Query 024505
Match_columns 266
No_of_seqs 44 out of 46
Neff 2.4
Searched_HMMs 29240
Date Mon Mar 25 09:24:15 2013
Command hhsearch -i /work/01045/syshi/csienesis_hhblits_a3m/024505.a3m -d /work/01045/syshi/HHdatabase/pdb70.hhm -o /work/01045/syshi/hhsearch_pdb/024505hhsearch_pdb -cpu 12 -v 0
No Hit Prob E-value P-value Score SS Cols Query HMM Template HMM
1 2fic_A Bridging integrator 1; 98.3 0.00021 7.2E-09 59.8 20.4 219 11-259 28-247 (251)
2 1uru_A Amphiphysin; endocytosi 98.1 0.00028 9.6E-09 57.9 17.6 221 9-257 11-232 (244)
3 1zww_A SH3-containing GRB2-lik 98.1 0.00014 4.9E-09 62.2 16.2 150 87-259 92-241 (256)
4 2q12_A DIP13 alpha, DCC-intera 97.9 0.0025 8.5E-08 53.9 19.7 200 49-256 22-224 (265)
5 2z0v_A SH3-containing GRB2-lik 97.8 0.00053 1.8E-08 58.3 13.6 150 88-260 77-226 (240)
6 2q13_A DCC-interacting protein 97.7 0.01 3.4E-07 52.7 20.4 186 58-251 31-218 (385)
7 4h8s_A DCC-interacting protein 95.5 1.3 4.3E-05 39.6 19.9 176 67-250 63-240 (407)
8 4avm_A Bridging integrator 2; 95.1 1.4 4.6E-05 37.6 21.5 213 11-259 9-228 (237)
9 2ykt_A Brain-specific angiogen 92.0 5.9 0.0002 34.8 15.8 171 73-254 47-225 (253)
10 3aco_A Pacsin2, protein kinase 84.9 19 0.00064 31.3 18.4 92 49-145 30-124 (350)
11 3haj_A Human pacsin2 F-BAR; pa 83.5 28 0.00094 32.2 17.6 200 50-260 24-272 (486)
12 2d1l_A Metastasis suppressor p 82.1 27 0.00092 31.0 18.6 103 72-183 48-157 (253)
13 4dyl_A Tyrosine-protein kinase 76.2 45 0.0015 30.2 17.6 64 82-145 43-108 (406)
14 2efl_A Formin-binding protein 74.7 35 0.0012 28.2 20.4 186 49-245 15-241 (305)
15 2x3v_A Syndapin I, protein kin 68.5 56 0.0019 27.9 18.2 187 49-246 21-252 (337)
16 4a3a_A Amphiphysin; structural 64.7 67 0.0023 27.4 16.4 212 8-258 11-232 (243)
17 3m3w_A Pacsin3, protein kinase 60.2 86 0.0029 27.2 17.9 202 48-261 20-271 (320)
18 3abh_A Pacsin2, protein kinase 60.2 78 0.0027 26.7 19.7 91 49-144 30-123 (312)
19 2v0o_A FCHO2, FCH domain only 56.4 81 0.0028 25.7 17.9 90 49-145 19-108 (276)
20 2i7u_A Four-alpha-helix bundle 42.2 61 0.0021 23.7 5.6 42 1-42 1-43 (62)
21 2efk_A CDC42-interacting prote 41.9 1.5E+02 0.005 24.5 18.7 117 49-169 8-149 (301)
22 3i2w_A Syndapin, LD46328P; EFC 36.4 1.9E+02 0.0063 24.1 17.9 62 83-145 40-103 (290)
23 1i4d_A Arfaptin 2, partner of 33.6 2.4E+02 0.0083 24.6 16.0 182 49-252 18-200 (224)
24 6rlx_A Relaxin, A-chain; hormo 25.0 25 0.00085 21.6 1.0 12 85-96 3-14 (24)
25 2fhw_A Relaxin 3 (prorelaxin H 24.1 26 0.0009 21.8 1.0 13 84-96 2-14 (26)
26 3o0z_A RHO-associated protein 22.9 3.5E+02 0.012 23.0 10.7 81 159-258 19-99 (168)
27 3vjz_A DMP19, putative unchara 22.2 47 0.0016 28.3 2.4 51 74-127 67-117 (166)
28 1uur_A Stata protein, STAT pro 20.5 2.3E+02 0.0077 27.5 7.1 88 35-170 10-103 (473)
No 1
>2fic_A Bridging integrator 1; BAR domain, homodimer, coiled-coils, endocytosis/exocytosis, protein complex, endocytosis-exocytosis; 1.99A {Homo sapiens} PDB: 2rmy_A 2rnd_A
Probab=98.29 E-value=0.00021 Score=59.76 Aligned_cols=219 Identities=14% Similarity=0.208 Sum_probs=113.5
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHhcCCCCCCCCccccchHHHhHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhccceeeeccchhhhhhhhhh
Q 024505 11 LREQVARQQQAVFKQFGGGGYGGSDNVVTDEAELHQHQRLERLYISTRAGKHFQRDIVRGVEGYIVTGSKQVEIGTKLSE 90 (266)
Q Consensus 11 lreqVAkQQQAV~Kqfg~~gy~~~d~~v~DE~Elq~HQ~LekLY~STRaaKhFQrdIVRgvEG~is~gsKq~Ei~~KLae 90 (266)
+..++.|-.|.|...+|++- ...|..+ |+. -+++..+...+ +.+++++- .|+..-..-......|++
T Consensus 28 ~~K~~~Ra~q~~~~k~G~~e-~T~D~~F-e~~----~~~f~~~e~~~---~~l~k~~k----~y~~~~~~~~~~~~~l~~ 94 (251)
T 2fic_A 28 VQKKLTRAQEKVLQKLGKAD-ETKDEQF-EQC----VQNFNKQLTEG---TRLQKDLR----TYLASVKAMHEASKKLNE 94 (251)
T ss_dssp -------------------------CHH-HHH----HHHHHHHHHHH---HHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHhhHHHHHHcCCcc-ccCCHHH-HHH----HHHHHHHHHHH---HHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 35667777889999998432 1223333 222 22222222221 22222221 111111112233445666
Q ss_pred hhhh-hcCCCCCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHhhHHHHHhhhhhhHHHHhhcCCCchhhhhHHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 91 DSRK-YGSDNTCTSGNTLSKAALSYGRARAQMEKERGNLLKALGTQVAEPLRAMVLGAPLDDARHLAQRYDRMRQEAEAQ 169 (266)
Q Consensus 91 Dc~k-YG~en~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEre~l~r~L~~QV~ePLRaMv~GaPLEDARhLaqrYdRmRQEaE~q 169 (266)
.... ||...+ +++.+......|+.+ -.++...+.++|.+||...+ + -+.+.+++-...++-|-+-+..
