Query 010350
Match_columns 512
No_of_seqs 536 out of 3429
Neff 10.3
Searched_HMMs 29240
Date Mon Mar 25 04:54:13 2013
Command hhsearch -i /work/01045/syshi/csienesis_hhblits_a3m/010350.a3m -d /work/01045/syshi/HHdatabase/pdb70.hhm -o /work/01045/syshi/hhsearch_pdb/010350hhsearch_pdb -cpu 12 -v 0
No Hit Prob E-value P-value Score SS Cols Query HMM Template HMM
1 1pw4_A Glycerol-3-phosphate tr 100.0 7.5E-38 2.6E-42 316.5 27.1 385 112-508 26-419 (451)
2 3o7q_A L-fucose-proton symport 100.0 4.3E-36 1.5E-40 302.4 32.4 366 112-508 24-418 (438)
3 2gfp_A EMRD, multidrug resista 100.0 3.5E-35 1.2E-39 289.6 13.7 354 117-505 3-359 (375)
4 4aps_A DI-OR tripeptide H+ sym 100.0 3.7E-30 1.3E-34 263.0 29.2 376 118-498 17-449 (491)
5 4gc0_A D-xylose-proton symport 100.0 7.3E-29 2.5E-33 253.4 28.5 370 117-496 15-431 (491)
6 2cfq_A Lactose permease; trans 100.0 3E-29 1E-33 250.7 15.4 366 116-507 9-384 (417)
7 2xut_A Proton/peptide symporte 99.9 5.9E-26 2E-30 233.9 21.7 374 119-497 17-467 (524)
8 1pw4_A Glycerol-3-phosphate tr 99.6 2E-15 6.9E-20 151.8 14.8 177 114-290 252-434 (451)
9 2cfq_A Lactose permease; trans 99.4 4.8E-13 1.6E-17 133.1 13.4 141 147-288 257-398 (417)
10 3o7q_A L-fucose-proton symport 99.4 7.4E-13 2.5E-17 132.5 14.3 160 121-284 265-427 (438)
11 4gc0_A D-xylose-proton symport 99.3 4.4E-11 1.5E-15 121.5 18.5 181 114-295 277-469 (491)
12 4aps_A DI-OR tripeptide H+ sym 99.2 5.4E-11 1.8E-15 120.9 13.4 162 336-508 13-182 (491)
13 2xut_A Proton/peptide symporte 99.2 5.1E-11 1.7E-15 122.1 8.9 164 335-508 11-184 (524)
14 2gfp_A EMRD, multidrug resista 99.1 6.9E-11 2.4E-15 115.5 6.8 160 114-276 199-363 (375)
15 2g9p_A Antimicrobial peptide l 44.1 8.6 0.00029 19.3 0.9 14 168-181 2-15 (26)
16 2jln_A MHP1; hydantoin, transp 36.9 3.1E+02 0.011 26.8 15.3 50 232-281 20-71 (501)
No 1
>1pw4_A Glycerol-3-phosphate transporter; transmembrane, inner membrane, major facilitator superfamily, secondary active membrane transporter; 3.30A {Escherichia coli} SCOP: f.38.1.1
Probab=100.00 E-value=7.5e-38 Score=316.46 Aligned_cols=385 Identities=15% Similarity=0.191 Sum_probs=299.9
Q ss_pred hHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhcccCCCchhhHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhcCCchHHHHHHHHHHH
Q 010350 112 RYKLIGTTSLAFVICNMDKVNLSVAIIPMSHRFGWNSSVAGLVQSSFFWGYALSQLPGGWLAKIFGGRKVLQTGVLIWSL 191 (512)
Q Consensus 112 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~g~r~~~~~~~~~~~~ 191 (512)
+++.+..+++..+...++...+.+.+|.+.+++ .+..+.+++.+++.+++.++++++|+++||+|||++++++.++.++
T Consensus 26 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~G~l~dr~g~r~~l~~~~~~~~~ 104 (451)
T 1pw4_A 26 RWQIFLGIFFGYAAYYLVRKNFALAMPYLVEQG-FSRGDLGFALSGISIAYGFSKFIMGSVSDRSNPRVFLPAGLILAAA 104 (451)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSHHHHHHHTTSST-TCSSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh-ccHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHhcCchHHHHHHHHHHHH
Confidence 456677788888888899999999999999999 9999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHHh---hhhHHHHHHHHHHHHhhcccchhhHHHHHHhhcCccchhhHHHHHHhhhhhHHHHHhhhhHHhccccC-
Q 010350 192 ATALLPLL---AGFMPGLVLSRVLVGIGEGVSPSAATDLIARSIPLEERSRAVSFVFGGLSFGSVAGLLLAPPIIENLG- 267 (512)
Q Consensus 192 ~~~~~~~~---~~~~~~~~~~r~l~G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~l~~~~g- 267 (512)
+.++.+.. +++++.++++|++.|++.+...+...++++|++|+++|++++++...+..+|.+++|.+++++.+..|
T Consensus 105 ~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~l~G~~~~~~~~~~~~~i~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~g~~~g~~~~~~l~~~~g~ 184 (451)
T 1pw4_A 105 VMLFMGFVPWATSSIAVMFVLLFLCGWFQGMGWPPCGRTMVHWWSQKERGGIVSVWNCAHNVGGGIPPLLFLLGMAWFND 184 (451)
T ss_dssp HHHHHHHCHHHHSSSSHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHTTCTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHTSHHHHHHHHHHHTCC
T ss_pred HHHHHHhhhhccccHHHHHHHHHHHHHHhhhccchHHHHHHHHCCchhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcc
Confidence 98777531 67778999999999999999999999999999999999999999999999999999999999888898
Q ss_pred chHHHHHHHHHHHHHHHH-HHhhccCCCCCCCCCCcchhhhhhhhhhhhhHHhhcCCCCCccHHHHhhcHhHHHHHHHHH
Q 010350 268 WESVFYIFGLLGIAWFSG-FKILQEGETSNGATLAPRSNYINMKKSLSASLEEMGESLKDVPWKAIFRSKAVWAMIYAHF 346 (512)
Q Consensus 268 w~~~f~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 346 (512)
||+.|++.+++.++..+. .++++|+++.......++.+... ++. ....++.+...++..+++++++|.++...+..+
T Consensus 185 w~~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 262 (451)
T 1pw4_A 185 WHAALYMPAFCAILVALFAFAMMRDTPQSCGLPPIEEYKNDY-PDD-YNEKAEQELTAKQIFMQYVLPNKLLWYIAIANV 262 (451)
T ss_dssp STTCTHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCSSTTTCCCSCTTTCCC---------------CCTHHHHHHTSSCHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccCCHhhcCCCChhhhcccc-ccc-chhhhhcccccccchHHHHHcCHHHHHHHHHHH
Confidence 999999999887765544 45556544332221111110000 000 000001111111222467889999999999999
Q ss_pred HhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCChhhhHHHhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhHH--HHcCCCccchhHHHHHHHhHHHHHH
Q 010350 347 CGSWGHYTCLSWLPTYFSEELSLNLTEAAWVSILPPLASVLVTSIAAQFADNL--IATGVETTMVRKICQTIAFLSPAVC 424 (512)
Q Consensus 347 ~~~~~~~~~~~~~p~~l~~~~g~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~--~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 424 (512)
+.....+....++|.|+++.+|++..+.+.+.+...++.+++.++.+++.||+ ++| +.......+...++
T Consensus 263 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~~~~~~~~~--------~~~~~~~~~~~~~~ 334 (451)
T 1pw4_A 263 FVYLLRYGILDWSPTYLKEVKHFALDKSSWAYFLYEYAGIPGTLLCGWMSDKVFRGNR--------GATGVFFMTLVTIA 334 (451)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHBTTBSCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSTTCH--------HHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCc--------hhHHHHHHHHHHHH
Confidence 99999999999999999887899999999999999999999999999999998 642 33333333333244
Q ss_pred HHHhhccCC-CChHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhHhhhcCcchhHHHHHHHHhhhch-hhhhHHhhhhhcccccCcce
Q 010350 425 MTLSSIDLG-LPHWEIVGILTAGLALSSFALSGLYCTHQDISPEYASILLGITNTVGAV-PGIVGVALTGYLLDSTHSWS 502 (512)
Q Consensus 425 ~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~g~~~~~~~l-g~~i~p~i~G~l~~~~g~~~ 502 (512)
+.+...... +.....+..++.|++.+...+.......+..|++++|++.|+.+++.++ |.+++|.+.|.+.|..| |+
T Consensus 335 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~g~l~~~~g-~~ 413 (451)
T 1pw4_A 335 TIVYWMNPAGNPTVDMICMIVIGFLIYGPVMLIGLHALELAPKKAAGTAAGFTGLFGYLGGSVAASAIVGYTVDFFG-WD 413 (451)
T ss_dssp HHHTTSCCTTCHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHTSCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSC-SH
T ss_pred HHHHHHhcccCHHHHHHHHHHHHHHHhchHHHHHHHHHHHhchhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcC-cH
Confidence 444433322 3333445556666666666666667778888999999999999999999 99999999999999987 66
Q ss_pred EEEEec
Q 010350 503 VSYQCP 508 (512)
Q Consensus 503 ~~f~~~ 508 (512)
..|++.
