Query 006784
Match_columns 631
No_of_seqs 37 out of 39
Neff 3.0
Searched_HMMs 13730
Date Mon Mar 25 08:53:14 2013
Command hhsearch -i /work/01045/syshi/csienesis_hhblits_a3m/006784.a3m -d /work/01045/syshi/HHdatabase/scop70.hhm -o /work/01045/syshi/hhsearch_scop/006784hhsearch_scop -cpu 12 -v 0
No Hit Prob E-value P-value Score SS Cols Query HMM Template HMM
1 d1fxka_ a.2.5.1 (A:) Prefoldin 53.0 25 0.0018 28.1 8.0 46 332-377 61-106 (107)
2 d1urfa_ a.2.6.1 (A:) Protein k 30.0 1.2E+02 0.0087 23.8 10.0 64 412-478 8-75 (81)
3 d1seta1 a.2.7.1 (A:1-110) Sery 25.9 1.4E+02 0.01 23.3 8.7 38 341-378 62-99 (110)
4 d1fxkc_ a.2.5.1 (C:) Prefoldin 20.3 1.9E+02 0.014 22.8 11.1 47 331-377 83-129 (133)
5 d1hcia4 a.7.1.1 (A:633-746) al 20.0 1.7E+02 0.013 22.1 11.2 65 501-566 40-108 (114)
6 d1s35a1 a.7.1.1 (A:1063-1168) 18.4 1.7E+02 0.012 21.4 9.3 67 500-566 34-104 (106)
7 d1qvra2 c.37.1.20 (A:149-535) 17.2 4E+02 0.029 25.1 11.8 101 246-355 230-332 (387)
8 d1u5pa2 a.7.1.1 (A:1772-1872) 15.6 2E+02 0.014 20.8 8.6 63 502-565 35-101 (101)
9 d2spca_ a.7.1.1 (A:) Spectrin 15.0 2.1E+02 0.015 20.8 9.2 65 500-565 38-106 (107)
10 d2oa5a1 d.362.1.1 (A:7-102) Un 14.9 87 0.0063 25.7 4.5 54 514-567 4-83 (96)
No 1
>d1fxka_ a.2.5.1 (A:) Prefoldin beta subunit {Archaeon Methanobacterium thermoautotrophicum [TaxId: 145262]}
Probab=53.00 E-value=25 Score=28.06 Aligned_cols=46 Identities=20% Similarity=0.231 Sum_probs=36.0
Q ss_pred hhHHHHHhcccchhHHHHHHHHHHHHHHHhhHhHHHHHHhhhhHhh
Q 006784 332 SNLAEALAAKNSEIETLVSSIDALKKQAALSEGNLASLQMNMESIM 377 (631)
Q Consensus 332 sdlteAlaAKdSqLavLkvrLdeadq~l~~~~~~LeelQ~e~~RIm 377 (631)
.+..+++..-+..++.|..++...+.+....+..+.+++......|
T Consensus 61 ~~~~e~~~~l~~~~e~l~~~i~~l~~q~~~l~~~l~~~~~~l~~~~ 106 (107)
T d1fxka_ 61 VAKDELTEELQEKLETLQLREKTIERQEERVMKKLQEMQVNIQEAM 106 (107)
T ss_dssp ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTC
T ss_pred CcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh
Confidence 5677787777788888888888888888888888888877665544
No 2
>d1urfa_ a.2.6.1 (A:) Protein kinase c-like 1, pkn/prk1 {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=30.00 E-value=1.2e+02 Score=23.75 Aligned_cols=64 Identities=8% Similarity=0.119 Sum_probs=44.7
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhc
Q 006784 412 TKMAAMEREVELEHRAAEASMALARIQRIADE----RTAKAGELEQKVAMLEVECATLQQELQDMEARLKR 478 (631)
Q Consensus 412 tr~aamERE~eLE~q~aEastALa~aqR~~~E----~k~Ka~eLeqqv~~lka~~esl~QELqDyk~KA~R 478 (631)
.|++.++++-..|.++.+.+.-|..+ |.- .++-..+.++.+.....-++.|++.|..|.+-...
