Q9Y6H5  SNCAP_HUMAN

Gene name: SNCAIP   Description: Synphilin-1

Length: 919    GTS: 1.404e-06   GTS percentile: 0.404     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 14      gnomAD_SAV: 442      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEAPEYLDLDEIDFSDDISYSVTSLKTIPELCRRCDTQNEDRSVSSSSWNCGISTLITNTQKPTGIADVYSKFRPVKRVSPLKHQPETLENNESDDQKNQ 100
BenignSAV:                                                A                            L                           
gnomAD_SAV:       #  H   KT  N  L C      MV Q  Q  YKE KG LA NCC K* V  VTAKM  SS VT     LCL  # L   R  DIPD    NNH K 
Conservation:  7223334433334533321213343523444346242425453463338234543334334764855745699999999889886962352223240222
SS_PSIPRED:                               HHHHHHH                    HH         HHHHH                              
SS_SPIDER3:            HHH               HHHHHHH                                HHHHH     EE                       
SS_PSSPRED:                                HHHHH                                 HHHH                              
DO_DISOPRED3:  DD           DDDDDD D  DD     DD  D DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                   D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D D                           DDDDDDDDDD  DDDD        D            D        DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KVVEYQKGGESDLGPQPQELGPGDGVGGPPGKSSEPSTSLGELEHYDLDMDEILDVPYIKSSQQLASFTKVTSEKRILGLCTTINGLSGKACSTGSSESS 200
gnomAD_SAV:      ADH  ES  VPDL S   RL ER  D  A    SG LVR  Q  N YV        V     #VPY TM L    WS R  LS F    RPIEN  GP
Conservation:  3122213102210011121111103112222411230125688999999998898996995554233536323555132232113623242122110822
SS_PSIPRED:     HH              HH                 HHHHHHH      HHHH    EEEE                 HHHHHH  HHHEEE        
SS_SPIDER3:                                         HH  H               EEEE               EEHHHHH   HHHHHH        
SS_PSSPRED:                                         HHHHH               EEEE                 HHHHHH  HHHHH         
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                         
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                            DDDDDDD  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSNMAPFCVLSPVKSPHLRKASAVIHDQHKLSTEETEISPPLVKCGSAYEPENQSKDFLNKTFSDPHGRKVEKTTPDCQLRAFHLQSSAAESKPEEQVSG 300
BenignSAV:       S                  L            G                                 Q                               
gnomAD_SAV:    L I  AL     M   R  N L  N    E  PKG KM    L    VC    H  A   QIC Y  A* F  A  AWP W L#     G      H I#
Conservation:  2221465868666433247532422141321112102132232243521314112344312331521134130112243121422412112121531122
SS_PSIPRED:            HHHHHH   HHHHHHHHH               HHH HHHH  HHHHHHHHHH                  EEHHHHHHHHH         H
SS_SPIDER3:          EH HHHHH   HHHHHHHHH                 HHH      HHHHHHHHH                  HEHHHHHHH           H
SS_PSSPRED:            EE       HHHHHHHHHHHH             HHHHH     HHHHHHHHH                HHHHHHHHHHH           H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:     DD DD           DDDDDDDDDDDDDDDD DDD   DDDDDD        DDDDDDDDDDDD DDDD DDDD    D DDDD DDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LNRTSSQGPEERSEYLKKVKSILNIVKEGQISLLPHLAADNLDKIHDENGNNLLHIAASQGHAECLQHLTSLMGEDCLNERNTEKLTPAGLAIKNGQLEC 400
gnomAD_SAV:    V Q R R #Q KRQ P    #   #     V   LP      E   NKS SS  P VVTK LTD   N    TVK R   H N RM   V #M S  WG 
Conservation:  0251113221513732551455549656996676655657696474970379999467547746959696799797595997023977769675364568
SS_PSIPRED:    HHHHHH   HHHHHHHH   HHHHHHH     HHHHHHH             HHHHHHH   HHHHHHHHH    HHHH        HHHHHHH   HHH
SS_SPIDER3:    HHHHHH  HHHHHHHH    HHHHHHH   HHHHHHHHH    H        HHHHHHH   HHHHHHHHH                HHHHHHH   HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH   HHHHHHHH   HHHHHHHH  HHHHHHHHHH            HHHHHHHH HHHHHHHHHHH               HHHHHHHH  HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDD                           D  D                                  D        D           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VRWMVSETEAIAELSCSKDFPSLIHYAGCYGQEKILLWLLQFMQEQGISLDEVDQDGNSAVHVASQHGYLGCIQTLVEYGANVTMQNHAGEKPSQSAERQ 500
gnomAD_SAV:    IH I #K       C          CT   D G  I  F   L G       #     #VI I   R C  *    I   G A  E YT      GTKQ*
Conservation:  5455324446666765324454556755245966497997766997766665381169654634422536364567755756763493136647937955
