Query 016338
Match_columns 391
No_of_seqs 367 out of 1094
Neff 10.9
Searched_HMMs 29240
Date Mon Mar 25 11:54:01 2013
Command hhsearch -i /work/01045/syshi/csienesis_hhblits_a3m/016338.a3m -d /work/01045/syshi/HHdatabase/pdb70.hhm -o /work/01045/syshi/hhsearch_pdb/016338hhsearch_pdb -cpu 12 -v 0
No Hit Prob E-value P-value Score SS Cols Query HMM Template HMM
1 1pw4_A Glycerol-3-phosphate tr 100.0 6.3E-42 2.2E-46 319.3 31.2 374 2-385 48-434 (451)
2 3o7q_A L-fucose-proton symport 100.0 4.9E-40 1.7E-44 305.4 35.1 360 2-386 46-434 (438)
3 2gfp_A EMRD, multidrug resista 100.0 7.1E-39 2.4E-43 291.6 18.7 341 2-371 20-363 (375)
4 4aps_A DI-OR tripeptide H+ sym 100.0 1.1E-35 3.6E-40 280.4 28.6 367 12-386 49-473 (491)
5 4gc0_A D-xylose-proton symport 100.0 6.9E-34 2.3E-38 268.0 27.9 375 2-387 32-465 (491)
6 2cfq_A Lactose permease; trans 100.0 9.3E-34 3.2E-38 261.3 21.2 367 3-389 28-404 (417)
7 2xut_A Proton/peptide symporte 100.0 1.4E-29 4.9E-34 240.4 24.5 373 6-385 37-503 (524)
8 4aps_A DI-OR tripeptide H+ sym 99.6 2.9E-13 9.9E-18 127.0 20.7 175 200-384 13-196 (491)
9 1pw4_A Glycerol-3-phosphate tr 99.5 4.6E-14 1.6E-18 130.9 13.3 155 4-158 274-433 (451)
10 3o7q_A L-fucose-proton symport 99.5 8.7E-13 3E-17 121.8 19.4 173 202-384 28-229 (438)
11 2xut_A Proton/peptide symporte 99.5 7.6E-13 2.6E-17 125.2 18.1 175 199-383 11-197 (524)
12 2cfq_A Lactose permease; trans 99.5 3.5E-13 1.2E-17 123.8 13.8 147 16-164 258-405 (417)
13 2gfp_A EMRD, multidrug resista 99.4 1.5E-12 5E-17 117.8 9.5 167 204-381 4-171 (375)
14 4gc0_A D-xylose-proton symport 99.3 4.7E-11 1.6E-15 111.9 19.0 160 5-165 300-469 (491)
15 2g9p_A Antimicrobial peptide l 60.8 4.1 0.00014 18.9 1.2 14 36-49 2-15 (26)
16 2jln_A MHP1; hydantoin, transp 22.5 4.4E+02 0.015 24.0 18.1 52 101-152 20-73 (501)
No 1
>1pw4_A Glycerol-3-phosphate transporter; transmembrane, inner membrane, major facilitator superfamily, secondary active membrane transporter; 3.30A {Escherichia coli} SCOP: f.38.1.1
Probab=100.00 E-value=6.3e-42 Score=319.30 Aligned_cols=374 Identities=17% Similarity=0.217 Sum_probs=297.2
Q ss_pred ccchhhHHHHhCCChhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhcCchHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhh--ccchHHHHHHH
Q 016338 2 SVAVVPLAAKFGWSSSFLGIVQSSFLWGYIFSSVIGGALVDKYGGKKVLAWGVALWSLSTLLTPWAA--THSTASLLAVR 79 (391)
Q Consensus 2 ~~~~~~i~~~~~~s~~~~g~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~Grr~~~~~~~~~~~~~~~~~~~a~--~~~~~~~~~~r 79 (391)
++.+|.+.+|+ .|.++.|++.+++.++..++++++|+++||+|||+++.++.++.+++.+++++.. ++|++.+++.|
T Consensus 48 ~~~~~~~~~~~-~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~G~l~dr~g~r~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~ 126 (451)
T 1pw4_A 48 ALAMPYLVEQG-FSRGDLGFALSGISIAYGFSKFIMGSVSDRSNPRVFLPAGLILAAAVMLFMGFVPWATSSIAVMFVLL 126 (451)
T ss_dssp HHHHHHTTSST-TCSSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHSSSSHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHh-ccHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHhcCchHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhccccHHHHHHHH
Confidence 35678899999 9999999999999999999999999999999999999999999999999995510 59999999999
Q ss_pred HHHHhhhhchhhhHHHHhhhhcCccchhhHHHHHHhhhhhhHHHHhhHHHHHHhhcC-chhHHHHHHHHHHHHHHHHhhc
Q 016338 80 AFFGLAEGVAMPAMSTLTSRWFPSHERASAIGICMGGFHLGNVVGLLLTPIMLSTIG-ISGPFILFSSLGLLWLSTWTSK 158 (391)
Q Consensus 80 ~l~G~g~~~~~~~~~~~i~~~~~~~~rg~~~~~~~~~~~lg~~~g~~~~~~l~~~~g-wr~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~ 158 (391)
+++|++.+...+...+++.|++|+|+|++++++.+...++|..++|.+++.+.+..| ||+.|++.+++.++..++.++.
T Consensus 127 ~l~G~~~~~~~~~~~~~i~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~g~~~g~~~~~~l~~~~g~w~~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~ 206 (451)
T 1pw4_A 127 FLCGWFQGMGWPPCGRTMVHWWSQKERGGIVSVWNCAHNVGGGIPPLLFLLGMAWFNDWHAALYMPAFCAILVALFAFAM 206 (451)
T ss_dssp HHHHHHHHHTHHHHHHHHHTTCTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHTSHHHHHHHHHHHTCCSTTCTHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHhhhccchHHHHHHHHCCchhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhh
Confidence 999999999999999999999999999999999999999999999999999889898 9999999999888877777777
Q ss_pred cccCCCCCCCCChhHHHHH--HcCCCcccccCCCcc--HHHhhcCCchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHhhhCCC
Q 016338 159 VTNDPCNSPFVSKSELRLI--QAGKSDSVKKRNPPS--LRHLLSKLPSWTVIIANITNNWGYFVLLSWMPIYFNTVFNVN 234 (391)
Q Consensus 159 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~--~~~~~~~~~~~~~~~--~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~ 234 (391)
.||+|++.+..++++.+.. ++..++++++....+ .++.+|+|.++...+..++..........+.|.|+++.+|.+
T Consensus 207 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~ 286 (451)
T 1pw4_A 207 MRDTPQSCGLPPIEEYKNDYPDDYNEKAEQELTAKQIFMQYVLPNKLLWYIAIANVFVYLLRYGILDWSPTYLKEVKHFA 286 (451)
T ss_dssp CCCSSTTTCCCSCTTTCCC-------------CCTHHHHHHTSSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHBTTBSCCC
T ss_pred ccCCHhhcCCCChhhhcccccccchhhhhcccccccchHHHHHcCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCC
Confidence 7887665432221111000 000001111111222 477889999999999999999999999999999999988999
Q ss_pred cchhhHHhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HhhccchhHHHHHHHHHHhHhhHHHHHHhhcCC--chhHHHHHHHHHHH
Q 016338 235 LKQAAWFSAVPWGTMAVSGYMAGKASDSL--IKAGYSLTLVRKIMQSIGFIGPGVSLLCLNYAK--SPAVAAVLITIALS 310 (391)
Q Consensus 235 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~--~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~--~~~~~~~~~~~~~~ 310 (391)
+.+.+.+.+...++.+++.++.+++.||+ ++| +.......+...++...+...+ +.+.......+.+.
T Consensus 287 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~~~~~~~~~--------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~ 358 (451)
T 1pw4_A 287 LDKSSWAYFLYEYAGIPGTLLCGWMSDKVFRGNR--------GATGVFFMTLVTIATIVYWMNPAGNPTVDMICMIVIGF 358 (451)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSTTCH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHTTSCCTTCHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCc--------hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcccCHHHHHHHHHHHHH
Confidence 99999999999999999999999999998 753 2333333333325555554443 33333333333334
Q ss_pred hhhhcccchhhhhhhccc-cchhHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHhhHhhccccchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhc
Q 016338 311 LSSFSQAGYLLNIQEIAP-DCAGFLHGIANSAGTL-AAIISTIGTGYFVQWLGSFQAFLTVTAGLYFVTTIFWNLYS 385 (391)
Q Consensus 311 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~g~~~~~~~~-g~~i~~~~~g~l~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 385 (391)
......+....+..|..| ++|+++.|+.+...++ |..++|.+.|.+.|..| +...+.+.+++.+++.++.+...