T Consensus 8 ~rl~~L~~~L~iE~kvkeGaEnm~k~---~~~~~~~DrK~l~eaq~~l~eS~~Ki~lLr~~L~~~~q~~~~ 75 (81)
T d1urfa_ 8 SRVAGLEKQLAIELKVKQGAENMIQT---YSNGSTKDRKLLLTAQQMLQDSKTKIDIIRMQLRRALQADQL 75 (81)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHSSSCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HccCCcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccc
Confidence 57778888888888887777774333 331 22334777888888888888888888888776543
No 3
>d1seta1 a.2.7.1 (A:1-110) Seryl-tRNA synthetase (SerRS) {Thermus thermophilus, strain hb27 [TaxId: 274]}
Probab=25.94 E-value=1.4e+02 Score=23.28 Aligned_cols=38 Identities=24% Similarity=0.269 Sum_probs=26.0
Q ss_pred ccchhHHHHHHHHHHHHHHHhhHhHHHHHHhhhhHhhh
Q 006784 341 KNSEIETLVSSIDALKKQAALSEGNLASLQMNMESIMR 378 (631)
Q Consensus 341 KdSqLavLkvrLdeadq~l~~~~~~LeelQ~e~~RImq 378 (631)
+......|..+..+....++..+..+.+++.+...+|-
T Consensus 62 ~~~~~~~l~~~~k~lk~~i~~le~~~~~~~~~l~~~ll 99 (110)
T d1seta1 62 PPEEKEALIARGKALGEEAKRLEEALREKEARLEALLL 99 (110)
T ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT
T ss_pred hccchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 34445566777777777777777777777777766653
No 4
>d1fxkc_ a.2.5.1 (C:) Prefoldin alpha subunit {Archaeon Methanobacterium thermoautotrophicum [TaxId: 145262]}
Probab=20.29 E-value=1.9e+02 Score=22.80 Aligned_cols=47 Identities=15% Similarity=0.256 Sum_probs=30.6
Q ss_pred hhhHHHHHhcccchhHHHHHHHHHHHHHHHhhHhHHHHHHhhhhHhh
Q 006784 331 ESNLAEALAAKNSEIETLVSSIDALKKQAALSEGNLASLQMNMESIM 377 (631)
Q Consensus 331 EsdlteAlaAKdSqLavLkvrLdeadq~l~~~~~~LeelQ~e~~RIm 377 (631)
|-++.+|+--=+..|..|...++.....+...+..+..++....+|+
T Consensus 83 E~~~~eA~~~l~~ri~~l~~~~~~l~~~~~~~~~~i~~l~~~~~~l~ 129 (133)
T d1fxkc_ 83 KKNFEDAMESIKSQKNELESTLQKMGENLRAITDIMMKLSPQAEELL 129 (133)
T ss_dssp EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred eecHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 36777777666666666666666666666666666666666666555
No 5
>d1hcia4 a.7.1.1 (A:633-746) alpha-actinin {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=19.98 E-value=1.7e+02 Score=22.11 Aligned_cols=65 Identities=9% Similarity=0.151 Sum_probs=47.7
Q ss_pred HHHHhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhh----hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 006784 501 ERARQGQRDAENKLSSLEAEVQKMRVEMAAMKRDAEHYS----REEHMELEKRYRELTDLLYYKQTQLET 566 (631)
Q Consensus 501 e~aR~~qreae~~lss~~aElq~lr~E~a~lkrda~~~s----rq~~~ELE~RlrELTdlLy~KQTqLEa 566 (631)
+.....+..++..|...+..++.+...-..|...- ++. .....+|..++..|-+.+-.+++.||.
