Query 006092
Match_columns 661
No_of_seqs 200 out of 280
Neff 5.5
Searched_HMMs 13730
Date Mon Mar 25 15:43:41 2013
Command hhsearch -i /work/01045/syshi/csienesis_hhblits_a3m/006092.a3m -d /work/01045/syshi/HHdatabase/scop70.hhm -o /work/01045/syshi/hhsearch_scop/006092hhsearch_scop -cpu 12 -v 0
No Hit Prob E-value P-value Score SS Cols Query HMM Template HMM
1 d1urua_ a.238.1.1 (A:) Amphiph 96.5 0.16 1.1E-05 46.4 20.8 193 437-648 17-212 (217)
2 d2efla1 a.238.1.4 (A:1-288) Fo 94.5 2 0.00014 40.1 21.2 176 451-636 28-226 (288)
3 d2elba1 a.238.1.1 (A:6-273) DC 93.4 3.2 0.00023 39.0 24.2 146 437-607 14-183 (268)
4 d1i4da_ a.238.1.2 (A:) Arfapti 93.0 2.8 0.0002 37.0 20.6 176 440-638 21-199 (200)
5 d2efka1 a.238.1.4 (A:10-288) C 88.5 9.2 0.00067 35.1 20.5 53 583-635 164-216 (279)
6 d2d4ca1 a.238.1.1 (A:11-247) E 70.4 35 0.0026 30.2 20.3 88 539-645 148-235 (237)
7 d1i4da_ a.238.1.2 (A:) Arfapti 68.8 8.7 0.00063 33.5 8.9 85 321-405 105-192 (200)
8 d1urua_ a.238.1.1 (A:) Amphiph 62.9 40 0.0029 29.2 12.4 101 306-413 93-203 (217)
9 d2j9ua1 a.24.28.1 (A:148-241) 55.0 8.2 0.00059 31.6 5.2 78 371-457 14-92 (94)
10 d1y2oa1 a.238.1.3 (A:1-248) BA 54.5 75 0.0055 28.6 21.6 32 615-646 197-228 (248)
11 d1y2oa1 a.238.1.3 (A:1-248) BA 32.5 1.6E+02 0.012 26.1 23.3 45 598-642 173-217 (248)
12 d1eo0a_ a.48.3.1 (A:) Transcri 30.6 28 0.0021 27.1 4.6 53 354-407 21-75 (77)
13 d1bu2a2 a.74.1.1 (A:149-250) V 24.9 11 0.00079 29.9 1.1 14 386-399 18-31 (102)
No 1
>d1urua_ a.238.1.1 (A:) Amphiphysin {Fruit fly (Drosophila melanogaster) [TaxId: 7227]}
Probab=96.53 E-value=0.16 Score=46.35 Aligned_cols=193 Identities=13% Similarity=0.116 Sum_probs=112.2
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhccccCCCCCCC---CChHHHHHHHHHHhhccCChHHHHH
Q 006092 437 HHQATAQLEAEVTSWYNSFCKLTKFQRDYVRTLSGWIKLTECLVDEHQRSNC---SSTIRRLCENWQLVFDKLPEKVASE 513 (661)
Q Consensus 437 h~~at~qLe~el~~W~~sF~~~i~~Qk~Yv~aLn~WL~~~~~~~~~~~~~~~---~ppIf~lc~~W~~~ld~lp~~~v~~ 513 (661)
+.+....++..+...+..+.+|+++.+.+..+...+-.-. ..... +.... .-.++..|......+...=...|++
T Consensus 17 ~~~~~~~~e~~l~~l~k~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l-~~l~~-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~ 94 (217)
T d1urua_ 17 HLNNFNRQQASANRLQKEFNNYIRCVRAAQAASKTLMDSV-CEIYE-PQWSGYDALQAQTGASESLWADFAHKLGDQVLI 94 (217)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHSC-TTSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHhc-cCcchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 4445566777777777777777777777777777665532 11111 11111 1122223333222222111234566
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhccccCCCCCCCCCCCChhhhhHHHHHHHHHHH
Q 006092 514 AINSFLSAIHAIFLQQIEERKLHKKIDRLEKRLQKEFNSMAEMEQRFEGNFAVGVEHPELSPKHPLILKAAKVEALKKRV 593 (661)
Q Consensus 514 aIk~f~~~v~~i~~~Q~eE~~~k~k~e~~~kelekk~~~l~~~e~k~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~kr~~le~lrkrl 593 (661)
-++.|...+..+ .+..++.+....++++-...+.....+...... ...+..-..+++..++..