T Consensus 414 ~~~~~~ 419 (451)
T 1pw4_A 414 GGFMVM 419 (451)
T ss_dssp HHHHHH
T ss_pred HHHHHH
Confidence 655443
No 2
>3o7q_A L-fucose-proton symporter; transporter, multi-PASS membrane protei transport protein; HET: BNG; 3.14A {Escherichia coli} PDB: 3o7p_A*
Probab=100.00 E-value=4.3e-36 Score=302.42 Aligned_cols=366 Identities=13% Similarity=0.141 Sum_probs=291.2
Q ss_pred hHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhcccCCCchhhHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhcCCchHHHHHHHHHHH
Q 010350 112 RYKLIGTTSLAFVICNMDKVNLSVAIIPMSHRFGWNSSVAGLVQSSFFWGYALSQLPGGWLAKIFGGRKVLQTGVLIWSL 191 (512)
Q Consensus 112 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~g~r~~~~~~~~~~~~ 191 (512)
+++.+..+++.++...++.....+..|.+.+++|+|..+.+++.+++.+++.++.+++|+++||+|||++++++.+++++
T Consensus 24 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~s~~~~g~~~~~~~~~~~i~~~~~G~l~dr~g~r~~l~~~~~~~~~ 103 (438)
T 3o7q_A 24 YIIPFALLCSLFFLWAVANNLNDILLPQFQQAFTLTNFQAGLIQSAFYFGYFIIPIPAGILMKKLSYKAGIITGLFLYAL 103 (438)
T ss_dssp THHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCCCSHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHhcchHHHHHHHHHHHH
Confidence 34566677777888888888999999999999999999999999999999999999999999999999999999999998
Q ss_pred HHHHHH--HhhhhHHHHHHHHHHHHhhcccchhhHHHHHHhhcCccchhhHHHHHHhhhhhHHHHHhhhhHHhc-cccC-
Q 010350 192 ATALLP--LLAGFMPGLVLSRVLVGIGEGVSPSAATDLIARSIPLEERSRAVSFVFGGLSFGSVAGLLLAPPII-ENLG- 267 (512)
Q Consensus 192 ~~~~~~--~~~~~~~~~~~~r~l~G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~l~-~~~g- 267 (512)
+.++.. ..+++++.++++|++.|++.+...+...++++|++|+++|++++++.+.+..+|.+++|.+++.+. +..+
T Consensus 104 ~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~l~G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~g~~~g~~~~~~l~~~~~~~ 183 (438)
T 3o7q_A 104 GAALFWPAAEIMNYTLFLVGLFIIAAGLGCLETAANPFVTVLGPESSGHFRLNLAQTFNSFGAIIAVVFGQSLILSNVPH 183 (438)
T ss_dssp HHHHHHHHHHTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSCSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHTSSCC
T ss_pred HHHHHHhccccccHHHHHHHHHHHHhhHHHhhhhHHHHHHHHcCchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccccc
Confidence 887762 245678999999999999999999999999999999999999999999999999999999999998 6555
Q ss_pred ------------------------chHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccCCCCCCCCCCcchhhhhhhhhhhhhHHhhcCC
Q 010350 268 ------------------------WESVFYIFGLLGIAWFSGFKILQEGETSNGATLAPRSNYINMKKSLSASLEEMGES 323 (512)
Q Consensus 268 ------------------------w~~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 323 (512)
||+.|++.+++.++..+..++.+.++.++..+.++++ .
T Consensus 184 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~w~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~p~~~~~~~~~~~~------------------~ 245 (438)
T 3o7q_A 184 QSQDVLDKMSPEQLSAYKHSLVLSVQTPYMIIVAIVLLVALLIMLTKFPALQSDNHSDAKQ------------------G 245 (438)
T ss_dssp CCHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCTTTCCCCSST------------------T
T ss_pred ccccccccCCcchhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCcccccccccccc------------------c
Confidence 9999998887776665555554333222211111000 0
Q ss_pred CCCccHHHHhhcHhHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHH-HHHhcCCChhhhHHHhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHc
Q 010350 324 LKDVPWKAIFRSKAVWAMIYAHFCGSWGHYTCLSWLPTY-FSEELSLNLTEAAWVSILPPLASVLVTSIAAQFADNLIAT 402 (512)
Q Consensus 324 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~p~~-l~~~~g~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~~~ 402 (512)
.....+++++|+|.++...+..++..........++|.| +++.+|++..+++.+.+...++.++++++.+++.||+++|
T Consensus 246 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~~r~~~~ 325 (438)
T 3o7q_A 246 SFSASLSRLARIRHWRWAVLAQFCYVGAQTACWSYLIRYAVEEIPGMTAGFAANYLTGTMVCFFIGRFTGTWLISRFAPH 325 (438)
T ss_dssp SHHHHHHHHTTCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSTTCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCHH
T ss_pred chhhhHHHHHhChHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhccCCcchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcch
Confidence 011235788899999999999999988899999999999 8887899999999999999999999999999999999754
Q ss_pred CCCccchhHHHHHHHhHHHHHHHHHhhccCCCChHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhHhhhcCcchhHHHHHHHHhhhch
Q 010350 403 GVETTMVRKICQTIAFLSPAVCMTLSSIDLGLPHWEIVGILTAGLALSSFALSGLYCTHQDISPEYASILLGITNTVGAV 482 (512)
Q Consensus 403 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~g~~~~~~~l 482 (512)
.....+.++..++..+.... ...+..+..++.+++.+...+.......+..+++ ++.+.++.. ...+
T Consensus 326 ---------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~--~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~-~~~~ 392 (438)
T 3o7q_A 326 ---------KVLAAYALIAMALCLISAFA--GGHVGLIALTLCSAFMSIQYPTIFSLGIKNLGQD-TKYGSSFIV-MTII 392 (438)
T ss_dssp ---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHC--CHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHSSCGGG-HHHHHHHHH-HTTH
T ss_pred ---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHc--CCcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhcccc-ccchhhHHH-HHHH
Confidence 23333334444444333332 2334444556667777766666666666766655 888888877 6779
Q ss_pred hhhhHHhhhhhcccccCcceEEEEec
Q 010350 483 PGIVGVALTGYLLDSTHSWSVSYQCP 508 (512)
Q Consensus 483 g~~i~p~i~G~l~~~~g~~~~~f~~~ 508 (512)
|++++|.+.|++.|..|+++..|++.
T Consensus 393 g~~~~~~~~g~l~~~~g~~~~~~~~~ 418 (438)
T 3o7q_A 393 GGGIVTPVMGFVSDAAGNIPTAELIP 418 (438)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHTSSGGGGHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHhcchHHHHHHH
Confidence 99999999999999988676665543
No 3
>2gfp_A EMRD, multidrug resistance protein D; membrane protein, multidrug transporter; 3.50A {Escherichia coli}
Probab=100.00 E-value=3.5e-35 Score=289.60 Aligned_cols=354 Identities=15% Similarity=0.117 Sum_probs=282.8
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhcccCCCchhhHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhcCCchHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 010350 117 GTTSLAFVICNMDKVNLSVAIIPMSHRFGWNSSVAGLVQSSFFWGYALSQLPGGWLAKIFGGRKVLQTGVLIWSLATALL 196 (512)
Q Consensus 117 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~g~r~~~~~~~~~~~~~~~~~ 196 (512)
..+++..+...++...+.+.+|.+.+++|.|..+.+++.+++.++..++++++|+++||+|||+++.++.++.+++.++.
T Consensus 3 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~g~r~~~~~~~~~~~~~~~~~ 82 (375)
T 2gfp_A 3 LMLVLLVAVGQMAQTIYIPAIADMARDLNVREGAVQSVMGAYLLTYGVSQLFYGPISDRVGRRPVILVGMSIFMLATLVA 82 (375)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSSSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHTTSCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHHHHcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCCchhHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 45566677788889999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999988777
Q ss_pred HHhhhhHHHHHHHHHHHHhhcccchhhHHHHHHhhcCccchhhHHHHHHhhhhhHHHHHhhhhHHhccccCchHHHHHHH
Q 010350 197 PLLAGFMPGLVLSRVLVGIGEGVSPSAATDLIARSIPLEERSRAVSFVFGGLSFGSVAGLLLAPPIIENLGWESVFYIFG 276 (512)
Q Consensus 197 ~~~~~~~~~~~~~r~l~G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~l~~~~gw~~~f~~~~ 276 (512)
+ ..++++.+++.|++.|++.+...+...+++.|++|+++|++++++......+|..++|.+++++.++.|||+.|++.+
T Consensus 83 ~-~~~~~~~l~~~~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~ 161 (375)
T 2gfp_A 83 V-TTSSLTVLIAASAMQGMGTGVGGVMARTLPRDLYERTQLRHANSLLNMGILVSPLLAPLIGGLLDTMWNWRACYLFLL 161 (375)
T ss_dssp H-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSCCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSCHHHHHHHHHHHH
T ss_pred H-HhccHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHhccHHHHHHHHH
Confidence 5 567789999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999899999999988
Q ss_pred HHHHHHHH-HHHhhccCCCCCCCCCCcchhhhhhhhhhhhhHHhhcCCCCCccHHHHhhcHhHHHHHHHHHHhHHHHHHH
Q 010350 277 LLGIAWFS-GFKILQEGETSNGATLAPRSNYINMKKSLSASLEEMGESLKDVPWKAIFRSKAVWAMIYAHFCGSWGHYTC 355 (512)
Q Consensus 277 ~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 355 (512)
++.++..+ ..+.+||+++.++++ +....++++++|+|.++...+..++........
