BLASTP 2.2.26 [Sep-21-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Reference for compositional score matrix adjustment: Altschul, Stephen F.,
John C. Wootton, E. Michael Gertz, Richa Agarwala, Aleksandr Morgulis,
Alejandro A. Schaffer, and Yi-Kuo Yu (2005) "Protein database searches
using compositionally adjusted substitution matrices", FEBS J. 272:5101-5109.
Query= 019464
(340 letters)
Database: swissprot
539,616 sequences; 191,569,459 total letters
Searching..................................................done
>sp|Q27409|FP1_MYTGA Adhesive plaque matrix protein OS=Mytilus galloprovincialis GN=FP1
PE=2 SV=1
Length = 751
Score = 75.5 bits (184), Expect = 6e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/139 (36%), Positives = 59/139 (42%), Gaps = 3/139 (2%)
Query: 151 YGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFESG 210
Y KP Y Y KP Y Y KP Y Y +KP + Y KP Y S Y +KP +
Sbjct: 449 YKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKTKPSYPRTYKAKPSYSSTYKAKPSYPPT 508
Query: 211 YGRKPEYESGYGSKP-HESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYESG 269
Y KP Y Y +KP + Y KP Y Y +KP Y Y KP Y Y +K Y
Sbjct: 509 YKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPQTYKAKSSYPPT 568
Query: 270 YGRKPESEYEGGYGGGSEY 288
Y KP Y Y Y
Sbjct: 569 YKAKP--SYPPTYKAKPSY 585
Score = 74.7 bits (182), Expect = 1e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/159 (33%), Positives = 62/159 (38%), Gaps = 23/159 (14%)
Query: 151 YGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFESG 210
Y KP Y + Y KP Y S Y KP Y Y +KP + Y KP Y S Y +KP +
Sbjct: 269 YKAKPSYPTSYRAKPSYPSTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPTYPSTYKAKPSYPPT 328
Query: 211 YGRKPEYESGYGSKP---------------------HESGYGRKPDYESGYGSKPEYESG 249
Y KP Y Y +KP + Y KP Y Y +KP Y
Sbjct: 329 YKAKPSYPPTYKAKPSYPPSYKPKTTYPPSYKPKISYPPTYKAKPSYPPIYKAKPSYPPT 388
Query: 250 YGRKPEYESGYGSKPEYESGYGRKPESEYEGGYGGGSEY 288
Y KP Y Y +KP Y Y KP Y Y Y
Sbjct: 389 YKAKPSYLPTYKAKPSYPPTYKAKP--RYPTTYKAKPSY 425
Score = 70.5 bits (171), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/143 (33%), Positives = 57/143 (39%), Gaps = 13/143 (9%)
Query: 157 YESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFESGYGRKPE 216
Y Y KP Y Y KP Y Y +KP + Y KP Y Y +KP + + Y KP
Sbjct: 365 YPPTYKAKPSYPPIYKAKPSYPPTYKAKPSYLPTYKAKPSYPPTYKAKPRYPTTYKAKPS 424
Query: 217 YESGYGSKP-----------HESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPE 265
Y Y +KP + Y KP Y Y +KP Y Y KP Y Y +KP
Sbjct: 425 YPPTYKAKPSYPPTYKAKLSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKTKPS 484
Query: 266 YESGYGRKPESEYEGGYGGGSEY 288
Y Y KP Y Y Y
Sbjct: 485 YPRTYKAKP--SYSSTYKAKPSY 505
Score = 70.5 bits (171), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/132 (36%), Positives = 58/132 (43%), Gaps = 6/132 (4%)
Query: 141 RTESEYGGSAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESG 200
+ +S Y + Y KP Y Y KP Y Y KP Y Y +KP + Y KP Y
Sbjct: 560 KAKSSYPPT-YKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPT 618
Query: 201 YGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKP-HESGYGRKPDYESGYGS----KPEYESGYGRKPE 255
Y +KP + Y KP Y Y +KP + Y KP Y + Y S KP Y Y KP
Sbjct: 619 YKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPATYPSTYKAKPSYPPTYKAKPS 678
Query: 256 YESGYGSKPEYE 267
Y Y KP Y
Sbjct: 679 YPPTYKPKPSYP 690
Score = 70.1 bits (170), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/141 (36%), Positives = 59/141 (41%), Gaps = 3/141 (2%)
Query: 149 SAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFE 208
S Y K Y Y KP Y + Y KP Y S Y +KP + Y KP Y Y +KP +
Sbjct: 257 STYKPKISYPPTYKAKPSYPTSYRAKPSYPSTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPTYP 316
Query: 209 SGYGRKPEYESGYGSKP-HESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYE 267
S Y KP Y Y +KP + Y KP Y Y K Y Y K Y Y +KP Y
Sbjct: 317 STYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPSYKPKTTYPPSYKPKISYPPTYKAKPSYP 376
Query: 268 SGYGRKPESEYEGGYGGGSEY 288
Y KP Y Y Y
Sbjct: 377 PIYKAKP--SYPPTYKAKPSY 395
Score = 60.1 bits (144), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/155 (30%), Positives = 54/155 (34%), Gaps = 35/155 (22%)
Query: 151 YGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFESG 210
Y KP Y Y KP Y Y KP Y Y +KP + Y KP Y Y +KP +
Sbjct: 579 YKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPT 638
Query: 211 YGRKPEYESGYGSKP-----HESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESG------ 259
Y KP Y Y +KP + S Y KP Y Y +KP Y Y KP Y
Sbjct: 639 YKAKPSYPPTYKAKPSYPATYPSTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKPKPSYPPTYKSKSS 698
Query: 260 ------------------------YGSKPEYESGY 270
Y KP Y Y
Sbjct: 699 YPSSYKPKKTYPPTYKPKLTYPPIYKPKPSYPPTY 733
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.47, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/185 (27%), Positives = 60/185 (32%), Gaps = 36/185 (19%)
Query: 135 ESGFGGRTESEYGGSAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYES--------------- 179
++ + +T Y K Y Y KP Y Y KP Y +
Sbjct: 96 KTTYNAKTN---YPPVYKPKMTYPPTYKPKPSYPPTYKPKPSYPATYKSKSSYPSSYKPK 152
Query: 180 ---------------GYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGY-GS 223
Y KP + Y KP Y + Y SK + Y K Y S Y
Sbjct: 153 KTYPPTYKPKLTYPPTYKPKPSYPPTYKPKPSYPATYKSKSSYPPSYKTKKTYPSSYKPK 212
Query: 224 KPHESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYESGYGRKPESEYEGGYG 283
K + S Y K Y Y SK Y Y K Y S Y K Y S Y KP+ Y Y
Sbjct: 213 KTYPSTYKPKVSYPPTYKSKKSYPPIYKTKASYPSSYKPKKTYPSTY--KPKISYPPTYK 270
Query: 284 GGSEY 288
Y
Sbjct: 271 AKPSY 275
>sp|Q25460|FP1_MYTED Adhesive plaque matrix protein (Fragment) OS=Mytilus edulis GN=FP1
PE=1 SV=1
Length = 875