T Consensus 95 ~~~~l~~~~~~--~~~~~~~~~~~~~~~-------~~d~~~~l~~~vi~Pl~~~~-~-~~~~i~~~ikKR~~k~lDyD~~ 163 (251)
T 2fic_A 95 CLQEVYEPDWP--GRDEANKIAENNDLL-------WMDYHQKLVDQALLTMDTYL-G-QFPDIKSRIAKRGRKLVDYDSA 163 (251)
T ss_dssp HHHHHCCTTST--THHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHTHHHHHHHH-H-THHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHhCCCcC--CchhHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-H-HhHHHHHHHHHHHHHHhhHHHH
Confidence 6555 665532 233343333333322 23455567799999999999 3 4888888877777677776665
Q ss_pred HHHHHHHHhhhcCCCCChhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 170 AIEVSKRQAKVRETPGNPDLALKLDAAEVKLHDLKSNMAILGKEAAAAMAAVESQQQRLTLQRLIAMVEAERTYHQRVLQ 249 (266)
Q Consensus 170 a~eV~rRq~k~re~~gn~e~~~KLq~AE~Kl~Elks~Ma~LGKEA~aAm~aVEaQQQrlTlQRLiaMVeaEr~YHqrv~~ 249 (266)
-..+.+-+.|.. . ...||..||.++.+.+.....+-..--.=|-....-...+-..=|.++|++...||..+..
T Consensus 164 ~~~l~kl~~k~~----k--d~~kl~kae~el~~ak~~ye~ln~~L~~eLp~l~~~~~~~~~~~l~~f~~~Q~~f~~~~~~ 237 (251)
T 2fic_A 164 RHHYESLQTAKK----K--DEAKIAKAEEELIKAQKVFEEMNVDLQEELPSLWNSRVGFYVNTFQSIAGLEENFHKEMSK 237 (251)
T ss_dssp HHHHHHHHC-------------CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHhcCc----C--cHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 555554443321 1 3578889999999988888777666656666555554444446788999999999999999
Q ss_pred HHHHhhhhhh
Q 024505 250 ILDQLEGEVS 259 (266)
Q Consensus 250 ILd~l~~emv 259 (266)
++.+|...|.
T Consensus 238 ~~~~L~~~l~ 247 (251)
T 2fic_A 238 LNQNLNDVLV 247 (251)
T ss_dssp HHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHH
Confidence 9999998874
No 2
>1uru_A Amphiphysin; endocytosis, coiled-coil, membrane curvature; 2.6A {Drosophila melanogaster} SCOP: a.238.1.1
Probab=98.13 E-value=0.00028 Score=57.95 Aligned_cols=221 Identities=17% Similarity=0.258 Sum_probs=121.5
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCCCCCCCccccchHHHhHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhccceeeeccchhhhhhhh
Q 024505 9 TKLREQVARQQQAVFKQFGGGGYGGSDNVVTDEAELHQHQRLERLYISTRAGKHFQRDIVRGVEGYIVTGSKQVEIGTKL 88 (266)
Q Consensus 9 sklreqVAkQQQAV~Kqfg~~gy~~~d~~v~DE~Elq~HQ~LekLY~STRaaKhFQrdIVRgvEG~is~gsKq~Ei~~KL 88 (266)
+-+..++.|-.|.|...+|.+ +.. .|+.=-...+++..+... .+.+++++-. |+..-..-......|
T Consensus 11 ~~~~k~~~R~~q~~~~k~G~~-----e~t-~D~~fe~~~~~f~~~e~~---~~~l~k~~~~----y~~~~~~~~~~~~~l 77 (244)
T 1uru_A 11 KSVQKHAGRAKEKILQNLGKV-----DRT-ADEIFDDHLNNFNRQQAS---ANRLQKEFNN----YIRCVRAAQAASKTL 77 (244)
T ss_dssp ---------------CCSSCT-----TCC-HHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHhCCC-----ccc-CCHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 345566777788888888732 222 254311122222222222 2223333222 211111112223445
Q ss_pred hhhhhh-hcCCCCCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHhhHHHHHhhhhhhHHHHhhcCCCchhhhhHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 89 SEDSRK-YGSDNTCTSGNTLSKAALSYGRARAQMEKERGNLLKALGTQVAEPLRAMVLGAPLDDARHLAQRYDRMRQEAE 167 (266)
Q Consensus 89 aeDc~k-YG~en~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEre~l~r~L~~QV~ePLRaMv~GaPLEDARhLaqrYdRmRQEaE 167 (266)
++.... |+.+.+ ..+ + ++.....++.-..+|...+.+.|.+||...+ .-+.+.+++-...++-|-+-+
T Consensus 78 ~~~~~~l~~~~~~--~~~----~---~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~vi~Pl~~~~--~~~~~i~~~ikKR~~k~lDyD 146 (244)
T 1uru_A 78 MDSVCEIYEPQWS--GYD----A---LQAQTGASESLWADFAHKLGDQVLIPLNTYT--GQFPEMKKKVEKRNRKLIDYD 146 (244)
T ss_dssp HHHHHHHSCTTST--THH----H---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHhCCCCC--Cch----H---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHhhHH
Confidence 555555 655532 122 2 2222233666666788888899999999998 467888888777555555555
Q ss_pred HHHHHHHHHHhhhcCCCCChhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 168 AQAIEVSKRQAKVRETPGNPDLALKLDAAEVKLHDLKSNMAILGKEAAAAMAAVESQQQRLTLQRLIAMVEAERTYHQRV 247 (266)
Q Consensus 168 ~qa~eV~rRq~k~re~~gn~e~~~KLq~AE~Kl~Elks~Ma~LGKEA~aAm~aVEaQQQrlTlQRLiaMVeaEr~YHqrv 247 (266)
..-..+.+-+.|. .......||..||.++.+.+.....|-..--.=|-.........-..=|.++|++.-.||..+
T Consensus 147 ~~~~~l~kl~~k~----~k~kd~~kl~~ae~el~~ak~~ye~ln~~L~~eLp~l~~~~~~~~~~~l~~fv~~q~~~~~~~ 222 (244)
T 1uru_A 147 GQRHSFQNLQANA----NKRKDDVKLTKGREQLEEARRTYEILNTELHDELPALYDSRILFLVTNLQTLFATEQVFHNET 222 (244)
T ss_dssp HHHHHHHHHHTTT----CBTTBCCTTTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHhcc----ccCccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 5555555544332 011335688899999999988888777777777777766666666677889999999999999
Q ss_pred HHHHHHhhhh
Q 024505 248 LQILDQLEGE 257 (266)
Q Consensus 248 ~~ILd~l~~e 257 (266)
..|+..|..-
T Consensus 223 ~~~~~~l~~~ 232 (244)
T 1uru_A 223 AKIYSELEAI 232 (244)
T ss_dssp HHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHH
Confidence 7777776553
No 3
>1zww_A SH3-containing GRB2-like protein 2; coiled coil, transferase; 2.30A {Mus musculus} SCOP: a.238.1.1 PDB: 1x03_A 2d4c_A 1x04_A 2c08_A
Probab=98.12 E-value=0.00014 Score=62.18 Aligned_cols=150 Identities=20% Similarity=0.277 Sum_probs=104.9
Q ss_pred hhhhhhhhhcCCCCCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHhhHHHHHhhhhhhHHHHhhcCCCchhhhhHHHHHHHHHHHH
Q 024505 87 KLSEDSRKYGSDNTCTSGNTLSKAALSYGRARAQMEKERGNLLKALGTQVAEPLRAMVLGAPLDDARHLAQRYDRMRQEA 166 (266)
Q Consensus 87 KLaeDc~kYG~en~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEre~l~r~L~~QV~ePLRaMv~GaPLEDARhLaqrYdRmRQEa 166 (266)
.|++-+-.+|.+=+ .++.+..|-..||.+...|...+..+...+.+.|.+||+..+. .-+-++++...+.+..|-+-
T Consensus 92 ~L~~~m~~~~~~l~--~~s~~g~aL~~~g~a~~~la~~~~~~~~~i~~~~l~pl~~~l~-~~~k~i~k~rkkl~~~rLdy 168 (256)
T 1zww_A 92 LLAEAMLKFGRELG--DDCNFGPALGEVGEAMRELSEVKDSLDMEVKQNFIDPLQNLHD-KDLREIQHHLKKLEGRRLDF 168 (256)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHC--SSSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHH-THHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHhhCC--CCChHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 45665555555432 2346889999999999999999999999999999999998765 34667788888888888777
Q ss_pred HHHHHHHHHHHhhhcCCCCChhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 167 EAQAIEVSKRQAKVRETPGNPDLALKLDAAEVKLHDLKSNMAILGKEAAAAMAAVESQQQRLTLQRLIAMVEAERTYHQR 246 (266)
Q Consensus 167 E~qa~eV~rRq~k~re~~gn~e~~~KLq~AE~Kl~Elks~Ma~LGKEA~aAm~aVEaQQQrlTlQRLiaMVeaEr~YHqr 246 (266)
++- +.|.+.. ++ .-|+.|+.+..+. -.++...|-.+-+=. -=-+.-|.++|++...||..