T Consensus 95 pL~~~~~~~~~~-------~~~~kkr~~~~~dyd~~~~~l~k~~~k~~~~~~----------~~~l~~~e~~~~~a~~~f 157 (217)
T d1urua_ 95 PLNTYTGQFPEM-------KKKVEKRNRKLIDYDGQRHSFQNLQANANKRKD----------DVKLTKGREQLEEARRTY 157 (217)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTCBTTB----------CCTTTTCHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHhHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccccccc----------hhhhHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 666665544333 112233455556777766666665544322110 011222234677777777
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHhh
Q 006092 594 ESEKAKYLNAARITQAMTLNNLKTSLPNVFQALMGFSNASAKAFEALHSHIKVAA 648 (661)
Q Consensus 594 e~e~~~~~~~~~~tr~~tl~~Lq~gLp~vF~al~~Fs~~~~~aye~l~~~~~~~~ 648 (661)
+.-...+..-+.........-+...|...+.+...|-..+.+.|++|....++..
T Consensus 158 e~~~~~l~~el~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~q~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~l~ 212 (217)
T d1urua_ 158 EILNTELHDELPALYDSRILFLVTNLQTLFATEQVFHNETAKIYSELEAIVDKLA 212 (217)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhH
Confidence 7777777666777777777888999999999999999999999999988776644
No 2
>d2efla1 a.238.1.4 (A:1-288) Formin-binding protein 1, FNBP1 {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=94.46 E-value=2 Score=40.13 Aligned_cols=176 Identities=12% Similarity=0.154 Sum_probs=89.7
Q ss_pred HHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhccccCCCCCCCCChHHHHHHHHHHhhccCChHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhH
Q 006092 451 WYNSFCKLTKFQRDYVRTLSGWIKLTECLVDEHQRSNCSSTIRRLCENWQLVFDKLPEKVASEAINSFLSAIHAIFLQQI 530 (661)
Q Consensus 451 W~~sF~~~i~~Qk~Yv~aLn~WL~~~~~~~~~~~~~~~~ppIf~lc~~W~~~ld~lp~~~v~~aIk~f~~~v~~i~~~Q~ 530 (661)
...-|..-+...+.|.+.|..+-+........ ....+....++..|...++.+ .........|+..|..-+.+.-
T Consensus 28 ~~~~~~eRa~iE~eYak~L~kl~~~~~~~~~~---~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~--~~~a~~h~~~a~~l~~~i~~~l 102 (288)
T d2efla1 28 YIKFVKERTEIELSYAKQLRNLSKKYQPKKNS---KEEEEYKYTSCKAFISNLNEM--NDYAGQHEVISENMASQIIVDL 102 (288)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCC----------CTTSHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhccc---cccccccCcHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 44556677788999999999998754321111 111344557788898877643 3444455555555533222211
Q ss_pred ----HHH-HHhhhh----hHHHHHHHHHHHHHHHHHHhh--------------hccccCCCCCCCCCCCChhhhhHHHHH
Q 006092 531 ----EER-KLHKKI----DRLEKRLQKEFNSMAEMEQRF--------------EGNFAVGVEHPELSPKHPLILKAAKVE 587 (661)
Q Consensus 531 ----eE~-~~k~k~----e~~~kelekk~~~l~~~e~k~--------------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~kr~~le 587 (661)
.++ +.++++ ..+.+++.+....+.....+| ..... ... .....+...+..++
T Consensus 103 ~~~~~~~~~~~K~~~~~~~k~~k~~~~~~~~l~k~k~~Y~~~~~e~e~~~~~~~~~~~----~~~-~~~~~~~K~~~k~~ 177 (288)
T d2efla1 103 ARYVQELKQERKSNFHDGRKAQQHIETCWKQLESSKRRFERDCKEADRAQQYFEKMDA----DIN-VTKADVEKARQQAQ 177 (288)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----CTT-SCHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhcc----ccc-cchHHHHHHHHHHH
Confidence 111 111111 222233333333333332222 11110 000 01122333445667
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 006092 588 ALKKRVESEKAKYLNAARITQAMTLNNLKTSLPNVFQALMGFSNASAKA 636 (661)
Q Consensus 588 ~lrkrle~e~~~~~~~~~~tr~~tl~~Lq~gLp~vF~al~~Fs~~~~~a 636 (661)
..+.+++.....|...+..++..--.-....+|.+|+.|..|-......