Score = 73.9 bits (180), Expect = 2e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/149 (35%), Positives = 63/149 (42%), Gaps = 9/149 (6%)
Query: 147 GGSAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPE 206
+Y KP Y S Y KP Y Y KP Y Y +KP + Y KP Y S Y +KP
Sbjct: 587 AKPSYKAKPTYPSTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPTYPSTYKAKPS 646
Query: 207 FESGYGRKPEYESGYGSKP-HESGYGRKPDYESGYGSKPEYE------SGYGRKPEYESG 259
+ Y K Y Y +KP + Y KP Y Y +KP Y+ S Y KP Y
Sbjct: 647 YPPTYKPKISYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPTYKAKPTNPSTYKAKPSYPPT 706
Query: 260 YGSKPEYESGYGRKPESEYEGGYGGGSEY 288
Y +KP Y Y KP Y Y Y
Sbjct: 707 YKAKPSYPPTYKAKP--SYPPTYKAKPTY 733
Score = 69.3 bits (168), Expect = 4e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/160 (32%), Positives = 64/160 (40%), Gaps = 17/160 (10%)
Query: 147 GGSAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPE 206
Y KP Y Y KP Y Y KP Y Y +KP + Y KP Y Y +KP
Sbjct: 277 AKPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPS 336
Query: 207 F------ESGYGRKPEYESGYGSKP-HESGYGRKPDYESGYGSKPEYES------GYGRK 253
+ + Y KP Y S Y +KP + Y KP Y Y +KP Y++ Y K
Sbjct: 337 YPPTYKAKPTYKAKPTYPSTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPTYKAKPSYPPTYKAK 396
Query: 254 PEYESGYGSKPEYESGYGRKP----ESEYEGGYGGGSEYG 289
P Y Y +KP Y Y KP + Y Y Y
Sbjct: 397 PSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPTYKAKPTYPSTYKAKPSYP 436
Score = 68.6 bits (166), Expect = 6e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/147 (34%), Positives = 63/147 (42%), Gaps = 15/147 (10%)
Query: 151 YGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYES--------GYGSKPEFESGYGRKPEYESGYG 202
Y KP Y Y KP Y Y KP Y++ Y +KP + Y KP Y Y
Sbjct: 243 YKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPTYKAKPTYKAKPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYK 302
Query: 203 SKPEFESGYGRKPEYESGYGSKP-HESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYG 261
+KP + Y KP Y Y +KP + Y KP Y Y +KP Y++ KP Y S Y
Sbjct: 303 AKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPTYKA----KPTYPSTYK 358
Query: 262 SKPEYESGYGRKPESEYEGGYGGGSEY 288
+KP Y Y KP Y Y Y
Sbjct: 359 AKPSYPPTYKAKP--SYPPTYKAKPTY 383
Score = 68.2 bits (165), Expect = 8e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/162 (33%), Positives = 64/162 (39%), Gaps = 25/162 (15%)
Query: 151 YGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYE------SGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSK 204
Y KP Y Y KP Y Y KP Y+ S Y +KP + Y KP Y Y +K
Sbjct: 565 YKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYKAKPTYPSTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAK 624
Query: 205 PEFESGYGRKPEYESGYGSKP-----------HESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRK 253
P + Y KP Y S Y +KP + Y KP Y Y +KP Y Y K
Sbjct: 625 PSYPPTYKAKPTYPSTYKAKPSYPPTYKPKISYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAK 684
Query: 254 PEYE------SGYGSKPEYESGYGRKPESEYEGGYGGGSEYG 289
P Y+ S Y +KP Y Y KP Y Y Y
Sbjct: 685 PTYKAKPTNPSTYKAKPSYPPTYKAKP--SYPPTYKAKPSYP 724
Score = 66.6 bits (161), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/112 (38%), Positives = 53/112 (47%), Gaps = 7/112 (6%)
Query: 157 YESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFESGYGRKPE 216
Y S Y KP Y Y KP Y Y +KP + Y KP Y++ KP + S Y KP
Sbjct: 167 YPSSYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPTYKA----KPTYPSTYKAKPS 222
Query: 217 YESGYGSKPHESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYES 268
Y Y +KP Y KP Y Y +KP Y Y KP Y Y +KP Y++
Sbjct: 223 YPPTYKAKP---TYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPTYKA 271
Score = 66.6 bits (161), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/138 (35%), Positives = 58/138 (42%), Gaps = 11/138 (7%)
Query: 157 YESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFESGYGRKPE 216
Y Y KP Y Y KP Y Y +K + S Y KP Y Y +KP + Y KP
Sbjct: 137 YPPTYKPKPSYPPTYKPKPSYPPSYKTKKTYPSSYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPS 196
Query: 217 YESGYGSKPHESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYES------GYGSKPEYESGY 270
Y Y +KP Y KP Y S Y +KP Y Y KP Y++ Y +KP Y Y
Sbjct: 197 YPPTYKAKP---TYKAKPTYPSTYKAKPSYPPTYKAKPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTY 253
Query: 271 GRKPESEYEGGYGGGSEY 288
KP Y Y Y
Sbjct: 254 KAKP--SYPPTYKAKPTY 269
Score = 63.9 bits (154), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/156 (33%), Positives = 65/156 (41%), Gaps = 21/156 (13%)
Query: 151 YGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYE------SGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSK 204
Y KP Y Y KP Y Y KP Y+ S Y +KP + Y KP Y Y +K
Sbjct: 321 YKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPTYKAKPTYPSTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAK 380
Query: 205 PEFES------GYGRKPEYESGYGSKP-HESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYE 257
P +++ Y KP Y Y +KP + Y KP Y+ +KP Y S Y KP Y
Sbjct: 381 PTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPTYK----AKPTYPSTYKAKPSYP 436
Query: 258 SGYGSKPEYESGYGRKP----ESEYEGGYGGGSEYG 289
Y +KP Y Y KP + Y Y Y
Sbjct: 437 PSYKAKPSYPPTYKAKPTYKAKPTYPSTYKAKPSYP 472
Score = 62.0 bits (149), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/144 (34%), Positives = 60/144 (41%), Gaps = 9/144 (6%)
Query: 151 YGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFESG 210
Y KP Y S Y K Y Y K Y Y KP + Y KP Y Y +K + S
Sbjct: 111 YKAKPSYPSSYKPKKTYPPTYKPKLTYPPTYKPKPSYPPTYKPKPSYPPSYKTKKTYPSS 170
Query: 211 YGRKPEYESGYGSKP-HESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYESG 269
Y KP Y Y +KP + Y KP Y Y +KP Y++ KP Y S Y +KP Y
Sbjct: 171 YKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPTYKA----KPTYPSTYKAKPSYPPT 226