T Consensus 162 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-----------------------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 218 (375)
T 2gfp_A 162 VLCAGVTFSMARWMPETRPVDAPR-----------------------TRLLTSYKTLFGNSGFNCYLLMLIGGLAGIAAF 218 (375)
T ss_dssp HHHHHHHCCCCCSSCCCSTTTCCC-----------------------CCTTTCSTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHCcccCCCCccc-----------------------ccHHHHHHHHhcCcchHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 87776655 334455443321111 001223467889999999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHHHHHhcCCChhhhHHHhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHcCCCccchhHHHHHHHh-HHHHHHHHHhhc-cCC
Q 010350 356 LSWLPTYFSEELSLNLTEAAWVSILPPLASVLVTSIAAQFADNLIATGVETTMVRKICQTIAF-LSPAVCMTLSSI-DLG 433 (512)
Q Consensus 356 ~~~~p~~l~~~~g~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~-~~~ 433 (512)
..+.|.|+++.+|.++.+.+.+.+...++.++++.+.+++.||.+++ ....... ......+..... ...
T Consensus 219 ~~~~~~~~~~~~g~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~r~~~~---------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 289 (375)
T 2gfp_A 219 EACSGVLMGAVLGLSSMTVSILFILPIPAAFFGAWFAGRPNKRFSTL---------MWQSVICCLLAGLLMWIPDWFGVM 289 (375)
T ss_dssp HHHCSCSSHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHTTTTHHHHH---------HHHHHHHHHHTSSSSSHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHhCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhccc
Confidence 99999999987899999999999999999999999999999998641 1111111 111111001111 011
Q ss_pred CChHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhHhhhcCcchhHHHHHHHHhhhchhhhhHHhhhhhcccccCcceEEE
Q 010350 434 LPHWEIVGILTAGLALSSFALSGLYCTHQDISPEYASILLGITNTVGAVPGIVGVALTGYLLDSTHSWSVSY 505 (512)
Q Consensus 434 ~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~g~~~~~~~lg~~i~p~i~G~l~~~~g~~~~~f 505 (512)
+....++..++.+++.+...+.......+..| +++|++.|+.+...++|..++|.+.|.+.+..+ |...+
T Consensus 290 ~~~~~~~~~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~p-~~~g~~~g~~~~~~~~g~~~~~~~~g~l~~~~~-~~~~~ 359 (375)
T 2gfp_A 290 NVWTLLVPAALFFFGAGMLFPLATSGAMEPFP-FLAGTAGALVGGLQNIGSGVLASLSAMLPQTGQ-GSLGL 359 (375)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSTTHHHHHTHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCSTTCTHHHHHHH-HHHHH
T ss_pred cHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHhCC-cccchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCc-ccHHH
Confidence 12223445566677777777777777777676 899999999999999999999999999987654 54443
No 4
>4aps_A DI-OR tripeptide H+ symporter; transport protein, peptide transport, major facilitator SUPE transporter, MFS; 3.30A {Streptococcus thermophilus}
Probab=99.97 E-value=3.7e-30 Score=263.05 Aligned_cols=376 Identities=15% Similarity=0.097 Sum_probs=261.2
Q ss_pred HHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhh-hhcc-----cCCCchhhHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhh-cCCchHHHHHHHHHH
Q 010350 118 TTSLAFVICNMDKVNLSVAIIP-MSHR-----FGWNSSVAGLVQSSFFWGYALSQLPGGWLAKI-FGGRKVLQTGVLIWS 190 (512)
Q Consensus 118 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~-----~g~s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr-~g~r~~~~~~~~~~~ 190 (512)
.+.+..+...++...+...++. +.++ +|.|..+.+++.+++.++..++++++|+++|| +|||+++.++.++.+
T Consensus 17 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~g~r~~~~~~~~~~~ 96 (491)
T 4aps_A 17 TLFMTEMWERFSYYGMRAILLYYMWFLISTGDLHITRATAASIMAIYASMVYLSGTIGGFVADRIIGARPAVFWGGVLIM 96 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCCSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccchhhcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccccchHHHHHHHHHHH
Confidence 3444444444554444444444 4444 99999999999999999999999999999999 899999999999999
Q ss_pred HHHHHHHHhhhhHHHHHHHHHHHHhhcccchhhHHHHHHhhcCccc--hhhHHHHHHhhhhhHHHHHhhhhHHhccccCc
Q 010350 191 LATALLPLLAGFMPGLVLSRVLVGIGEGVSPSAATDLIARSIPLEE--RSRAVSFVFGGLSFGSVAGLLLAPPIIENLGW 268 (512)
Q Consensus 191 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~l~G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~--r~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~l~~~~gw 268 (512)
++.++.+ .+++++.++++|++.|++.+...+...++++|++|+++ |+.++++++....+|..++|.+++++.++.||
T Consensus 97 ~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~l~~~~g~ 175 (491)
T 4aps_A 97 LGHIVLA-LPFGASALFGSIILIIIGTGFLKPNVSTLVGTLYDEHDRRRDAGFSIFVFGINLGAFIAPLIVGAAQEAAGY 175 (491)
T ss_dssp HHHHHHH-SCCSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCH
T ss_pred HHHHHHH-HhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhccchHHHHHHHHcCcccccceeeehHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhH
Confidence 8887774 56777999999999999999999999999999999988 77888889999999999999999999999999
Q ss_pred hHHHHHHHHHHHHHHHHHHhh-ccCCCCCCCCCCcchhhhhhhhhhhh---------------hHH--------------
Q 010350 269 ESVFYIFGLLGIAWFSGFKIL-QEGETSNGATLAPRSNYINMKKSLSA---------------SLE-------------- 318 (512)
Q Consensus 269 ~~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~---------------~~~-------------- 318 (512)
|+.|++.++..++..+...+. ++..+++....++..+..+.++.... ...
T Consensus 176 ~~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 255 (491)
T 4aps_A 176 HVAFSLAAIGMFIGLLVYYFGGKKTLDPHYLRPTDPLAPEEVKPLLVKVSLAVAGFIAIIVVMNLVGWNSLPAYINLLTI 255 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCSCCSCCSCCCSHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHSSCCTTHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCcccccccccCCCCccccchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccCcccccchhhhhH
Confidence 999999887766655544433 22221111111110000000000000 000
Q ss_pred ----------hhcCCCCCccHHHHhhcHhHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCChhhhHHHhhhhHHHHHHH
Q 010350 319 ----------EMGESLKDVPWKAIFRSKAVWAMIYAHFCGSWGHYTCLSWLPTYFSEELSLNLTEAAWVSILPPLASVLV 388 (512)
Q Consensus 319 ----------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~p~~l~~~~g~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~ 388 (512)
....+..........+....+...+..++....+.....++|.|+++..+.+....+.+.....++.+++
T Consensus 256 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 335 (491)
T 4aps_A 256 VAIAIPVFYFAWMISSVKVTSTEHLRVVSYIPLFIAAVLFWAIEEQGSVVLATFAAERVDSSWFPVSWFQSLNPLFIMLY 335 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHC------------CTTHHHHHHHHHHHHHHHGGGGTHHHHHHHHSCCCSSSCSGGGTTHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHhhcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccHHHHHHHHHHhccCccCHHHHhccchHHHHHH
Confidence 0000000000011112233445555555566666667788899998878888778888889999999999
Q ss_pred HHHHHHHHhHHHHcCCCccchhHHHHHHHhHHHHHHHHHhhcc--------CCCChHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhH
Q 010350 389 TSIAAQFADNLIATGVETTMVRKICQTIAFLSPAVCMTLSSID--------LGLPHWEIVGILTAGLALSSFALSGLYCT 460 (512)
Q Consensus 389 ~~~~g~l~dr~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~--------~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~ 460 (512)
.++.+++.||+++|+.. ....+..+..+.++++.+.... ..+..+.++..++.+++.+...+......
T Consensus 336 ~~~~~~l~~r~~~r~~~----~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~g~~~~~~~~~~~~~~ 411 (491)
T 4aps_A 336 TPFFAWLWTAWKKNQPS----SPTKFAVGLMFAGLSFLLMAIPGALYGTSGKVSPLWLVGSWALVILGEMLISPVGLSVT 411 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHHTTTC-------CHHHHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHCCCCTTCCTHHHHHHHHHHHHHHHTTTTHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHhccCCC----chHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCCCCccHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHH
Confidence 99999999999876432 1122223333333333322221 12334555666777777777777777788
Q ss_pred hhhcCcchhHHHHHHHHhhhchhhhhHHhhhhhccccc
Q 010350 461 HQDISPEYASILLGITNTVGAVPGIVGVALTGYLLDST 498 (512)
Q Consensus 461 ~~~~~~~~~g~~~g~~~~~~~lg~~i~p~i~G~l~~~~ 498 (512)
.+..|+++||++.|+.++..++|..++|.+.|.+.+..