T Consensus 169 D~~-------k~k~~k~---~e--eEle~A~~~fe~~-------~e~~~~~m~~l~~~e-~e~~~~L~~~v~aQl~y~~~ 228 (256)
T 1zww_A 169 GYK-------KKRQGKI---PD--EELRQALEKFDES-------KEIAESSMFNLLEMD-IEQVSQLSALVQAQLEYHKQ 228 (256)
T ss_dssp HHH-------HHTTTTS---CH--HHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHTT-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHH-------HHHhccc---cH--HHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHhCc-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 653 2232211 11 1244555555444 455566665543321 11247789999999999999
Q ss_pred HHHHHHHhhhhhh
Q 024505 247 VLQILDQLEGEVS 259 (266)
Q Consensus 247 v~~ILd~l~~emv 259 (266)
..++|.+|..++-
T Consensus 229 ~~e~L~~l~~~l~ 241 (256)
T 1zww_A 229 AVQILQQVTVRLE 241 (256)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHH
Confidence 9999999988764
No 4
>2q12_A DIP13 alpha, DCC-interacting protein 13 alpha; APPL1, BAR domain, protein transport; 1.79A {Homo sapiens} PDB: 2z0n_A
Probab=97.90 E-value=0.0025 Score=53.94 Aligned_cols=200 Identities=12% Similarity=0.108 Sum_probs=152.5
Q ss_pred HHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhccceeeeccchhhhhhhhhhhhhhhcCCC--CCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHh
Q 024505 49 RLERLYISTRAGKHFQRDIVRGVEGYIVTGSKQVEIGTKLSEDSRKYGSDN--TCTSGNTLSKAALSYGRARAQMEKERG 126 (266)
Q Consensus 49 ~LekLY~STRaaKhFQrdIVRgvEG~is~gsKq~Ei~~KLaeDc~kYG~en--~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEre 126 (266)
.|.-+=..+-.-+.+=+.+++.+..++..|..-....++|++.-..|+... .+++++.+..+-..||.+...|+.-|.
T Consensus 22 ~l~~~E~~~~~l~~~l~kl~k~~~~~~~a~~~~~~a~~~f~~~L~~~~~~~~~~~~~d~~~~~~L~~f~~~l~ei~~~~~ 101 (265)
T 2q12_A 22 LLGVFEEDATAISNYMNQLYQAMHRIYDAQNELSAATHLTSKLLKEYEKQRFPLGGDDEVMSSTLQQFSKVIDELSSCHA 101 (265)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGSCCC-----CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhccCCCCcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 333333444445566777888888888888888888999999999998742 234455677888899999999999999
Q ss_pred hHHHHHhhhhhhHHHHhhcCCCchhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhcCCCCChhhhhhHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 127 NLLKALGTQVAEPLRAMVLGAPLDDARHLAQRYDRMRQEAEAQAIEVSKRQAKVRETPGNPDLALKLDAAEVKLHDLKSN 206 (266)
Q Consensus 127 ~l~r~L~~QV~ePLRaMv~GaPLEDARhLaqrYdRmRQEaE~qa~eV~rRq~k~re~~gn~e~~~KLq~AE~Kl~Elks~ 206 (266)
.|+.-+..-|.+||+..+.+. |..++.+..+||+.+.+-++--.-.+. ..|.+ + +| ..|+.|+.+|.+.+.+
T Consensus 102 ~l~~~~~~~~~~PL~~f~~~d-lk~~ke~kk~fdk~~~~yd~al~k~~~-~~k~k--~--~e--~~l~Ea~~~l~~~Rk~ 173 (265)
T 2q12_A 102 VLSTQLADAMMFPITQFKERD-LKEILTLKEVFQIASNDHDAAINRYSR-LSKKR--E--ND--KVKYEVTEDVYTSRKK 173 (265)
T ss_dssp HHHHHHHHHTHHHHHHHHHTH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHTSC--C--CH--HHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhc-CCCCC--c--ch--hhHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 999999999999999999875 567888889999999999865554332 12222 1 22 3477888889988888
Q ss_pred HHHhcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-Hhhh
Q 024505 207 MAILGKEAAAAMAAVESQQQRLTLQRLIAMVEAERTYHQRVLQILD-QLEG 256 (266)
Q Consensus 207 Ma~LGKEA~aAm~aVEaQQQrlTlQRLiaMVeaEr~YHqrv~~ILd-~l~~ 256 (266)
.--..-+-...|..+....----|.-|+..+++--+|++.-.+++. +++.