Query: 270 YGRKP----ESEYEGGYGGGSEYG 289
Y KP + Y Y Y
Sbjct: 227 YKAKPTYKAKPSYPPTYKAKPSYP 250
Score = 55.8 bits (133), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/134 (33%), Positives = 56/134 (41%), Gaps = 7/134 (5%)
Query: 157 YESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFESGYGRKPE 216
Y Y K Y+ Y KP Y Y K + Y K Y Y +KP + + Y KP
Sbjct: 501 YPPTYKPKLTYKPTYKPKPSYPPSYKPKTTYPPTYKPKISYPPTYKAKPSYPATYKAKPS 560
Query: 217 YESGYGSKP-HESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYESGYGRKPE 275
Y Y +KP + Y KP Y Y +KP Y++ KP Y S Y +KP Y Y KP
Sbjct: 561 YPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYKA----KPTYPSTYKAKPSYPPTYKAKP- 615
Query: 276 SEYEGGYGGGSEYG 289
Y Y Y
Sbjct: 616 -SYPPTYKAKPSYP 628
Score = 54.7 bits (130), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/166 (30%), Positives = 64/166 (38%), Gaps = 27/166 (16%)
Query: 147 GGSAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYES------GYGSKPEFESGYGRKPEYESG 200
Y KP Y S Y KP Y Y KP Y++ Y +KP + Y KP Y
Sbjct: 203 AKPTYKAKPTYPSTYKAKPSYPPTYKAKPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPT 262
Query: 201 YGSKPEFES--------GYGRKPEYESGYGSKP-HESGYGRKP----DYESGYGSKPEYE 247
Y +KP +++ Y KP Y Y +KP + Y KP Y++ P Y
Sbjct: 263 YKAKPTYKAKPTYKAKPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAK----PSYP 318
Query: 248 SGYGRKPEYESGYGSKPEYESGYGRKP----ESEYEGGYGGGSEYG 289
Y KP Y Y +KP Y Y KP + Y Y Y
Sbjct: 319 PTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPTYKAKPTYPSTYKAKPSYP 364
Score = 53.5 bits (127), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/200 (26%), Positives = 63/200 (31%), Gaps = 59/200 (29%)
Query: 147 GGSAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPG------------------------------ 176
Y KP Y S Y KP Y + Y KP
Sbjct: 451 AKPTYKAKPTYPSTYKAKPSYPASYKAKPSYPPTYKSKSSYPSSYKPKKTYPPTYKPKLT 510
Query: 177 YESGYGSKPEFESG--------------------YGRKPEYESGYGSKPEFESGYGRKPE 216
Y+ Y KP + Y KP Y + Y +KP + Y KP
Sbjct: 511 YKPTYKPKPSYPPSYKPKTTYPPTYKPKISYPPTYKAKPSYPATYKAKPSYPPTYKAKPS 570
Query: 217 YESGYGSKPH-------ESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYESG 269
Y Y +KP + Y KP Y S Y +KP Y Y KP Y Y +KP Y
Sbjct: 571 YPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYKAKPTYPSTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPTYKAKPSYPPT 630
Query: 270 YGRKPESEYEGGYGGGSEYG 289
Y KP Y Y Y
Sbjct: 631 YKAKP--TYPSTYKAKPSYP 648
Score = 52.8 bits (125), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/147 (33%), Positives = 56/147 (38%), Gaps = 9/147 (6%)
Query: 149 SAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFE------SGYGRKPEYESGYG 202
+ Y K Y Y K Y Y KP Y Y SKP ++ Y KP Y S Y
Sbjct: 63 TTYNAKTNYPPVYKPKMTYPPTYKPKPSYPPTYKSKPTYKPKITYPPTYKAKPSYPSSYK 122
Query: 203 SKPEFESGYGRKPEYESGYGSKP-HESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYG 261
K + Y K Y Y KP + Y KP Y Y +K Y S Y KP Y Y
Sbjct: 123 PKKTYPPTYKPKLTYPPTYKPKPSYPPTYKPKPSYPPSYKTKKTYPSSYKAKPSYPPTYK 182
Query: 262 SKPEYESGYGRKPESEYEGGYGGGSEY 288
+KP Y Y KP Y Y Y
Sbjct: 183 AKPSYPPTYKAKP--SYPPTYKAKPTY 207
Score = 50.8 bits (120), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/125 (35%), Positives = 49/125 (39%), Gaps = 1/125 (0%)
Query: 147 GGSAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPE 206
Y KP Y Y KP Y Y KP Y Y SK + S Y K Y Y K
Sbjct: 745 AKPTYKAKPTYPPTYKAKPSYPPTYKPKPSYPPTYKSKSIYPSSYKPKKTYPPTYKPKLT 804
Query: 207 FESGYGRKPEYESGYGSK-PHESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPE 265
+ Y KP Y Y K + S Y KP Y Y SK Y Y +K Y S Y +K
Sbjct: 805 YPPTYKPKPSYPPSYKPKITYPSTYKLKPSYPPTYKSKTSYPPTYNKKISYPSSYKAKTS 864
Query: 266 YESGY 270
Y Y
Sbjct: 865 YPPAY 869
>sp|Q9FKA5|Y5957_ARATH Uncharacterized protein At5g39570 OS=Arabidopsis thaliana
GN=At5g39570 PE=1 SV=1
Length = 381
Score = 64.3 bits (155), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 123/290 (42%), Positives = 143/290 (49%), Gaps = 64/290 (22%)
Query: 58 QPQPAYGFQPGMGRPEPYGSGRPESEYASGYA--------KRPDSQEYGSGYGKRPESE- 108
+P P YG + G GR +PESEY SGY +RP+ Q YGSGYG R E+E
Sbjct: 105 RPNPGYGSESGYGR-------KPESEYGSGYGGQTEVEYGRRPE-QSYGSGYGGRTETES 156
Query: 109 EYGSGYGRKPDSEVHGSGYGRRPESGE-SGFGGRTESEYGGS-AYGRKPEYESGYGQKPE 166
EYGSG G + + E YGRRPESG SG+GGR+ESEY +YGR E E GY +KP
Sbjct: 157 EYGSGGGGRTEVE-----YGRRPESGLGSGYGGRSESEYERKPSYGRSEEQEEGY-RKPS 210
Query: 167 YESGYGGKPGYES-GYGSKPEFESGYGRKPEY-------ESGYGSKPEFESGYGRKPEYE 218
Y + GY YG E E GY RKP Y E GY KP YGR E E
Sbjct: 211 YGRSEEQEEGYRKPSYGRSEEQEEGY-RKPSYGRSEEEQEEGY-RKP----SYGRSEEQE 264
Query: 219 SGYGSKPHESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYESGYGRKPESEY 278
G KP YGR D Y KP YGR E E G KP YGR E E
Sbjct: 265 EGSYRKPS---YGRSDDQVESY-IKP----SYGRSEEQEEGSYRKP----SYGRSEEQE- 311
Query: 279 EGGYGGGSEYGK-------FERKSSHGRSDDEEGYKKPCSYGYERRGDDD 321
EG Y YG+ +R++ G DDEEG SYG ++ G +D
Sbjct: 312 EGSYRKQPSYGRGNDDDDDEQRRNRSGSGDDEEG-----SYGRKKYGGND 356
Score = 53.1 bits (126), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 111/269 (41%), Positives = 129/269 (47%), Gaps = 58/269 (21%)
Query: 117 KPDSEVHGSGYGRRPESG---ESGFGGRTESEYGGSAYGRKPEYESGYGQKPE--YESGY 171
+PDS G G RP G ESG+G + ESEYG S YG + E E YG++PE Y SGY
Sbjct: 92 RPDSGGGGHVQGERPNPGYGSESGYGRKPESEYG-SGYGGQTEVE--YGRRPEQSYGSGY 148
Query: 172 GGKPGYESGYGSKPE--FESGYGRKPE--YESGYGSKPEFE----SGYGRKPEYESGYGS 223
GG+ ES YGS E YGR+PE SGYG + E E YGR E E GY
Sbjct: 149 GGRTETESEYGSGGGGRTEVEYGRRPESGLGSGYGGRSESEYERKPSYGRSEEQEEGY-R 207
Query: 224 KPHESGYGRKPDYESG-----YGSKPEYESGYGRKPEY------------ESGYGSKPEY 266
KP YGR + E G YG E E GY RKP Y + YG E
Sbjct: 208 KPS---YGRSEEQEEGYRKPSYGRSEEQEEGY-RKPSYGRSEEEQEEGYRKPSYGRSEEQ 263