T Consensus 412 ~~~~p~~~~g~~~g~~~~~~~~g~~i~~~~~~~~~~~~ 449 (491)
T 4aps_A 412 TKLAPKAFNSQMMSMWFLSSSVGSALNAQLVTLYNAKS 449 (491)
T ss_dssp HHHTTTTCSSSSTHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGGSS
T ss_pred HHhCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccc
Confidence 88899999999999999999999999999999998763
No 5
>4gc0_A D-xylose-proton symporter; MFS, transport protein; HET: 6BG BNG; 2.60A {Escherichia coli} PDB: 4gbz_A* 4gby_A*
Probab=99.97 E-value=7.3e-29 Score=253.44 Aligned_cols=370 Identities=16% Similarity=0.161 Sum_probs=252.3
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhcccCC--------CchhhHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhcCCchHHHHHHHH
Q 010350 117 GTTSLAFVICNMDKVNLSVAIIPMSHRFGW--------NSSVAGLVQSSFFWGYALSQLPGGWLAKIFGGRKVLQTGVLI 188 (512)
Q Consensus 117 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~--------s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~g~r~~~~~~~~~ 188 (512)
+..++..++.++|...++..+|.+.++++. +..+.|++.+++.++..+|++++|+++||+|||++++++.++
T Consensus 15 ~~a~lg~~~~Gyd~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~s~~~~G~~iG~~~~G~laDr~GRk~~l~~~~~l 94 (491)
T 4gc0_A 15 LVATLGGLLFGYDTAVISGTVESLNTVFVAPQNLSESAANSLLGFCVASALIGCIIGGALGGYCSNRFGRRDSLKIAAVL 94 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHGGGGTHHHHHHHHTGGGCCCHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCCCCCcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCHHHHHHHHHH
Confidence 344566677788999999999988877743 345678999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHHHHH-----------------hhhhHHHHHHHHHHHHhhcccchhhHHHHHHhhcCccchhhHHHHHHhhhhhH
Q 010350 189 WSLATALLPL-----------------LAGFMPGLVLSRVLVGIGEGVSPSAATDLIARSIPLEERSRAVSFVFGGLSFG 251 (512)
Q Consensus 189 ~~~~~~~~~~-----------------~~~~~~~~~~~r~l~G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~g 251 (512)
+.++.++.++ .++++++++++|+++|++.|...+....+++|+.|+++|++..++...+..+|
T Consensus 95 ~~i~~i~~a~~~~~~~~~~~~~~~~~~~a~~~~~l~~~R~l~G~g~G~~~~~~~~~i~E~~p~~~rg~~~~~~~~~~~~g 174 (491)
T 4gc0_A 95 FFISGVGSAWPELGFTSINPDNTVPVYLAGYVPEFVIYRIIGGIGVGLASMLSPMYIAELAPAHIRGKLVSFNQFAIIFG 174 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHCTTTTTSCSSSSSSCCGGGGGCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSCGGGHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHhhhhhhhcchhHHHHHHhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhCCHHhhhhhHHhhhhhhhhh
Confidence 9999887753 46788999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred HHHHhhhhHHhccc--------cCchHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccCCCCCCCCCCcchh--hhhhhhhhhh---hHH
Q 010350 252 SVAGLLLAPPIIEN--------LGWESVFYIFGLLGIAWFSGFKILQEGETSNGATLAPRSN--YINMKKSLSA---SLE 318 (512)
Q Consensus 252 ~~~~~~~~~~l~~~--------~gw~~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~--~~~~~~~~~~---~~~ 318 (512)
..+++.++..+... .+||+.+.+..+..++..+..++.||+++....+.+.++. ..++...... +..
T Consensus 175 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~peSp~~L~~~~~~~~a~~~l~~~~~~~~~~~~~~ 254 (491)
T 4gc0_A 175 QLLVYCVNYFIARSGDASWLNTDGWRYMFASECIPALLFLMLLYTVPESPRWLMSRGKQEQAEGILRKIMGNTLATQAVQ 254 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHTTSCTTTTTTTHHHHHHHTTHHHHHHHHHHGGGSCCCHHHHHHTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred hhhhhhcchhhccccccccccchhhHHHhhhhhhhhhhhhhhhhcCCCChHHHHHcCchhHHHHhHHHhcCCchhHHHHH
Confidence 99999988876543 3477777777777777777777888876532222221111 1111110000 000
Q ss_pred ----hhcCCCCCccHHHHhhcHhHHHHHH-HHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCChhhhHHHhhhhHHHHHHHHHHHH
Q 010350 319 ----EMGESLKDVPWKAIFRSKAVWAMIY-AHFCGSWGHYTCLSWLPTYFSEELSLNLTEAAWVSILPPLASVLVTSIAA 393 (512)
Q Consensus 319 ----~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~p~~l~~~~g~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~g 393 (512)
...+..+.......++.+....... ..+......+.+..|.|.+.+ ..+.+...........++..+++.++.+
T Consensus 255 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 333 (491)
T 4gc0_A 255 EIKHSLDHGRKTGGRLLMFGVGVIVIGVMLSIFQQFVGINVVLYYAPEVFK-TLGASTDIALLQTIIVGVINLTFTVLAI 333 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHTTHHHHSCCTHHHHHHHHHHHHHHTCHHHHHHHHHHHHH-HSSCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHhhhhhhhHHHHhcccHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHhcchHHHH-hcCCCccchhhHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 0000011111223333444433333 333344445556666776665 4688888888788888899999999999
Q ss_pred HHHhHHHHcCCCccchhHHHHHHHhHHHHHHHHHh--hccCCCChHH-HHHHHHHHHHHHH-hhhhhhhhHhhhcCcchh
Q 010350 394 QFADNLIATGVETTMVRKICQTIAFLSPAVCMTLS--SIDLGLPHWE-IVGILTAGLALSS-FALSGLYCTHQDISPEYA 469 (512)
Q Consensus 394 ~l~dr~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~--~~~~~~~~~~-~~~~~~~g~~~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 469 (512)
++.||+|+| .....+.....+++... ........+. ++..++...+++. ..+....+..+.+|++.|
T Consensus 334 ~l~dr~Grr---------~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~E~fPt~~R 404 (491)
T 4gc0_A 334 MTVDKFGRK---------PLQIIGALGMAIGMFSLGTAFYTQAPGIVALLSMLFYVAAFAMSWGPVCWVLLSEIFPNAIR 404 (491)
T ss_dssp HHHHHHCSH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTHHHHHHHHHSSCTTTH
T ss_pred HHHHhhcCc---------chhccchHHHHHHHHHHHHHHhcccchHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHhCCHhHH
Confidence 999999864 22222222222222211 1112222222 2222222222222 233344556677899999
Q ss_pred HHHHHHHHhhhchhhhhHHhhhhhccc
Q 010350 470 SILLGITNTVGAVPGIVGVALTGYLLD 496 (512)
Q Consensus 470 g~~~g~~~~~~~lg~~i~p~i~G~l~~ 496 (512)
+++.|+.+.++++++++++.+...+.+
T Consensus 405 ~~~~g~~~~~~~~~~~i~~~~~p~l~~ 431 (491)
T 4gc0_A 405 GKALAIAVAAQWLANYFVSWTFPMMDK 431 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHCH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 999999999999999999988776654
No 6
>2cfq_A Lactose permease; transport, transport mechanism, lactose/H+ symport, sugar transport, transmembrane, formylation; 2.95A {Escherichia coli} SCOP: f.38.1.2 PDB: 1pv7_A* 1pv6_A 2cfp_A 2v8n_A 2y5y_A*
Probab=99.96 E-value=3e-29 Score=250.66 Aligned_cols=366 Identities=11% Similarity=0.014 Sum_probs=236.9
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhh-hhcccCCCchhhHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhcCCchHHHHHHHHHHHHHH
Q 010350 116 IGTTSLAFVICNMDKVNLSVAIIP-MSHRFGWNSSVAGLVQSSFFWGYALSQLPGGWLAKIFGGRKVLQTGVLIWSLATA 194 (512)
Q Consensus 116 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~g~s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~g~r~~~~~~~~~~~~~~~ 194 (512)
+..+....+........+.+.+|. +++++|+|..+.|++.+++.+++.++++++|+++||+|||++++++..+++++..
