Query 008742
Match_columns 555
No_of_seqs 40 out of 42
Neff 2.5
Searched_HMMs 13730
Date Mon Mar 25 10:40:40 2013
Command hhsearch -i /work/01045/syshi/csienesis_hhblits_a3m/008742.a3m -d /work/01045/syshi/HHdatabase/scop70.hhm -o /work/01045/syshi/hhsearch_scop/008742hhsearch_scop -cpu 12 -v 0
No Hit Prob E-value P-value Score SS Cols Query HMM Template HMM
1 d2efla1 a.238.1.4 (A:1-288) Fo 73.6 23 0.0017 29.5 19.8 77 328-407 81-157 (288)
2 d1fxka_ a.2.5.1 (A:) Prefoldin 50.3 51 0.0037 25.4 11.3 78 395-472 21-104 (107)
3 d2efka1 a.238.1.4 (A:10-288) C 48.0 70 0.0051 26.3 20.2 76 326-404 70-145 (279)
4 d1s35a2 a.7.1.1 (A:1169-1273) 47.5 47 0.0034 24.2 8.5 70 351-421 34-104 (105)
5 d1quua1 a.7.1.1 (A:1-124) alph 35.8 80 0.0058 23.5 10.1 110 394-506 5-118 (124)
6 d1u5pa2 a.7.1.1 (A:1772-1872) 34.8 70 0.0051 22.8 7.3 67 434-506 32-101 (101)
7 d1gs9a_ a.24.1.1 (A:) Apolipop 31.9 1.2E+02 0.0084 24.1 11.1 56 443-501 81-137 (144)
8 d1hcia4 a.7.1.1 (A:633-746) al 27.1 63 0.0046 24.1 6.0 71 434-507 38-108 (114)
9 d1seta1 a.2.7.1 (A:1-110) Sery 25.6 1.2E+02 0.0089 23.1 7.6 82 388-477 20-101 (110)
10 d1cuna2 a.7.1.1 (A:116-219) Sp 23.2 1.2E+02 0.0091 21.7 8.8 70 351-421 31-101 (104)
11 d2f23a1 a.2.1.1 (A:3-77) GreA 22.3 1.5E+02 0.011 22.3 7.5 53 446-498 7-67 (75)
12 d1seta1 a.2.7.1 (A:1-110) Sery 20.9 1.1E+02 0.0083 23.2 6.5 57 365-421 39-96 (110)
13 d1nkpa_ a.38.1.1 (A:) Myc prot 20.8 85 0.0062 23.3 5.6 16 456-471 54-69 (88)
14 d1fxka_ a.2.5.1 (A:) Prefoldin 20.1 1.7E+02 0.013 22.2 8.6 86 391-476 3-101 (107)
No 1
>d2efla1 a.238.1.4 (A:1-288) Formin-binding protein 1, FNBP1 {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=73.65 E-value=23 Score=29.47 Aligned_cols=77 Identities=12% Similarity=0.150 Sum_probs=44.4
Q ss_pred HHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHh
Q 008742 328 EERAKQQVKEASELQTSMMETMDAFELEKQRHNNTRMEALQLLAKLETANADLARALAAAQKKLEMETNQVAELRQQTEL 407 (555)
Q Consensus 328 ~er~kQqaqEassLQ~~m~ET~QalerEqe~h~~TQmEalaRLaKLE~e~qeLAeSLAaAQRkleeEk~rvaELqQQVkl 407 (555)
...+.++..-+..|.+.+.+-+..+..++ ...+.....-..+++.+....-..|..+.++|.....-+..++++...