T Consensus 359 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~g~l~~~~g-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 434 (451)
T 1pw4_A 359 LIYGPVMLIGLHALELAPKKAAGTAAGFTGLFGYLGGSVAASAIVGYTVDFFG-WDGGFMVMIGGSILAVILLIVVM 434 (451)
T ss_dssp HHTHHHHHHHHHHHHTSCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSC-SHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHhchHHHHHHHHHHHhchhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcC-cHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 444445555677777777 7899999999999999 99999999999999988 89999988888888877766554
No 2
>3o7q_A L-fucose-proton symporter; transporter, multi-PASS membrane protei transport protein; HET: BNG; 3.14A {Escherichia coli} PDB: 3o7p_A*
Probab=100.00 E-value=4.9e-40 Score=305.43 Aligned_cols=360 Identities=13% Similarity=0.082 Sum_probs=288.9
Q ss_pred ccchhhHHHHhCCChhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhcCchHHHHHHHHHHHHHHhhhhh-hhccchHHHHHHHH
Q 016338 2 SVAVVPLAAKFGWSSSFLGIVQSSFLWGYIFSSVIGGALVDKYGGKKVLAWGVALWSLSTLLTPW-AATHSTASLLAVRA 80 (391)
Q Consensus 2 ~~~~~~i~~~~~~s~~~~g~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~Grr~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-a~~~~~~~~~~~r~ 80 (391)
++.+|.+.+++|.|+++.|++.+.+.+++.+++++.|+++||+|||+++.++.++.+++.+++.. ..+++++.+++.|+
T Consensus 46 ~~~~~~~~~~~g~s~~~~g~~~~~~~~~~~i~~~~~G~l~dr~g~r~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~ 125 (438)
T 3o7q_A 46 DILLPQFQQAFTLTNFQAGLIQSAFYFGYFIIPIPAGILMKKLSYKAGIITGLFLYALGAALFWPAAEIMNYTLFLVGLF 125 (438)
T ss_dssp HHHHHHHHHHSCCCSHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHhcchHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccccccHHHHHHHHH
Confidence 46789999999999999999999999999999999999999999999999999999999998822 23499999999999
Q ss_pred HHHhhhhchhhhHHHHhhhhcCccchhhHHHHHHhhhhhhHHHHhhHHHHHH-hhcC-----------------------
Q 016338 81 FFGLAEGVAMPAMSTLTSRWFPSHERASAIGICMGGFHLGNVVGLLLTPIML-STIG----------------------- 136 (391)
Q Consensus 81 l~G~g~~~~~~~~~~~i~~~~~~~~rg~~~~~~~~~~~lg~~~g~~~~~~l~-~~~g----------------------- 136 (391)
+.|++.+...+...+++.|++|+|+|++++++.+...++|..+++.+++.+. +..+
T Consensus 126 l~G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~g~~~g~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 205 (438)
T 3o7q_A 126 IIAAGLGCLETAANPFVTVLGPESSGHFRLNLAQTFNSFGAIIAVVFGQSLILSNVPHQSQDVLDKMSPEQLSAYKHSLV 205 (438)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSCSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHTSSCCCCHHHHHHSCHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHhhHHHhhhhHHHHHHHHcCchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcccccccccccccCCcchhhhhhhhhh
Confidence 9999999999999999999999999999999999999999999999999998 5554
Q ss_pred --chhHHHHHHHHHHHHHHHHhhc-cccCCCCCCCCChhHHHHHHcCCCcccccCCCccHHHhhcCCchHHHHHHHHHHH
Q 016338 137 --ISGPFILFSSLGLLWLSTWTSK-VTNDPCNSPFVSKSELRLIQAGKSDSVKKRNPPSLRHLLSKLPSWTVIIANITNN 213 (391)
Q Consensus 137 --wr~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 213 (391)
||+.|++.+.+.++..++.++. .||++++++++ +++++...++++++|+|.++...+..++..
T Consensus 206 ~~w~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~p~~~~~~~~~--------------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 271 (438)
T 3o7q_A 206 LSVQTPYMIIVAIVLLVALLIMLTKFPALQSDNHSD--------------AKQGSFSASLSRLARIRHWRWAVLAQFCYV 271 (438)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCTTTCCCC--------------SSTTSHHHHHHHHTTCSHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCccccccccc--------------ccccchhhhHHHHHhChHHHHHHHHHHHHH
Confidence 9999988887776655554433 33333221111 011122346788999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHHHhhHHH-HHhhhCCCcchhhHHhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccchhHHHHHHHHHHhHhhHHHHHHh
Q 016338 214 WGYFVLLSWMPIY-FNTVFNVNLKQAAWFSAVPWGTMAVSGYMAGKASDSLIKAGYSLTLVRKIMQSIGFIGPGVSLLCL 292 (391)
Q Consensus 214 ~~~~~~~~~~~~~-~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 292 (391)
........+.|.| +++.+|.++.+++...+...++..+++++.+++.||+++| ..+..+.+...+.....
T Consensus 272 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~~r~~~~---------~~~~~~~~~~~~~~~~~ 342 (438)
T 3o7q_A 272 GAQTACWSYLIRYAVEEIPGMTAGFAANYLTGTMVCFFIGRFTGTWLISRFAPH---------KVLAAYALIAMALCLIS 342 (438)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHSTTCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHhhhccCCcchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcch---------HHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 9999999999999 8887899999999999999999999999999999999853 45555666666666666
Q ss_pred hcCCchhHHHHHHHHHHHhhhhcccchhhhhhhccccchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHhhccccchhHHHHHHHH
Q 016338 293 NYAKSPAVAAVLITIALSLSSFSQAGYLLNIQEIAPDCAGFLHGIANSAGTLAAIISTIGTGYFVQWLGSFQAFLTVTAG 372 (391)
Q Consensus 293 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~g~~i~~~~~g~l~~~~g~~~~~~~~~~~ 372 (391)
...++........+.+ ...+...+....+..|..|++++.+.++.. ...+++.++|.+.|.+.|..|++...+.+.++
T Consensus 343 ~~~~~~~~~~~~~~~g-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~g~~~~~~~~g~l~~~~g~~~~~~~~~~~ 420 (438)
T 3o7q_A 343 AFAGGHVGLIALTLCS-AFMSIQYPTIFSLGIKNLGQDTKYGSSFIV-MTIIGGGIVTPVMGFVSDAAGNIPTAELIPAL 420 (438)
T ss_dssp HHCCHHHHHHHHHHHH-HHHTTHHHHHHHHHHSSCGGGHHHHHHHHH-HTTHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSGGGGHHHHH
T ss_pred HHcCCcHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHhhccccccchhhHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchHHHHHHHHH
Confidence 6655554444443333 444445566777767777766888888877 77899999999999999998877888887766
Q ss_pred HHHHHHHHHHHhcc
Q 016338 373 LYFVTTIFWNLYST 386 (391)
Q Consensus 373 ~~~~~~~~~~~~~~ 386 (391)
+.++..+..+..+|
T Consensus 421 ~~~~~~~~~~~~~~ 434 (438)
T 3o7q_A 421 CFAVIFIFARFRSQ 434 (438)
T ss_dssp HHHHHHHHHTTCCC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHh
Confidence 66555554443333
No 3
>2gfp_A EMRD, multidrug resistance protein D; membrane protein, multidrug transporter; 3.50A {Escherichia coli}
Probab=100.00 E-value=7.1e-39 Score=291.57 Aligned_cols=341 Identities=14% Similarity=0.105 Sum_probs=279.3
Q ss_pred ccchhhHHHHhCCChhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhcCchHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhccchHHHHHHHHH
Q 016338 2 SVAVVPLAAKFGWSSSFLGIVQSSFLWGYIFSSVIGGALVDKYGGKKVLAWGVALWSLSTLLTPWAATHSTASLLAVRAF 81 (391)
Q Consensus 2 ~~~~~~i~~~~~~s~~~~g~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~Grr~~~~~~~~~~~~~~~~~~~a~~~~~~~~~~~r~l 81 (391)
++.+|.+.+|+|.|+++.+++.+.+.++..+++++.|+++||+|||+++..+..+..++.++.++ ++|++.+++.|++
T Consensus 20 ~~~~~~~~~~~g~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~g~r~~~~~~~~~~~~~~~~~~~--~~~~~~l~~~~~l 97 (375)
T 2gfp_A 20 IPAIADMARDLNVREGAVQSVMGAYLLTYGVSQLFYGPISDRVGRRPVILVGMSIFMLATLVAVT--TSSLTVLIAASAM 97 (375)
T ss_dssp HHHHHHHHTTSSSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHTTSCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHH
T ss_pred hhhhHHHHHHcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCCchhHHHHHHHHHHHHHHHHH--hccHHHHHHHHHH
Confidence 45688899999999999999999999999999999999999999999999999999999999854 4999999999999
Q ss_pred HHhhhhchhhhHHHHhhhhcCccchhhHHHHHHhhhhhhHHHHhhHHHHHHhhcCchhHHHHHHHHHHHHHHHHhhcccc
Q 016338 82 FGLAEGVAMPAMSTLTSRWFPSHERASAIGICMGGFHLGNVVGLLLTPIMLSTIGISGPFILFSSLGLLWLSTWTSKVTN 161 (391)
Q Consensus 82 ~G~g~~~~~~~~~~~i~~~~~~~~rg~~~~~~~~~~~lg~~~g~~~~~~l~~~~gwr~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 161 (391)
.|++.+...+...+++.|++|+|+|++++++.+....+|..++|.+++.+.+..|||+.|.+.+++.++..+...+..||
T Consensus 98 ~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 177 (375)
T 2gfp_A 98 QGMGTGVGGVMARTLPRDLYERTQLRHANSLLNMGILVSPLLAPLIGGLLDTMWNWRACYLFLLVLCAGVTFSMARWMPE 177 (375)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSCCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCSSCC
T ss_pred HHHHHHhhhhhHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHhccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCcc
Confidence 99999999999999999999999999999999999999999999999999998999999999998888777766666676
Q ss_pred CCCCCCCCChhHHHHHHcCCCcccccCCCccHHHhhcCCchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHhhhCCCcchhhHH
Q 016338 162 DPCNSPFVSKSELRLIQAGKSDSVKKRNPPSLRHLLSKLPSWTVIIANITNNWGYFVLLSWMPIYFNTVFNVNLKQAAWF 241 (391)
Q Consensus 162 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~ 241 (391)
++++++++ ++..+++++.+|+|+++...+..++..........+.|.|+++.+|.++.+.+.+
T Consensus 178 ~~~~~~~~-----------------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~g~~ 240 (375)
T 2gfp_A 178 TRPVDAPR-----------------TRLLTSYKTLFGNSGFNCYLLMLIGGLAGIAAFEACSGVLMGAVLGLSSMTVSIL 240 (375)
T ss_dssp CSTTTCCC-----------------CCTTTCSTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCSCSSHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred cCCCCccc-----------------ccHHHHHHHHhcCcchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCCCHHHHHHH
Confidence 65432211 1123356788899999999999999999999999999999999889999999999
Q ss_pred hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccchhHHHHHHHHHHh-HhhHHHHHHhhc--CCchhHHHHHHHHHHHhhhhcccc
Q 016338 242 SAVPWGTMAVSGYMAGKASDSLIKAGYSLTLVRKIMQSIGF-IGPGVSLLCLNY--AKSPAVAAVLITIALSLSSFSQAG 318 (391)
Q Consensus 242 ~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~--~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 318 (391)
.....++..+++++.+++.||.+++ ....... ...+........ .++.+.......+.+...+...+.