T Consensus 9 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~g~s~~~~g~~~~~~~~~~~i~~~~~G~lsDr~Grr~~l~~~~~~~~~~~~ 88 (417)
T 2cfq_A 9 FWMFGLFFFFYFFIMGAYFPFFPIWLHDINHISKSDTGIIFAAISLFSLLFQPLFGLLSDKLGLRKYLLWIITGMLVMFA 88 (417)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHTTTCCCTTTSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSTTCCHHHHHHHHTTSCHH
T ss_pred hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 334444445555566666777777 5567999999999999999999999999999999999999999988777654321
Q ss_pred HHH--HhhhhH-HHHHHHHHHHHhhcccchhhHHHHHHhhcCc--cchhhHHHHHHhhhhhHHHHHhhhhHHhccccCch
Q 010350 195 LLP--LLAGFM-PGLVLSRVLVGIGEGVSPSAATDLIARSIPL--EERSRAVSFVFGGLSFGSVAGLLLAPPIIENLGWE 269 (512)
Q Consensus 195 ~~~--~~~~~~-~~~~~~r~l~G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~--~~r~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~l~~~~gw~ 269 (512)
... ...... ..++..+++.|++.+...+.....+.++.++ ++++...+.......+|..++|.+++++.+ .+|+
T Consensus 89 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~g~~~~~~l~~~l~~-~~~~ 167 (417)
T 2cfq_A 89 PFFIFIFGPLLQYNILVGSIVGGIYLGFCFNAGAPAVEAFIEKVSRRSNFEFGRARMFGCVGWALGASIVGIMFT-INNQ 167 (417)
T ss_dssp HHHHHTHHHHHHTTCCHHHHGGGSSTTHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHTCCHHHHSSSTTTHHHHHHHHHHHHHH-HCSH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhHHHHHHHHHHhhhhcccchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-hchh
Confidence 110 111111 1234456666665554444434444444432 456777888888999999999999999886 5899
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccCCCCCCCCCCcchhhhhhhhhhhhhHHhhcCCCCCccHHHHhhcHhHHHHHHHHHHhH
Q 010350 270 SVFYIFGLLGIAWFSGFKILQEGETSNGATLAPRSNYINMKKSLSASLEEMGESLKDVPWKAIFRSKAVWAMIYAHFCGS 349 (512)
Q Consensus 270 ~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 349 (512)
+.|++.++..++..+..++.++++++..+. +++++. .+++.....+++++++|.++...+..++..
T Consensus 168 ~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~-------------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 233 (417)
T 2cfq_A 168 FVFWLGSGCALILAVLLFFAKTDAPSSATV-ANAVGA-------------NHSAFSLKLALELFRQPKLWFLSLYVIGVS 233 (417)
T ss_dssp HHHTTTTTTTTTHHHHSCSSCCCCSCSSCS-SSSSSS-------------CCCCCCHHHHHHHTTCHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCccccccccc-cccccc-------------ccccccHHHHHHHhcCCchhhHHHHHHHHH
Confidence 999987766544444444443332111100 000000 000011123457888999888777666665
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHhcCC---ChhhhHHHhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHcCCCccchhHHHHHHHhHHHHHHHH
Q 010350 350 WGHYTCLSWLPTYFSEELSL---NLTEAAWVSILPPLASVLVTSIAAQFADNLIATGVETTMVRKICQTIAFLSPAVCMT 426 (512)
Q Consensus 350 ~~~~~~~~~~p~~l~~~~g~---s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 426 (512)
..++....++|.|+.+.++. +....+.+.++..++.+++.++.+++.||+++| +. ...+.+..++...
T Consensus 234 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~g~~--------~~-l~~~~~~~~~~~~ 304 (417)
T 2cfq_A 234 CTYDVFDQQFANFFTSFFATGEQGTRVFGYVTTMGELLNASIMFFAPLIINRIGGK--------NA-LLLAGTIMSVRII 304 (417)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHTSSSHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH--------HH-HHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHhccCCChhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcHH--------HH-HHHHHHHHHHHHH
Confidence 66666677899998765542 234457777888888899999999999999864 22 3333333334333
Q ss_pred HhhccCCCChHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhHhhhcCcchhHHHHHH-HHhhhchhhhhHHhhhhhcccccCcceEEE
Q 010350 427 LSSIDLGLPHWEIVGILTAGLALSSFALSGLYCTHQDISPEYASILLGI-TNTVGAVPGIVGVALTGYLLDSTHSWSVSY 505 (512)
Q Consensus 427 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~g~-~~~~~~lg~~i~p~i~G~l~~~~g~~~~~f 505 (512)
..... .+....++..++.+++.+...........+..|++.||++.|+ +++..++|++++|.++|++.|..| +...|
T Consensus 305 ~~~~~-~~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~p~~~~g~~~g~~~~~~~~lg~~~gp~l~G~l~~~~g-~~~~f 382 (417)
T 2cfq_A 305 GSSFA-TSALEVVILKTLHMFEVPFLLVGCFKYITSQFEVRFSATIYLVCFCFFKQLAMIFMSVLAGNMYESIG-FQGAY 382 (417)
T ss_dssp HHTTC-CSHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHHHTHHHHTHHHHSH-HHHHH
T ss_pred HHHHh-ccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHhhhhHHHHHHhcC-cHHHH
Confidence 33322 2223333333344444444444455667777899999999999 488889999999999999999776 65555
Q ss_pred Ee
Q 010350 506 QC 507 (512)
Q Consensus 506 ~~ 507 (512)
.+
T Consensus 383 ~~ 384 (417)
T 2cfq_A 383 LV 384 (417)
T ss_dssp HH
T ss_pred HH
Confidence 43
No 7
>2xut_A Proton/peptide symporter family protein; transport protein, membrane protein, major facilitator super transporter; 3.62A {Shewanella oneidensis}
Probab=99.94 E-value=5.9e-26 Score=233.86 Aligned_cols=374 Identities=15% Similarity=0.113 Sum_probs=231.2
Q ss_pred HHHHHHHHHHhhhhhhhhhhh-hhcccC------CCchhhHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhc-CCchHHHHHHHHHH
Q 010350 119 TSLAFVICNMDKVNLSVAIIP-MSHRFG------WNSSVAGLVQSSFFWGYALSQLPGGWLAKIF-GGRKVLQTGVLIWS 190 (512)
Q Consensus 119 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~g------~s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~-g~r~~~~~~~~~~~ 190 (512)
+.+..++..+......+.++. +.+++| .|..+.+++.+++.++..++++++|+++||+ |||+++.++.++.+
T Consensus 17 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~l~~~~~~~~~~~~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~G~l~dr~~g~r~~~~~~~~~~~ 96 (524)
T 2xut_A 17 IIASEACERFSFYGMRNILTPFLMTALLLSIPEELRGAVAKDVFHSFVIGVYFFPLLGGWIADRFFGKYNTILWLSLIYC 96 (524)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCSSCCSSSTTTTTHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHTTSSCSHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccccccccCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchHHHHHHHHHHH
Confidence 334444444555555555554 677889 9999999999999999999999999999999 99999999999998
Q ss_pred HHHHHHHHhhh-hHHHHHHHHHHHHhhcccchhhHHHHHHhhcCccchhhHHHH---HHhhhhhHHHHHhhhhHHhcccc
Q 010350 191 LATALLPLLAG-FMPGLVLSRVLVGIGEGVSPSAATDLIARSIPLEERSRAVSF---VFGGLSFGSVAGLLLAPPIIENL 266 (512)
Q Consensus 191 ~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~r~l~G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~---~~~~~~~g~~~~~~~~~~l~~~~ 266 (512)
++.++.+ .++ +++.+++.|++.|++.+...+...++++|++|+++|+++.+. +..+..+|.+++|.+++++.+..
T Consensus 97 ~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~g~~~~~~l~~~~ 175 (524)
T 2xut_A 97 VGHAFLA-IFEHSVQGFYTGLFLIALGSGGIKPLVSSFMGDQFDQSNKSLAQKAFDMFYFTINFGSFFASLSMPLLLKNF 175 (524)
T ss_dssp HHHHHHH-HTSSCHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHTCSTTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSTHHHHTS
T ss_pred HHHHHHH-HhcccHHHHHHHHHHHHHhccccchhHHHHHHHHcCccchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccc
Confidence 8887775 455 778999999999999999999999999999999999876666 88999999999999999999989
Q ss_pred CchHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccCCCCCCCCCCcchh---h----hhhhhhhhhh---HH-------------hhc--
Q 010350 267 GWESVFYIFGLLGIAWFSGFKILQEGETSNGATLAPRSN---Y----INMKKSLSAS---LE-------------EMG-- 321 (512)
Q Consensus 267 gw~~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~---~----~~~~~~~~~~---~~-------------~~~-- 321 (512)
|||+.|++.+++.++..+..++..++.+.+..+..+..+ . .+.++...+. .. ..+
T Consensus 176 g~~~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 255 (524)
T 2xut_A 176 GAAVAFGIPGVLMFVATVFFWLGRKRYIHMPPEPKDPHGFLPVIRSALLTKVEGKGNIGLVLALIGGVSAAYALVNIPTL 255 (524)
T ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSSSCCCCC--------------------CTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHTGGGTTTT
T ss_pred cHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcccccccCCCCccchhHHHHHHHHHhhhhcccCccchhhhhhhhhhhhhhhcccchh
Confidence 999999998887666555444332211111100000000 0 0000000000 00 000
Q ss_pred --------------CCCCCccHH------------HHhhcHhHHHHHHHHHHhHHHHHH----HHHHHHHHHHHhcCCCh
Q 010350 322 --------------ESLKDVPWK------------AIFRSKAVWAMIYAHFCGSWGHYT----CLSWLPTYFSEELSLNL 371 (512)
Q Consensus 322 --------------~~~~~~~~~------------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~----~~~~~p~~l~~~~g~s~ 371 (512)
+...+.+|+ ...+.+..+..... ++.....+. ....++.+..+ .+.+.