SS_PSIPRED:    HHHHHH   HHHHH        HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH              HHHHHHH   HHHHHHHHH              HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHH   HH HH        HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH              HHHHHHH   HHHHHHHHH              HHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHH   HHHHHHHHHH    E        HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                      DDDDDDDDDDDDDDD  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GHTLCSRYLVVVETCMSLASQVVKLTKQLKEQTVERVTLQNQLQQFLEAQKSEGKSLPSSPSSPSSPASRKSQWKSPDADDDSVAKSKPGVQEGIQVLGS 600
BenignSAV:                                                          D                                              
gnomAD_SAV:      #     V  M             I         H M    FR  VK   A*D   S L G   LL C  AR TAS# N  C DQ   EG Q  RDPRN
Conservation:  9774957997979999999999799977547873443288374625542322531352154654363142324452231232211534233465231433
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH      HHHHHH   HHHHHHHH                HHHHH         HHH           HHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHH      HHHHHHHHH     HHHHHHH   HHHHHHHH                HHHHH      HHHHH              HHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHH                           HHH
DO_DISOPRED3:                                                      DDDDDDDDDD                                      
DO_SPOTD:                                    D                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   
DO_IUPRED2A:                                                  D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LSASSRARPKAKDEDSDKILRQLLGKEISENVCTQEKLSLEFQDAQASSRNSKKIPLEKRELKLARLRQLMQRSLSESDTDSNNSEDPKTTPVRKADRPR 700
BenignSAV:                         C                                                                               
gnomAD_SAV:      S  W  L G   EY    H   ER   G L I   P    R GHP   D  MF R  K   V T         R   # FS #     ISL  T QT 
Conservation:  1312210216233334516566554572361342366877696522213410412325776599588756579569959472222561621222625765
SS_PSIPRED:    HHH             HHHHHHHH             HHHHH  HHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                        
SS_SPIDER3:    HHH            HHHHHHHHH           H HHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHH                   EE     
SS_PSSPRED:    HHH             HHHHHHHH          HHHHHHH   HHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                         
DO_DISOPRED3:                                       DDDDDD                             DDDDDDDDDDDDDDDDD           
DO_SPOTD:         DDDDDDDDDDDDDDDDDD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD             D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PQPIVESVESMDSAESLHLMIKKHTLASGGRRFPFSIKASKSLDGHSPSPTSESSEPDLESQYPGSGSIPPNQPSGDPQQPSPDSTAAQKVATSPKSALK 800
BenignSAV:          Q  Q V                   C                                L                                    
gnomAD_SAV:    L     RIQ VN S     #     M    HM  L L      GS    A  QG K#  KT  L         SF  L * R  # T  E TP     F 
Conservation:  5565351241224323733337654222335634732326653521435644623412021102224113334124600111151112283659999999
SS_PSIPRED:       HHHHHH      HHHHEEEE                                                              HHHHHH    HHH  
SS_SPIDER3:        HHHHH      H   EEE E       E                                                          E         
SS_PSSPRED:       HHHHHH       HHHHHEE                                                                             
DO_DISOPRED3:           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SPSSKRRTSQNLKLRVTFEEPVVQMEQPSLELNGEKDKDKGRTLQRTSTSNESGDQLKRPFGAFRSIMETLSGNQNNNNNYQAANQLKTSTLPLTSLGRK 900
BenignSAV:          H                                                                                              
gnomAD_SAV:         LK C*      N V    PV  # F  KA R   N K  PP   TKKL HP R S# G Q T    ND R S D   V  *   CPSSF PPET 
Conservation:  9966776876569999996865552323113212312221132203331322136246756957696686766955777614122104111443242676
SS_PSIPRED:                EEEEEE   EE                                      HHHHHHHHHH                             
SS_SPIDER3:          E     EEEEE   EEEE                                    HHHHHHHHHHH         H H                 
SS_PSSPRED:                 EEEEE                                            HHHHHHHHH                             
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDD            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        2
AA:            TDAKGNPASSASKGKNKAA 919
gnomAD_SAV:     VVERK    T T E    
Conservation:  2528332212117263632
SS_PSIPRED:                       
SS_SPIDER3:                       
SS_PSSPRED:                       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDD