Query 002095
Match_columns 967
No_of_seqs 130 out of 152
Neff 4.6
Searched_HMMs 13730
Date Mon Mar 25 12:09:02 2013
Command hhsearch -i /work/01045/syshi/csienesis_hhblits_a3m/002095.a3m -d /work/01045/syshi/HHdatabase/scop70.hhm -o /work/01045/syshi/hhsearch_scop/002095hhsearch_scop -cpu 12 -v 0
No Hit Prob E-value P-value Score SS Cols Query HMM Template HMM
1 d1seta1 a.2.7.1 (A:1-110) Sery 45.0 27 0.002 29.9 7.5 33 858-890 29-61 (110)
2 d1fxkc_ a.2.5.1 (C:) Prefoldin 39.7 49 0.0036 28.8 8.6 26 931-960 103-128 (133)
3 d1ux5a_ a.207.1.1 (A:) Bni1 {B 39.5 1.8E+02 0.013 29.7 14.5 57 900-956 342-401 (411)
4 d1s35a1 a.7.1.1 (A:1063-1168) 36.7 64 0.0047 26.0 8.4 31 904-934 74-104 (106)
5 d2ap3a1 a.24.27.1 (A:12-196) H 35.3 1.2E+02 0.0085 25.3 12.9 136 344-479 50-185 (185)
6 d1seta1 a.2.7.1 (A:1-110) Sery 32.2 1.2E+02 0.0085 25.6 9.6 24 408-431 29-52 (110)
7 d1fxka_ a.2.5.1 (A:) Prefoldin 28.3 1.5E+02 0.011 24.8 9.6 84 859-942 3-105 (107)
8 d1hcia4 a.7.1.1 (A:633-746) al 27.5 1.2E+02 0.0087 25.0 8.8 65 589-660 45-109 (114)
9 d1cuna2 a.7.1.1 (A:116-219) Sp 23.7 1E+02 0.0075 24.8 7.4 65 869-933 35-100 (104)
10 d1s35a2 a.7.1.1 (A:1169-1273) 22.3 1.5E+02 0.011 23.7 8.2 69 866-934 35-104 (105)
11 d2a26a1 a.2.16.1 (A:1-47) Calc 20.1 27 0.0019 26.2 2.3 15 932-946 3-17 (47)
No 1
>d1seta1 a.2.7.1 (A:1-110) Seryl-tRNA synthetase (SerRS) {Thermus thermophilus, strain hb27 [TaxId: 274]}
Probab=45.04 E-value=27 Score=29.85 Aligned_cols=33 Identities=21% Similarity=0.312 Sum_probs=25.4
Q ss_pred HHhhhhhhHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHH
Q 002095 858 ILRQKEGELASYMSRLASMESIRDSLAEELVKM 890 (967)
Q Consensus 858 ~LRrrEGEla~Lq~ELarLes~Rd~L~eELVrL 890 (967)
.|-.++-+...++.++..|.+.|+.++.+|-++
T Consensus 29 ~i~~ld~~rr~l~~~~e~l~~~rN~~sk~i~k~ 61 (110)
T d1seta1 29 ALLALDREVQELKKRLQEVQTERNQVAKRVPKA 61 (110)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh
Confidence 445566777888888888888888888888654
No 2
>d1fxkc_ a.2.5.1 (C:) Prefoldin alpha subunit {Archaeon Methanobacterium thermoautotrophicum [TaxId: 145262]}
Probab=39.75 E-value=49 Score=28.79 Aligned_cols=26 Identities=8% Similarity=0.229 Sum_probs=12.3
Q ss_pred HHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhc
Q 002095 931 ELEELRADIMDLKEMYREQVNLLVNKIQVM 960 (967)
Q Consensus 931 eVEELraDV~DVKeMYR~QIdeLlkQi~~L 960 (967)
..+.|..++.++ +.+|.++..+++.+
T Consensus 103 ~~~~l~~~~~~~----~~~i~~l~~~~~~l 128 (133)
T d1fxkc_ 103 TLQKMGENLRAI----TDIMMKLSPQAEEL 128 (133)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH
Confidence 334444555554 44444454444444
No 3
>d1ux5a_ a.207.1.1 (A:) Bni1 {Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]}
Probab=39.47 E-value=1.8e+02 Score=29.74 Aligned_cols=57 Identities=9% Similarity=0.025 Sum_probs=45.6
Q ss_pred HHhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccch---hHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 002095 900 EAAILPGIQAELDALRRRHSAALELMGERD---EELEELRADIMDLKEMYREQVNLLVNK 956 (967)
Q Consensus 900 e~~~v~~Le~eleeLqqRYeTlLELLGEKs---EeVEELraDV~DVKeMYR~QIdeLlkQ 956 (967)
...++..|+..+..+..+|..++++|||-. -.-++.=..+.+...+|+.-..+.+++
T Consensus 342 ~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~yfGEd~~~~~~~~~fF~~~~~F~~~~~~a~~en~~~ 401 (411)
T d1ux5a_ 342 ARKKGDLLEDEVKLTIMEFESLMHTYGEDSGDKFAKISFFKKFADFINEYKKAQAQNLAA 401 (411)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCSSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 335678899999999999999999999943 356788888899999998877665444