T Consensus 174 f~~~~ldyv~~l~~l~~kk~~e~le~l~~~~~a~~~ff~~g~e~~~~~~~p 224 (265)
T 2q12_A 174 QHQTMMHYFCALNTLQYKKKIALLEPLLGYMQAQISFFKMGSENLNEQLEE 224 (265)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 8888888899998888866666788899999999999999888873 5443
No 5
>2z0v_A SH3-containing GRB2-like protein 3; helix bundle, alternative splicing, coiled coil, SH3 domain, endocytosis, structural genomics, NPPSFA; 2.49A {Homo sapiens}
Probab=97.78 E-value=0.00053 Score=58.29 Aligned_cols=150 Identities=20% Similarity=0.306 Sum_probs=110.1
Q ss_pred hhhhhhhhcCCCCCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHhhHHHHHhhhhhhHHHHhhcCCCchhhhhHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 88 LSEDSRKYGSDNTCTSGNTLSKAALSYGRARAQMEKERGNLLKALGTQVAEPLRAMVLGAPLDDARHLAQRYDRMRQEAE 167 (266)
Q Consensus 88 LaeDc~kYG~en~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEre~l~r~L~~QV~ePLRaMv~GaPLEDARhLaqrYdRmRQEaE 167 (266)
|+..+..+|.+-. .++.++.|-..||.+..+|...+..+..-...-|.+||+..+. .-+-++-+...+.+..|-+-+
T Consensus 77 L~~~m~~~~~~l~--~ds~~g~aL~~~g~a~~~ia~~~~~~~~~v~~~~l~pL~~~l~-~d~k~i~~~rKkle~~rLd~D 153 (240)
T 2z0v_A 77 LGDCMLKYGKELG--EDSTFGNALIEVGESMKLMAEVKDSLDINVKQTFIDPLQLLQD-KDLKEIGHHLKKLEGRRLDYD 153 (240)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHC--TTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHH-THHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHhhcC--CCchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 7888877777643 3557999999999999999999999999999999999998875 345667777778888887777
Q ss_pred HHHHHHHHHHhhhcCCCCChhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 168 AQAIEVSKRQAKVRETPGNPDLALKLDAAEVKLHDLKSNMAILGKEAAAAMAAVESQQQRLTLQRLIAMVEAERTYHQRV 247 (266)
Q Consensus 168 ~qa~eV~rRq~k~re~~gn~e~~~KLq~AE~Kl~Elks~Ma~LGKEA~aAm~aVEaQQQrlTlQRLiaMVeaEr~YHqrv 247 (266)
+- |. |.+.. + -.-|+.|+.++.+.+. .+...|-.|-+=. -=-+.-|.++|+|...||...
T Consensus 154 ~a-----k~--k~~k~---~--eeEl~~A~~~fe~~~e-------~~~~~m~~~~~~~-~e~l~~l~~~v~aQl~y~~~~ 213 (240)
T 2z0v_A 154 YK-----KK--RVGKI---P--DEEVRQAVEKFEESKE-------LAERSMFNFLEND-VEQVSQLAVFIEAALDYHRQS 213 (240)
T ss_dssp HH-----HT--TTTSS---C--HHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHST-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HH-----HH--Hhccc---c--HHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHhCc-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 53 22 32211 1 2236666666666554 4455565553221 122457899999999999999
Q ss_pred HHHHHHhhhhhhh
Q 024505 248 LQILDQLEGEVSN 260 (266)
Q Consensus 248 ~~ILd~l~~emvs 260 (266)
.++|.+|..++-.
T Consensus 214 ~e~L~~l~~~l~~ 226 (240)
T 2z0v_A 214 TEILQELQSKLQM 226 (240)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHH
Confidence 9999999887643
No 6
>2q13_A DCC-interacting protein 13 alpha; APPL1, BAR domain, PH domain, BAR-PH domain, protein transpo; 2.05A {Homo sapiens} PDB: 2z0o_A 2elb_A
Probab=97.66 E-value=0.01 Score=52.70 Aligned_cols=186 Identities=10% Similarity=0.093 Sum_probs=133.4
Q ss_pred hhhhhhhhhhhhhccceeeeccchhhhhhhhhhhhhhhcCCCC--CCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHhhHHHHHhhh
Q 024505 58 RAGKHFQRDIVRGVEGYIVTGSKQVEIGTKLSEDSRKYGSDNT--CTSGNTLSKAALSYGRARAQMEKERGNLLKALGTQ 135 (266)
Q Consensus 58 RaaKhFQrdIVRgvEG~is~gsKq~Ei~~KLaeDc~kYG~en~--~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEre~l~r~L~~Q 135 (266)
-.-+.+=+.+++.+..++..|.....-..+|++.-..|+.+++ +.+++.+..+-..||.+.+.|+.-+..|+.-+...
T Consensus 31 ~~l~~~l~kl~k~~~~~~~a~~~~~~a~~~f~~~L~~~~~~~~~~~~~d~~v~~~l~~f~~~~~ei~~~~~~l~~~~~~~ 110 (385)
T 2q13_A 31 TAISNYMNQLYQAMHRIYDAQNELSAATHLTSKLLKEYEKQRFPLGGDDEVMSSTLQQFSKVIDELSSCHAVLSTQLADA 110 (385)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTSCCCC---CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhccCCCCCcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 3344455666667777777666666667788888888887543 23445567788889999999999999999999999
Q ss_pred hhhHHHHhhcCCCchhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhcCCCCChhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcHHHH
Q 024505 136 VAEPLRAMVLGAPLDDARHLAQRYDRMRQEAEAQAIEVSKRQAKVRETPGNPDLALKLDAAEVKLHDLKSNMAILGKEAA 215 (266)
Q Consensus 136 V~ePLRaMv~GaPLEDARhLaqrYdRmRQEaE~qa~eV~rRq~k~re~~gn~e~~~KLq~AE~Kl~Elks~Ma~LGKEA~ 215 (266)
|.+||+..+.+. |..++.+..+||+.+.+-++--.-.+. ..|.+ .+ ...++.|+..|.+.+..-.-..-+=.
T Consensus 111 ~~~PL~~f~~~d-i~~~ke~kk~fek~~~~yd~al~k~~~-~~k~k----~~--e~~~~ea~~~l~~~rk~f~~~~ldy~ 182 (385)
T 2q13_A 111 MMFPITQFKERD-LKEILTLKEVFQIASNDHDAAINRYSR-LSKKR----EN--DKVKYEVTEDVYTSRKKQHQTMMHYF 182 (385)
T ss_dssp THHHHHHHHHTH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT-CCSSS----CC--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhc-CCCCC----ch--hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 999999999874 567788888999999998865443222 11211 12 22456677778777777766666667
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 216 AAMAAVESQQQRLTLQRLIAMVEAERTYHQRVLQIL 251 (266)
Q Consensus 216 aAm~aVEaQQQrlTlQRLiaMVeaEr~YHqrv~~IL 251 (266)
..|..++...-.--|+-|+..+++--+|++.-.+++
T Consensus 183 ~~l~~l~~rk~~e~le~l~~~~~a~~~ff~~g~~~~ 218 (385)
T 2q13_A 183 CALNTLQYKKKIALLEPLLGYMQAQISFFKMGSENL 218 (385)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 778888776666678888899998877776666654
No 7
>4h8s_A DCC-interacting protein 13-beta; BAR domain, pleckstrin homology domain, adaptor protein, RAB signaling protein; 3.50A {Homo sapiens}
Probab=95.52 E-value=1.3 Score=39.57 Aligned_cols=176 Identities=10% Similarity=0.150 Sum_probs=106.7
Q ss_pred hhhhccceeeeccchhhhhhhhhhhhhhhcCCCCC--CcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHhhHHHHHhhhhhhHHHHhh
Q 024505 67 IVRGVEGYIVTGSKQVEIGTKLSEDSRKYGSDNTC--TSGNTLSKAALSYGRARAQMEKERGNLLKALGTQVAEPLRAMV 144 (266)
Q Consensus 67 IVRgvEG~is~gsKq~Ei~~KLaeDc~kYG~en~~--~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEre~l~r~L~~QV~ePLRaMv 144 (266)
+++.+..++..|..-....+.|++....|..++.+ ..+..+.-+-..|+.....++..+..|+.-+...|.+||...+
T Consensus 63 l~k~~~~~~~~~~~~~~a~~~f~~~l~~~~~~~~~~~~~d~~~~~~l~~f~~~~~ei~~~~~~L~~~~~~~i~~pL~~f~ 142 (407)
T 4h8s_A 63 LLQAMQRVYGAQNEMCLATQQLSKQLLAYEKQNFALGKGDEEVISTLHYFSKVVDELNLLHTELAKQLADTMVLPIIQFR 142 (407)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTGGGSCCC----CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhccccccCCcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 33333333333333333344555555556555432 2233455566789999999999999999999999999999999
Q ss_pred cCCCchhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhcCCCCChhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 145 LGAPLDDARHLAQRYDRMRQEAEAQAIEVSKRQAKVRETPGNPDLALKLDAAEVKLHDLKSNMAILGKEAAAAMAAVESQ 224 (266)
Q Consensus 145 ~GaPLEDARhLaqrYdRmRQEaE~qa~eV~rRq~k~re~~gn~e~~~KLq~AE~Kl~Elks~Ma~LGKEA~aAm~aVEaQ 224 (266)
.+ -|.+++.+..+||+...+-++--..... ..|.++ +..+..-+...|.+.+...--..-+-...|..+...