T Consensus 241 ~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~r~~~~---------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~g~~~~~~~~~ 311 (375)
T 2gfp_A 241 FILPIPAAFFGAWFAGRPNKRFSTL---------MWQSVICCLLAGLLMWIPDWFGVMNVWTLLVPAALFFFGAGMLFPL 311 (375)
T ss_dssp HHTHHHHHHHHHHHHHTTTTHHHHH---------HHHHHHHHHHTSSSSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSST
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhccccHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHH
Confidence 9999999999999999999998742 1111111 111111111111 123333334444444555666777
Q ss_pred hhhhhhhccccchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHhhccccchhHHHHHHH
Q 016338 319 YLLNIQEIAPDCAGFLHGIANSAGTLAAIISTIGTGYFVQWLGSFQAFLTVTA 371 (391)
Q Consensus 319 ~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~g~~i~~~~~g~l~~~~g~~~~~~~~~~ 371 (391)
......|..|++|+++.|+.+...++|..++|.+.|.+.|..+ +...+....
T Consensus 312 ~~~~~~~~~p~~~g~~~g~~~~~~~~g~~~~~~~~g~l~~~~~-~~~~~~~~~ 363 (375)
T 2gfp_A 312 ATSGAMEPFPFLAGTAGALVGGLQNIGSGVLASLSAMLPQTGQ-GSLGLLMTL 363 (375)
T ss_dssp THHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCSTTCTHHHHHHH-HHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHhCCcccchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCc-ccHHHHHHH
Confidence 7888888888999999999999999999999999999988755 766666543
No 4
>4aps_A DI-OR tripeptide H+ symporter; transport protein, peptide transport, major facilitator SUPE transporter, MFS; 3.30A {Streptococcus thermophilus}
Probab=100.00 E-value=1.1e-35 Score=280.36 Aligned_cols=367 Identities=14% Similarity=0.103 Sum_probs=263.6
Q ss_pred hCCChhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhh-cCchHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhccchHHHHHHHHHHHhhhhchh
Q 016338 12 FGWSSSFLGIVQSSFLWGYIFSSVIGGALVDK-YGGKKVLAWGVALWSLSTLLTPWAATHSTASLLAVRAFFGLAEGVAM 90 (391)
Q Consensus 12 ~~~s~~~~g~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr-~Grr~~~~~~~~~~~~~~~~~~~a~~~~~~~~~~~r~l~G~g~~~~~ 90 (391)
+|.|.++.+++.+.+.++..+++++.|+++|| +|||+++..+.++..++.++++ .++|++.+++.|+++|++.+...
T Consensus 49 ~~~s~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~g~r~~~~~~~~~~~~~~~~~~--~~~~~~~~~~~~~l~g~~~~~~~ 126 (491)
T 4aps_A 49 LHITRATAASIMAIYASMVYLSGTIGGFVADRIIGARPAVFWGGVLIMLGHIVLA--LPFGASALFGSIILIIIGTGFLK 126 (491)
T ss_dssp CCSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--SCCSTTHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred cCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccccchHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhcc
Confidence 99999999999999999999999999999999 8999999999999999999984 45999999999999999999999
Q ss_pred hhHHHHhhhhcCccc--hhhHHHHHHhhhhhhHHHHhhHHHHHHhhcCchhHHHHHHHHHHHHHHHHhhccccCCCCC--
Q 016338 91 PAMSTLTSRWFPSHE--RASAIGICMGGFHLGNVVGLLLTPIMLSTIGISGPFILFSSLGLLWLSTWTSKVTNDPCNS-- 166 (391)
Q Consensus 91 ~~~~~~i~~~~~~~~--rg~~~~~~~~~~~lg~~~g~~~~~~l~~~~gwr~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-- 166 (391)
+...+++.|++|+++ |++++++.+...++|..++|.+++.+.+..|||+.|++.++..++..+......++..+++
T Consensus 127 ~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~l~~~~g~~~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 206 (491)
T 4aps_A 127 PNVSTLVGTLYDEHDRRRDAGFSIFVFGINLGAFIAPLIVGAAQEAAGYHVAFSLAAIGMFIGLLVYYFGGKKTLDPHYL 206 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHHSSSCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCSCCS
T ss_pred chHHHHHHHHcCcccccceeeehHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCccccccccc
Confidence 999999999999988 7788888999999999999999999999999999999987777665555444333322111
Q ss_pred -CCC--ChhHHHH-HHc-------------------CCCccc--------------------ccCCCccHHHhhcCCchH
Q 016338 167 -PFV--SKSELRL-IQA-------------------GKSDSV--------------------KKRNPPSLRHLLSKLPSW 203 (391)
Q Consensus 167 -~~~--~~~~~~~-~~~-------------------~~~~~~--------------------~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 203 (391)
++. ++++.+. .+. ..+.++ .++...+..+..+....+
T Consensus 207 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 286 (491)
T 4aps_A 207 RPTDPLAPEEVKPLLVKVSLAVAGFIAIIVVMNLVGWNSLPAYINLLTIVAIAIPVFYFAWMISSVKVTSTEHLRVVSYI 286 (491)
T ss_dssp CCSCCCSHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHSSCCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC------------CTTHH
T ss_pred CCCCccccchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccCcccccchhhhhHHHHHHHHHHHHHHhhcccccHHHHHHHHHHH
Confidence 111 1111111 000 000000 000011111111223345
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHhhhCCCcchhhHHhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccchhHHHHHHHHHHhH
Q 016338 204 TVIIANITNNWGYFVLLSWMPIYFNTVFNVNLKQAAWFSAVPWGTMAVSGYMAGKASDSLIKAGYSLTLVRKIMQSIGFI 283 (391)
Q Consensus 204 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 283 (391)
...+........+.....++|.|.++..+.+..+.+.......+...++.++.+++.||++||+... ...+..+..
T Consensus 287 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~r~~~r~~~~----~~~~~~~~~ 362 (491)
T 4aps_A 287 PLFIAAVLFWAIEEQGSVVLATFAAERVDSSWFPVSWFQSLNPLFIMLYTPFFAWLWTAWKKNQPSS----PTKFAVGLM 362 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHGGGGTHHHHHHHHSCCCSSSCSGGGTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTC---C----HHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHhhccHHHHHHHHHHhccCccCHHHHhccchHHHHHHHHHHHHHHHHHhccCCCc----hHHHHHHHH
Confidence 5555566666666667788889999888888788888888999999999999999999999874321 122334444
Q ss_pred hhHHHHHHhhcC---------CchhHHHHHHHHHHHhhhhcccchhhhhhhccc-cchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh
Q 016338 284 GPGVSLLCLNYA---------KSPAVAAVLITIALSLSSFSQAGYLLNIQEIAP-DCAGFLHGIANSAGTLAAIISTIGT 353 (391)
Q Consensus 284 ~~~~~~~~~~~~---------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~g~~~~~~~~g~~i~~~~~ 353 (391)
..+++...+... .+.+......++.+...+...+....+..|..| ++|+++.|+.+...++|..++|.+.