T Consensus 256 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~ 333 (524)
T 2xut_A 256 GIVAGLCCAMVLVMGFVGAGASLQLERARKSHPDAAVDGVRSVLRILVL-FALVTPFWSLFDQKASTWILQAND-MVKPQ 333 (524)
T ss_dssp CSSHHHHHHHHHHHHHHHTGGGTHHHHSCCSCCSSSSTTTTTHHHHHHH-HTTSHHHHTTTSSTTTHHHHHHHH-SCCCS
T ss_pred hhhhhhhhhhhhhhcccccchhhHHhhhhccccHhHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHhccchhhHHhHHh-cCCCe
Confidence 000000110 00111222222111 111111111 12233333322 23322
Q ss_pred -hhhHHHhhhhHHHHHHHHHHHHHHH-hHHHHcCCCccchhHHHHHHHhHHHHHHHHHhhcc--------CCCChHHHHH
Q 010350 372 -TEAAWVSILPPLASVLVTSIAAQFA-DNLIATGVETTMVRKICQTIAFLSPAVCMTLSSID--------LGLPHWEIVG 441 (512)
Q Consensus 372 -~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~-dr~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~--------~~~~~~~~~~ 441 (512)
...+.+.....++.+++..+.+++. ++.++++.+.. .+....++.++.++++.+.... ..+..+.++.
T Consensus 334 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~--~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 411 (524)
T 2xut_A 334 WFEPAMMQALNPLLVMLLIPFNNFVLYPAIERMGVKLT--ALRKMGAGIAITGLSWIVVGTIQLMMDGGSALSIFWQILP 411 (524)
T ss_dssp SSCHHHHHTTSGGGHHHHGGGTTTC------------C--CHHHHHTHHHHHHHHHHTTTTTTTTTTTTCCCCSHHHHHH
T ss_pred eecHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHhhhHHHHHhcCCCCC--hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCCCcCHHHHHHH
Confidence 2455666665566666665555543 22222111111 1122334444444444433331 1234455666
Q ss_pred HHHHHHHHHHhhhhhhhhHhhhcCcchhHHHHHHHHhhhchhhhhHHhhhhhcccc
Q 010350 442 ILTAGLALSSFALSGLYCTHQDISPEYASILLGITNTVGAVPGIVGVALTGYLLDS 497 (512)
Q Consensus 442 ~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~g~~~~~~~lg~~i~p~i~G~l~~~ 497 (512)
.++.+++.+...+.......+..|+++||+++|+.++..++|+.++|.+.|.+.+.
T Consensus 412 ~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~p~~~~g~~~g~~~~~~~~g~~~g~~~~g~~~~~ 467 (524)
T 2xut_A 412 YALLTFGEVLVSATGLEFAYSQAPKAMKGTIMSFWTLSVTVGNLWVLLANVSVKSP 467 (524)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHTTTHHHHCCTTCCTTTHHHHGGGHHHHHHHHHHHHHHTTSC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCcHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccc
Confidence 77778888877888888888889999999999999999999999999999999884
No 8
>1pw4_A Glycerol-3-phosphate transporter; transmembrane, inner membrane, major facilitator superfamily, secondary active membrane transporter; 3.30A {Escherichia coli} SCOP: f.38.1.1
Probab=99.63 E-value=2e-15 Score=151.80 Aligned_cols=177 Identities=14% Similarity=0.054 Sum_probs=145.3
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhcc-cCCCchhhHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhc--CCchHHHHHHHHHH
Q 010350 114 KLIGTTSLAFVICNMDKVNLSVAIIPMSHR-FGWNSSVAGLVQSSFFWGYALSQLPGGWLAKIF--GGRKVLQTGVLIWS 190 (512)
Q Consensus 114 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~g~s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~--g~r~~~~~~~~~~~ 190 (512)
+.+..+.+..++.......+..+.|.+.++ +|.+..+.+++.+...++..++.++.|++.||+ |||+.+.++.++..
T Consensus 252 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 331 (451)
T 1pw4_A 252 KLLWYIAIANVFVYLLRYGILDWSPTYLKEVKHFALDKSSWAYFLYEYAGIPGTLLCGWMSDKVFRGNRGATGVFFMTLV 331 (451)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHBTTBSCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSTTCHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCchhHHHHHHHHH
Confidence 344455555556666666677778876555 899999999999999999999999999999999 99999988877766
Q ss_pred -HHHHHHHHhh-hhHHHHHHHHHHHHhhcccchhhHHHHHHhhcCccchhhHHHHHHhhhhh-HHHHHhhhhHHhccccC
Q 010350 191 -LATALLPLLA-GFMPGLVLSRVLVGIGEGVSPSAATDLIARSIPLEERSRAVSFVFGGLSF-GSVAGLLLAPPIIENLG 267 (512)
Q Consensus 191 -~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~r~l~G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~-g~~~~~~~~~~l~~~~g 267 (512)
++.++..... .+.+.+.+..++.|++.+...+....++.|.+|+++|++++|+.+....+ |..++|.+.|++.+..|
T Consensus 332 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~g~l~~~~g 411 (451)
T 1pw4_A 332 TIATIVYWMNPAGNPTVDMICMIVIGFLIYGPVMLIGLHALELAPKKAAGTAAGFTGLFGYLGGSVAASAIVGYTVDFFG 411 (451)
T ss_dssp HHHHHHTTSCCTTCHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHTSCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSC
T ss_pred HHHHHHHHHhcccCHHHHHHHHHHHHHHHhchHHHHHHHHHHHhchhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcC
Confidence 4554443222 25567788888999999988888899999999999999999999999999 99999999999999999
Q ss_pred chHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhc
Q 010350 268 WESVFYIFGLLGIAWFSGFKILQ 290 (512)
Q Consensus 268 w~~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 290 (512)
|++.|++.+++.++..+..++..
T Consensus 412 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 434 (451)
T 1pw4_A 412 WDGGFMVMIGGSILAVILLIVVM 434 (451)
T ss_dssp SHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred cHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 99999998888777666555543
No 9
>2cfq_A Lactose permease; transport, transport mechanism, lactose/H+ symport, sugar transport, transmembrane, formylation; 2.95A {Escherichia coli} SCOP: f.38.1.2 PDB: 1pv7_A* 1pv6_A 2cfp_A 2v8n_A 2y5y_A*
Probab=99.45 E-value=4.8e-13 Score=133.11 Aligned_cols=141 Identities=13% Similarity=0.069 Sum_probs=115.8
Q ss_pred CchhhHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhcCCchHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHHHHHHHHHHhhcccchhhHHH
Q 010350 147 NSSVAGLVQSSFFWGYALSQLPGGWLAKIFGGRKVLQTGVLIWSLATALLPLLAGFMPGLVLSRVLVGIGEGVSPSAATD 226 (512)
Q Consensus 147 s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~g~r~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~l~G~~~~~~~~~~~~ 226 (512)
+....++..++..++..++.++.|+++||+|||+++.++.++.+++.++.+ ..++.+.+++..++.+++.+...+....
T Consensus 257 ~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~g~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~ 335 (417)
T 2cfq_A 257 GTRVFGYVTTMGELLNASIMFFAPLIINRIGGKNALLLAGTIMSVRIIGSS-FATSALEVVILKTLHMFEVPFLLVGCFK 335 (417)
T ss_dssp HTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT-TCCSHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred ChhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HhccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 345668888888888899999999999999999999988888777665553 3445566777777888877766777788
Q ss_pred HHHhhcCccchhhHHHH-HHhhhhhHHHHHhhhhHHhccccCchHHHHHHHHHHHHHHHHHHh
Q 010350 227 LIARSIPLEERSRAVSF-VFGGLSFGSVAGLLLAPPIIENLGWESVFYIFGLLGIAWFSGFKI 288 (512)
Q Consensus 227 ~~~~~~~~~~r~~~~~~-~~~~~~~g~~~~~~~~~~l~~~~gw~~~f~~~~~~~~~~~~~~~~ 288 (512)
+++|.+|++.|+.+.++ ++....+|.+++|.++|++.++.|++..|++.+++.++..+..++
T Consensus 336 ~~~~~~p~~~~g~~~g~~~~~~~~lg~~~gp~l~G~l~~~~g~~~~f~~~~~~~l~~~~~~~~ 398 (417)
T 2cfq_A 336 YITSQFEVRFSATIYLVCFCFFKQLAMIFMSVLAGNMYESIGFQGAYLVLGLVALGFTLISVF 398 (417)
T ss_dssp HHHHHSCHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHHHTHHHHTHHHHSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT
T ss_pred HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHhhhhHHHHHHhcCcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh
Confidence 99999999999999999 588888999999999999999889999999888877766555443
No 10
>3o7q_A L-fucose-proton symporter; transporter, multi-PASS membrane protei transport protein; HET: BNG; 3.14A {Escherichia coli} PDB: 3o7p_A*
Probab=99.44 E-value=7.4e-13 Score=132.47 Aligned_cols=160 Identities=16% Similarity=0.108 Sum_probs=126.5
Q ss_pred HHHHHHHHhhhhhhhhhhhh-hcc-cCCCchhhHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhcCCchHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 010350 121 LAFVICNMDKVNLSVAIIPM-SHR-FGWNSSVAGLVQSSFFWGYALSQLPGGWLAKIFGGRKVLQTGVLIWSLATALLPL 198 (512)
Q Consensus 121 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~-~g~s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~g~r~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 198 (512)
+..++.......+..+.|.+ .++ +|.+..+.++..+++.++..++.++.|+++||+|||+++.++.++..++.++..