T Consensus 40 e~~l~~h~~~e~el~~~~~~i~~l~~~g~~L~~~~-~~~~~~i~~~~~~L~~~W~~L~~~~~~R~~~Le~ 108 (114)
T d1hcia4 40 EDQMNQLKQYEHNIINYKNNIDKLEGDHQLIQEAL-VFDNKHTNYTMEHIRVGWELLLTTIARTINEVET 108 (114)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT-CCCCTTCSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcC-CchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 34445666788888888888888866655555433 322 246789999999999999999999874
No 6
>d1s35a1 a.7.1.1 (A:1063-1168) Spectrin beta chain {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=18.38 E-value=1.7e+02 Score=21.37 Aligned_cols=67 Identities=9% Similarity=0.125 Sum_probs=46.0
Q ss_pred HHHHHhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhh----hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 006784 500 VERARQGQRDAENKLSSLEAEVQKMRVEMAAMKRDAEHYSR----EEHMELEKRYRELTDLLYYKQTQLET 566 (631)
Q Consensus 500 ve~aR~~qreae~~lss~~aElq~lr~E~a~lkrda~~~sr----q~~~ELE~RlrELTdlLy~KQTqLEa 566 (631)
+......+.++...|...+..+..+...-..|-....+... .--..|..++..|.+++-.++..|+.
T Consensus 34 ~~~~l~~h~~l~~ei~~~~~~~~~~~~~g~~L~~~~~~~~~~~I~~~l~~L~~~w~~L~~~~~~R~~~Le~ 104 (106)
T d1s35a1 34 AEQLLQQHAGIKDEIDGHQDSYQRVKESGEKVIQGQTDPEYLLLGQRLEGLDTGWDALGRMWESRSHTLAQ 104 (106)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 44445566677778888888888776666666544332222 13367999999999999999888874
No 7
>d1qvra2 c.37.1.20 (A:149-535) ClpB, AAA+ modules {Thermus thermophilus [TaxId: 274]}
Probab=17.22 E-value=4e+02 Score=25.15 Aligned_cols=101 Identities=21% Similarity=0.306 Sum_probs=46.3
Q ss_pred CcchhhhHHHHhhhHHHhhhhhhhHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHhhhhh
Q 006784 246 PTKEQDQLDEAQGLLKTTISTGQSKEARLARVCAGLSSRLQEYKSENAQLEELLVAERELSRSYEARIKQLEQELSVYKS 325 (631)
Q Consensus 246 p~k~q~ql~e~~~lL~~~~~~~~~ke~rL~rv~~qls~rLs~lr~EN~QLEeLLr~E~~~~~Sl~ar~k~lQ~ELs~ar~ 325 (631)
|-|-=|=|++|=..+|-...+--.....+.|-..++..+.+.++.++.. .-......+...++.++++++..+
T Consensus 230 PdKAidlld~a~a~~~i~~~s~P~el~~ler~I~qLe~E~~aL~ke~d~------~s~~rl~~le~el~~lee~~~~L~- 302 (387)
T d1qvra2 230 PDKAIDLIDEAAARLRMALESAPEEIDALERKKLQLEIEREALKKEKDP------DSQERLKAIEAEIAKLTEEIAKLR- 302 (387)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSCSSH------HHHSCTHHHHHHHHHHHHHHHHHH-
T ss_pred hhhHHHHHHHHHHHHHhhccCCcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccch------HHHHHHhhhhhhhhHHHHHHHHHH-
Confidence 4444455555555555444444334455555555555555555544320 001113344444444444444332
Q ss_pred hhhhh--hhhHHHHHhcccchhHHHHHHHHHH
Q 006784 326 EVTKV--ESNLAEALAAKNSEIETLVSSIDAL 355 (631)
Q Consensus 326 ~v~k~--EsdlteAlaAKdSqLavLkvrLdea 355 (631)
++| +..+.+.+..-..+|..++..++.+
T Consensus 303 --~~w~~ek~~l~~i~~Lk~~Le~lr~~le~A 332 (387)
T d1qvra2 303 --AEWEREREILRKLREAQHRLDEVRREIELA 332 (387)
T ss_dssp --HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred --HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 224 3444444444455555555544443
No 8
>d1u5pa2 a.7.1.1 (A:1772-1872) Spectrin alpha chain {Chicken (Gallus gallus) [TaxId: 9031]}