T Consensus 143 k~-di~~~ke~kK~Fek~~~~Yd~~l~Ky~~-~~k~k~------~~~~~~e~~~~l~~~Rk~f~~asldyv~~l~~lq~r 214 (407)
T 4h8s_A 143 EK-DLTEVSTLKDLFGLASNEHDLSMAKYSR-LPKKKE------NEKVKTEVGKEVAAARRKQHLSSLQYYCALNALQYR 214 (407)
T ss_dssp HT-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-SCSTTC------CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh-ccccCC------chHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 88 3666777788888888877765544332 112221 122233344445554444443344555667767665
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 225 QQRLTLQRLIAMVEAERTYHQRVLQI 250 (266)
Q Consensus 225 QQrlTlQRLiaMVeaEr~YHqrv~~I 250 (266)
.----++-|+..+++--+|++.-.+.
T Consensus 215 k~~e~le~l~~~~~a~~~~f~~~~~~ 240 (407)
T 4h8s_A 215 KQMAMMEPMIGFAHGQINFFKKGAEM 240 (407)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 55555666777777776666555444
No 8
>4avm_A Bridging integrator 2; protein binding, plasma membrane, BAR adaptor; 1.91A {Homo sapiens}
Probab=95.12 E-value=1.4 Score=37.61 Aligned_cols=213 Identities=14% Similarity=0.169 Sum_probs=117.8
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHhcCCCCCCCCccccchHHHhHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhccceeeeccchhhhhhhhhh
Q 024505 11 LREQVARQQQAVFKQFGGGGYGGSDNVVTDEAELHQHQRLERLYISTRAGKHFQRDIVRGVEGYIVTGSKQVEIGTKLSE 90 (266)
Q Consensus 11 lreqVAkQQQAV~Kqfg~~gy~~~d~~v~DE~Elq~HQ~LekLY~STRaaKhFQrdIVRgvEG~is~gsKq~Ei~~KLae 90 (266)
+...+.|-.|-|.-.+|.+ -...|..+-|+ -++.+.||+ .++.+|+++-.=.+.+-..-.-|..++.-|.+
T Consensus 9 ~~K~~~R~~q~lkqk~G~~-e~T~D~~Fe~~--e~rF~~le~------~~~kL~k~~k~y~~ai~~~~~~q~~~~~~l~~ 79 (237)
T 4avm_A 9 VQKKFSRAQEKVLQKLGKA-VETKDERFEQS--ASNFYQQQA------EGHKLYKDLKNFLSAVKVMHESSKRVSETLQE 79 (237)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHTTSS-CCCCCHHHHHH--HHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHhhhhHHHHHHcCCC-cccccHHHHHH--HHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 4445777788888888843 22445444222 223344443 35667777654444433333333333333322
Q ss_pred hhhhhcCCCCCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHhhHHHHHhhhhhhHHHHhhcCCCchhhhhHHH-------HHHHHH
Q 024505 91 DSRKYGSDNTCTSGNTLSKAALSYGRARAQMEKERGNLLKALGTQVAEPLRAMVLGAPLDDARHLAQ-------RYDRMR 163 (266)
Q Consensus 91 Dc~kYG~en~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEre~l~r~L~~QV~ePLRaMv~GaPLEDARhLaq-------rYdRmR 163 (266)
=|+.+.+ +. ..|......++.=-.+++..|.++|..||..+..= +.+-+.+.. =|||.|
T Consensus 80 ---~y~~~~~---~~------~~~~~~~~~~~~l~~~~~~~l~~~vi~Pl~~~~~~--~~~i~k~I~KR~~kllDyd~~~ 145 (237)
T 4avm_A 80 ---IYSSEWD---GH------EELKAIVWNNDLLWEDYEEKLADQAVRTMEIYVAQ--FSEIKERIAKRGRKLVDYDSAR 145 (237)
T ss_dssp ---HSCTTST---TH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHT--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred ---HhCCccC---cH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 2443321 21 12333333333335566777888899999988743 333333333 366666
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHhhhcCCCCChhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 164 QEAEAQAIEVSKRQAKVRETPGNPDLALKLDAAEVKLHDLKSNMAILGKEAAAAMAAVESQQQRLTLQRLIAMVEAERTY 243 (266)
Q Consensus 164 QEaE~qa~eV~rRq~k~re~~gn~e~~~KLq~AE~Kl~Elks~Ma~LGKEA~aAm~aVEaQQQrlTlQRLiaMVeaEr~Y 243 (266)
..++.- +.| +. - ...||..||.++.+.+.....|...--.=+-..-.=...+--.-|-++|..++.|
T Consensus 146 ~~~~kl-------~~k----~~-k-d~~kl~kae~el~~a~~~ye~lN~~L~~eLP~l~~~~~~~~~~~~~~~i~~q~~f 212 (237)
T 4avm_A 146 HHLEAV-------QNA----KK-K-DEAKTAKAEEEFNKAQTVFEDLNQELLEELPILYNSRIGCYVTIFQNISNLRDVF 212 (237)
T ss_dssp HHHHHH-------HTC----SS-C-CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHH-------Hhc----cC-C-cHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 655532 222 21 1 2579999999999888877777665444443333322333334466788889999
Q ss_pred HHHHHHHHHHhhhhhh
Q 024505 244 HQRVLQILDQLEGEVS 259 (266)
Q Consensus 244 Hqrv~~ILd~l~~emv 259 (266)
|..+..+...|.+=|.