Query: 267 ESGYGRKP---------ESEYEGGYGGGSEY--GKFERKSSHGRSDDEE--GYKKPCSYG 313
E G RKP ES + YG E G + RK S+GRS+++E Y+K SYG
Sbjct: 264 EEGSYRKPSYGRSDDQVESYIKPSYGRSEEQEEGSY-RKPSYGRSEEQEEGSYRKQPSYG 322
Query: 314 YERRGDDDEH------SGGSHEYGYGRKK 336
DDDE SG E YGRKK
Sbjct: 323 RGNDDDDDEQRRNRSGSGDDEEGSYGRKK 351
>sp|Q25434|FP1_MYTCO Adhesive plaque matrix protein OS=Mytilus coruscus GN=FP1 PE=2 SV=1
Length = 872
Score = 53.9 bits (128), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/141 (33%), Positives = 53/141 (37%), Gaps = 3/141 (2%)
Query: 150 AYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFES 209
Y RKP Y + Y QKP Y Y K Y + Y SK + Y K Y Y KP +
Sbjct: 491 TYKRKPSYPTPYKQKPSYPPIYKSKSSYPTSYKSKKTYPPTYKPKITYPPTYKPKPSYPP 550
Query: 210 GYGRKPEYESGYGSKP-HESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYES 268
Y K Y Y K + Y K Y Y K Y Y KP Y + Y KP Y
Sbjct: 551 SYKPKTTYPPTYKPKIRYPPTYKPKASYPPTYKPKITYPPTYKPKPSYPTPYKQKPSYPP 610
Query: 269 GYGRKPESEYEGGYGGGSEYG 289
Y K S Y Y Y
Sbjct: 611 IYKSK--SSYPTAYKSKKTYP 629
Score = 52.8 bits (125), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/142 (33%), Positives = 55/142 (38%), Gaps = 3/142 (2%)
Query: 149 SAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFE 208
S+Y K Y Y K Y Y KP Y Y K + Y KP Y Y K +
Sbjct: 430 SSYKSKKTYPPTYKPKISYPPTYKPKPSYPPTYKPKITYPPTYKPKPSYPPTYKPKITYP 489
Query: 209 SGYGRKPEYESGYGSKP-HESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYE 267
Y RKP Y + Y KP + Y K Y + Y SK Y Y K Y Y KP Y
Sbjct: 490 PTYKRKPSYPTPYKQKPSYPPIYKSKSSYPTSYKSKKTYPPTYKPKITYPPTYKPKPSYP 549
Query: 268 SGYGRKPESEYEGGYGGGSEYG 289
Y KP++ Y Y Y
Sbjct: 550 PSY--KPKTTYPPTYKPKIRYP 569
Score = 51.6 bits (122), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/141 (32%), Positives = 53/141 (37%), Gaps = 3/141 (2%)
Query: 150 AYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFES 209
Y KP Y Y K Y Y KP Y Y K + Y RKP Y + Y KP +
Sbjct: 451 TYKPKPSYPPTYKPKITYPPTYKPKPSYPPTYKPKITYPPTYKRKPSYPTPYKQKPSYPP 510
Query: 210 GYGRKPEYESGYGS-KPHESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYES 268
Y K Y + Y S K + Y K Y Y KP Y Y K Y Y K Y
Sbjct: 511 IYKSKSSYPTSYKSKKTYPPTYKPKITYPPTYKPKPSYPPSYKPKTTYPPTYKPKIRYPP 570
Query: 269 GYGRKPESEYEGGYGGGSEYG 289
Y KP++ Y Y Y
Sbjct: 571 TY--KPKASYPPTYKPKITYP 589
Score = 50.4 bits (119), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/259 (26%), Positives = 92/259 (35%), Gaps = 35/259 (13%)
Query: 51 VSYPGRPQPQPAY--GFQPGMGRPEPYGSGRPESEYASGYAKRPD-------SQEYGSGY 101
V+YP +P+P+Y ++P + P + +P+ Y + Y ++P Y + Y
Sbjct: 286 VTYPPTYKPKPSYPPTYKPKITYPP---TYKPKPSYPTPYKQKPSYPPIYKSKSSYPTSY 342
Query: 102 GKRPESEEYGSGYGRKPDSEVHGSGYGRRPESGESGFGGRTESEYGGSAYGRKPEYESGY 161
+ + Y Y K + Y +P S +T S Y K Y Y
Sbjct: 343 KSK---KTYPPTYKPK---ITYPPTYKPKPSYPPSYKPKKTYSP----TYKPKITYPPTY 392
Query: 162 GQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGY 221
KP Y Y K Y Y K + Y K Y S Y SK + Y K Y Y
Sbjct: 393 KPKPSYPPSYKPKTTYPPTYKPKISYPPTYKPKASYVSSYKSKKTYPPTYKPKISYPPTY 452
Query: 222 GSKP-----------HESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYESGY 270
KP + Y KP Y Y K Y Y RKP Y + Y KP Y Y
Sbjct: 453 KPKPSYPPTYKPKITYPPTYKPKPSYPPTYKPKITYPPTYKRKPSYPTPYKQKPSYPPIY 512
Query: 271 GRKPESEYEGGYGGGSEYG 289
K S Y Y Y
Sbjct: 513 KSK--SSYPTSYKSKKTYP 529
Score = 50.4 bits (119), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/136 (35%), Positives = 52/136 (38%), Gaps = 3/136 (2%)
Query: 148 GSAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEF 207
S Y KP Y Y KP Y S Y K Y Y KP + S Y K Y Y KP +
Sbjct: 739 PSTYKAKPSYPPTYKPKPSYASSYKPKIRYPPTYKPKPSYASSYKPKIRYPPTYKPKPSY 798
Query: 208 ESGYGRKPEYESGYGSKP-HESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEY 266
S Y K Y Y KP + S Y K Y Y K Y Y K Y Y K Y
Sbjct: 799 ASSYKPKIRYPPTYKPKPSYASSYKPKITYPPTYKPKISYPPTYKPKITYPPTYKPKISY 858
Query: 267 ESGYGRKPESEYEGGY 282
Y KP+ Y Y
Sbjct: 859 PPAY--KPKISYPSQY 872
Score = 50.1 bits (118), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/163 (30%), Positives = 61/163 (37%), Gaps = 14/163 (8%)
Query: 150 AYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFES 209
Y KP Y Y K Y Y KP Y Y K + Y KP Y + Y KP +
Sbjct: 271 TYKPKPSYPPTYKPKVTYPPTYKPKPSYPPTYKPKITYPPTYKPKPSYPTPYKQKPSYPP 330
Query: 210 GYGRKPEYESGYGSK---P--------HESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYES 258
Y K Y + Y SK P + Y KP Y Y K Y Y K Y
Sbjct: 331 IYKSKSSYPTSYKSKKTYPPTYKPKITYPPTYKPKPSYPPSYKPKKTYSPTYKPKITYPP 390
Query: 259 GYGSKPEYESGYGRKPESEYEGGYGGGSEYGK-FERKSSHGRS 300
Y KP Y Y KP++ Y Y Y ++ K+S+ S
Sbjct: 391 TYKPKPSYPPSY--KPKTTYPPTYKPKISYPPTYKPKASYVSS 431
Score = 48.5 bits (114), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/142 (32%), Positives = 53/142 (37%), Gaps = 3/142 (2%)
Query: 149 SAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFE 208
S+Y K Y Y K Y Y KP Y Y K + Y KP Y Y K +
Sbjct: 250 SSYKSKKTYPPTYKPKISYPPTYKPKPSYPPTYKPKVTYPPTYKPKPSYPPTYKPKITYP 309
Query: 209 SGYGRKPEYESGYGSKP-HESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYE 267
Y KP Y + Y KP + Y K Y + Y SK Y Y K Y Y KP Y
Sbjct: 310 PTYKPKPSYPTPYKQKPSYPPIYKSKSSYPTSYKSKKTYPPTYKPKITYPPTYKPKPSYP 369
Query: 268 SGYGRKPESEYEGGYGGGSEYG 289
Y KP+ Y Y Y
Sbjct: 370 PSY--KPKKTYSPTYKPKITYP 389
Score = 47.4 bits (111), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/143 (32%), Positives = 53/143 (37%), Gaps = 3/143 (2%)
Query: 148 GSAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEF 207
S Y K Y S Y K Y Y K Y Y KP + Y K Y Y KP +
Sbjct: 239 PSIYKPKASYVSSYKSKKTYPPTYKPKISYPPTYKPKPSYPPTYKPKVTYPPTYKPKPSY 298
Query: 208 ESGYGRKPEYESGYGSKP-HESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEY 266
Y K Y Y KP + + Y +KP Y Y SK Y + Y K Y Y K Y