No 4
>d1s35a1 a.7.1.1 (A:1063-1168) Spectrin beta chain {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=36.72 E-value=64 Score=26.05 Aligned_cols=31 Identities=16% Similarity=0.156 Sum_probs=27.1
Q ss_pred hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccchhHHHH
Q 002095 904 LPGIQAELDALRRRHSAALELMGERDEELEE 934 (967)
Q Consensus 904 v~~Le~eleeLqqRYeTlLELLGEKsEeVEE 934 (967)
.+.++..+..|+.||+.+.++..++...+++
T Consensus 74 ~~~I~~~l~~L~~~w~~L~~~~~~R~~~Le~ 104 (106)
T d1s35a1 74 YLLLGQRLEGLDTGWDALGRMWESRSHTLAQ 104 (106)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 4568889999999999999999999887764
No 5
>d2ap3a1 a.24.27.1 (A:12-196) Hypothetical protein MW0975 (SA0943) {Staphylococcus aureus [TaxId: 1280]}
Probab=35.33 E-value=1.2e+02 Score=25.28 Aligned_cols=136 Identities=10% Similarity=0.122 Sum_probs=0.0
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcccchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 002095 344 LEKLKREMKMMETALQGAARQAQAKADEIAKMMNENEHLKAVIEDLKRKTNDAELETLREEYHQRVATLERKVYALTKER 423 (967)
Q Consensus 344 ~~kl~~~~~~~~~~l~~~~r~~~~k~~~~a~L~e~n~~L~~~~e~l~~~~~~~~~~~L~eEy~qRI~aLErKlq~L~KEr 423 (967)
.+.+...+..+...+......+......+..+......+...+..+........+..+...+..+...++.....+....
T Consensus 50 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 129 (185)
T d2ap3a1 50 TAVRGKAVKDLIKNADDRLKEFEKEEDAIKKSEQDFKKAKSHVDNIDNDVKRKEVKQLDDVLKEKYKLHSDYAKAYKKAV 129 (185)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTC-----CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q ss_pred HHHHHHhhhhhHHHHHHhhHHHHHHHHHHHhHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 002095 424 DTLRREQNKKSDAAALLKEKDEIINQVMAEGEELSKKQAAQEAQIRKLRAQIRELE 479 (967)
Q Consensus 424 D~LKke~~k~s~~~a~LkEKDE~IaqLmEEGEKLSKkELq~sniIKKLRakikElE 479 (967)
.....-..........+.+-.+.|..|...-..|-...-.....++++.....+++
T Consensus 130 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ek~~le 185 (185)
T d2ap3a1 130 NSEKTLFKYLNQNDATQQGVNEKSKAIEQNYKKLKEVSDKYTKVLNKVQKEKQDVD 185 (185)
T ss_dssp HHHHHHHHHHTSTTCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
T ss_pred hhhHHHHHHHHhhHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhcC
No 6
>d1seta1 a.2.7.1 (A:1-110) Seryl-tRNA synthetase (SerRS) {Thermus thermophilus, strain hb27 [TaxId: 274]}
Probab=32.20 E-value=1.2e+02 Score=25.55 Aligned_cols=24 Identities=29% Similarity=0.462 Sum_probs=12.3
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhh
Q 002095 408 RVATLERKVYALTKERDTLRREQN 431 (967)
Q Consensus 408 RI~aLErKlq~L~KErD~LKke~~ 431 (967)
.|-++..+...+..+.+.|+.+.+
T Consensus 29 ~i~~ld~~rr~l~~~~e~l~~~rN 52 (110)
T d1seta1 29 ALLALDREVQELKKRLQEVQTERN 52 (110)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 344445555555555555555443
No 7
>d1fxka_ a.2.5.1 (A:) Prefoldin beta subunit {Archaeon Methanobacterium thermoautotrophicum [TaxId: 145262]}
Probab=28.31 E-value=1.5e+02 Score=24.84 Aligned_cols=84 Identities=12% Similarity=0.230 Sum_probs=0.0
Q ss_pred HhhhhhhHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------------hhhhhHHHHHHHHHHHHH
Q 002095 859 LRQKEGELASYMSRLASMESIRDSLAEELVKMTAQCEKLRAEA-------------------AILPGIQAELDALRRRHS 919 (967)
Q Consensus 859 LRrrEGEla~Lq~ELarLes~Rd~L~eELVrLt~EnEel~~e~-------------------~~v~~Le~eleeLqqRYe 919 (967)
|...-..+..++.++..+..++..+..++-....-.+++..-. .-++.|...++-|+.+..