T Consensus 81 ~~~a~~h~~~a~~l~~~i~~~l~~~~~~~---~~~~K~~~~~~~k~~k~~~~~~~~l~k~k~~Y~~~~~e~e~~~~~~~~ 157 (288)
T d2efla1 81 NDYAGQHEVISENMASQIIVDLARYVQEL---KQERKSNFHDGRKAQQHIETCWKQLESSKRRFERDCKEADRAQQYFEK 157 (288)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhh
Confidence 34445555556777776666555544333 333344444555666677777777777777776665555555444433
No 2
>d1fxka_ a.2.5.1 (A:) Prefoldin beta subunit {Archaeon Methanobacterium thermoautotrophicum [TaxId: 145262]}
Probab=50.31 E-value=51 Score=25.44 Aligned_cols=78 Identities=19% Similarity=0.176 Sum_probs=44.0
Q ss_pred HhHHHHHHHHHHhHHHhHHHHhh---hhhhhcccchhh-h--hhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 008742 395 TNQVAELRQQTELKEVAHEELSQ---RNSNTHQTGIYL-K--RLAASKGVEFEREILEAEYTFIADKIIQLEDKAKKLEG 468 (555)
Q Consensus 395 k~rvaELqQQVkl~e~~~EslKQ---eL~d~kQkas~l-~--ql~eL~~~r~ErE~~reE~q~l~~kI~qLq~ea~KLEe 468 (555)
..+...|+.+..-.+.+++.+.. ...=|+..|.-+ . --+....+..-.+.++.++..+..++..++.+...++.
T Consensus 21 ~~q~~~le~q~~E~~~vl~eL~~l~~d~~vyk~vG~vLv~~~~~e~~~~l~~~~e~l~~~i~~l~~q~~~l~~~l~~~~~ 100 (107)
T d1fxka_ 21 SVQKQTVEMQINETQKALEELSRAADDAEVYKSSGNILIRVAKDELTEELQEKLETLQLREKTIERQEERVMKKLQEMQV 100 (107)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCTTCCEEEEETTEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCcccHHHHHhcchhhcCcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 33444455555555555554432 222244444321 1 11234456667777788888888888888888777777
Q ss_pred HHHH
Q 008742 469 NIEM 472 (555)
Q Consensus 469 EI~~ 472 (555)
+|.-
T Consensus 101 ~l~~ 104 (107)
T d1fxka_ 101 NIQE 104 (107)
T ss_dssp HHHT
T ss_pred HHHH
Confidence 6643
No 3
>d2efka1 a.238.1.4 (A:10-288) CDC42-interacting protein 4, CIP4 {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=47.97 E-value=70 Score=26.32 Aligned_cols=76 Identities=13% Similarity=0.152 Sum_probs=38.2
Q ss_pred HHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHH
Q 008742 326 ILEERAKQQVKEASELQTSMMETMDAFELEKQRHNNTRMEALQLLAKLETANADLARALAAAQKKLEMETNQVAELRQQ 404 (555)
Q Consensus 326 iL~er~kQqaqEassLQ~~m~ET~QalerEqe~h~~TQmEalaRLaKLE~e~qeLAeSLAaAQRkleeEk~rvaELqQQ 404 (555)
.+...++++..-+..|.+.+..-+..+..++......-. .=..+++.....+...|..+.++|..-.+.+..++..