Sbjct: 299 PPTYKPKITYPPTYKPKPSYPTPYKQKPSYPPIYKSKSSYPTSYKSKKTYPPTYKPKITY 358
Query: 267 ESGYGRKPESEYEGGYGGGSEYG 289
Y KP+ Y Y Y
Sbjct: 359 PPTY--KPKPSYPPSYKPKKTYS 379
Score = 46.2 bits (108), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/134 (32%), Positives = 51/134 (38%), Gaps = 3/134 (2%)
Query: 157 YESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFESGYGRKPE 216
Y S Y K Y Y K Y Y KP + Y K Y Y KP + Y K
Sbjct: 428 YVSSYKSKKTYPPTYKPKISYPPTYKPKPSYPPTYKPKITYPPTYKPKPSYPPTYKPKIT 487
Query: 217 YESGYGSKP-HESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYESGYGRKPE 275
Y Y KP + + Y +KP Y Y SK Y + Y K Y Y K Y Y KP+
Sbjct: 488 YPPTYKRKPSYPTPYKQKPSYPPIYKSKSSYPTSYKSKKTYPPTYKPKITYPPTY--KPK 545
Query: 276 SEYEGGYGGGSEYG 289
Y Y + Y
Sbjct: 546 PSYPPSYKPKTTYP 559
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/144 (31%), Positives = 55/144 (38%), Gaps = 4/144 (2%)
Query: 157 YESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFESGYGRKPE 216
Y Y KP Y + Y KP Y Y SK + + Y K Y Y K + Y KP
Sbjct: 588 YPPTYKPKPSYPTPYKQKPSYPPIYKSKSSYPTAYKSKKTYPPTYKPKITYPPTYKPKPS 647
Query: 217 YESGYGSK-PHESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYESGYGRKPE 275
Y Y K + Y K Y Y SK Y Y K Y Y K Y Y KP+
Sbjct: 648 YPPSYRPKITYPPTYKPKKSYPQAYKSKGSYPPSYQPKKTYPPSYKPKKTYPPTY--KPK 705
Query: 276 SEYEGGYGGGSEY-GKFERKSSHG 298
Y Y Y ++RK+S+
Sbjct: 706 ISYPPTYKTKPSYPASYKRKTSYP 729
Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.096, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/129 (31%), Positives = 47/129 (36%), Gaps = 3/129 (2%)
Query: 160 GYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFESGYGRKPEYES 219
Y K Y Y K Y Y K + Y +KP Y Y K + Y K Y
Sbjct: 123 AYKAKTSYPPSYKHKITYPPTYKPKITYPPTYKQKPSYPPSYKPKTTYPPTYKPKITYPP 182
Query: 220 GYGSKPHESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYESGYGRKPESEYE 279
Y KP + Y K Y Y K Y Y RKP Y + Y K Y Y KP+ Y
Sbjct: 183 TYKRKPSYTPYKPKATYPPTYKPKITYPPTYKRKPSY-TPYKPKTTYPPTY--KPKISYP 239
Query: 280 GGYGGGSEY 288
Y + Y
Sbjct: 240 SIYKPKASY 248
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/125 (31%), Positives = 45/125 (36%), Gaps = 1/125 (0%)
Query: 150 AYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFES 209
+Y K Y Y K Y Y K Y Y K + Y KP Y + Y KP +
Sbjct: 551 SYKPKTTYPPTYKPKIRYPPTYKPKASYPPTYKPKITYPPTYKPKPSYPTPYKQKPSYPP 610
Query: 210 GYGRKPEYESGYGS-KPHESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYES 268
Y K Y + Y S K + Y K Y Y KP Y Y K Y Y K Y
Sbjct: 611 IYKSKSSYPTAYKSKKTYPPTYKPKITYPPTYKPKPSYPPSYRPKITYPPTYKPKKSYPQ 670
Query: 269 GYGRK 273
Y K
Sbjct: 671 AYKSK 675
>sp|Q6ZQX7|CQ097_HUMAN Uncharacterized protein C17orf97 OS=Homo sapiens GN=C17orf97 PE=2
SV=2
Length = 453
Score = 49.7 bits (117), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/119 (30%), Positives = 50/119 (42%), Gaps = 3/119 (2%)
Query: 160 GYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFESGYGRKPEYES 219
G+ PE G+ P G+ PE G+ PE G+ PE G+ PE
Sbjct: 204 GFHPDPEALKGFHPDPDALKGFHPDPEALKGFHPDPEALKGFHPDPEALKGFHPDPEALK 263
Query: 220 GYGSKPHESGYGRKPDYES--GYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYESGYGRKPES 276
G P E+ G PD E+ G+ PE G+ PE G+ + PE G+ PE+
Sbjct: 264 GIHPDP-EALKGIHPDPEALKGFHPDPEALKGFHPDPEALKGFHTDPEALKGFHIDPEA 321
Score = 49.3 bits (116), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/207 (26%), Positives = 88/207 (42%), Gaps = 20/207 (9%)
Query: 80 PESEYASGYAKRPDSQEYGSGYGKRPESEEYGSGYGRKPDSEVHGSGYGRRPESGESGFG 139
P+ E G+ PD+ + G+ PE+ + G PD E G+ PE+ + GF
Sbjct: 207 PDPEALKGFHPDPDALK---GFHPDPEALK-----GFHPDPEA-LKGFHPDPEALK-GFH 256
Query: 140 GRTESEYGG-----SAYGRKPEYES--GYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYG 192
E+ G + G P+ E+ G+ PE G+ P G+ + PE G+
Sbjct: 257 PDPEALKGIHPDPEALKGIHPDPEALKGFHPDPEALKGFHPDPEALKGFHTDPEALKGFH 316
Query: 193 RKPEYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPHESGYGRKPDYES--GYGSKPEYESGY 250
PE G+ P+ G+ P+ G+ + P E+ G PD ++ G+ PE G+
Sbjct: 317 IDPEALKGFHPDPKALKGFHPDPKALKGFHTDP-EALKGFHPDPKALKGFHPDPEALKGF 375
Query: 251 GRKPEYESGYGSKPEYESGYGRKPESE 277
PE G+ PE G+ P +E
Sbjct: 376 HPDPEALKGFHPDPEALKGFHTDPNAE 402
Score = 34.3 bits (77), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/179 (25%), Positives = 67/179 (37%), Gaps = 20/179 (11%)
Query: 57 PQPQPAYGFQPGMGRPEPYGSGRPESEYASGYAKRPDSQEYGSGYGKRPESEEYGSGYGR 116
P P+ GF P PE P+ E G P++ + G+ PE+ + G
Sbjct: 247 PDPEALKGFHPD---PEALKGIHPDPEALKGIHPDPEALK---GFHPDPEALK-----GF 295
Query: 117 KPDSEVHGSGYGRRPESGESGFGGRTESEYG-------GSAYGRKPEYESGYGQKPEYES 169
PD E G+ PE+ + GF E+ G + P+ G+ PE
Sbjct: 296 HPDPEA-LKGFHTDPEALK-GFHIDPEALKGFHPDPKALKGFHPDPKALKGFHTDPEALK 353
Query: 170 GYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPHES 228
G+ P G+ PE G+ PE G+ PE G+ P E + P+ S
Sbjct: 354 GFHPDPKALKGFHPDPEALKGFHPDPEALKGFHPDPEALKGFHTDPNAEEAPENLPYLS 412
>sp|A9KNW4|IF2_CLOPH Translation initiation factor IF-2 OS=Clostridium phytofermentans
(strain ATCC 700394 / DSM 18823 / ISDg) GN=infB PE=3
SV=1
Length = 1131
Score = 48.5 bits (114), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 71/238 (29%), Positives = 115/238 (48%), Gaps = 28/238 (11%)
Query: 56 RPQPQPAYGFQ----PGMGRPEPYGSGRPESEYASGYAKRPDSQEYGSGYGKRPESEEYG 111
RPQ Q YG + G PY RP+ + G +RP Q GS +RP S +
Sbjct: 215 RPQGQGNYGDRRPQGQNSGDRRPYNGDRPQGQGNYG-DRRPQGQ--GSYGDRRPNSGDRP 271
Query: 112 SGYGRKPDSEVHGSG-YGRRPESGESGFGGRTESEYGGSAYGRKPEYESGYG-QKPEYES 169
G G D G G YG R G+ +G R + G +YG +P+ + YG ++P+ +
Sbjct: 272 QGQGNYGDRRPQGQGSYGDRRPQGQGSYGDRPQ---GQGSYGDRPQGQGSYGDRRPQGQG 328
Query: 170 GYGGK-PGYESGYGSKPEFESGYG-RKPEYESGYGSKPEFESGYG------------RKP 215
YG + P + YG +P+ + YG R+P+ + YG +P+ + YG R+P
Sbjct: 329 SYGDRRPQGQGSYGDRPQGQGSYGDRRPQGQGSYGDRPQGQGNYGDRRPGGQGSYGDRRP 388