T Consensus 178 ~~~~~~~~a~~~Y~~~v~~~n~~~~~~~~~~~~~~~~~~q~~e~~r~~~ 226 (288)
T d2efla1 178 IRHQMAEDSKADYSSILQKFNHEQHEYYHTHIPNIFQKIQEMEERRIVR 226 (288)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 7777777778888888877766555556677888887775544444333
No 3
>d2elba1 a.238.1.1 (A:6-273) DCC-interacting protein 13-alpha, APPL1 {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=93.42 E-value=3.2 Score=38.96 Aligned_cols=146 Identities=13% Similarity=0.055 Sum_probs=70.6
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHhhhccccCCCCCCCCChHHHHHHHHHHhhccCChH
Q 006092 437 HHQATAQLEAEVTSWYNSFCKLTKFQRDYVRTLSGW-------IKLTECLVDEHQRSNCSSTIRRLCENWQLVFDKLPEK 509 (661)
Q Consensus 437 h~~at~qLe~el~~W~~sF~~~i~~Qk~Yv~aLn~W-------L~~~~~~~~~~~~~~~~ppIf~lc~~W~~~ld~lp~~ 509 (661)
=|.....+|.++........++++.-+.|+.+++.- .. ++..+... ....+. .+.
T Consensus 14 FRa~l~~~E~~~~~l~~~l~kl~k~~~~~~~~~~~~~~~~~~f~~-~L~~~~~~-----~~~~~~------------dd~ 75 (268)
T d2elba1 14 TRSLLGVFEEDATAISNYMNQLYQAMHRIYDAQNELSAATHLTSK-LLKEYEKQ-----RFPLGG------------DDE 75 (268)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHTTGGGS-----CCC-----------------C
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHhhhh-----cccccC------------CcH
Confidence 455666666666666666666666666666555433 32 11111100 000000 123
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHH----------------hhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhccccCCCCCCCC
Q 006092 510 VASEAINSFLSAIHAIFLQQIEERKL----------------HKKIDRLEKRLQKEFNSMAEMEQRFEGNFAVGVEHPEL 573 (661)
Q Consensus 510 ~v~~aIk~f~~~v~~i~~~Q~eE~~~----------------k~k~e~~~kelekk~~~l~~~e~k~~~~~~~~~~~~~~ 573 (661)
.+..+++.|+..++.|+.....-..+ -+.+..+.|.|++....++.+..||..... .
T Consensus 76 ~~~~~l~~f~~~~~el~~~~~~l~~~~~~~~~~pL~~f~~~di~~~ke~kk~fek~~~~yd~~l~k~~~~~k-------~ 148 (268)
T d2elba1 76 VMSSTLQQFSKVIDELSSCHAVLSTQLADAMMFPITQFKERDLKEILTLKEVFQIASNDHDAAINRYSRLSK-------K 148 (268)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCCC-------C
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcc-------c
Confidence 34556666666665555432211110 023346678888888888888888864321 0
Q ss_pred CCCC-hhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 006092 574 SPKH-PLILKAAKVEALKKRVESEKAKYLNAARIT 607 (661)
Q Consensus 574 ~~~~-~~~~kr~~le~lrkrle~e~~~~~~~~~~t 607 (661)
...+ ...+--..|...|+..+...-.|...+...