Probab=15.57 E-value=2e+02 Score=20.81 Aligned_cols=63 Identities=17% Similarity=0.271 Sum_probs=40.7
Q ss_pred HHHhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhh----hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 006784 502 RARQGQRDAENKLSSLEAEVQKMRVEMAAMKRDAEHYS----REEHMELEKRYRELTDLLYYKQTQLE 565 (631)
Q Consensus 502 ~aR~~qreae~~lss~~aElq~lr~E~a~lkrda~~~s----rq~~~ELE~RlrELTdlLy~KQTqLE 565 (631)
.....+..++..|...+..+..+...-..|...- ++. +.-..+|..++..|.+.+..+...||
T Consensus 35 ~ll~~h~~~~~~i~~~~~~~~~l~~~~~~l~~~~-~~~~~~I~~~~~~l~~~w~~L~~~~~~R~~~Le 101 (101)
T d1u5pa2 35 NLRKKHKRLEAELAAHEPAIQGVLDTGKKLSDDN-TIGKEEIQQRLAQFVDHWKELKQLAAARGQRLE 101 (101)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTC-SSCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHcC-CCcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCc
Confidence 3344555666666666666666655555544332 211 12447899999999999999888875
No 9
>d2spca_ a.7.1.1 (A:) Spectrin alpha chain {Drosophila sp. [TaxId: 7242]}
Probab=14.96 E-value=2.1e+02 Score=20.81 Aligned_cols=65 Identities=20% Similarity=0.360 Sum_probs=42.0
Q ss_pred HHHHHhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhh----hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 006784 500 VERARQGQRDAENKLSSLEAEVQKMRVEMAAMKRDAEHYSR----EEHMELEKRYRELTDLLYYKQTQLE 565 (631)
Q Consensus 500 ve~aR~~qreae~~lss~~aElq~lr~E~a~lkrda~~~sr----q~~~ELE~RlrELTdlLy~KQTqLE 565 (631)
++.....+..++..+......+..+......|...- |+.. .-..+|..++..|-+.+-.+...||
T Consensus 38 ~~~l~~~h~~~~~ei~~~~~~~~~l~~~~~~L~~~~-~~~~~~I~~~~~~l~~~w~~L~~~~~~r~~~Le 106 (107)
T d2spca_ 38 VEALIKKHEDFDKAINGHEQKIAALQTVADQLIAQN-HYASNLVDEKRKQVLERWRHLKEGLIEKRSRLG 106 (107)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHcC-CCcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHcC
Confidence 344555666666677777777777666655555432 2222 2346788899999888888887775
No 10
>d2oa5a1 d.362.1.1 (A:7-102) Uncharacterized protein BQLF2 {Murid herpesvirus 4 [TaxId: 33708]}
Probab=14.86 E-value=87 Score=25.69 Aligned_cols=54 Identities=13% Similarity=0.196 Sum_probs=34.7
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhh--------------------------hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh
Q 006784 514 LSSLEAEVQKMRVEMAAMKRDAEHYS--------------------------REEHMELEKRYRELTDLLYYKQTQLETM 567 (631)
Q Consensus 514 lss~~aElq~lr~E~a~lkrda~~~s--------------------------rq~~~ELE~RlrELTdlLy~KQTqLEaL 567 (631)
+..+.+++++|+.|=..||+.+.+.. ++..--+|.|++-+|.-+--|.-.-+.|
T Consensus 4 ~EeLaaeL~rL~~ENk~LKkkl~~~~~~~~~d~~LT~~qke~~I~s~~~~lts~A~kKIe~kV~~~~~~~vTk~e~e~~l 83 (96)
T d2oa5a1 4 YEEMVKEVERLKLENKTLKQKVKSSGAVSSDDSILTAAKRESIIVSSSRALGAVAMRKIEAKVRSRAAKAVTEQELTSLL 83 (96)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTC---------CCBCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCBHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCCCCCCCccCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcccccHHHHHHHH
Confidence 56789999999999999999998741 1233556666666665555554444444
Done!