Query: 216 EYESGYGSKPHESGY--GRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYESGYG 271
+ + YG +P G R+P + GYG +P+ + YG +P+ + GY + + + +G
Sbjct: 389 QGQGSYGDRPQGQGNFGDRRPQGQGGYGGRPQGQGSYGGRPQGQGGYAGRSQGQGSFG 446
Score = 34.7 bits (78), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/162 (33%), Positives = 84/162 (51%), Gaps = 24/162 (14%)
Query: 52 SYPGRPQPQPAYGFQP-GMGRPEPYGSGRPESEYASGYAKRPDSQEYGSGYGKRPESE-E 109
SY RPQ Q +YG +P G G YG RP+ + + G +RP Q GS YG RP+ +
Sbjct: 298 SYGDRPQGQGSYGDRPQGQG---SYGDRRPQGQGSYG-DRRPQGQ--GS-YGDRPQGQGS 350
Query: 110 YGS-------GYGRKPDSEVHGSG-YGRRPESGESGFGGRTESEYGGSAYGRKPEYESGY 161
YG YG +P G G YG R G+ +G R G +YG +P+ + +
Sbjct: 351 YGDRRPQGQGSYGDRP----QGQGNYGDRRPGGQGSYGDRRPQ--GQGSYGDRPQGQGNF 404
Query: 162 G-QKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYG 202
G ++P+ + GYGG+P + YG +P+ + GY + + + +G
Sbjct: 405 GDRRPQGQGGYGGRPQGQGSYGGRPQGQGGYAGRSQGQGSFG 446
>sp|Q12816|TROP_HUMAN Trophinin OS=Homo sapiens GN=TRO PE=1 SV=3
Length = 1431
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/142 (26%), Positives = 61/142 (42%), Gaps = 15/142 (10%)
Query: 136 SGFGG--RTESEYGG-----SAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYE--------SG 180
+GFGG T +GG +++G +G+ G+G +P G
Sbjct: 1277 AGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFGSRPNASFDRGLSTIIG 1336
Query: 181 YGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPHESGYGRKPDYESGY 240
+GS +G+ +P +G+ S P G+ P G+ S P SG+ P +G+
Sbjct: 1337 FGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSGPSTSGFSGGPSTGAGF 1396
Query: 241 GSKPEYESGYGRKPEYESGYGS 262
G P +G+G P +G+GS
Sbjct: 1397 GGGPNTGAGFGGGPSTSAGFGS 1418
Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.087, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/179 (18%), Positives = 59/179 (32%), Gaps = 25/179 (13%)
Query: 124 GSGYGRRPESGESGFGGRTESEYGGSAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGS 183
G+G+G + S FG + G +G + +G +GG PG +GS
Sbjct: 966 GAGFGGALNTSAS-FGSVLNTSTG---FGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFGS 1021
Query: 184 KPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPHESG-------------- 229
+GYG + +G +G P +G+G + +
Sbjct: 1022 ALNTNAGYGGAVSTNTDFGGTLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFSG 1081
Query: 230 -------YGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYESGYGRKPESEYEGG 281
+ P G+G +G+G + +G P G+G P + G
Sbjct: 1082 AVSTSACFSGAPITNPGFGGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFG 1140
Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.55, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/172 (23%), Positives = 66/172 (38%), Gaps = 30/172 (17%)
Query: 133 SGESGFGG--RTESEYGGSAYGRKPEYESGYGQKPEYE------SGYGGKPG----YESG 180
S +GFGG T + +GG G + G ++ +G+GG PG + G
Sbjct: 1204 STNAGFGGGLNTSAGFGG-GLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFGGG 1262
Query: 181 YGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFESGYGRKPEYES----------------GYGSK 224
G+ F G G + G + F G G + S G+GS+
Sbjct: 1263 LGTSAGFSGGLGTSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFGSR 1322
Query: 225 PHESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYESGYGRKPES 276
P+ S + R G+GS +G+ +P +G+ S P G+ P +
Sbjct: 1323 PNAS-FDRGLSTIIGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPST 1373
Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.61, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/146 (18%), Positives = 48/146 (32%), Gaps = 13/146 (8%)
Query: 150 AYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFES 209
+G P +G+G +GG + +G + P +G+G +
Sbjct: 918 CFGGSPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFDGSPSTGAGFGGALNTSA 977
Query: 210 GYGRKPEYESGYGSKPHESG-----------YGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYES 258
+G +G+G S +G P +GS +GYG +
Sbjct: 978 SFGSVLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFGSALNTNAGYGGAVSTNT 1037
Query: 259 GYGSKPEYESGYGRKPESEYEGGYGG 284
+G +G P + G+GG
Sbjct: 1038 DFGGTLSTSVCFGGSPST--SAGFGG 1061
>sp|Q9P2E9|RRBP1_HUMAN Ribosome-binding protein 1 OS=Homo sapiens GN=RRBP1 PE=1 SV=4
Length = 1410
Score = 38.9 bits (89), Expect = 0.062, Method: Composition-based stats.
Identities = 48/194 (24%), Positives = 67/194 (34%), Gaps = 4/194 (2%)
Query: 92 PDSQEYGSGYGKRPESEEYGSGYGRKPDSEVH-GSGYGRRPESGESGFGGRTESEY--GG 148
P+ + G + + E G+K D+ + G P G G + +++ G
Sbjct: 246 PNQGKKAEGTPNQGKKAEGAQNQGKKVDTTPNQGKKVEGAPTQGRKAEGAQNQAKKVEGA 305
Query: 149 SAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFE 208
G+K E G+K E G K G K E G+K E G K E
Sbjct: 306 QNQGKKAEGAQNQGKKGEGAQNQGKKAEGAQNQGKKAEGAQNQGKKAEGAQNQGKKAEGA 365
Query: 209 SGYGRKPEYESGYGSKPH-ESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYE 267
G+K E G K G+K + G K E G+K E G K E
Sbjct: 366 QNQGKKAEGAQNQGKKSEGAQNQGKKVEGAQNQGKKAEGAQNQGKKAEGAQNQGKKAEGA 425
Query: 268 SGYGRKPESEYEGG 281
G+K E G
Sbjct: 426 QNQGKKAEGAQNQG 439
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.19, Method: Composition-based stats.
Identities = 42/154 (27%), Positives = 54/154 (35%), Gaps = 10/154 (6%)
Query: 147 GGSAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPE 206
G G+K E G+K E G K G K E G+K E G K E
Sbjct: 394 GAQNQGKKAEGAQNQGKKAEGAQNQGKKAEGAQNQGKKAEGAQNQGKKAEGAQNQGKKAE 453
Query: 207 FESGYGRKPEYESGYGSKPH-ESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPE 265
G+K E G K G+K + G K E G+K E G K E
Sbjct: 454 GAQNQGKKAEGAQNQGKKVEGAQNQGKKAEGAQNQGKKAEGAQNQGKKAEGAQNQGQKGE 513
Query: 266 YESGYGRKPESEYEGGYGGGSEYGKFERKSSHGR 299
G+K E G++ K ER + G+
Sbjct: 514 GAQNQGKKTE---------GAQGKKAERSPNQGK 538
Score = 33.9 bits (76), Expect = 1.7, Method: Composition-based stats.