T Consensus 70 ~~~~~a~~~~~~~~~l~~~i~~~l~~~~~~~~~~~k~~~---~~~~~~~k~l~~~~~~~~k~k~~y~~~~~e~e~~~~~ 145 (279)
T d2efka1 70 EVNDFAGQRELVAENLSVRVCLELTKYSQEMKQERKMHF---QEGRRAQQQLENGFKQLENSKRKFERDCREAEKAAQT 145 (279)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 334445555555666666666655554444333222211 1223445555555666666666665555444444433
No 4
>d1s35a2 a.7.1.1 (A:1169-1273) Spectrin beta chain {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=47.47 E-value=47 Score=24.18 Aligned_cols=70 Identities=13% Similarity=0.017 Sum_probs=46.4
Q ss_pred HHHHHHHHhHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHhHHHHHHHHHHhHHHhHHHHhhhhhh
Q 008742 351 AFELEKQRHNNTRMEALQLLAKLETANADLARALAAAQK-KLEMETNQVAELRQQTELKEVAHEELSQRNSN 421 (555)
Q Consensus 351 alerEqe~h~~TQmEalaRLaKLE~e~qeLAeSLAaAQR-kleeEk~rvaELqQQVkl~e~~~EslKQeL~d 421 (555)
.++.-..+|...+.+...+..+++.-. ..|+.|....- ..+.=..+...|.+++......++..+++|.|
T Consensus 34 ~v~~l~k~h~~l~~~l~~~~~~v~~l~-~~a~~L~~~~~~~~~~I~~~~~~l~~rw~~l~~~~~~r~~~L~d 104 (105)
T d1s35a2 34 AAEAGIRKFEDFLGSMENNRDKVLSPV-DSGNKLVAEGNLYSDKIKEKVQLIEDRHRKNNEKAQEASVLLRD 104 (105)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHTTCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHH-HHHHHHhhcCCCcchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccC
Confidence 455556677777777777777765443 34555544322 22233467888888888888888888888765
No 5
>d1quua1 a.7.1.1 (A:1-124) alpha-actinin {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=35.79 E-value=80 Score=23.46 Aligned_cols=110 Identities=11% Similarity=0.070 Sum_probs=0.0
Q ss_pred HHhHHHHHHHHHHhHHHhHHHHhhhhhhhcccch----hhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 008742 394 ETNQVAELRQQTELKEVAHEELSQRNSNTHQTGI----YLKRLAASKGVEFEREILEAEYTFIADKIIQLEDKAKKLEGN 469 (555)
Q Consensus 394 Ek~rvaELqQQVkl~e~~~EslKQeL~d~kQkas----~l~ql~eL~~~r~ErE~~reE~q~l~~kI~qLq~ea~KLEeE 469 (555)
|.+|...|.+.+.--...|+.+..=|.+.....+ +...+..++.+....+.+..++.....+|.++...+.+|-..
T Consensus 5 e~~R~~~l~~~~q~F~~~~~~l~~Wl~~~e~~l~~~~~~~~d~~~v~~l~~~h~~~~~~i~~~~~~v~~l~~~~~~L~~~ 84 (124)
T d1quua1 5 EIRRLERLEHLAEKFRQKASTHETWAYGKEQILLQKDYESASLTEVRALLRKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNEL 84 (124)
T ss_dssp THHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHCCCCSSCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHhh
Q ss_pred HHHHhhhccCchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhc
Q 008742 470 IEMTRKEIEDPTEVEIELKRRLGQLTDHLIQKQAQVF 506 (555)
Q Consensus 470 I~~TKktl~~~TssE~ELE~RLhQLTD~LIQKQTqLE 506 (555)
-+-....+ ...-.+|..|...|++.+-.++..|+
T Consensus 85 ~~~~~~~i---~~~~~~l~~rW~~L~~~~~~R~~~L~ 118 (124)
T d1quua1 85 DYHDAVNV---NDRCQKICDQWDRLGTLTQKRREALE 118 (124)
T ss_dssp TCTTHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred ccccHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
No 6
>d1u5pa2 a.7.1.1 (A:1772-1872) Spectrin alpha chain {Chicken (Gallus gallus) [TaxId: 9031]}
Probab=34.80 E-value=70 Score=22.78 Aligned_cols=67 Identities=15% Similarity=0.110 Sum_probs=44.1