T Consensus 213 ~~~~~~~~~~l~~~~~ 228 (237)
T 4avm_A 213 YREMSKLNHNLYEVMS 228 (237)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHhhHHHHHH
Confidence 9888877777666554
No 9
>2ykt_A Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associate protein 2; signaling protein, NPY motif, binding pocket; 2.11A {Homo sapiens} PDB: 1y2o_A 1wdz_A
Probab=92.04 E-value=5.9 Score=34.76 Aligned_cols=171 Identities=13% Similarity=0.158 Sum_probs=104.5
Q ss_pred ceeeeccchhhhhhhhhhhhhhhcCCCCCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHhhHHHHHhhhhhhHHHHhhcCCCchhh
Q 024505 73 GYIVTGSKQVEIGTKLSEDSRKYGSDNTCTSGNTLSKAALSYGRARAQMEKERGNLLKALGTQVAEPLRAMVLGAPLDDA 152 (266)
Q Consensus 73 G~is~gsKq~Ei~~KLaeDc~kYG~en~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEre~l~r~L~~QV~ePLRaMv~GaPLEDA 152 (266)
+.+..+.-=++-..|+++-+-. ++ .+. -|.-+-......+..+|..++++.+.|-..+.-||.-=|- +|-
T Consensus 47 ~~~~a~~~f~dal~kia~~A~~----s~-gs~-elG~~L~~i~~~~r~ie~~l~~~~~~~~~~li~pL~~kie----~d~ 116 (253)
T 2ykt_A 47 GVTYAAKGYFDALVKMGELASE----SQ-GSK-ELGDVLFQMAEVHRQIQNQLEEMLKSFHNELLTQLEQKVE----LDS 116 (253)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT----SS-SCH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHHHH----HHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcc----Cc-chH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----hhH
Confidence 3444444445666666664432 11 122 3555555678889999999999999999999999886432 232
Q ss_pred -------hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhcCCCCChh-hhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 153 -------RHLAQRYDRMRQEAEAQAIEVSKRQAKVRETPGNPD-LALKLDAAEVKLHDLKSNMAILGKEAAAAMAAVESQ 224 (266)
Q Consensus 153 -------RhLaqrYdRmRQEaE~qa~eV~rRq~k~re~~gn~e-~~~KLq~AE~Kl~Elks~Ma~LGKEA~aAm~aVEaQ 224 (266)
++.+.-|.+-+++.+-...|+.|-+.|.+.+. |+. .-.|+..+-.-+.+.++.|-..=+++--.-.--|-=
T Consensus 117 K~v~~~~K~~~~e~k~~~~~l~K~~~e~~kl~KK~k~gk-~~~~~~~~~~~~~e~v~~~~~~le~~~~~~lr~aL~EERr 195 (253)
T 2ykt_A 117 RYLSAALKKYQTEQRSKGDALDKCQAELKKLRKKSQGSK-NPQKYSDKELQYIDAISNKQGELENYVSDGYKTALTEERR 195 (253)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC-------CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHhHhHHHHHHHHHHHHHhhccCCC-CcchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 34456778888999888889888877766322 221 113444444445555555554444444333333333
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh
Q 024505 225 QQRLTLQRLIAMVEAERTYHQRVLQILDQL 254 (266)
Q Consensus 225 QQrlTlQRLiaMVeaEr~YHqrv~~ILd~l 254 (266)
.=..=+.++...+..|-.||.....+|..-
T Consensus 196 Rycflv~~~~~v~~~~~~~h~~~~~~L~~~ 225 (253)
T 2ykt_A 196 RFCFLVEKQCAVAKNSAAYHSKGKELLAQK 225 (253)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh
Confidence 333345778889999999998877776553
No 10
>3aco_A Pacsin2, protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2; helix bundle, coiled-coil, endocytosis; 2.70A {Homo sapiens}
Probab=84.93 E-value=19 Score=31.33 Aligned_cols=92 Identities=13% Similarity=0.169 Sum_probs=62.7
Q ss_pred HHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhccceeeeccchhhhhhhhhhhhhhhcC---CCCCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHH
Q 024505 49 RLERLYISTRAGKHFQRDIVRGVEGYIVTGSKQVEIGTKLSEDSRKYGS---DNTCTSGNTLSKAALSYGRARAQMEKER 125 (266)
Q Consensus 49 ~LekLY~STRaaKhFQrdIVRgvEG~is~gsKq~Ei~~KLaeDc~kYG~---en~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEr 125 (266)
.++.|+.-+..|..|=+||..=+-== ..=--|.+.+|..=|++|.. .++ ..| +|..|-..+-..-..+-+.+
T Consensus 30 g~~~L~~r~~~g~~~~~el~~f~keR---a~IE~eYak~L~kLakk~~~~~~~~~-e~g-tl~~aw~~l~~e~e~~a~~H 104 (350)
T 3aco_A 30 NYKRTVKRIDDGHRLCSDLMNCLHER---ARIEKAYAQQLTEWARRWRQLVEKGP-QYG-TVEKAWMAFMSEAERVSELH 104 (350)
T ss_dssp TTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSS-CCH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred CcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccCCC-CCc-hHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 56777777777776666664322100 00113668888888999863 222 234 78888777777777777888
Q ss_pred hhHHHHHhhhhhhHHHHhhc
Q 024505 126 GNLLKALGTQVAEPLRAMVL 145 (266)
Q Consensus 126 e~l~r~L~~QV~ePLRaMv~ 145 (266)
..|-..|.++|.+||+..+.
T Consensus 105 ~~la~~L~~~v~~~l~~~~~ 124 (350)
T 3aco_A 105 LEVKASLMNDDFEKIKNWQK 124 (350)
T ss_dssp HHHHHHHHHTHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 89999999999999998753
No 11
>3haj_A Human pacsin2 F-BAR; pacsin,syndapin,FAP52,F-BAR, alternative splicing, coiled coil, cytoplasmic vesicle, endocytosis, phosphoprotein, polymorphism; 2.78A {Homo sapiens}
Probab=83.54 E-value=28 Score=32.16 Aligned_cols=200 Identities=15% Similarity=0.153 Sum_probs=105.5
Q ss_pred HHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhccceeeeccchhhhhhhhhhhhhhhcC---CCCCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHh
Q 024505 50 LERLYISTRAGKHFQRDIVRGVEGYIVTGSKQVEIGTKLSEDSRKYGS---DNTCTSGNTLSKAALSYGRARAQMEKERG 126 (266)
Q Consensus 50 LekLY~STRaaKhFQrdIVRgvEG~is~gsKq~Ei~~KLaeDc~kYG~---en~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEre 126 (266)
++.||.-+..|..+=+||+.=+.== ..=-.|.+.+|..=|+||-. .++ ..| +|..+-..+=..-..+-+-+.