T Consensus 363 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~p~~~~g~~~g~~~~~~~~g~~i~~~~~ 442 (491)
T 4aps_A 363 FAGLSFLLMAIPGALYGTSGKVSPLWLVGSWALVILGEMLISPVGLSVTTKLAPKAFNSQMMSMWFLSSSVGSALNAQLV 442 (491)
T ss_dssp HHHHHHTTTHHHHHHCCCCTTCCTHHHHHHHHHHHHHHHTTTTHHHHHHHHHTTTTCSSSSTHHHHHHHHHHHHHHHHHG
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHhcCCCCCccHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHhCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 444444333321 133444444444444455556667778888777 7899999999999999999999999
Q ss_pred hHhhccccchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcc
Q 016338 354 GYFVQWLGSFQAFLTVTAGLYFVTTIFWNLYST 386 (391)
Q Consensus 354 g~l~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 386 (391)
+.+.|. + +...+...+.+.+++.+..+...+
T Consensus 443 ~~~~~~-~-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 473 (491)
T 4aps_A 443 TLYNAK-S-EVAYFSYFGLGSVVLGIVLVFLSK 473 (491)
T ss_dssp GGGGGS-S-TTHHHHHTHHHHHHHHHHHHHC--
T ss_pred HHHhcc-c-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 988775 4 667777777777777666655544
No 5
>4gc0_A D-xylose-proton symporter; MFS, transport protein; HET: 6BG BNG; 2.60A {Escherichia coli} PDB: 4gbz_A* 4gby_A*
Probab=100.00 E-value=6.9e-34 Score=267.95 Aligned_cols=375 Identities=17% Similarity=0.135 Sum_probs=257.5
Q ss_pred ccchhhHHHHhCC--------ChhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhcCchHHHHHHHHHHHHHHhhhhhh------
Q 016338 2 SVAVVPLAAKFGW--------SSSFLGIVQSSFLWGYIFSSVIGGALVDKYGGKKVLAWGVALWSLSTLLTPWA------ 67 (391)
Q Consensus 2 ~~~~~~i~~~~~~--------s~~~~g~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~Grr~~~~~~~~~~~~~~~~~~~a------ 67 (391)
+..+|.+.++++. ++++.|++.+.+.+|..++++++|+++||+|||+++.++.+++.++.+++++.
T Consensus 32 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~s~~~~G~~iG~~~~G~laDr~GRk~~l~~~~~l~~i~~i~~a~~~~~~~~ 111 (491)
T 4gc0_A 32 SGTVESLNTVFVAPQNLSESAANSLLGFCVASALIGCIIGGALGGYCSNRFGRRDSLKIAAVLFFISGVGSAWPELGFTS 111 (491)
T ss_dssp GGTHHHHHHHHTGGGCCCHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCTTTTTSC
T ss_pred HHHHHHHHHHhcCCCCCCcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhh
Confidence 5677888888743 34568999999999999999999999999999999999999999999998632
Q ss_pred ----------hccchHHHHHHHHHHHhhhhchhhhHHHHhhhhcCccchhhHHHHHHhhhhhhHHHHhhHHHHHHhh---
Q 016338 68 ----------ATHSTASLLAVRAFFGLAEGVAMPAMSTLTSRWFPSHERASAIGICMGGFHLGNVVGLLLTPIMLST--- 134 (391)
Q Consensus 68 ----------~~~~~~~~~~~r~l~G~g~~~~~~~~~~~i~~~~~~~~rg~~~~~~~~~~~lg~~~g~~~~~~l~~~--- 134 (391)
.++|+++++++|+++|+|.|...+....+++|+.|+++|++..+..+.+...|..+++.++......
T Consensus 112 ~~~~~~~~~~~a~~~~~l~~~R~l~G~g~G~~~~~~~~~i~E~~p~~~rg~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~ 191 (491)
T 4gc0_A 112 INPDNTVPVYLAGYVPEFVIYRIIGGIGVGLASMLSPMYIAELAPAHIRGKLVSFNQFAIIFGQLLVYCVNYFIARSGDA 191 (491)
T ss_dssp SSSSSSCCGGGGGCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSCGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSCT
T ss_pred hcchhHHHHHHhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhCCHHhhhhhHHhhhhhhhhhhhhhhhcchhhcccccc
Confidence 3689999999999999999999999999999999999999999999999999999999888776543
Q ss_pred -----cCchhHHHHHHHHHHHHHHHHhhccccCCCCCCCCChhH--HHHHHcC-------------CCcccccCCCccHH
Q 016338 135 -----IGISGPFILFSSLGLLWLSTWTSKVTNDPCNSPFVSKSE--LRLIQAG-------------KSDSVKKRNPPSLR 194 (391)
Q Consensus 135 -----~gwr~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~--~~~~~~~-------------~~~~~~~~~~~~~~ 194 (391)
.+||..+.+..+..++..+ ..+..||+|+....+.+++ .+..++. .+..+++++.....
T Consensus 192 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~peSp~~L~~~~~~~~a~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 270 (491)
T 4gc0_A 192 SWLNTDGWRYMFASECIPALLFLM-LLYTVPESPRWLMSRGKQEQAEGILRKIMGNTLATQAVQEIKHSLDHGRKTGGRL 270 (491)
T ss_dssp TTTTTTHHHHHHHTTHHHHHHHHH-HGGGSCCCHHHHHHTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHH
T ss_pred ccccchhhHHHhhhhhhhhhhhhh-hhhcCCCChHHHHHcCchhHHHHhHHHhcCCchhHHHHHHHHHHHHhhhhhhhHH
Confidence 3477777776666555444 4556788876321111111 0000000 00000001111122
Q ss_pred HhhcCCchHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHhhHHHHHhhhCCCcchhhHHhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccchhHH
Q 016338 195 HLLSKLPSWTVIIANIT-NNWGYFVLLSWMPIYFNTVFNVNLKQAAWFSAVPWGTMAVSGYMAGKASDSLIKAGYSLTLV 273 (391)
Q Consensus 195 ~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~~~~~~~~~~ 273 (391)
...+.++.......... .......+..+.|.+.++ .+.+............+...++.++.+++.||+|||
T Consensus 271 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~dr~Grr------- 342 (491)
T 4gc0_A 271 LMFGVGVIVIGVMLSIFQQFVGINVVLYYAPEVFKT-LGASTDIALLQTIIVGVINLTFTVLAIMTVDKFGRK------- 342 (491)
T ss_dssp HHSCCTHHHHHHHHHHHHHHTCHHHHHHHHHHHHHH-SSCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCSH-------
T ss_pred HHhcccHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHhcchHHHHh-cCCCccchhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhcCc-------
Confidence 33334444443333333 333445555666666655 677777777777788889999999999999999965
Q ss_pred HHHHHHHHhHhhHHHHHHhh----cCCchhHHHHH-HHHHHHhhhhcccchhhhhhhccc-cchhHHHHHHHHHHHHHHH
Q 016338 274 RKIMQSIGFIGPGVSLLCLN----YAKSPAVAAVL-ITIALSLSSFSQAGYLLNIQEIAP-DCAGFLHGIANSAGTLAAI 347 (391)
Q Consensus 274 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~----~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~g~~~~~~~~g~~ 347 (391)
..+..+...+.++++.+. ........... .+...++.....+..+.+..|.+| +.|+++.|+.+..+++++.
T Consensus 343 --~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~E~fPt~~R~~~~g~~~~~~~~~~~ 420 (491)
T 4gc0_A 343 --PLQIIGALGMAIGMFSLGTAFYTQAPGIVALLSMLFYVAAFAMSWGPVCWVLLSEIFPNAIRGKALAIAVAAQWLANY 420 (491)
T ss_dssp --HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTHHHHHHHHHSSCTTTHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred --chhccchHHHHHHHHHHHHHHhcccchHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHhCCHhHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 333334444443333322 12222222222 222333333344566788899999 8999999999999999999
Q ss_pred HHHHHhhHhhcccc-----chhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccC
Q 016338 348 ISTIGTGYFVQWLG-----SFQAFLTVTAGLYFVTTIFWNLYSTG 387 (391)
Q Consensus 348 i~~~~~g~l~~~~g-----~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 387 (391)
+++.+.+.+.+... .....+++.+++.+++.++.+++.++
T Consensus 421 i~~~~~p~l~~~~~~~~~~~~~~~~~i~~~~~~~~~i~~~~~~PE 465 (491)
T 4gc0_A 421 FVSWTFPMMDKNSWLVAHFHNGFSYWIYGCMGVLAALFMWKFVPE 465 (491)
T ss_dssp HHHTHHHHHCHHHHHHHHHTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHheecC
Confidence 99999887765321 14456777777777777766555443
No 6
>2cfq_A Lactose permease; transport, transport mechanism, lactose/H+ symport, sugar transport, transmembrane, formylation; 2.95A {Escherichia coli} SCOP: f.38.1.2 PDB: 1pv7_A* 1pv6_A 2cfp_A 2v8n_A 2y5y_A*
Probab=100.00 E-value=9.3e-34 Score=261.25 Aligned_cols=367 Identities=15% Similarity=0.072 Sum_probs=248.6
Q ss_pred cchhh-HHHHhCCChhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhcCchHHHHHHHHHHHHHHhhhh-hhhccch-HHHHHHH
Q 016338 3 VAVVP-LAAKFGWSSSFLGIVQSSFLWGYIFSSVIGGALVDKYGGKKVLAWGVALWSLSTLLTP-WAATHST-ASLLAVR 79 (391)
Q Consensus 3 ~~~~~-i~~~~~~s~~~~g~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~Grr~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~a~~~~~-~~~~~~r 79 (391)
+.+|. +++++|.|+++.|++.+.+.+++.++++++|+++||+|||+++.++..+.+++..... ....+.. ..+...+
T Consensus 28 ~~~~~~l~~~~g~s~~~~g~~~~~~~~~~~i~~~~~G~lsDr~Grr~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 107 (417)
T 2cfq_A 28 PFFPIWLHDINHISKSDTGIIFAAISLFSLLFQPLFGLLSDKLGLRKYLLWIITGMLVMFAPFFIFIFGPLLQYNILVGS 107 (417)
T ss_dssp TTHHHHHHTTTCCCTTTSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSTTCCHHHHHHHHTTSCHHHHHHHTHHHHHHTTCCHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHhCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 45565 5567999999999999999999999999999999999999999988877654221110 0111211 1234456
Q ss_pred HHHHhhhhchhhhHHHHhhhhcCc--cchhhHHHHHHhhhhhhHHHHhhHHHHHHhhcCchhHHHHHHHHHHHHHHHHhh
Q 016338 80 AFFGLAEGVAMPAMSTLTSRWFPS--HERASAIGICMGGFHLGNVVGLLLTPIMLSTIGISGPFILFSSLGLLWLSTWTS 157 (391)
Q Consensus 80 ~l~G~g~~~~~~~~~~~i~~~~~~--~~rg~~~~~~~~~~~lg~~~g~~~~~~l~~~~gwr~~f~~~~~~~~~~~~~~~~ 157 (391)
.+.|++.+...+.....+.++.++ ++|+...+.......+|..++|.+++++.+ .+||+.|++.++..++..+..+.