T Consensus 149 k~~~~~~~Ea~~~l~~~r~~f~~~~~d~~~~l~~l 183 (268)
T d2elba1 149 RENDKVKYEVTEDVYTSRKKQHQTMMHYFCALNTL 183 (268)
T ss_dssp -----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred CCcchhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 0001 122223346666666666555554444433
No 4
>d1i4da_ a.238.1.2 (A:) Arfaptin, Rac-binding fragment {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=92.99 E-value=2.8 Score=36.99 Aligned_cols=176 Identities=12% Similarity=0.058 Sum_probs=85.7
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhccccCCCCCCCCChHHHHHHHH---HHhhccCChHHHHHHHH
Q 006092 440 ATAQLEAEVTSWYNSFCKLTKFQRDYVRTLSGWIKLTECLVDEHQRSNCSSTIRRLCENW---QLVFDKLPEKVASEAIN 516 (661)
Q Consensus 440 at~qLe~el~~W~~sF~~~i~~Qk~Yv~aLn~WL~~~~~~~~~~~~~~~~ppIf~lc~~W---~~~ld~lp~~~v~~aIk 516 (661)
.+..|...+..+..++..++.+|..+..+|+.+-.. .|++...+..- ...++..- ......+.
T Consensus 21 ~~~~l~k~~k~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~-------------~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~ 86 (200)
T d1i4da_ 21 KYESVLQLGRALTAHLYSLLQTQHALGDAFADLSQK-------------SPELQEEFGYNAETQKLLCKNG-ETLLGAVN 86 (200)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT-------------CGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCC-------------CCchHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHH
Confidence 456677778888888888888888888888776431 12222222222 22333322 22345556
Q ss_pred HHHHHHHHHHHhhHHHHHHhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhccccCCCCCCCCCCCChhhhhHHHHHHHHHHHHHH
Q 006092 517 SFLSAIHAIFLQQIEERKLHKKIDRLEKRLQKEFNSMAEMEQRFEGNFAVGVEHPELSPKHPLILKAAKVEALKKRVESE 596 (661)
Q Consensus 517 ~f~~~v~~i~~~Q~eE~~~k~k~e~~~kelekk~~~l~~~e~k~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~kr~~le~lrkrle~e 596 (661)
.++..+..++...-.+.+ .+.|.++++...++....++...+....+.... .-+.+=..+++..+.+.+..
T Consensus 87 ~~~~~l~~~~~~~~~~~~------~~~kk~~~~~~dyd~~~~k~~~~~~~~~~~~~~---~kl~~ae~~~~~a~~~fe~~ 157 (200)
T d1i4da_ 87 FFVSSINTLVTKTMEDTL------MTVKQYEAARLEYDAYRTDLEELSLGPRDAGTR---GRLESAQATFQAHRDKYEKL 157 (200)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHTHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC---------------CHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHhhHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHhhcccccchh---hhHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 666666666555543332 233444444444444444443221100000000 01111122344444444444
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 006092 597 KAKYLNAARITQAMTLNNLKTSLPNVFQALMGFSNASAKAFE 638 (661)
Q Consensus 597 ~~~~~~~~~~tr~~tl~~Lq~gLp~vF~al~~Fs~~~~~aye 638 (661)
...+..-+......-...+...|-...+++..|-..|.++++
T Consensus 158 ~~~~~~~l~~l~~~r~~~~~~~l~~~~~~~~~f~~~~~~~le 199 (200)
T d1i4da_ 158 RGDVAIKLKFLEENKIKVMHKQLLLFHNAVSAYFAGNQKQLE 199 (200)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhc
Confidence 444444444444444455566666677777777777766654
No 5
>d2efka1 a.238.1.4 (A:10-288) CDC42-interacting protein 4, CIP4 {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=88.47 E-value=9.2 Score=35.08 Aligned_cols=53 Identities=13% Similarity=0.184 Sum_probs=31.8
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhCCHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 006092 583 AAKVEALKKRVESEKAKYLNAARITQAMTLNNLKTSLPNVFQALMGFSNASAK 635 (661)
Q Consensus 583 r~~le~lrkrle~e~~~~~~~~~~tr~~tl~~Lq~gLp~vF~al~~Fs~~~~~ 635 (661)
+.+++..+++++..+..|...+..++...-.-...-+|.+|+.|..+-..+..
