTILPPQAHLVPPPSDPLGSELFSPGGSTRDLLGQEEETRQKAACKSLPCARWNLAHFARYQFAPLLLQSHAKAIVLVLFGALLGLS 700
BenignSAV:                          #                                          #       L                           
gnomAD_SAV:            R     N  L   Y    R N  # D  TR    WEPV  D QIK   #  Y    C   T LTH*   L    L    FM MF # F    
Conservation:  5536353424333573445242614241211133221324857685340222211012023331283551854134474964322732732463355446
STMI:                                                                                                MMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HH        EEEEEE     EE                  HHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHEE     EEEEEE      E                   H HH HHHHHHHHH          HHHHHHHH HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH        EEEEE                                HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                        
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                    DD          DDD                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LYGATLVQDGLALTDVVPRGTKEHAFLSAQLRYFSLYEVALVTQGGFDYAHSQRALFDLHQRFSSLKAVLPPPATQAPRTWLHYYRNWLQGIQAAFDQDW 800
PathogenicSAV:                   Q                                                                                 
BenignSAV:                                                      T                                                  
gnomAD_SAV:      RTI G  S   M    W    RG  CT  G  #  K##   H   N TL  HP  N   # #   VM # #S   L#      C  PRR HD  N  *
Conservation:  9674625377715674575572554863663466946344546252447422812632651351232355323102382578544337725451456175
STMI:          MMMMMMM                                                                                             
SS_PSIPRED:    HHHHHH      HHH      HHHHHHHHHHHH     EEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHH HHH
SS_SPIDER3:    HH   E       HH      HHHHHHHHHHHH    EEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHH                 HHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ASGRITRHSYRNGSEDGALAYKLLIQTGDAQEPLDFSQLTTRKLVDREGLIPPELFYMGLTVWVSSDPLGLAASQANFYPPPPEWLHDKYDTTGENLRIP 900
BenignSAV:                                                                                                      H  
gnomAD_SAV:       PVIH W CS T   S V R   *SE#T     VI  S            LKF  VE  M*   # P    L G    QS   # G H #M KS C L
Conservation:  2261530034354444446435663558113364414572233754128452512873568466658867475744542834546355234243343246
SS_PSIPRED:    H                 HHHH             HHH              HHHHHHHHHHHH                  HHHH              
SS_SPIDER3:                      EEHHEEEE         H       EE     E HHHHHHHHHHHH                    H               
SS_PSSPRED:                    HHHHHHH            HHH              HHHHHH  EEEEE                                   
DO_DISOPRED3:                                    DD D                                                              
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:         D                                                                                             
CARBOHYD:                 N                                                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PAQPLEFAQFPFLLRGLQKTADFVEAIEGARAACAEAGQAGVHAYPSGSPFLFWEQYLGLRRCFLLAVCILLVCTFLVCALLLLNPWTAGLIVLVLAMMT 1000
BenignSAV:                                K                                       I                   M      M     
gnomAD_SAV:       L Q #      H         KS K VW   T TS V#L T S S#    RKR    QCG    I  PP    FI      S SMS  T#   PVK 
Conservation:  2546656465656835552636958496479369154212740489463854888884466546754554484658659546754753634593363446
STMI:                                                                         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       MMMMMMMMM
SS_PSIPRED:         EEEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:         EEEEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    E       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EE     E  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VELFGIMGFLGIKLSAIPVVILVASVGIGVEFTVHVALGFLTTQGSRNLRAAHALEHTFAPVTDGAISTLLGLLMLAGSHFDFIVRYFFAALTVLTLLGL 1100
BenignSAV:                       M    V                                     M                                      
gnomAD_SAV:     Q  DM S          MM PMV IDT F#  G M  #L N E  QD W T V QRI  LM N D   F # F   V     T K Y V# SLHM V  
Conservation:  3976747756477666667677646799755665543435624173221632044443547526454643674546465356773468826744953874
STMI:          MMMMMMMMMMMM MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH   E HHHHHHHHHHH  EEEEEHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LHGLVLLPVLLSILGPPPEVIQMYKESPEILSPPAPQGGGLRWGASSSLPQSFARVTTSMTVAIHPPPLPGAYIHPAPDEPPWSPAATSSGNLSSRGPGP 1200
BenignSAV:                         M                                                                           R   
gnomAD_SAV:        M          LL Q M # E    T  #R LEEVR  LEV  Y L G DT  SFT MS Y S#P   CV  SL   #LAS   T     FTR   
Conservation:  6679477945852277445221122214321013222120122202312201434344422333132112210102210201021210001010000222
STMI:          MMMMMMMMMMMMMM                                                                                      
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH   HHHHH                                EE    EEE                                     
SS_SPIDER3:    HHHH HHHHHHHH      HHHHH                              E      EEE         E                          
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH                                              EEE                                     
DO_DISOPRED3:                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                            DD    D  DDDD  DD                                DDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                  
AA:            ATG 1203
gnomAD_SAV:      E
Conservation:  210
SS_PSIPRED:       
SS_SPIDER3:       
SS_PSSPRED:       
DO_DISOPRED3:  DDD
DO_SPOTD:      DDD
DO_IUPRED2A:   DDD