T Consensus 24 ~~~L~~r~~~g~~~~~el~~f~keR---a~iE~eYAk~L~kLakk~~~~~~~~~-e~g-tl~~aw~~~~~e~e~~a~~H~ 98 (486)
T 3haj_A 24 YKRTVKRIDDGHRLCSDLMNCLHER---ARIEKAYAQQLTEWARRWRQLVEKGP-QYG-TVEKAWMAFMSEAERVSELHL 98 (486)
T ss_dssp THHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSS-CCS-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccCCC-Ccc-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 4445555555555555544321100 01123567777777777721 112 234 688877777777777777788
Q ss_pred hHHHHHhhhhhhHHHHhhcCC------------------------Cc----hhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh
Q 024505 127 NLLKALGTQVAEPLRAMVLGA------------------------PL----DDARHLAQRYDRMRQEAEAQAIEVSKRQA 178 (266)
Q Consensus 127 ~l~r~L~~QV~ePLRaMv~Ga------------------------PL----EDARhLaqrYdRmRQEaE~qa~eV~rRq~ 178 (266)
.+-..|.++|.+||+....-. +| .+......+|+..++|++..-....+ +
T Consensus 99 ~~a~~L~~~v~~~l~~~~~e~~~K~~~~~~kerK~~~~~~~k~qk~l~~~~~~l~KaKk~Y~~~cke~e~a~~~~~~--a 176 (486)
T 3haj_A 99 EVKASLMNDDFEKIKNWQKEAFHKQMMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKLKEVEAAKKAHHAACKEEKLAISREAN--S 176 (486)
T ss_dssp HHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHCCBCSSSSBHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--H
T ss_pred HHHHHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--h
Confidence 888899999999999875311 00 01122344677777775544322211 1
Q ss_pred hhcCCCCChhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 179 KVRETPGNPDLALKLDAAEVKLHDLKSNMAILGKEAAA--------------AMAAVESQQQRLTLQRLIAMVEAERTYH 244 (266)
Q Consensus 179 k~re~~gn~e~~~KLq~AE~Kl~Elks~Ma~LGKEA~a--------------Am~aVEaQQQrlTlQRLiaMVeaEr~YH 244 (266)
+ .+...++....|++. |++..+..+...-.+=.. .|..+=.+-|.+--+||..|-+.=..|+
T Consensus 177 ~-~d~~~t~k~~eK~~~---k~~k~~~~~~~a~~~Y~~~v~~~n~~~~~y~~~~~~~~~~lQ~lEeeRi~~lK~~L~~y~ 252 (486)
T 3haj_A 177 K-ADPSLNPEQLKKLQD---KIEKCKQDVLKTKEKYEKSLKELDQGTPQYMENMEQVFEQCQQFEEKRLRFFREVLLEVQ 252 (486)
T ss_dssp H-HCCCSCSHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred h-ccccCCHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 1 123334554555443 333333333322222222 3444444556666667777766666777
Q ss_pred HHHH----HHHHHhhhhhhh
Q 024505 245 QRVL----QILDQLEGEVSN 260 (266)
Q Consensus 245 qrv~----~ILd~l~~emvs 260 (266)
..+- .++++++.+|..
T Consensus 253 ~~l~~~~~~~~~~~~e~l~~ 272 (486)
T 3haj_A 253 KHLDLSNVAGYKAIYHDLEQ 272 (486)
T ss_dssp HHHCCSSCHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHhhhcchhHHHHHHHHHH
Confidence 6653 245666666543
No 12
>2d1l_A Metastasis suppressor protein 1; IRSP53, actin binding, IMD, protein binding; HET: MSE; 1.85A {Mus musculus}
Probab=82.07 E-value=27 Score=30.98 Aligned_cols=103 Identities=15% Similarity=0.180 Sum_probs=74.3
Q ss_pred cceeeeccchhhhhhhhhhhhhhhcCCCCCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHhhHHHHHhhhhhhHHHHhhcCCCchh
Q 024505 72 EGYIVTGSKQVEIGTKLSEDSRKYGSDNTCTSGNTLSKAALSYGRARAQMEKERGNLLKALGTQVAEPLRAMVLGAPLDD 151 (266)
Q Consensus 72 EG~is~gsKq~Ei~~KLaeDc~kYG~en~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEre~l~r~L~~QV~ePLRaMv~GaPLED 151 (266)
.|.+.+|.-=++-..|+++-.- ..++++. -|--+-..+...++.+|..++++.+.|-+.+.-||.-=+- .|
T Consensus 48 ~~~~~a~~af~Da~qKvad~A~----~s~g~s~-elG~~L~~i~~~hr~ie~~l~~~~k~~~~eli~pLe~k~e----~d 118 (253)
T 2d1l_A 48 RTTVVAAAAFLDAFQKVADMAT----NTRGGTR-EIGSALTRMCMRHRSIEAKLRQFSSALIDCLINPLQEQME----EW 118 (253)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----TSSTHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHH----HH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcc----cCCcchH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----hh
Confidence 4444455545666666665432 1111122 3666667788899999999999999999999999976553 34
Q ss_pred hhhHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhcCC
Q 024505 152 ARHLA-------QRYDRMRQEAEAQAIEVSKRQAKVRET 183 (266)
Q Consensus 152 ARhLa-------qrYdRmRQEaE~qa~eV~rRq~k~re~ 183 (266)
.+-++ ..|.|.|.|.+....+..|-+.|.|-.
T Consensus 119 ~k~~~~~~K~~~~~~k~~r~elkk~~~~~~k~qkK~rk~ 157 (253)
T 2d1l_A 119 KKVANQLDKDHAKEYKKARQEIKKKSSDTLKLQKKAKKV 157 (253)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSCG
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHhccc
Confidence 55444 679999999999999999988888763
No 13
>4dyl_A Tyrosine-protein kinase FES/FPS; structural genomics, structural genomics consortium, BCR, CR associated substrate, transferase; 2.18A {Homo sapiens}
Probab=76.24 E-value=45 Score=30.17 Aligned_cols=64 Identities=9% Similarity=0.043 Sum_probs=44.7
Q ss_pred hhhhhhhhhhhhhhcCCC--CCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHhhHHHHHhhhhhhHHHHhhc
Q 024505 82 VEIGTKLSEDSRKYGSDN--TCTSGNTLSKAALSYGRARAQMEKERGNLLKALGTQVAEPLRAMVL 145 (266)
Q Consensus 82 ~Ei~~KLaeDc~kYG~en--~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEre~l~r~L~~QV~ePLRaMv~ 145 (266)
-|.+.+|..=|+||.... ....+++++.|-..+=+.-.++=+.+.++-..|.++|++||..++.