T Consensus 164 ~~~~~~~~~~~~~~~~~y~~~l~~~n~~~~~~~~~~~p~~l~~lq~~e~~r~~ 216 (279)
T d2efka1 164 KQQAHLRSHMAEESKNEYAAQLQRFNRDQAHFYFSQMPQIFDKLQDMDERRAT 216 (279)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 34556666667777777777776666554444456667776666555444333
No 6
>d2d4ca1 a.238.1.1 (A:11-247) Endophilin-1 {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=70.39 E-value=35 Score=30.19 Aligned_cols=88 Identities=9% Similarity=0.135 Sum_probs=59.5
Q ss_pred hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhccccCCCCCCCCCCCChhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhC
Q 006092 539 IDRLEKRLQKEFNSMAEMEQRFEGNFAVGVEHPELSPKHPLILKAAKVEALKKRVESEKAKYLNAARITQAMTLNNLKTS 618 (661)
Q Consensus 539 ~e~~~kelekk~~~l~~~e~k~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~kr~~le~lrkrle~e~~~~~~~~~~tr~~tl~~Lq~g 618 (661)
....+|.+++....++....+.... .+..++..+.+++.....+...+....+.-...+. .
T Consensus 148 ~~~~rk~~d~~~~~~~~~~~k~~~~------------------~~e~l~~a~~~~e~~~~~~~~~l~~l~~~~~~~~~-~ 208 (237)
T d2d4ca1 148 LQHHLKKLEGRRLDFDYKKKRQGKI------------------PDEELRQALEKFDESKEIAESSMFNLLEMDIEQVS-Q 208 (237)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSC------------------CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-H
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhh------------------hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHH-H
Confidence 3455667777777776665554211 13466777777777777776666666554444453 5
Q ss_pred CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHH
Q 006092 619 LPNVFQALMGFSNASAKAFEALHSHIK 645 (661)
Q Consensus 619 Lp~vF~al~~Fs~~~~~aye~l~~~~~ 645 (661)
|-..++|-..|-..|.+.+++|....+
T Consensus 209 l~~~~~aq~~y~~~~~~~l~~l~~~l~ 235 (237)
T d2d4ca1 209 LSALVQAQLEYHKQAVQILQQVTVRLE 235 (237)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh
Confidence 788999999999999999999876543
No 7
>d1i4da_ a.238.1.2 (A:) Arfaptin, Rac-binding fragment {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=68.81 E-value=8.7 Score=33.48 Aligned_cols=85 Identities=11% Similarity=0.080 Sum_probs=51.0
Q ss_pred HHHHhhhhhHHHHHHHHHHHhhhhhc---CCchhhhHHHHHHHHhhhhhHHHHHhhHHHHHhhhcccccchhhhHHHHHH
Q 006092 321 KEVKEEERTKVEHEKKSMILQKQDEE---NHDWTKIEKIRLSVDSLEVDIRRLQHSISETCSSILNVIDEELYPQLATLI 397 (661)
Q Consensus 321 ~EVKa~E~~r~~yekK~~~Lr~~d~r---g~~~~~idkTra~Vk~L~tri~Vaiq~vdsis~~I~kLRDeEL~PQL~eLi 397 (661)
+-+|..+..+.+||+.+..|.++..+ +....+++++...+.....++.-.-.-+-.--..++.=|-.++-++|..++
T Consensus 105 ~~~kk~~~~~~dyd~~~~k~~~~~~~~~~~~~~~kl~~ae~~~~~a~~~fe~~~~~~~~~l~~l~~~r~~~~~~~l~~~~ 184 (200)
T d1i4da_ 105 MTVKQYEAARLEYDAYRTDLEELSLGPRDAGTRGRLESAQATFQAHRDKYEKLRGDVAIKLKFLEENKIKVMHKQLLLFH 184 (200)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC------------CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHhhcccccchhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHHH
Confidence 33467788999999999888766433 244456666666666666665544443333333444445577888888888
Q ss_pred HHHHHHHH
Q 006092 398 SGLMRMWR 405 (661)
Q Consensus 398 ~GL~~MWk 405 (661)
+.+..-|.