Q ss_pred hhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhccCch---hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhc
Q 008742 434 ASKGVEFEREILEAEYTFIADKIIQLEDKAKKLEGNIEMTRKEIEDPT---EVEIELKRRLGQLTDHLIQKQAQVF 506 (555)
Q Consensus 434 eL~~~r~ErE~~reE~q~l~~kI~qLq~ea~KLEeEI~~TKktl~~~T---ssE~ELE~RLhQLTD~LIQKQTqLE 506 (555)
.++.+-...+.++.++....++|..+...+..|-.+-+ .+.. ..-.+|..|..+|.+.+-++..+||
T Consensus 32 ~~~~ll~~h~~~~~~i~~~~~~~~~l~~~~~~l~~~~~------~~~~~I~~~~~~l~~~w~~L~~~~~~R~~~Le 101 (101)
T d1u5pa2 32 GVQNLRKKHKRLEAELAAHEPAIQGVLDTGKKLSDDNT------IGKEEIQQRLAQFVDHWKELKQLAAARGQRLE 101 (101)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCS------SCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHcCC------CcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCc
Confidence 34444445555667777777777777777666544211 1122 2237999999999999999998886
No 7
>d1gs9a_ a.24.1.1 (A:) Apolipoprotein E {Human (Homo sapiens), E4 [TaxId: 9606]}
Probab=31.85 E-value=1.2e+02 Score=24.15 Aligned_cols=56 Identities=20% Similarity=0.275 Sum_probs=31.5
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHhhhccCchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 008742 443 EILEAEYTFIADKIIQLEDKAK-KLEGNIEMTRKEIEDPTEVEIELKRRLGQLTDHLIQK 501 (555)
Q Consensus 443 E~~reE~q~l~~kI~qLq~ea~-KLEeEI~~TKktl~~~TssE~ELE~RLhQLTD~LIQK 501 (555)
+.+...+..+..+|...-++.+ ++...++-.|..+..++ .||..||.+.++-|=.|
T Consensus 81 ~~l~~~lee~r~kl~~~~eel~~~~~~~~ee~r~~l~p~~---eel~~~l~~~~eel~~k 137 (144)
T d1gs9a_ 81 ARLGADMEDVRGRLVQYRGEVQAMLGQSTEELRVRLASHL---RKLRKRLLRDADDLQKR 137 (144)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSTTCCCHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 3444455555555554444432 25555555666664444 37788888887776443
No 8
>d1hcia4 a.7.1.1 (A:633-746) alpha-actinin {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=27.10 E-value=63 Score=24.12 Aligned_cols=71 Identities=10% Similarity=0.047 Sum_probs=51.1
Q ss_pred hhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhccCchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhcc
Q 008742 434 ASKGVEFEREILEAEYTFIADKIIQLEDKAKKLEGNIEMTRKEIEDPTEVEIELKRRLGQLTDHLIQKQAQVFP 507 (555)
Q Consensus 434 eL~~~r~ErE~~reE~q~l~~kI~qLq~ea~KLEeEI~~TKktl~~~TssE~ELE~RLhQLTD~LIQKQTqLEA 507 (555)
.++.+-.-.+.++.++....++|..+.....+|.+.-+-.. ..-...-.+|..+...|-+.+-++++.||.
T Consensus 38 ~ve~~l~~h~~~e~el~~~~~~i~~l~~~g~~L~~~~~~~~---~~i~~~~~~L~~~W~~L~~~~~~R~~~Le~ 108 (114)
T d1hcia4 38 ALEDQMNQLKQYEHNIINYKNNIDKLEGDHQLIQEALVFDN---KHTNYTMEHIRVGWELLLTTIARTINEVET 108 (114)
T ss_dssp STHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCCC---TTCSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCchH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 44444555667788888888888888888888776322111 111244589999999999999999999875
No 9
>d1seta1 a.2.7.1 (A:1-110) Seryl-tRNA synthetase (SerRS) {Thermus thermophilus, strain hb27 [TaxId: 274]}