Identities = 44/157 (28%), Positives = 58/157 (36%), Gaps = 10/157 (6%)
Query: 147 GGSAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPE 206
G G+K E G+K E G K G K E G+K E G K E
Sbjct: 464 GAQNQGKKVEGAQNQGKKAEGAQNQGKKAEGAQNQGKKAEGAQNQGQKGEGAQNQGKKTE 523
Query: 207 FESGYGRKPEYESGYGSKPHESGY-GRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPE 265
G+K E G K + G+K D + G+K E + G+K E G K E
Sbjct: 524 --GAQGKKAERSPNQGKKGEGAPIQGKKADSVANQGTKVEGITNQGKKAEGSPSEGKKAE 581
Query: 266 YESGYGRKPESEYEGGYGGGSEYGKFERKSSHGRSDD 302
G+K ++ G K E S GR+ D
Sbjct: 582 GSPNQGKKADAAANQG-------KKTESASVQGRNTD 611
>sp|Q24UI6|IF2_DESHY Translation initiation factor IF-2 OS=Desulfitobacterium hafniense
(strain Y51) GN=infB PE=3 SV=1
Length = 971
Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.095, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/126 (20%), Positives = 61/126 (48%), Gaps = 1/126 (0%)
Query: 151 YGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFESG 210
G +P+ + G +P+ + G +P + G +P+ + G +P+ + G +P+ +
Sbjct: 107 MGDRPQGQRPMGDRPQGQRPMGDRPQGQRPMGDRPQGQRPMGDRPQGQRPMGDRPQGQRP 166
Query: 211 YGRKPEYESGYGSKPH-ESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYESG 269
G +P+ + G +P + G +P + G +P+ + G +P+ + G +P+ +
Sbjct: 167 MGDRPQGQRPMGDRPQGQRPMGDRPQGQRPMGDRPQGQRPMGDRPQGQRPMGDRPQGQRP 226
Query: 270 YGRKPE 275
G +P+
Sbjct: 227 MGDRPQ 232
>sp|P53353|ASPX_VULVU Sperm acrosomal protein FSA-ACR.1 (Fragment) OS=Vulpes vulpes PE=2
SV=1
Length = 349
Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/177 (27%), Positives = 62/177 (35%), Gaps = 17/177 (9%)
Query: 133 SGESGFGGRTESEYGGSAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYG 192
SGE G T SE+ S E G++P G +P E G +P E G
Sbjct: 94 SGERATGEHTSSEHATS--------EHTSGEQP-----SGEQPSGEKSSGEQPSGEKSSG 140
Query: 193 RKPEYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPHESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGR 252
+P E G +P E G K E G E KP E KP E
Sbjct: 141 EQPSGEKSLGEQPSGEQSSGEKSSAEQTSG----EQAVAEKPSGEHAVAEKPSGEQAVAE 196
Query: 253 KPEYESGYGSKPEYESGYGRKPESEYEGGYGGGSEYGKFERKSSHGRSDDEEGYKKP 309
+P E KP E +P E SE E+ S+ S ++ +KP
Sbjct: 197 RPSGEQAVAEKPLGEQAVAERPSGEQASIEKASSEQASAEQASAEQASSEQASGEKP 253
>sp|Q99PL5|RRBP1_MOUSE Ribosome-binding protein 1 OS=Mus musculus GN=Rrbp1 PE=2 SV=2
Length = 1605
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.30, Method: Composition-based stats.
Identities = 45/184 (24%), Positives = 73/184 (39%), Gaps = 5/184 (2%)
Query: 147 GGSAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPE 206
G G+KPE S G+K E G K G K E G+K E G K E
Sbjct: 575 GAQNQGKKPEGTSNQGKKGEGAQNQGKKGEGAQNQGKKGEGAQNQGKKGEGAQNQGKKGE 634
Query: 207 FESGYGRKPEYESGYGSKPHESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEY 266
G+K E G K G G + + G G + + + G G + + + G G++ +
Sbjct: 635 GAQNQGKKGEGAQNQGKK----GEGAQNQGKKGEGPQNQAKKGEGAQNQGKKGEGAQNQG 690
Query: 267 ESGYGRKPESEYEGGYGGGSEYGK-FERKSSHGRSDDEEGYKKPCSYGYERRGDDDEHSG 325
+ G G + + + G S+ G+ + + G + +G K + R+ D + G
Sbjct: 691 KKGEGAQNQGKKAEGVQSQSKKGEGTQNQGKKGDGNPNQGKKGEGASNQNRKTDTVANQG 750
Query: 326 GSHE 329
E
Sbjct: 751 TKQE 754
Score = 32.7 bits (73), Expect = 4.4, Method: Composition-based stats.
Identities = 45/217 (20%), Positives = 83/217 (38%), Gaps = 6/217 (2%)
Query: 124 GSGYGRRPESGESGFGGRTESEYGGSAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGS 183
G G + + GE + G G+K E +K E K G
Sbjct: 361 GEGAQNQAKKGEGVQNQAKKGVEGAQNQGKKGEANQNQAKKGEGGQNQTKKGEGPQNQGK 420
Query: 184 KPEFESGYGRKPEYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPHESGYGRKPDYESGYGSK 243
K E +K E G KPE S G+K E G K G G + + G G++
Sbjct: 421 KGEAAQKQDKKIEGAQNQGKKPEGTSNQGKKGEGAQNQGKK----GEGAQNQSKKGEGAQ 476
Query: 244 PEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYESGYGRKPESEYEGGYGGGSEYG--KFERKSSHGRSD 301
+ + G G + + + G G++ + + G G + +++ G ++ G + + G ++
Sbjct: 477 NQAKKGEGGQNQAKKGEGAQNQAKKGEGAQNQAKKGEGVQNQAKKGVEGAQNQGKKGEAN 536
Query: 302 DEEGYKKPCSYGYERRGDDDEHSGGSHEYGYGRKKKV 338
+ K ++G+ ++ G E + KK+
Sbjct: 537 QNQAKKGEGGQNQTKKGEGPQNQGKKGEAAQKQDKKI 573
Score = 31.6 bits (70), Expect = 9.4, Method: Composition-based stats.
Identities = 50/281 (17%), Positives = 120/281 (42%), Gaps = 15/281 (5%)
Query: 67 PGMGRPEPYGSGRPESEYASGYAKRPDSQEYGSGYGKRPESEEYGSGYGRKPDSEVHGSG 126
P +G + + + G + E GK+ E + + G ++ G
Sbjct: 183 PPVGSKASSPATSSQGKKGQGAQNQAKKGEGAQNQGKKGEGAQNQAKKGEGAQNQAK-KG 241
Query: 127 YGRRPESGESGFGGRTESEYGGSAYGRKPEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPE 186
G + + G+ G G + +++ G G + + + G G + + + G G + + G G++ +
Sbjct: 242 EGAQNQ-GKKGEGAQNQAKKG---EGGQNQAKKGEGAQNQGKKGEGAQNQGKKGEGAQNQ 297
Query: 187 FESGYGRKPEYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPH-ESGYGRKPDYESGYGSKPE 245
+ G G + + + G G++ + + G G + + + G G++ + G G + + G G++ +
Sbjct: 298 AKKGEGAQNQAKKGEGAQNQGKKGEGAQNQSKKGEGAQNQAKKGEGGQNQAKKGEGAQNQ 357
Query: 246 YESGYGRKPEYESGYGSKPEYESGY---------GRKPESEYEGGYGGGSEYGKFERKSS 296
+ G G + + + G G + + + G G +++ + G GG ++ K E +
Sbjct: 358 AKKGEGAQNQAKKGEGVQNQAKKGVEGAQNQGKKGEANQNQAKKGEGGQNQTKKGEGPQN 417
Query: 297 HGRSDDEEGYKKPCSYGYERRGDDDEHSGGSHEYGYGRKKK 337
G+ + + G + +G E + + G G + +
Sbjct: 418 QGKKGEAAQKQDKKIEGAQNQGKKPEGTSNQGKKGEGAQNQ 458
>sp|Q21338|SPT5H_CAEEL Transcription elongation factor SPT5 OS=Caenorhabditis elegans
GN=spt-5 PE=3 SV=3
Length = 1208
Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.67, Method: Compositional matrix adjust.