T Consensus 185 ~~~~~f~~ 192 (200)
T d1i4da_ 185 NAVSAYFA 192 (200)
T ss_dssp HHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHH
Confidence 88776654
No 8
>d1urua_ a.238.1.1 (A:) Amphiphysin {Fruit fly (Drosophila melanogaster) [TaxId: 7227]}
Probab=62.86 E-value=40 Score=29.22 Aligned_cols=101 Identities=13% Similarity=0.137 Sum_probs=67.0
Q ss_pred hhhHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHHHHHHHHHhhhhhcCCc----------hhhhHHHHHHHHhhhhhHHHHHhhHH
Q 006092 306 CITLAKLYATEQKLYKEVKEEERTKVEHEKKSMILQKQDEENHD----------WTKIEKIRLSVDSLEVDIRRLQHSIS 375 (661)
Q Consensus 306 ssTLdkLyaWEKKLY~EVKa~E~~r~~yekK~~~Lr~~d~rg~~----------~~~idkTra~Vk~L~tri~Vaiq~vd 375 (661)
...|..+..==+...+-+|..+..++.|++-...|.++..++.. ..+++.+|..-..+...+...+..+.
T Consensus 93 ~~pL~~~~~~~~~~~~~~kkr~~~~~dyd~~~~~l~k~~~k~~~~~~~~~l~~~e~~~~~a~~~fe~~~~~l~~el~~~~ 172 (217)
T d1urua_ 93 LIPLNTYTGQFPEMKKKVEKRNRKLIDYDGQRHSFQNLQANANKRKDDVKLTKGREQLEEARRTYEILNTELHDELPALY 172 (217)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTCBTTBCCTTTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccccccchhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 45555554322334555667899999999988887776555432 24566666666677777776666655
Q ss_pred HHHhhhcccccchhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 006092 376 ETCSSILNVIDEELYPQLATLISGLMRMWRKMYECLQV 413 (661)
Q Consensus 376 sis~~I~kLRDeEL~PQL~eLi~GL~~MWk~M~ecH~~ 413 (661)
. .|-..+-+.|..++.......+.+++.++.
T Consensus 173 ~-------~~~~~~~~~l~~~~~~q~~~~~~~~~~~~~ 203 (217)
T d1urua_ 173 D-------SRILFLVTNLQTLFATEQVFHNETAKIYSE 203 (217)
T ss_dssp H-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred H-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 3 455778888888888877777777665543
No 9
>d2j9ua1 a.24.28.1 (A:148-241) Vacuolar protein sorting-associated protein 28, VPS28 {Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]}
Probab=55.01 E-value=8.2 Score=31.59 Aligned_cols=78 Identities=18% Similarity=0.159 Sum_probs=44.8
Q ss_pred HhhHHHHHhhhcccccchhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccCCCCCCCC-CchhHHHHHHHHHHHHH
Q 006092 371 QHSISETCSSILNVIDEELYPQLATLISGLMRMWRKMYECLQVQNHISQRLNHVTDNQSMDF-TTDYHHQATAQLEAEVT 449 (661)
Q Consensus 371 iq~vdsis~~I~kLRDeEL~PQL~eLi~GL~~MWk~M~ecH~~Q~~ii~~~~~l~~~~~~~~-~s~~h~~at~qLe~el~ 449 (661)
|..||++--.|.-. ++|+|-|-+|+.+|.++=....|+..+ +++=+..|+.....+. +.+.-| ||.-.|.
T Consensus 14 IT~mDaLkL~~~a~--DqLhPlL~dL~~slnrl~~~dfegk~k---v~~Wl~~Ln~M~AsdeL~e~q~R----q~lfDle 84 (94)
T d2j9ua1 14 ITVMDALKLNYNAK--DQLHPLLAELLISINRVTRDDFENRSK---LIDWIVRINKLSIGDTLTETQIR----ELLFDLE 84 (94)
T ss_dssp HHHHHHHHTTCCBH--HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCTTHHH---HHHHHHHHHTSCTTCBCCHHHHH----HHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHhhcCcch--hhhchhHHHHHHHHHhcCccccchHHH---HHHHHHHHhCCchhhhcCHHHHH----HHHHHHH
Confidence 34566665555544 799999999999999974333444432 3333333444444444 344444 5555555
Q ss_pred HHHHhHHH
Q 006092 450 SWYNSFCK 457 (661)
Q Consensus 450 ~W~~sF~~ 457 (661)
.=|.+|..