Probab=25.56 E-value=1.2e+02 Score=23.06 Aligned_cols=82 Identities=15% Similarity=0.229 Sum_probs=49.4
Q ss_pred HHHHHHHHhHHHHHHHHHHhHHHhHHHHhhhhhhhcccchhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 008742 388 QKKLEMETNQVAELRQQTELKEVAHEELSQRNSNTHQTGIYLKRLAASKGVEFEREILEAEYTFIADKIIQLEDKAKKLE 467 (555)
Q Consensus 388 QRkleeEk~rvaELqQQVkl~e~~~EslKQeL~d~kQkas~l~ql~eL~~~r~ErE~~reE~q~l~~kI~qLq~ea~KLE 467 (555)
-|.++....++-+|-+++..+...++.++.+--.+-. ++... -..+.+-+.++...+..+|..|+.+...++
T Consensus 20 ~R~~~~~ld~i~~ld~~rr~l~~~~e~l~~~rN~~sk------~i~k~--~~~~~~~l~~~~k~lk~~i~~le~~~~~~~ 91 (110)
T d1seta1 20 EKGVALDLEALLALDREVQELKKRLQEVQTERNQVAK------RVPKA--PPEEKEALIARGKALGEEAKRLEEALREKE 91 (110)
T ss_dssp HTTCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HGGGC--CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HcCCccCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHh--hccchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 3455555667777777777777777776666433210 11111 122344566777777788888888877777
Q ss_pred HHHHHHhhhc
Q 008742 468 GNIEMTRKEI 477 (555)
Q Consensus 468 eEI~~TKktl 477 (555)
.+++..--.+
T Consensus 92 ~~l~~~ll~i 101 (110)
T d1seta1 92 ARLEALLLQV 101 (110)
T ss_dssp HHHHHHHTTC
T ss_pred HHHHHHHHcC
Confidence 7777654443
No 10
>d1cuna2 a.7.1.1 (A:116-219) Spectrin alpha chain {Chicken (Gallus gallus) [TaxId: 9031]}
Probab=23.19 E-value=1.2e+02 Score=21.66 Aligned_cols=70 Identities=13% Similarity=0.078 Sum_probs=41.8
Q ss_pred HHHHHHHHhHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHhHHHHHHHHHHhHHHhHHHHhhhhhh
Q 008742 351 AFELEKQRHNNTRMEALQLLAKLETANADLARALAAAQK-KLEMETNQVAELRQQTELKEVAHEELSQRNSN 421 (555)
Q Consensus 351 alerEqe~h~~TQmEalaRLaKLE~e~qeLAeSLAaAQR-kleeEk~rvaELqQQVkl~e~~~EslKQeL~d 421 (555)
.++.-+..|...+.++-++...++.-.... +.|....- ..+.=..++++|+.++..+...++.-++.|.+
T Consensus 31 ~v~~ll~~h~~~~~ei~~~~~~~~~l~~~g-~~L~~~~~~~~~~I~~~~~~l~~~w~~L~~~~~~R~~~Le~ 101 (104)
T d1cuna2 31 AIQGLLKKHEAFETDFTVHKDRVNDVCANG-EDLIKKNNHHVENITAKMKGLKGKVSDLEKAAAQRKAKLDE 101 (104)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHCCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHH-HHHHHcCCccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 456667778888888877777776554433 33333211 11222356677777777777777766666554
No 11
>d2f23a1 a.2.1.1 (A:3-77) GreA transcript cleavage protein, N-terminal domain {Thermus thermophilus [TaxId: 274]}
Probab=22.30 E-value=1.5e+02 Score=22.27 Aligned_cols=53 Identities=13% Similarity=0.245 Sum_probs=32.6
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhh--c-cCch-----hHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 008742 446 EAEYTFIADKIIQLEDKAKKLEGNIEMTRKE--I-EDPT-----EVEIELKRRLGQLTDHL 498 (555)
Q Consensus 446 reE~q~l~~kI~qLq~ea~KLEeEI~~TKkt--l-~~~T-----ssE~ELE~RLhQLTD~L 498 (555)
++.|.+|...+..|+.+...+-.+|..++-. + +|-- ..+.-|+.|+.+|.+.|
T Consensus 7 ~eg~~kL~~EL~~l~~~r~ei~~~I~eAr~~GDl~ENaeY~aAke~q~~~e~rI~eLe~~L 67 (75)