T Consensus 108 ~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~g~~~~~~l~~~l~~-~~~~~~f~~~~~~~~~~~~~~~~ 186 (417)
T 2cfq_A 108 IVGGIYLGFCFNAGAPAVEAFIEKVSRRSNFEFGRARMFGCVGWALGASIVGIMFT-INNQFVFWLGSGCALILAVLLFF 186 (417)
T ss_dssp HGGGSSTTHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHTCCHHHHSSSTTTHHHHHHHHHHHHHH-HCSHHHHTTTTTTTTTHHHHSCS
T ss_pred HHHHHHHHHHHhhhHHHHHHHHHHhhhhcccchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-hchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 666666555544445555555543 456778889989999999999999999887 58999999877765544444333
Q ss_pred ccccCCCCCCCCChhHHHHHHcCCCcccccCCCccHHHhhcCCchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHhhhCC---C
Q 016338 158 KVTNDPCNSPFVSKSELRLIQAGKSDSVKKRNPPSLRHLLSKLPSWTVIIANITNNWGYFVLLSWMPIYFNTVFNV---N 234 (391)
Q Consensus 158 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~---~ 234 (391)
..||++++.++. ++ .++++++....++++++|+|+++...+..+.....+..+..+.|.|+++.++. +
T Consensus 187 ~~~~~~~~~~~~-~~--------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 257 (417)
T 2cfq_A 187 AKTDAPSSATVA-NA--------VGANHSAFSLKLALELFRQPKLWFLSLYVIGVSCTYDVFDQQFANFFTSFFATGEQG 257 (417)
T ss_dssp SCCCCSCSSCSS-SS--------SSSCCCCCCHHHHHHHTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSSHHHH
T ss_pred cCcccccccccc-cc--------cccccccccHHHHHHHhcCCchhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccCCC
Confidence 333432211100 00 00011111223456788999988877766666666666777889888775442 2
Q ss_pred cchhhHHhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccchhHHHHHHHHHHhHhhHHHHHHhhcCCchhHHHHHHHHHHHhhhh
Q 016338 235 LKQAAWFSAVPWGTMAVSGYMAGKASDSLIKAGYSLTLVRKIMQSIGFIGPGVSLLCLNYAKSPAVAAVLITIALSLSSF 314 (391)
Q Consensus 235 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 314 (391)
....+...+...++..++.++.+++.||+++| ..+..+....++........++.+.......+.......
T Consensus 258 ~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~g~~---------~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~~ 328 (417)
T 2cfq_A 258 TRVFGYVTTMGELLNASIMFFAPLIINRIGGK---------NALLLAGTIMSVRIIGSSFATSALEVVILKTLHMFEVPF 328 (417)
T ss_dssp THHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCSHHHHHHHTTHHHHHHHH
T ss_pred hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 34456777777788889999999999999954 344455566666555555555544443333222222333
Q ss_pred cccchhhhhhhccc-cchhHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHhhHhhccccchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccCcc
Q 016338 315 SQAGYLLNIQEIAP-DCAGFLHGIA-NSAGTLAAIISTIGTGYFVQWLGSFQAFLTVTAGLYFVTTIFWNLYSTGER 389 (391)
Q Consensus 315 ~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~g~~-~~~~~~g~~i~~~~~g~l~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 389 (391)
..+....+..|..| +.|+++.+.. +...++|+.++|.+.|.+.|..| +...|.+.+++.+++.+..+...+++|
T Consensus 329 ~~~~~~~~~~~~~p~~~~g~~~g~~~~~~~~lg~~~gp~l~G~l~~~~g-~~~~f~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~ 404 (417)
T 2cfq_A 329 LLVGCFKYITSQFEVRFSATIYLVCFCFFKQLAMIFMSVLAGNMYESIG-FQGAYLVLGLVALGFTLISVFTLSGPG 404 (417)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHHHTHHHHTHHHHSH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSSCCSC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHhhhhHHHHHHhcC-cHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhcCCC
Confidence 33445667788777 8899999994 88888999999999999999887 888888888888888777655555443
No 7
>2xut_A Proton/peptide symporter family protein; transport protein, membrane protein, major facilitator super transporter; 3.62A {Shewanella oneidensis}
Probab=99.97 E-value=1.4e-29 Score=240.41 Aligned_cols=373 Identities=12% Similarity=0.042 Sum_probs=231.2
Q ss_pred hhHHHHhC------CChhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhc-CchHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhcc-chHHHHH
Q 016338 6 VPLAAKFG------WSSSFLGIVQSSFLWGYIFSSVIGGALVDKY-GGKKVLAWGVALWSLSTLLTPWAATH-STASLLA 77 (391)
Q Consensus 6 ~~i~~~~~------~s~~~~g~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~-Grr~~~~~~~~~~~~~~~~~~~a~~~-~~~~~~~ 77 (391)
+.+.+++| .|.++.+++.+.+.++..+++++.|+++||+ |||+++.++.++.+++.++.++ ++ +++.+++
T Consensus 37 ~~l~~~~~~~~~~~~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~G~l~dr~~g~r~~~~~~~~~~~~~~~~~~~--~~~~~~~~~~ 114 (524)
T 2xut_A 37 PFLMTALLLSIPEELRGAVAKDVFHSFVIGVYFFPLLGGWIADRFFGKYNTILWLSLIYCVGHAFLAI--FEHSVQGFYT 114 (524)
T ss_dssp HHHHHSCSSCCSSSTTTTTHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHTTSSCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--TSSCHHHHHH
T ss_pred HHHHHHhccccccccCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--hcccHHHHHH
Confidence 34677889 9999999999999999999999999999999 9999999999999999998854 47 9999999
Q ss_pred HHHHHHhhhhchhhhHHHHhhhhcCccchhhHHHH---HHhhhhhhHHHHhhHHHHHHhhcCchhHHHHHHHHHHHHHHH
Q 016338 78 VRAFFGLAEGVAMPAMSTLTSRWFPSHERASAIGI---CMGGFHLGNVVGLLLTPIMLSTIGISGPFILFSSLGLLWLST 154 (391)
Q Consensus 78 ~r~l~G~g~~~~~~~~~~~i~~~~~~~~rg~~~~~---~~~~~~lg~~~g~~~~~~l~~~~gwr~~f~~~~~~~~~~~~~ 154 (391)
.|++.|++.+...+...+++.|++|+++|+++.+. .+...++|..++|.+++.+.+..|||+.|++.+++.++..+.
T Consensus 115 ~~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~g~~~~~~l~~~~g~~~~f~~~~~~~~~~~~~ 194 (524)
T 2xut_A 115 GLFLIALGSGGIKPLVSSFMGDQFDQSNKSLAQKAFDMFYFTINFGSFFASLSMPLLLKNFGAAVAFGIPGVLMFVATVF 194 (524)
T ss_dssp HHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHTCSTTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSTHHHHTSCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHhccccchhHHHHHHHHcCccchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccccHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 99999999999999999999999999999876666 999999999999999999999899999999988887766555
Q ss_pred HhhccccCCCCCCCCCh--hHHHHH----HcCCCc-cc-------------------------------------ccCCC
Q 016338 155 WTSKVTNDPCNSPFVSK--SELRLI----QAGKSD-SV-------------------------------------KKRNP 190 (391)
Q Consensus 155 ~~~~~~~~~~~~~~~~~--~~~~~~----~~~~~~-~~-------------------------------------~~~~~ 190 (391)
.....++.++++++.++ +..+.. ++...+ ++ +++..