T Consensus 85 ~aY~~F~~ 92 (94)
T d2j9ua1 85 LAYKSFYA 92 (94)
T ss_dssp HHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHH
Confidence 55555554
No 10
>d1y2oa1 a.238.1.3 (A:1-248) BAP2/IRSp53 N-terminal domain {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=54.46 E-value=75 Score=28.59 Aligned_cols=32 Identities=6% Similarity=-0.027 Sum_probs=25.1
Q ss_pred hhhCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHH
Q 006092 615 LKTSLPNVFQALMGFSNASAKAFEALHSHIKV 646 (661)
Q Consensus 615 Lq~gLp~vF~al~~Fs~~~~~aye~l~~~~~~ 646 (661)
|=..|-.+|++...|-..+.+.|+++......
T Consensus 197 lv~~l~~~~~a~~~~~~q~~~~l~~~~~~~~~ 228 (248)
T d1y2oa1 197 LVEKQCAVAKNSAAYHSKGKELLAQKLPLWQQ 228 (248)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHH
Confidence 34567788999999999999999888776544
No 11
>d1y2oa1 a.238.1.3 (A:1-248) BAP2/IRSp53 N-terminal domain {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=32.45 E-value=1.6e+02 Score=26.09 Aligned_cols=45 Identities=9% Similarity=-0.034 Sum_probs=26.0
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHhhhhhhhhCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 006092 598 AKYLNAARITQAMTLNNLKTSLPNVFQALMGFSNASAKAFEALHS 642 (661)
Q Consensus 598 ~~~~~~~~~tr~~tl~~Lq~gLp~vF~al~~Fs~~~~~aye~l~~ 642 (661)
..|...+...-...+.--+..+--+.+.|-.|..+.+..|...+.
T Consensus 173 ~~~~~~l~~~~~~~~~eerkr~~~lv~~l~~~~~a~~~~~~q~~~ 217 (248)
T d1y2oa1 173 GELENYVSDGYKTALTEERRRFCFLVEKQCAVAKNSAAYHSKGKE 217 (248)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 334444444333333444555555567788888888777776654
No 12
>d1eo0a_ a.48.3.1 (A:) Transcription elongation factor TFIIS N-domain {Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]}
Probab=30.59 E-value=28 Score=27.08 Aligned_cols=53 Identities=6% Similarity=0.157 Sum_probs=40.5
Q ss_pred HHHHHHHHhhhhhH--HHHHhhHHHHHhhhcccccchhhhHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 006092 354 EKIRLSVDSLEVDI--RRLQHSISETCSSILNVIDEELYPQLATLISGLMRMWRKM 407 (661)
Q Consensus 354 dkTra~Vk~L~tri--~Vaiq~vdsis~~I~kLRDeEL~PQL~eLi~GL~~MWk~M 407 (661)
+..-.+++.|...+ .+.+=.--.|-..+++||-- =-|++-.|...|..-||.|
T Consensus 21 ~~~l~~L~~L~~~~~it~d~L~~T~iG~~Vn~LRkh-~~~~v~~lAk~Lv~~WK~~ 75 (77)
T d1eo0a_ 21 AAVLEILHVLDKEFVPTEKLLRETKVGVEVNKFKKS-TNVEISKLVKKMISSWKDA 75 (77)
T ss_dssp HHHHHHHHHHTTTCSCSTTHHHHHHHHHHHHHCCSS-SCTTHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHhcCCCcHHHHHHCCccHHHHHHhcC-CcHHHHHHHHHHHHHHHHh
Confidence 34455788888754 44555556678999999964 3699999999999999986
No 13
>d1bu2a2 a.74.1.1 (A:149-250) Viral cyclin {Herpesvirus saimiri [TaxId: 10381]}
Probab=24.94 E-value=11 Score=29.92 Aligned_cols=14 Identities=43% Similarity=0.591 Sum_probs=11.7
Q ss_pred cchhhhHHHHHHHH
Q 006092 386 DEELYPQLATLISG 399 (661)
Q Consensus 386 DeEL~PQL~eLi~G 399 (661)
-|||||||.|+..-
T Consensus 18 pe~~wpql~e~~s~ 31 (102)
T d1bu2a2 18 PEDLWPQLYEAAST 31 (102)
T ss_dssp CTTSHHHHHHHHHH
T ss_pred cHHHhHHHHHHHHH
Confidence 48999999998754
Done!