T Consensus 3 lqe~~~~~q~lq~el~~~~~q~~~le~q~~E~~~vl~eL~~l~~d~~vyk~vG~vLv~~~~~e~~~~l~~~~e~l~~~i~ 82 (107)
T d1fxka_ 3 VQHQLAQFQQLQQQAQAISVQKQTVEMQINETQKALEELSRAADDAEVYKSSGNILIRVAKDELTEELQEKLETLQLREK 82 (107)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCTTCCEEEEETTEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCcccHHHHHhcchhhcCcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q ss_pred HHHHHhccchhHHHHHHHhHHHH
Q 002095 920 AALELMGERDEELEELRADIMDL 942 (967)
Q Consensus 920 TlLELLGEKsEeVEELraDV~DV 942 (967)
++=.-+....++.++|+..|..+
T Consensus 83 ~l~~q~~~l~~~l~~~~~~l~~~ 105 (107)
T d1fxka_ 83 TIERQEERVMKKLQEMQVNIQEA 105 (107)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
No 8
>d1hcia4 a.7.1.1 (A:633-746) alpha-actinin {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=27.53 E-value=1.2e+02 Score=25.04 Aligned_cols=65 Identities=11% Similarity=0.165 Sum_probs=49.5
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccCCcCchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 002095 589 REDMLRRDIEDLQRRYQASERRCEELVTQVPESTRPLLRQIEAIQETTARRAEAWAAVERSLNLRLQEAEAK 660 (967)
Q Consensus 589 rEeeLR~EIs~Le~RLEeaEsRaEELSssvseATrPLLRQIEtLQ~q~asqsenWe~iE~sL~~RL~elE~k 660 (967)
+-..|..+|...+.++.......+.|....+....-+-..++.| ...|+.+-..+..|...++.+
T Consensus 45 ~h~~~e~el~~~~~~i~~l~~~g~~L~~~~~~~~~~i~~~~~~L-------~~~W~~L~~~~~~R~~~Le~~ 109 (114)
T d1hcia4 45 QLKQYEHNIINYKNNIDKLEGDHQLIQEALVFDNKHTNYTMEHI-------RVGWELLLTTIARTINEVETQ 109 (114)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCCCTTCSCHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCchHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 34568899999999999999999999887655544454555444 456888888888888877765
No 9
>d1cuna2 a.7.1.1 (A:116-219) Spectrin alpha chain {Chicken (Gallus gallus) [TaxId: 9031]}
Probab=23.73 E-value=1e+02 Score=24.78 Aligned_cols=65 Identities=15% Similarity=0.216 Sum_probs=35.6
Q ss_pred HHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-hhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccchhHHH
Q 002095 869 YMSRLASMESIRDSLAEELVKMTAQCEKLRAEA-AILPGIQAELDALRRRHSAALELMGERDEELE 933 (967)
Q Consensus 869 Lq~ELarLes~Rd~L~eELVrLt~EnEel~~e~-~~v~~Le~eleeLqqRYeTlLELLGEKsEeVE 933 (967)
+......++..-..-..-+-.|....+.+.... -..+.++..+.+|+.+|+.+.+.+-++-..++
T Consensus 35 ll~~h~~~~~ei~~~~~~~~~l~~~g~~L~~~~~~~~~~I~~~~~~l~~~w~~L~~~~~~R~~~Le 100 (104)
T d1cuna2 35 LLKKHEAFETDFTVHKDRVNDVCANGEDLIKKNNHHVENITAKMKGLKGKVSDLEKAAAQRKAKLD 100 (104)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHcCCccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 334444455555544445555555444444332 11345677777777777777777666555544
No 10
>d1s35a2 a.7.1.1 (A:1169-1273) Spectrin beta chain {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=22.27 E-value=1.5e+02 Score=23.74 Aligned_cols=69 Identities=14% Similarity=0.160 Sum_probs=0.0
Q ss_pred HHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-hhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccchhHHHH
Q 002095 866 LASYMSRLASMESIRDSLAEELVKMTAQCEKLRAEA-AILPGIQAELDALRRRHSAALELMGERDEELEE 934 (967)
Q Consensus 866 la~Lq~ELarLes~Rd~L~eELVrLt~EnEel~~e~-~~v~~Le~eleeLqqRYeTlLELLGEKsEeVEE 934 (967)
+..+......|+..-..-..-|..|....+.+-... -....++..+..|+.||+.++++..++-...++
T Consensus 35 v~~l~k~h~~l~~~l~~~~~~v~~l~~~a~~L~~~~~~~~~~I~~~~~~l~~rw~~l~~~~~~r~~~L~d 104 (105)
T d1s35a2 35 AEAGIRKFEDFLGSMENNRDKVLSPVDSGNKLVAEGNLYSDKIKEKVQLIEDRHRKNNEKAQEASVLLRD 104 (105)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHhhcCCCcchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccC
No 11
>d2a26a1 a.2.16.1 (A:1-47) Calcyclin-binding protein, CacyBP {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=20.11 E-value=27 Score=26.17 Aligned_cols=15 Identities=33% Similarity=0.541 Sum_probs=13.2
Q ss_pred HHHHHHhHHHHHHHH
Q 002095 932 LEELRADIMDLKEMY 946 (967)
Q Consensus 932 VEELraDV~DVKeMY 946 (967)
.|||+.|+++||.+.
T Consensus 3 ~eElqkDLeEvk~LL 17 (47)
T d2a26a1 3 SEELQKDLEEVKVLL 17 (47)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHhhHHHHHHHH
Confidence 389999999999876
Done!