T Consensus 195 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 274 (524)
T 2xut_A 195 FWLGRKRYIHMPPEPKDPHGFLPVIRSALLTKVEGKGNIGLVLALIGGVSAAYALVNIPTLGIVAGLCCAMVLVMGFVGA 274 (524)
T ss_dssp HHSSSSSCCCCC--------------------CTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHTGGGTTTTCSSHHHHHHHHHHHHHHHT
T ss_pred HHHhcccccccCCCCccchhHHHHHHHHHhhhhcccCccchhhhhhhhhhhhhhhcccchhhhhhhhhhhhhhhhccccc
Confidence 44433332211111000 000000 000000 00 00000
Q ss_pred ccHH------------HhhcCCchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHhhhCCCc---chhhHHhhhHHHHHHHHHHH
Q 016338 191 PSLR------------HLLSKLPSWTVIIANITNNWGYFVLLSWMPIYFNTVFNVNL---KQAAWFSAVPWGTMAVSGYM 255 (391)
Q Consensus 191 ~~~~------------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~---~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 255 (391)
.+++ +..+.++.+..................+.+.+..+..+.+. ...+.+.....++..+...+
T Consensus 275 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 354 (524)
T 2xut_A 275 GASLQLERARKSHPDAAVDGVRSVLRILVLFALVTPFWSLFDQKASTWILQANDMVKPQWFEPAMMQALNPLLVMLLIPF 354 (524)
T ss_dssp GGGTHHHHSCCSCCSSSSTTTTTHHHHHHHHTTSHHHHTTTSSTTTHHHHHHHHSCCCSSSCHHHHHTTSGGGHHHHGGG
T ss_pred chhhHHhhhhccccHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccchhhHHhHHhcCCCeeecHHHHHHHHHHHHHHhHHH
Confidence 0110 00112222222211111111111111222222222122222 24556666655666666666
Q ss_pred HHHHH----HHHHhhccchhHHHHHHHHHHhHhhHHHHHHhhcC---------CchhHHHHHHHHHHHhhhhcccchhhh
Q 016338 256 AGKAS----DSLIKAGYSLTLVRKIMQSIGFIGPGVSLLCLNYA---------KSPAVAAVLITIALSLSSFSQAGYLLN 322 (391)
Q Consensus 256 ~g~l~----dr~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~---------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 322 (391)
.+++. ||.++|.. ++..+..+..+.+++...+... .+.+.......+.+...+...+....+
T Consensus 355 ~~~~~~~~~~~~~~~~~-----~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~g~~~~~~~~~~~~~ 429 (524)
T 2xut_A 355 NNFVLYPAIERMGVKLT-----ALRKMGAGIAITGLSWIVVGTIQLMMDGGSALSIFWQILPYALLTFGEVLVSATGLEF 429 (524)
T ss_dssp TTTC------------C-----CHHHHHTHHHHHHHHHHTTTTTTTTTTTTCCCCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTT
T ss_pred HHhhhHHHHHhcCCCCC-----hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCCCcCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 66653 33332100 1223345555566655555442 233444444444444445556666777
Q ss_pred hhhccc-cchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHhhcccc----------chhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhc
Q 016338 323 IQEIAP-DCAGFLHGIANSAGTLAAIISTIGTGYFVQWLG----------SFQAFLTVTAGLYFVTTIFWNLYS 385 (391)
Q Consensus 323 ~~~~~~-~~~~~~~g~~~~~~~~g~~i~~~~~g~l~~~~g----------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 385 (391)
..|..| ++|++++|+.+...++|+.++|.+.|.+.+..+ .....|++.+++.+++.+..+...
T Consensus 430 ~~~~~p~~~~g~~~g~~~~~~~~g~~~g~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 503 (524)
T 2xut_A 430 AYSQAPKAMKGTIMSFWTLSVTVGNLWVLLANVSVKSPTVTEQIVQTGMSVTAFQMFFFAGFAILAAIVFALYA 503 (524)
T ss_dssp HHHHCCTTCCTTTHHHHGGGHHHHHHHHHHHHHHTTSCHHHHHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC---
T ss_pred HHHhCcHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 777776 899999999999999999999999999987431 112336666666666666554443
No 8
>4aps_A DI-OR tripeptide H+ symporter; transport protein, peptide transport, major facilitator SUPE transporter, MFS; 3.30A {Streptococcus thermophilus}
Probab=99.56 E-value=2.9e-13 Score=127.02 Aligned_cols=175 Identities=13% Similarity=0.097 Sum_probs=146.9
Q ss_pred CchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHhh-----hCCCcchhhHHhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHhhccchhHH
Q 016338 200 LPSWTVIIANITNNWGYFVLLSWMPIYFNTV-----FNVNLKQAAWFSAVPWGTMAVSGYMAGKASDS-LIKAGYSLTLV 273 (391)
Q Consensus 200 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-----~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr-~~~~~~~~~~~ 273 (391)
|.++......++..+.++....+++.|+++. +|.+..+.+++.+...++..++.++.|+++|| +|
T Consensus 13 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~g--------- 83 (491)
T 4aps_A 13 LGLSTLFMTEMWERFSYYGMRAILLYYMWFLISTGDLHITRATAASIMAIYASMVYLSGTIGGFVADRIIG--------- 83 (491)
T ss_dssp THHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCCSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSC---------
T ss_pred hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccchhhcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcccc---------
Confidence 4567777888888888999999999999998 89999999999999999999999999999999 89
Q ss_pred HHHHHHHHhHhhHHHHHHhhcCCchhHHHHHHHHHHHhhhhcccchhhhhhhccc-cc--hhHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 016338 274 RKIMQSIGFIGPGVSLLCLNYAKSPAVAAVLITIALSLSSFSQAGYLLNIQEIAP-DC--AGFLHGIANSAGTLAAIIST 350 (391)
Q Consensus 274 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~--~~~~~g~~~~~~~~g~~i~~ 350 (391)
||..+..+.+...++.......++.+...+..++.+...+...+....+..|..| ++ |+.+.+..+...++|..++|
T Consensus 84 ~r~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~g~~~~~ 163 (491)
T 4aps_A 84 ARPAVFWGGVLIMLGHIVLALPFGASALFGSIILIIIGTGFLKPNVSTLVGTLYDEHDRRRDAGFSIFVFGINLGAFIAP 163 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCCSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred chHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhccchHHHHHHHHcCcccccceeeehHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 4466677777788887777777777777766666666666677778888888776 66 77888889999999999999
Q ss_pred HHhhHhhccccchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh
Q 016338 351 IGTGYFVQWLGSFQAFLTVTAGLYFVTTIFWNLY 384 (391)
Q Consensus 351 ~~~g~l~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 384 (391)
.+.+.+.+..| |+..|.+.++..+++.+.....
T Consensus 164 ~~~~~l~~~~g-~~~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~ 196 (491)
T 4aps_A 164 LIVGAAQEAAG-YHVAFSLAAIGMFIGLLVYYFG 196 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHSC-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHhhhh-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh
Confidence 99999999888 9999998887777777665544
No 9
>1pw4_A Glycerol-3-phosphate transporter; transmembrane, inner membrane, major facilitator superfamily, secondary active membrane transporter; 3.30A {Escherichia coli} SCOP: f.38.1.1
Probab=99.54 E-value=4.6e-14 Score=130.85 Aligned_cols=155 Identities=11% Similarity=0.028 Sum_probs=133.3
Q ss_pred chhhHHHH-hCCChhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhc--CchHHHHHHHHHHH-HHHhhhhhhhccchHHHHHHH
Q 016338 4 AVVPLAAK-FGWSSSFLGIVQSSFLWGYIFSSVIGGALVDKY--GGKKVLAWGVALWS-LSTLLTPWAATHSTASLLAVR 79 (391)
Q Consensus 4 ~~~~i~~~-~~~s~~~~g~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~--Grr~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~a~~~~~~~~~~~r 79 (391)
..|.+.++ +|.+..+.+++.+...++..++.++.|++.||+ |||+.+.++..+.. ++.++..+...++.+.+.+..
T Consensus 274 ~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 353 (451)
T 1pw4_A 274 WSPTYLKEVKHFALDKSSWAYFLYEYAGIPGTLLCGWMSDKVFRGNRGATGVFFMTLVTIATIVYWMNPAGNPTVDMICM 353 (451)
T ss_dssp HHHHHBTTBSCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSCCTTCHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHhcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcccCHHHHHHHH
Confidence 34555555 899999999999999999999999999999999 99999888877766 666666433224777888888
Q ss_pred HHHHhhhhchhhhHHHHhhhhcCccchhhHHHHHHhhhhh-hHHHHhhHHHHHHhhcCchhHHHHHHHHHHHHHHHHhhc
Q 016338 80 AFFGLAEGVAMPAMSTLTSRWFPSHERASAIGICMGGFHL-GNVVGLLLTPIMLSTIGISGPFILFSSLGLLWLSTWTSK 158 (391)
Q Consensus 80 ~l~G~g~~~~~~~~~~~i~~~~~~~~rg~~~~~~~~~~~l-g~~~g~~~~~~l~~~~gwr~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~ 158 (391)
++.|++.+...+....++.|.+|+++|+++.++.+....+ |..++|.+.+.+.+..||+..|++.+++.++..+..+..