T Consensus 265 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~~r~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~- 343 (438)
T 3o7q_A 265 LAQFCYVGAQTACWSYLIRYAVEEIPGMTAGFAANYLTGTMVCFFIGRFTGTWLISRFAPHKVLAAYALIAMALCLISA- 343 (438)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSTTCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhccCCcchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchHHHHHHHHHHHHHHHHHH-
Confidence 33344444455555666665 544 599999999999999999999999999999999999999999888877776664
Q ss_pred hhhhHHHHHHHHHHHHhhcccchhhHHHHHHhhcCccchhhHHHHHHhhhhhHHHHHhhhhHHhccccC-chHHHHHHHH
Q 010350 199 LAGFMPGLVLSRVLVGIGEGVSPSAATDLIARSIPLEERSRAVSFVFGGLSFGSVAGLLLAPPIIENLG-WESVFYIFGL 277 (512)
Q Consensus 199 ~~~~~~~~~~~r~l~G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~l~~~~g-w~~~f~~~~~ 277 (512)
..++... ++..++.|++.+...+...++..|.+|++ ++.+.++.. ...+|..++|.+.|++.+..| +++.|++.++
T Consensus 344 ~~~~~~~-~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~-~~~~g~~~~~~~~g~l~~~~g~~~~~~~~~~~ 420 (438)
T 3o7q_A 344 FAGGHVG-LIALTLCSAFMSIQYPTIFSLGIKNLGQD-TKYGSSFIV-MTIIGGGIVTPVMGFVSDAAGNIPTAELIPAL 420 (438)
T ss_dssp HCCHHHH-HHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHSSCGGG-HHHHHHHHH-HTTHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSGGGGHHHHH
T ss_pred HcCCcHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhcccc-ccchhhHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchHHHHHHHHH
Confidence 4444343 44458889999999999999999999855 888888877 667999999999999999999 9999988665
Q ss_pred HHHHHHH
Q 010350 278 LGIAWFS 284 (512)
Q Consensus 278 ~~~~~~~ 284 (512)
..++..+
T Consensus 421 ~~~~~~~ 427 (438)
T 3o7q_A 421 CFAVIFI 427 (438)
T ss_dssp HHHHHHH
T ss_pred HHHHHHH
Confidence 5444433
No 11
>4gc0_A D-xylose-proton symporter; MFS, transport protein; HET: 6BG BNG; 2.60A {Escherichia coli} PDB: 4gbz_A* 4gby_A*
Probab=99.32 E-value=4.4e-11 Score=121.52 Aligned_cols=181 Identities=11% Similarity=0.017 Sum_probs=132.3
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhcccCCCchhhHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhcCCchHHHHHHHHHHHHH
Q 010350 114 KLIGTTSLAFVICNMDKVNLSVAIIPMSHRFGWNSSVAGLVQSSFFWGYALSQLPGGWLAKIFGGRKVLQTGVLIWSLAT 193 (512)
Q Consensus 114 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~g~r~~~~~~~~~~~~~~ 193 (512)
+.........+....+...+..+.+.+.+..+.+.........+..+...++.++.+++.||+|||+.++.+....+++.
T Consensus 277 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~dr~Grr~~~~~~~~~~~~~~ 356 (491)
T 4gc0_A 277 VIVIGVMLSIFQQFVGINVVLYYAPEVFKTLGASTDIALLQTIIVGVINLTFTVLAIMTVDKFGRKPLQIIGALGMAIGM 356 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHTCHHHHHHHHHHHHHHSSCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCSHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHhcchHHHHhcCCCccchhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhcCcchhccchHHHHHHH
Confidence 44445555555556666777777888888889888888888888888899999999999999999999999888777766
Q ss_pred HHHHHhh----hhHHHHH-HHHHHHHhhcccchhhHHHHHHhhcCccchhhHHHHHHhhhhhHHHHHhhhhHHhcc----
Q 010350 194 ALLPLLA----GFMPGLV-LSRVLVGIGEGVSPSAATDLIARSIPLEERSRAVSFVFGGLSFGSVAGLLLAPPIIE---- 264 (512)
Q Consensus 194 ~~~~~~~----~~~~~~~-~~r~l~G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~l~~---- 264 (512)
+..+... .....++ +..+..+++ ....+..+.+.+|.+|.+.|++++|+......+++++++.+.+.+.+
T Consensus 357 ~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~E~fPt~~R~~~~g~~~~~~~~~~~i~~~~~p~l~~~~~~ 435 (491)
T 4gc0_A 357 FSLGTAFYTQAPGIVALLSMLFYVAAFA-MSWGPVCWVLLSEIFPNAIRGKALAIAVAAQWLANYFVSWTFPMMDKNSWL 435 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHTTCCHHHHHHHHHHHHHHHH-TTTTHHHHHHHHHSSCTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHCHHHHH
T ss_pred HHHHHHHhcccchHHHHHHHHHHHHHHH-hHHHHHHHHHHHHhCCHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 5543221 1111122 222222333 33446778899999999999999999999999999999988776654
Q ss_pred --ccCchHHHHHHHHHHHHHHH-HHHhhccCCCC
Q 010350 265 --NLGWESVFYIFGLLGIAWFS-GFKILQEGETS 295 (512)
Q Consensus 265 --~~gw~~~f~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~ 295 (512)
..++.+.|++.++++++..+ .++++||++.+
T Consensus 436 ~~~~~~~~~~~i~~~~~~~~~i~~~~~~PETkg~ 469 (491)
T 4gc0_A 436 VAHFHNGFSYWIYGCMGVLAALFMWKFVPETKGK 469 (491)
T ss_dssp HHHHTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCTTC
T ss_pred HhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHheecCCCCC
Confidence 34677788888888776654 45677877654
No 12
>4aps_A DI-OR tripeptide H+ symporter; transport protein, peptide transport, major facilitator SUPE transporter, MFS; 3.30A {Streptococcus thermophilus}
Probab=99.23 E-value=5.4e-11 Score=120.85 Aligned_cols=162 Identities=9% Similarity=-0.037 Sum_probs=132.3
Q ss_pred HhHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHh-----cCCChhhhHHHhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhH-HHHcCCCccch
Q 010350 336 KAVWAMIYAHFCGSWGHYTCLSWLPTYFSEE-----LSLNLTEAAWVSILPPLASVLVTSIAAQFADN-LIATGVETTMV 409 (512)
Q Consensus 336 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~p~~l~~~-----~g~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr-~~~~~~~~~~~ 409 (512)
+.++...+..++..+.++....+++.|+++. +|.+..+.+++.+...++..++.++.|+++|| +|+|
T Consensus 13 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~g~r------- 85 (491)
T 4aps_A 13 LGLSTLFMTEMWERFSYYGMRAILLYYMWFLISTGDLHITRATAASIMAIYASMVYLSGTIGGFVADRIIGAR------- 85 (491)
T ss_dssp THHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCCSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCHH-------
T ss_pred hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccchhhcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccccch-------
Confidence 4667778888888889999999999999988 89999999999999999999999999999999 8864
Q ss_pred hHHHHHHHhHHHHHHHHHhhccCCCChHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhHhhhcCcch--hHHHHHHHHhhhchhhhhH
Q 010350 410 RKICQTIAFLSPAVCMTLSSIDLGLPHWEIVGILTAGLALSSFALSGLYCTHQDISPEY--ASILLGITNTVGAVPGIVG 487 (512)
Q Consensus 410 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~--~g~~~g~~~~~~~lg~~i~ 487 (512)
..+..+.++..++..+.... .+....++..++.|++.+...+.....+.+.+++++ |+.+.++.+...++|..++
T Consensus 86 --~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~g~~~~ 162 (491)
T 4aps_A 86 --PAVFWGGVLIMLGHIVLALP-FGASALFGSIILIIIGTGFLKPNVSTLVGTLYDEHDRRRDAGFSIFVFGINLGAFIA 162 (491)
T ss_dssp --HHHHHHHHHHHHHHHHHHSC-CSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred --HHHHHHHHHHHHHHHHHHHh-hhHHHHHHHHHHHHHHHHhccchHHHHHHHHcCcccccceeeehHHHHHHHHHHHHH
Confidence 34444444444444444443 344556667778888888888888888888888888 8888998999999999999
Q ss_pred HhhhhhcccccCcceEEEEec
Q 010350 488 VALTGYLLDSTHSWSVSYQCP 508 (512)
Q Consensus 488 p~i~G~l~~~~g~~~~~f~~~ 508 (512)
|.++|.+.+..| |++.|++.
