DB04315 Guanosine-5'-Diphosphate
InChI Key: QGWNDRXFNXRZMB-UUOKFMHZSA-N
SMILES: NC1=NC2=C(N=CN2[C@@H]2O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]2O)C(=O)N1
Small molecule PDB accession : GDP
List of small molecule binding-associated PTMs for P13639
| Residue | UniProt number | Type of PTM | AlphaFold3 models | Rosetta models | Chai-1 models |
|---|---|---|---|---|---|
| LYS | 337 | Acetylation | PyMOL_AF3 | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 |
| LYS | 32 | Acetylation | PyMOL_AF3 | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 |
| LYS | 159 | Acetylation | PyMOL_AF3 | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 |
| LYS | 333 | Acetylation | PyMOL_AF3 | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 |
| LYS | 337 | Malonylation | PyMOL_RFAA | ||
| SER | 38 | Phosphorylation | PyMOL_AF3 | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 |
| THR | 54 | Phosphorylation | PyMOL_AF3 | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 |
| THR | 57 | Phosphorylation | PyMOL_AF3 | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 |
| SER | 33 | Phosphorylation | PyMOL_AF3 | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 |
| THR | 34 | Phosphorylation | PyMOL_AF3 | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 |
| THR | 36 | Phosphorylation | PyMOL_AF3 | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 |
| CYS | 67 | S-nitrosylation | PyMOL_AF3 | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 |
| LYS | 159 | Ubiquitination | |||
| LYS | 333 | Ubiquitination | |||
| LYS | 337 | Ubiquitination | |||
| LYS | 445 | Acetylation | PyMOL_AF3 | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 |
| LYS | 445 | Malonylation | PyMOL_RFAA | ||
| LYS | 445 | Methylation | PyMOL_AF3 PyMOL_AF3 | PyMOL_RFAA PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 PyMOL_Chai1 PyMOL_Chai1 PyMOL_Chai1 |
| LYS | 525 | Methylation | PyMOL_AF3 PyMOL_AF3 | PyMOL_RFAA PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 PyMOL_Chai1 PyMOL_Chai1 PyMOL_Chai1 |
| TYR | 443 | Phosphorylation | PyMOL_AF3 | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 |
| MET | 430 | Sulfoxidation | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 | |
| MET | 401 | Sulfoxidation | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 | |
| LYS | 529 | Sumoylation | |||
| LYS | 445 | Ubiquitination | |||
| LYS | 481 | Ubiquitination | |||
| LYS | 525 | Ubiquitination | |||
| CYS | 41 | Glutathionylation | PyMOL_RFAA | ||
| SER | 23 | Phosphorylation | PyMOL_AF3 | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 |
| CYS | 41 | S-nitrosylation | PyMOL_AF3 | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 |
| MET | 22 | Sulfoxidation | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 | |
| MET | 353 | Sulfoxidation | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 | |
| LYS | 42 | Acetylation | PyMOL_AF3 | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 |
| SER | 48 | Phosphorylation | PyMOL_AF3 | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 |
| THR | 59 | Phosphorylation | PyMOL_AF3 | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 |
| MET | 1 | Sulfoxidation | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 | |
| MET | 453 | Sulfoxidation | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 | |
| MET | 454 | Sulfoxidation | PyMOL_RFAA | PyMOL_Chai1 | |
| LYS | 42 | Ubiquitination |