T d2f23a1 7 KAGYERLMQQLERERERLQEATKILQELMESSDDYDDSGLEAAKQEKARIEARIDSLEDIL 67 (75)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCSCCSCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHHHHhCccccchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 4556666666666665555565666555543 2 2211 44678888888888776
No 12
>d1seta1 a.2.7.1 (A:1-110) Seryl-tRNA synthetase (SerRS) {Thermus thermophilus, strain hb27 [TaxId: 274]}
Probab=20.87 E-value=1.1e+02 Score=23.24 Aligned_cols=57 Identities=19% Similarity=0.159 Sum_probs=28.4
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHhHHHHHHHHHHhHHHhHHHHhhhhhh
Q 008742 365 EALQLLAKLETANADLARALAAAQK-KLEMETNQVAELRQQTELKEVAHEELSQRNSN 421 (555)
Q Consensus 365 EalaRLaKLE~e~qeLAeSLAaAQR-kleeEk~rvaELqQQVkl~e~~~EslKQeL~d 421 (555)
+....+..|.+++-.+++.+..+.. ..++-+.++..|..+++.++..+..+..++.+
T Consensus 39 ~l~~~~e~l~~~rN~~sk~i~k~~~~~~~~l~~~~k~lk~~i~~le~~~~~~~~~l~~ 96 (110)
T d1seta1 39 ELKKRLQEVQTERNQVAKRVPKAPPEEKEALIARGKALGEEAKRLEEALREKEARLEA 96 (110)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 3444445555555556655543211 11223445555566666666555555555544
No 13
>d1nkpa_ a.38.1.1 (A:) Myc proto-oncogene protein {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
Probab=20.82 E-value=85 Score=23.29 Aligned_cols=16 Identities=19% Similarity=0.391 Sum_probs=6.5
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHH
Q 008742 456 IIQLEDKAKKLEGNIE 471 (555)
Q Consensus 456 I~qLq~ea~KLEeEI~ 471 (555)
|.+|+.+...+..++.
T Consensus 54 I~~L~~~~~~l~~~~~ 69 (88)
T d1nkpa_ 54 ILSVQAEEQKLISEED 69 (88)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 3444444444443333
No 14
>d1fxka_ a.2.5.1 (A:) Prefoldin beta subunit {Archaeon Methanobacterium thermoautotrophicum [TaxId: 145262]}
Probab=20.09 E-value=1.7e+02 Score=22.18 Aligned_cols=86 Identities=14% Similarity=0.142 Sum_probs=41.7
Q ss_pred HHHHHhHHHHHHHHHHhHHHhHHHHhhhhhhhcccchhhhhhhh------------h-hhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 008742 391 LEMETNQVAELRQQTELKEVAHEELSQRNSNTHQTGIYLKRLAA------------S-KGVEFEREILEAEYTFIADKII 457 (555)
Q Consensus 391 leeEk~rvaELqQQVkl~e~~~EslKQeL~d~kQkas~l~ql~e------------L-~~~r~ErE~~reE~q~l~~kI~ 457 (555)
+++...+...|++++...-.....+...+....-....++.++. + .....=...+...+..+...|.
T Consensus 3 lqe~~~~~q~lq~el~~~~~q~~~le~q~~E~~~vl~eL~~l~~d~~vyk~vG~vLv~~~~~e~~~~l~~~~e~l~~~i~ 82 (107)
T d1fxka_ 3 VQHQLAQFQQLQQQAQAISVQKQTVEMQINETQKALEELSRAADDAEVYKSSGNILIRVAKDELTEELQEKLETLQLREK 82 (107)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCTTCCEEEEETTEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCcccHHHHHhcchhhcCcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 44555566666666665555555555544444333222222210 0 1111113444555666666666
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHhhh
Q 008742 458 QLEDKAKKLEGNIEMTRKE 476 (555)
Q Consensus 458 qLq~ea~KLEeEI~~TKkt 476 (555)
.|......++.++...+..
T Consensus 83 ~l~~q~~~l~~~l~~~~~~ 101 (107)
T d1fxka_ 83 TIERQEERVMKKLQEMQVN 101 (107)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 6666666666666554443
Done!