T Consensus 354 ~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~g~l~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 433 (451)
T 1pw4_A 354 IVIGFLIYGPVMLIGLHALELAPKKAAGTAAGFTGLFGYLGGSVAASAIVGYTVDFFGWDGGFMVMIGGSILAVILLIVV 433 (451)
T ss_dssp HHHHHHHTHHHHHHHHHHHHTSCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHhchHHHHHHHHHHHhchhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 9999998888888899999999999999999999999999 999999999999999999999999888887766665544
No 10
>3o7q_A L-fucose-proton symporter; transporter, multi-PASS membrane protei transport protein; HET: BNG; 3.14A {Escherichia coli} PDB: 3o7p_A*
Probab=99.51 E-value=8.7e-13 Score=121.80 Aligned_cols=173 Identities=11% Similarity=0.007 Sum_probs=134.8
Q ss_pred hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHhhhCCCcchhhHHhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccchhHHHHHHHHHH
Q 016338 202 SWTVIIANITNNWGYFVLLSWMPIYFNTVFNVNLKQAAWFSAVPWGTMAVSGYMAGKASDSLIKAGYSLTLVRKIMQSIG 281 (391)
Q Consensus 202 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 281 (391)
+....+..+.............|.+.++ +|.+..+.+++.+...++..++.++.|++.||+|| |..+..+
T Consensus 28 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~g~s~~~~g~~~~~~~~~~~i~~~~~G~l~dr~g~---------r~~l~~~ 97 (438)
T 3o7q_A 28 FALLCSLFFLWAVANNLNDILLPQFQQA-FTLTNFQAGLIQSAFYFGYFIIPIPAGILMKKLSY---------KAGIITG 97 (438)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-SCCCSHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHSCH---------HHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHH-cCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHhcc---------hHHHHHH
Confidence 3344455555566666666777775555 89999999999999999999999999999999994 4566677
Q ss_pred hHhhHHHHHHh---hcCCchhHHHHHHHHHHHhhhhcccchhhhhhhccc-cchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHhh
Q 016338 282 FIGPGVSLLCL---NYAKSPAVAAVLITIALSLSSFSQAGYLLNIQEIAP-DCAGFLHGIANSAGTLAAIISTIGTGYFV 357 (391)
Q Consensus 282 ~~~~~~~~~~~---~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~g~~~~~~~~g~~i~~~~~g~l~ 357 (391)
.....++.++. ...++.+...+.-++.+...+...+....+..|..| ++|+++.++.+....+|..++|.+.+.+.
T Consensus 98 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~l~G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~g~~~g~~~~~~l~ 177 (438)
T 3o7q_A 98 LFLYALGAALFWPAAEIMNYTLFLVGLFIIAAGLGCLETAANPFVTVLGPESSGHFRLNLAQTFNSFGAIIAVVFGQSLI 177 (438)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSCSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHhccccccHHHHHHHHHHHHhhHHHhhhhHHHHHHHHcCchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 77777777766 666777777776666666667777778888888877 89999999999999999999999999998
Q ss_pred -ccccc------------------------hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh
Q 016338 358 -QWLGS------------------------FQAFLTVTAGLYFVTTIFWNLY 384 (391)
Q Consensus 358 -~~~g~------------------------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 384 (391)
+..+. ++..+...+....+..+.....
T Consensus 178 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~w~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 229 (438)
T 3o7q_A 178 LSNVPHQSQDVLDKMSPEQLSAYKHSLVLSVQTPYMIIVAIVLLVALLIMLT 229 (438)
T ss_dssp HTSSCCCCHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
T ss_pred hcccccccccccccCCcchhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 55554 6778877776666665555544
No 11
>2xut_A Proton/peptide symporter family protein; transport protein, membrane protein, major facilitator super transporter; 3.62A {Shewanella oneidensis}
Probab=99.50 E-value=7.6e-13 Score=125.23 Aligned_cols=175 Identities=10% Similarity=-0.042 Sum_probs=140.1
Q ss_pred CCchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHhhhC------CCcchhhHHhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-Hhhccchh
Q 016338 199 KLPSWTVIIANITNNWGYFVLLSWMPIYFNTVFN------VNLKQAAWFSAVPWGTMAVSGYMAGKASDSL-IKAGYSLT 271 (391)
Q Consensus 199 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~-~~~~~~~~ 271 (391)
+|.++...+..++..+.++....+++.|+++++| .++.+.+.+.+...++..++.++.|+++||+ |+|
T Consensus 11 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~l~~~~~~~~~~~~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~G~l~dr~~g~r----- 85 (524)
T 2xut_A 11 PRQIPYIIASEACERFSFYGMRNILTPFLMTALLLSIPEELRGAVAKDVFHSFVIGVYFFPLLGGWIADRFFGKY----- 85 (524)
T ss_dssp --CCTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCSSCCSSSTTTTTHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHTTSSCSH-----
T ss_pred CcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccccccccCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcch-----
Confidence 4567778888888888999999999999998889 9999999999999999999999999999999 954
Q ss_pred HHHHHHHHHHhHhhHHHHHHhhcCC-chhHHHHHHHHHHHhhhhcccchhhhhhhccc-cchhHHHHH---HHHHHHHHH
Q 016338 272 LVRKIMQSIGFIGPGVSLLCLNYAK-SPAVAAVLITIALSLSSFSQAGYLLNIQEIAP-DCAGFLHGI---ANSAGTLAA 346 (391)
Q Consensus 272 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~g~---~~~~~~~g~ 346 (391)
..+..+.++..++.+.....+ +.+......++.+...+...+....+..|..| ++|+++.+. .+...++|.
T Consensus 86 ----~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~~~~g~ 161 (524)
T 2xut_A 86 ----NTILWLSLIYCVGHAFLAIFEHSVQGFYTGLFLIALGSGGIKPLVSSFMGDQFDQSNKSLAQKAFDMFYFTINFGS 161 (524)
T ss_dssp ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSCHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHTCSTTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred ----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcccHHHHHHHHHHHHHhccccchhHHHHHHHHcCccchHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 445566666666666666666 66666655555555566667777888888777 788766555 889999999
Q ss_pred HHHHHHhhHhhccccchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 016338 347 IISTIGTGYFVQWLGSFQAFLTVTAGLYFVTTIFWNL 383 (391)
Q Consensus 347 ~i~~~~~g~l~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 383 (391)
.++|.+.+.+.+..| ++..|.+.++..+++.+....
T Consensus 162 ~~g~~~~~~l~~~~g-~~~~f~~~~~~~~~~~~~~~~ 197 (524)
T 2xut_A 162 FFASLSMPLLLKNFG-AAVAFGIPGVLMFVATVFFWL 197 (524)
T ss_dssp HHHHHTSTHHHHTSC-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS
T ss_pred HHHHHHHHHHhcccc-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 999999999998887 899998888887777666544
No 12
>2cfq_A Lactose permease; transport, transport mechanism, lactose/H+ symport, sugar transport, transmembrane, formylation; 2.95A {Escherichia coli} SCOP: f.38.1.2 PDB: 1pv7_A* 1pv6_A 2cfp_A 2v8n_A 2y5y_A*
Probab=99.48 E-value=3.5e-13 Score=123.76 Aligned_cols=147 Identities=12% Similarity=0.096 Sum_probs=124.3
Q ss_pred hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhcCchHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhccchHHHHHHHHHHHhhhhchhhhHHH
Q 016338 16 SSFLGIVQSSFLWGYIFSSVIGGALVDKYGGKKVLAWGVALWSLSTLLTPWAATHSTASLLAVRAFFGLAEGVAMPAMST 95 (391)
Q Consensus 16 ~~~~g~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~Grr~~~~~~~~~~~~~~~~~~~a~~~~~~~~~~~r~l~G~g~~~~~~~~~~ 95 (391)
..+.++..+...++..++.++.|+++||+|||+.+..+..+.+++.++.+ ..++.+.+++..++.+++.+...+....