T Consensus 163 ~~~~~~l~~~~g-~~~~f~~~ 182 (491)
T 4aps_A 163 PLIVGAAQEAAG-YHVAFSLA 182 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHHSC-HHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHhhhh-HHHHHHHH
Confidence 999999999887 88776654
No 13
>2xut_A Proton/peptide symporter family protein; transport protein, membrane protein, major facilitator super transporter; 3.62A {Shewanella oneidensis}
Probab=99.15 E-value=5.1e-11 Score=122.12 Aligned_cols=164 Identities=12% Similarity=0.000 Sum_probs=128.1
Q ss_pred cHhHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcC------CChhhhHHHhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhHH-HHcCCCcc
Q 010350 335 SKAVWAMIYAHFCGSWGHYTCLSWLPTYFSEELS------LNLTEAAWVSILPPLASVLVTSIAAQFADNL-IATGVETT 407 (512)
Q Consensus 335 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~p~~l~~~~g------~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~-~~~~~~~~ 407 (512)
++.+|.+.+..++....++....++|.|+++.+| .+..+.+++.+...++..++.++.|+++||+ |+|
T Consensus 11 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~l~~~~~~~~~~~~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~G~l~dr~~g~r----- 85 (524)
T 2xut_A 11 PRQIPYIIASEACERFSFYGMRNILTPFLMTALLLSIPEELRGAVAKDVFHSFVIGVYFFPLLGGWIADRFFGKY----- 85 (524)
T ss_dssp --CCTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCSSCCSSSTTTTTHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHTTSSCSH-----
T ss_pred CcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccccccccCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcch-----
Confidence 4566777888888888999999999999998889 9999999999999999999999999999999 853
Q ss_pred chhHHHHHHHhHHHHHHHHHhhccCCCChHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhHhhhcCcchhHHHHHH---HHhhhchhh
Q 010350 408 MVRKICQTIAFLSPAVCMTLSSIDLGLPHWEIVGILTAGLALSSFALSGLYCTHQDISPEYASILLGI---TNTVGAVPG 484 (512)
Q Consensus 408 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~g~---~~~~~~lg~ 484 (512)
....++.++..++.++......+....++..++.|++.+...+.....+.+.+++++|+++.+. .+...++|.
T Consensus 86 ----~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~~~~g~ 161 (524)
T 2xut_A 86 ----NTILWLSLIYCVGHAFLAIFEHSVQGFYTGLFLIALGSGGIKPLVSSFMGDQFDQSNKSLAQKAFDMFYFTINFGS 161 (524)
T ss_dssp ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSCHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHTCSTTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcccHHHHHHHHHHHHHhccccchhHHHHHHHHcCccchHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 3333444444444444433321344556667778888888888888888888999999766665 889999999
Q ss_pred hhHHhhhhhcccccCcceEEEEec
Q 010350 485 IVGVALTGYLLDSTHSWSVSYQCP 508 (512)
Q Consensus 485 ~i~p~i~G~l~~~~g~~~~~f~~~ 508 (512)
+++|.++|.+.+..| |+..|++.
T Consensus 162 ~~g~~~~~~l~~~~g-~~~~f~~~ 184 (524)
T 2xut_A 162 FFASLSMPLLLKNFG-AAVAFGIP 184 (524)
T ss_dssp HHHHHTSTHHHHTSC-HHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHhcccc-HHHHHHHH
Confidence 999999999998877 87766544
No 14
>2gfp_A EMRD, multidrug resistance protein D; membrane protein, multidrug transporter; 3.50A {Escherichia coli}
Probab=99.10 E-value=6.9e-11 Score=115.55 Aligned_cols=160 Identities=13% Similarity=-0.059 Sum_probs=122.3
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhcc-cCCCchhhHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhcCCchHHHHHHHH-HHH
Q 010350 114 KLIGTTSLAFVICNMDKVNLSVAIIPMSHR-FGWNSSVAGLVQSSFFWGYALSQLPGGWLAKIFGGRKVLQTGVLI-WSL 191 (512)
Q Consensus 114 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~g~s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~g~r~~~~~~~~~-~~~ 191 (512)
+.+....+..++.......+....|.+.++ +|.+..+.+++.+...++..++.++.+++.||+|++. ..+..+ ...
T Consensus 199 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~r~~~~~--~~~~~~~~~~ 276 (375)
T 2gfp_A 199 SGFNCYLLMLIGGLAGIAAFEACSGVLMGAVLGLSSMTVSILFILPIPAAFFGAWFAGRPNKRFSTLM--WQSVICCLLA 276 (375)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCSCSSHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHTTTTHHHHHH--HHHHHHHHHT
T ss_pred cchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHH
Confidence 344445555556666666777778876555 8999999999999999999999999999999998832 223222 222
Q ss_pred HHH--HHHH-hhhhHHHHHHHHHHHHhhcccchhhHHHHHHhhcCccchhhHHHHHHhhhhhHHHHHhhhhHHhccccCc
Q 010350 192 ATA--LLPL-LAGFMPGLVLSRVLVGIGEGVSPSAATDLIARSIPLEERSRAVSFVFGGLSFGSVAGLLLAPPIIENLGW 268 (512)
Q Consensus 192 ~~~--~~~~-~~~~~~~~~~~r~l~G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~l~~~~gw 268 (512)
+.. .... ..++.+.+++..++.|++.+...+...+++.|..| ++|+++.|+.+....+|..++|.+.+.+.+..+|
T Consensus 277 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~p-~~~g~~~g~~~~~~~~g~~~~~~~~g~l~~~~~~ 355 (375)
T 2gfp_A 277 GLLMWIPDWFGVMNVWTLLVPAALFFFGAGMLFPLATSGAMEPFP-FLAGTAGALVGGLQNIGSGVLASLSAMLPQTGQG 355 (375)
T ss_dssp SSSSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSTTHHHHHTHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCSTTCTHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHhhhccccHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHhCC-cccchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCcc
Confidence 221 1111 12355667788889999999999999999999998 8999999999999999999999999999888788
Q ss_pred hHHHHHHH
Q 010350 269 ESVFYIFG 276 (512)
Q Consensus 269 ~~~f~~~~ 276 (512)
+..+++.+
T Consensus 356 ~~~~~~~~ 363 (375)
T 2gfp_A 356 SLGLLMTL 363 (375)
T ss_dssp HHHHHHHH
T ss_pred cHHHHHHH
Confidence 87777643
No 15
>2g9p_A Antimicrobial peptide latarcin 2A; helix-hinge-helix, antimicrobial protein; NMR {Synthetic}
Probab=44.12 E-value=8.6 Score=19.29 Aligned_cols=14 Identities=36% Similarity=0.427 Sum_probs=11.1
Q ss_pred hhhhhhhhcCCchH
Q 010350 168 PGGWLAKIFGGRKV 181 (512)
Q Consensus 168 ~~g~l~dr~g~r~~ 181 (512)
++|.+..+||||.+
T Consensus 2 lfgklikkfgrkai 15 (26)
T 2g9p_A 2 LFGKLIKKFGRKAI 15 (26)
T ss_dssp HHHHHHHHHTSHHH
T ss_pred cHHHHHHHHhHHHH
Confidence 46889999999854
No 16
>2jln_A MHP1; hydantoin, transporter, membrane protein, nucleobase-cation-symport-1 family; 2.85A {Microbacterium liquefaciens} PDB: 2jlo_A* 2x79_A
Probab=36.92 E-value=3.1e+02 Score=26.82 Aligned_cols=50 Identities=10% Similarity=-0.013 Sum_probs=24.6
Q ss_pred cCccch-hhHHHHHHhhhhhHHHHHhh-hhHHhccccCchHHHHHHHHHHHH
Q 010350 232 IPLEER-SRAVSFVFGGLSFGSVAGLL-LAPPIIENLGWESVFYIFGLLGIA 281 (512)
Q Consensus 232 ~~~~~r-~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~-~~~~l~~~~gw~~~f~~~~~~~~~ 281 (512)
.|+++| .....+.....+....++.. +++.+....+|.+.++...+-.++
T Consensus 20 vp~~~R~~~~~~~~~~W~g~~~~i~~~~~Ga~~~~GLs~~~a~lai~lG~li 71 (501)
T 2jln_A 20 TRYAERSVGPFSLAAIWFAMAIQVAIFIAAGQMTSSFQVWQVIVAIAAGCTI 71 (501)
T ss_dssp CCGGGCCBCHHHHHHHHHHHHCSTHHHHHHHHHTTTSCHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred CChhhCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCcCHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 455666 44555544444444334444 333333356677777554444443
Done!