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Query: 123 HGSGYGRRPESGESGFGGRTESEYGGSAYGRKPEYESGYGQK-PEYESGYGGKPGYESGY 181
+G+ R P G S G RT + YG + GR P Y S + P Y+ G PGYES
Sbjct: 870 YGNDSSRTPAYG-SADGARTPA-YGSTEGGRTPAYGSMDNSRTPAYDDS-GRTPGYESMP 926
Query: 182 GSKPEFESGYGRKPEY-ESGYGSK-PEFESGYG--RKPEYE----SGYGSKPHES--GYG 231
P ++S + P Y ES + ++ P + + Y P YE Y + P +
Sbjct: 927 SRTPNYDSS-SKTPAYPESEHSARTPAYNNDYDIPLSPAYEPDAPEAYDNAPARTPAFVS 985
Query: 232 RKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYES 268
R P Y++ S P YE K E + G S P Y+S
Sbjct: 986 RTPGYDTYENSSPTYEPDAATKVEEDIGDTSSPTYDS 1022
>sp|O30611|ICEK_PSESX Ice nucleation protein OS=Pseudomonas syringae GN=inaK PE=3 SV=1
Length = 1148
Score = 33.1 bits (74), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 89/323 (27%), Positives = 112/323 (34%), Gaps = 78/323 (24%)
Query: 76 GSGRPESEYASGYAKRPDS---QEYGSGYGKRPESEE---YGSGYGRK----PDSEVHGS 125
G+ +S +GY S +GYG + E +GYG DS + +
Sbjct: 450 GTAGADSSLIAGYGSTQTSGSESSLTAGYGSTQTAREGSTLTAGYGSTGTAGADSSLI-A 508
Query: 126 GYGRRPESG-ESGFG---GRTESEYGGSAYGRKPEYESGYG------QKPEYESGYG--G 173
GYG SG ES G T++ GS SGYG +GYG G
Sbjct: 509 GYGSTQTSGSESSLTAGYGSTQTAQQGSVL------TSGYGSTQTAGAASNLTTGYGSTG 562
Query: 174 KPGYES----GYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPE------FESGYGRK------PEY 217
G+ES GYGS G K +GYGS +GYG
Sbjct: 563 TAGHESFIIAGYGSTQTA----GHKSILTAGYGSTQTARDGSYLIAGYGSTGTAGSGSSL 618
Query: 218 ESGYGSKPHES-------GYGRK------PDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGS-- 262
+GYGS S GYG D +GYGS S G +GYGS
Sbjct: 619 IAGYGSTQTASYRSMLTAGYGSTQTAREHSDLVTGYGST----STAGSNSSLIAGYGSTQ 674
Query: 263 ----KPEYESGYGRKPE----SEYEGGYGGGSEYGKFERKSSHGRSDDEEGYKKPCSYGY 314
K +GYG S+ GYG S G + S GY+ + GY
Sbjct: 675 TAGFKSILTAGYGSTQTAQERSDLVAGYGSTSTAGYSSSLIAGYGSTQTAGYESTLTAGY 734
Query: 315 ERRGDDDEHSGGSHEYGYGRKKK 337
E+S S GYG
Sbjct: 735 GSTQTAQENS--SLTTGYGSTST 755
>sp|P18899|DDR48_YEAST Stress protein DDR48 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC
204508 / S288c) GN=DDR48 PE=1 SV=4
Length = 430
Score = 32.3 bits (72), Expect = 5.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 71/250 (28%), Positives = 104/250 (41%), Gaps = 43/250 (17%)
Query: 47 SLVPVSYPGRPQPQPAYGFQPGMGRPEPYGSGRPESEYASGYAKRPDSQEYGS----GYG 102
S SY + + +YG + YGS +S Y S K+ YGS YG
Sbjct: 165 SNNDDSYGSSNKNKSSYG----SNNDDSYGSNNDDS-YGSSNKKKS---SYGSSNNDSYG 216
Query: 103 KRPESEEYGSG----YGRKPDSEVHGSGYGRRPESGESGFGGRTESEYGGS----AYGRK 154
+ + YGS YG D + +GS ++ S +G + YG S +YG
Sbjct: 217 SNND-DSYGSNNNDSYGSNND-DSYGSSNKKK-----SSYGSNNDDSYGSSNNNDSYGSN 269
Query: 155 PEYESGYGQKPEYESGYGGKPGYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPE------FE 208
+ YG + +S YG +S YGS +S YG + +S YGS + +
Sbjct: 270 N--DDSYGSSNKNKSSYGSSSNDDS-YGSSNNDDS-YGSSNKKKSSYGSNNDDSYGSNND 325
Query: 209 SGYGRKPEYESGYGSKPHESGYGRKPDYESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYES 268
YG + +S YGS ++S YG D YGS + +S YG + YGS +S
Sbjct: 326 DSYGSSNKKKSSYGSSNNDS-YGSNND--DSYGSSNKKKSSYGSNN--DDSYGSSNNNDS 380
Query: 269 GYGRKPESEY 278
YG + Y
Sbjct: 381 -YGSNNDDSY 389
>sp|P14907|NSP1_YEAST Nucleoporin NSP1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 /
S288c) GN=NSP1 PE=1 SV=1
Length = 823
Score = 32.0 bits (71), Expect = 7.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/220 (25%), Positives = 96/220 (43%), Gaps = 23/220 (10%)
Query: 60 QPAYGFQPGMGRPEPYGSGRPESEYASGYAKRPDSQEYGSGYGKRPESEEYGSGYGRKPD 119
+PA+ F + G+ +P + + A++ +++ + +S+E G KP
Sbjct: 319 KPAFSFGAKSNEDKQDGTAKPAFSFGAKPAEKNNNETSKPAFSFGAKSDEKKDGDASKP- 377
Query: 120 SEVHGSGYGRRPESGESGFGGRTESEYGGSAYGRKPE-YESGYGQKPEYESGYGGKPGYE 178
+G +P+ ++ + + ++G KPE + KP + +G K +
Sbjct: 378 ----AFSFGAKPDENKA-----SATSKPAFSFGAKPEEKKDDNSSKPAF--SFGAKSNED 426
Query: 179 SGYGS-KPEFESGYGRKP-EYESGYGSKPEFESGYGRKPEYESGYGSKPHESGYGRKPD- 235
G+ KP F +G KP E + SKP F G + E + G SKP S +G K D
Sbjct: 427 KQDGTAKPAF--SFGAKPAEKNNNETSKPAFSFG-AKSDEKKDGDASKPAFS-FGAKSDE 482
Query: 236 YESGYGSKPEYESGYGRKPEYESGYGSKPEYESGYGRKPE 275
+ SKP + G + +SG SKP + +G KP+
Sbjct: 483 KKDSDSSKPAFSFGTKSNEKKDSG-SSKPAF--SFGAKPD 519
Database: swissprot
Posted date: Mar 23, 2013 2:32 AM
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Number of sequences in database: 539,616
Lambda K H
0.305 0.134 0.400
Lambda K H
0.267 0.0410 0.140
Matrix: BLOSUM62
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Number of Sequences: 539616
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Number of successful extensions: 26356
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length of database: 191,569,459
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