T Consensus 258 ~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~g~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~--~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~ 335 (417)
T 2cfq_A 258 TRVFGYVTTMGELLNASIMFFAPLIINRIGGKNALLLAGTIMSVRIIGSS--FATSALEVVILKTLHMFEVPFLLVGCFK 335 (417)
T ss_dssp THHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT--TCCSHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HhccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 45568888888889999999999999999999999998888888776663 4478888888888888887777777889
Q ss_pred HhhhhcCccchhhHHHH-HHhhhhhhHHHHhhHHHHHHhhcCchhHHHHHHHHHHHHHHHHhhccccCCC
Q 016338 96 LTSRWFPSHERASAIGI-CMGGFHLGNVVGLLLTPIMLSTIGISGPFILFSSLGLLWLSTWTSKVTNDPC 164 (391)
Q Consensus 96 ~i~~~~~~~~rg~~~~~-~~~~~~lg~~~g~~~~~~l~~~~gwr~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 164 (391)
+++|.+|++.|+.+.+. .+....+|..++|.+++.+.+..|++..|.+.+++.++..+..+...||+++
T Consensus 336 ~~~~~~p~~~~g~~~g~~~~~~~~lg~~~gp~l~G~l~~~~g~~~~f~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~ 405 (417)
T 2cfq_A 336 YITSQFEVRFSATIYLVCFCFFKQLAMIFMSVLAGNMYESIGFQGAYLVLGLVALGFTLISVFTLSGPGP 405 (417)
T ss_dssp HHHHHSCHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHHHTHHHHTHHHHSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSSCCSCT
T ss_pred HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHhhhhHHHHHHhcCcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhcCCCc
Confidence 99999999999999998 5888899999999999999998899999999888888777766666665443
No 13
>2gfp_A EMRD, multidrug resistance protein D; membrane protein, multidrug transporter; 3.50A {Escherichia coli}
Probab=99.36 E-value=1.5e-12 Score=117.76 Aligned_cols=167 Identities=10% Similarity=-0.015 Sum_probs=130.3
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHhhhCCCcchhhHHhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccchhHHHHHHHHHHhH
Q 016338 204 TVIIANITNNWGYFVLLSWMPIYFNTVFNVNLKQAAWFSAVPWGTMAVSGYMAGKASDSLIKAGYSLTLVRKIMQSIGFI 283 (391)
Q Consensus 204 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 283 (391)
...+..+.............|.+.++ +|.|+.+.+...+...++..++.++.|++.||+|||+ .+..+..
T Consensus 4 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~g~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~g~r~---------~~~~~~~ 73 (375)
T 2gfp_A 4 MLVLLVAVGQMAQTIYIPAIADMARD-LNVREGAVQSVMGAYLLTYGVSQLFYGPISDRVGRRP---------VILVGMS 73 (375)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT-SSSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHTTSCCCC---------CCHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHHHH-cCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCCch---------hHHHHHH
Confidence 44556666667777777788877666 8999999999999999999999999999999999763 3334555
Q ss_pred hhHHHHHHhhcCCchhHHHHHHHHHHHhhhhcccchhhhhhhccc-cchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHhhccccc
Q 016338 284 GPGVSLLCLNYAKSPAVAAVLITIALSLSSFSQAGYLLNIQEIAP-DCAGFLHGIANSAGTLAAIISTIGTGYFVQWLGS 362 (391)
Q Consensus 284 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~g~~~~~~~~g~~i~~~~~g~l~~~~g~ 362 (391)
...+........++.+.......+.+...+...+....+..|..| ++|+++.+..+....+|..++|.+.+.+.+..|
T Consensus 74 ~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~l~~~~~- 152 (375)
T 2gfp_A 74 IFMLATLVAVTTSSLTVLIAASAMQGMGTGVGGVMARTLPRDLYERTQLRHANSLLNMGILVSPLLAPLIGGLLDTMWN- 152 (375)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSCCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSCHHH-
T ss_pred HHHHHHHHHHHhccHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHhcc-
Confidence 555555555555566666665556566666667777788888776 899999999999999999999999999999887
Q ss_pred hhHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 016338 363 FQAFLTVTAGLYFVTTIFW 381 (391)
Q Consensus 363 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 381 (391)
++..+.+.++..++..+..
T Consensus 153 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 171 (375)
T 2gfp_A 153 WRACYLFLLVLCAGVTFSM 171 (375)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHCCC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 8888888887777666533
No 14
>4gc0_A D-xylose-proton symporter; MFS, transport protein; HET: 6BG BNG; 2.60A {Escherichia coli} PDB: 4gbz_A* 4gby_A*
Probab=99.35 E-value=4.7e-11 Score=111.91 Aligned_cols=160 Identities=17% Similarity=0.081 Sum_probs=122.5
Q ss_pred hhhHHHHhCCChhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhcCchHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhc--cchHHHHHHH--H
Q 016338 5 VVPLAAKFGWSSSFLGIVQSSFLWGYIFSSVIGGALVDKYGGKKVLAWGVALWSLSTLLTPWAAT--HSTASLLAVR--A 80 (391)
Q Consensus 5 ~~~i~~~~~~s~~~~g~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~Grr~~~~~~~~~~~~~~~~~~~a~~--~~~~~~~~~r--~ 80 (391)
.|.+.++.+.+..+.........+...++.++.+.+.||+|||+.+..+.....++.+..+.... .+.+..++.- +
T Consensus 300 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~dr~Grr~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 379 (491)
T 4gc0_A 300 APEVFKTLGASTDIALLQTIIVGVINLTFTVLAIMTVDKFGRKPLQIIGALGMAIGMFSLGTAFYTQAPGIVALLSMLFY 379 (491)
T ss_dssp HHHHHHHSSCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCHHHHHHHHHHH
T ss_pred chHHHHhcCCCccchhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhcCcchhccchHHHHHHHHHHHHHHhcccchHHHHHHHHHH
Confidence 45677778888888888888888999999999999999999999999998888877766543321 1122222222 2
Q ss_pred HHHhhhhchhhhHHHHhhhhcCccchhhHHHHHHhhhhhhHHHHhhHHHHHHh------hcCchhHHHHHHHHHHHHHHH
Q 016338 81 FFGLAEGVAMPAMSTLTSRWFPSHERASAIGICMGGFHLGNVVGLLLTPIMLS------TIGISGPFILFSSLGLLWLST 154 (391)
Q Consensus 81 l~G~g~~~~~~~~~~~i~~~~~~~~rg~~~~~~~~~~~lg~~~g~~~~~~l~~------~~gwr~~f~~~~~~~~~~~~~ 154 (391)
..+.+.+ ..+....+.+|.+|.+.|++++++......++..+++.+.+.+.+ ..++...|++.++++++..+.
T Consensus 380 ~~~~~~~-~~~~~~~~~~E~fPt~~R~~~~g~~~~~~~~~~~i~~~~~p~l~~~~~~~~~~~~~~~~~i~~~~~~~~~i~ 458 (491)
T 4gc0_A 380 VAAFAMS-WGPVCWVLLSEIFPNAIRGKALAIAVAAQWLANYFVSWTFPMMDKNSWLVAHFHNGFSYWIYGCMGVLAALF 458 (491)
T ss_dssp HHHHHTT-TTHHHHHHHHHSSCTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHCHHHHHHHHHTTCHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHhH-HHHHHHHHHHHhCCHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 2233322 346778899999999999999999999999999999888766543 356777899999999998888
Q ss_pred HhhccccCCCC
Q 016338 155 WTSKVTNDPCN 165 (391)
Q Consensus 155 ~~~~~~~~~~~ 165 (391)
.+++.||++.+
T Consensus 459 ~~~~~PETkg~ 469 (491)
T 4gc0_A 459 MWKFVPETKGK 469 (491)
T ss_dssp HHHHCCCCTTC
T ss_pred HHheecCCCCC
Confidence 88889987654
No 15
>2g9p_A Antimicrobial peptide latarcin 2A; helix-hinge-helix, antimicrobial protein; NMR {Synthetic}
Probab=60.79 E-value=4.1 Score=18.94 Aligned_cols=14 Identities=36% Similarity=0.743 Sum_probs=11.2
Q ss_pred hhhhhhhhcCchHH
Q 016338 36 IGGALVDKYGGKKV 49 (391)
Q Consensus 36 ~~g~l~dr~Grr~~ 49 (391)
+.|.+..+||||.+
T Consensus 2 lfgklikkfgrkai 15 (26)
T 2g9p_A 2 LFGKLIKKFGRKAI 15 (26)
T ss_dssp HHHHHHHHHTSHHH
T ss_pred cHHHHHHHHhHHHH
Confidence 36888999999864
No 16
>2jln_A MHP1; hydantoin, transporter, membrane protein, nucleobase-cation-symport-1 family; 2.85A {Microbacterium liquefaciens} PDB: 2jlo_A* 2x79_A
Probab=22.51 E-value=4.4e+02 Score=23.95 Aligned_cols=52 Identities=12% Similarity=0.077 Sum_probs=26.7
Q ss_pred cCccch-hhHHHHHHhhhhhhHHHHhh-HHHHHHhhcCchhHHHHHHHHHHHHH
Q 016338 101 FPSHER-ASAIGICMGGFHLGNVVGLL-LTPIMLSTIGISGPFILFSSLGLLWL 152 (391)
Q Consensus 101 ~~~~~r-g~~~~~~~~~~~lg~~~g~~-~~~~l~~~~gwr~~f~~~~~~~~~~~ 152 (391)
.|+++| .....+.....+....++.. +++.+....+|+..+....+-.++..
T Consensus 20 vp~~~R~~~~~~~~~~W~g~~~~i~~~~~Ga~~~~GLs~~~a~lai~lG~li~~ 73 (501)
T 2jln_A 20 TRYAERSVGPFSLAAIWFAMAIQVAIFIAAGQMTSSFQVWQVIVAIAAGCTIAV 73 (501)
T ss_dssp CCGGGCCBCHHHHHHHHHHHHCSTHHHHHHHHHTTTSCHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred CChhhCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCcCHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 455666 45555555555555444444 33333345567766655444444433
Done!