T Consensus 43 ~eYAk~L~kLakk~~~k~~~~~~~~~tl~~aW~~ll~ete~~a~~H~~lae~L~~~v~~~l~~~~k 108 (406)
T 4dyl_A 43 REYAGLLHHMSLQDSGGQSRAISPDSPISQSWAEITSQTEGLSRLLRQHAEDLNSGPLSKLSLLIR 108 (406)
T ss_dssp HHHHHHHHHHC------------CCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHhcccccCCCCCChHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 457889999999997521 1123457888877787777888888999999999999999988764
No 14
>2efl_A Formin-binding protein 1; EFC domain, structural genomics, NPPSFA, national project on structural and functional analyses; 2.61A {Homo sapiens} SCOP: a.238.1.4
Probab=74.67 E-value=35 Score=28.18 Aligned_cols=186 Identities=14% Similarity=0.153 Sum_probs=99.4
Q ss_pred HHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhccceeeeccchhhhhhhhhhhhhhhcCCC------CCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHH
Q 024505 49 RLERLYISTRAGKHFQRDIVRGVEGYIVTGSKQVEIGTKLSEDSRKYGSDN------TCTSGNTLSKAALSYGRARAQME 122 (266)
Q Consensus 49 ~LekLY~STRaaKhFQrdIVRgvEG~is~gsKq~Ei~~KLaeDc~kYG~en------~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mE 122 (266)
.++.|+.-+..|..+=+||..=+.-= ..=--|.+.+|..=|++|.... | ..+ ++..|-..+-+.-..+=
T Consensus 15 g~~~l~~r~~~g~~~~~el~~f~~eR---a~iE~eYak~L~kLa~~~~~~~~~~~~~~-~~~-t~~~aw~~~~~~~e~~a 89 (305)
T 2efl_A 15 QFDNLEKHTQWGIDILEKYIKFVKER---TEIELSYAKQLRNLSKKYQPKKNSKEEEE-YKY-TSCKAFISNLNEMNDYA 89 (305)
T ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHTSCC-------C-TTS-HHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHhccccccCcccc-ccc-cHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 46667776777766666664322110 1112366788888888885432 2 123 57666555555555666
Q ss_pred HHHhhHHHHHhhhhhhHHHHhhcCC----------------Cchh----hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhcC
Q 024505 123 KERGNLLKALGTQVAEPLRAMVLGA----------------PLDD----ARHLAQRYDRMRQEAEAQAIEVSKRQAKVRE 182 (266)
Q Consensus 123 kEre~l~r~L~~QV~ePLRaMv~Ga----------------PLED----ARhLaqrYdRmRQEaE~qa~eV~rRq~k~re 182 (266)
+.+..+-..|.++|.+||...+..- ++.+ .......|+...+|+|.--.... ++. .+
T Consensus 90 ~~h~~~a~~l~~~v~~~l~~~~~~~~~~rK~~~~~~~k~~k~~~~~~~~l~KaK~~Y~~~~~e~e~a~~~~~--~~~-~~ 166 (305)
T 2efl_A 90 GQHEVISENMASQIIVDLARYVQELKQERKSNFHDGRKAQQHIETCWKQLESSKRRFERDCKEADRAQQYFE--KMD-AD 166 (305)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHH-HC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHh-cc
Confidence 6777888888999999999876531 1111 12245567777777764222211 111 11
Q ss_pred CCCChhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 183 TPGNPDLALKLDAAEVKLHDLKSNMAILGKEAAAAMAAVESQ---------------QQRLTLQRLIAMVEAERTYHQ 245 (266)
Q Consensus 183 ~~gn~e~~~KLq~AE~Kl~Elks~Ma~LGKEA~aAm~aVEaQ---------------QQrlTlQRLiaMVeaEr~YHq 245 (266)
.+.++. +++-+..|+.+.+..+...-.+=..++..++.. -|.+-..|+..|-+.=..|+.
T Consensus 167 ~~~s~~---~~eK~~~k~~~~~~~~~~a~~~Y~~~v~~~n~~~~~~~~~~~~~~~~~lQ~le~~r~~~lk~~l~~~~~ 241 (305)
T 2efl_A 167 INVTKA---DVEKARQQAQIRHQMAEDSKADYSSILQKFNHEQHEYYHTHIPNIFQKIQEMEERRIVRMGESMKTYAE 241 (305)
T ss_dssp TTSCHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred ccccHh---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 222332 344455555555544443333333444444443 345556666655555445544
No 15
>2x3v_A Syndapin I, protein kinase C and casein kinase substrate in N protein 1; BAR, N-WAsp, dynamin, pacsin 1, endocytosis; 2.45A {Mus musculus} PDB: 2x3w_A 2x3x_A
Probab=68.53 E-value=56 Score=27.95 Aligned_cols=187 Identities=13% Similarity=0.152 Sum_probs=101.9
Q ss_pred HHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhccceeeeccchhhhhhhhhhhhhhhcC---CCCCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHH
Q 024505 49 RLERLYISTRAGKHFQRDIVRGVEGYIVTGSKQVEIGTKLSEDSRKYGS---DNTCTSGNTLSKAALSYGRARAQMEKER 125 (266)
Q Consensus 49 ~LekLY~STRaaKhFQrdIVRgvEG~is~gsKq~Ei~~KLaeDc~kYG~---en~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEr 125 (266)
.++.|+.-+..|..+=+||..=+.== ..=--|.+.+|..=|++|.. .++ .. .+|..|-..+-..-..+-+-+
T Consensus 21 g~~~l~~r~~~g~~~~~el~~f~keR---a~iE~eYak~L~kLakk~~~~~~~~~-~~-gtl~~aw~~~~~e~e~~a~~H 95 (337)
T 2x3v_A 21 NYKRTVKRIDDGHRLCNDLMSCVQER---AKIEKAYAQQLTDWAKRWRQLIEKGP-QY-GSLERAWGAMMTEADKVSELH 95 (337)
T ss_dssp TTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSS-CC-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred ChHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccCCC-CC-chHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 45555655556655555554311100 00123567788888888864 122 23 468877777777777777788
Q ss_pred hhHHHHHhhhhhhHHHHhhc--------C-----CCc---------------hhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 126 GNLLKALGTQVAEPLRAMVL--------G-----APL---------------DDARHLAQRYDRMRQEAEAQAIEVSKRQ 177 (266)
Q Consensus 126 e~l~r~L~~QV~ePLRaMv~--------G-----aPL---------------EDARhLaqrYdRmRQEaE~qa~eV~rRq 177 (266)
..|-..|.++|.+||+.... | -.+ .+.......|+..++|++.--..+.+
T Consensus 96 ~~~a~~L~~~v~~~l~~~~~e~~~k~~~~~~ke~K~~~~~~~k~~k~~~~~~~~l~KaKk~Y~~~c~e~e~a~~~~~~-- 173 (337)
T 2x3v_A 96 QEVKNSLLNEDLEKVKNWQKDAYHKQIMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKMKELEAAKKAYHLACKEERLAMTREMN-- 173 (337)
T ss_dssp HHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHCCBCSSCSBHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHhc--
Confidence 88889999999999998653 1 011 11233456788888776643222222
Q ss_pred hhhcCCCCChhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 178 AKVRETPGNPDLALKLDAAEVKLHDLKSNMAILGKEAAAAMAAVE--------------SQQQRLTLQRLIAMVEAERTY 243 (266)
Q Consensus 178 ~k~re~~gn~e~~~KLq~AE~Kl~Elks~Ma~LGKEA~aAm~aVE--------------aQQQrlTlQRLiaMVeaEr~Y 243 (266)
++ .+++.++....|+ +.|+.+++..+...-.+=..++...+ .+-|.+-.+||..|-+.=..|
T Consensus 174 ~~-~~~~~s~k~~eK~---~~k~~k~~~~~~~a~~~Y~~~v~~~n~~~~~~~~~~~~~~~~~Q~le~~Rl~~lk~~l~~~ 249 (337)
T 2x3v_A 174 SK-TEQSVTPEQQKKL---VDKVDKCRQDVQKTQEKYEKVLEDVGKTTPQYMEGMEQVFEQCQQFEEKRLVFLKEVLLDI 249 (337)
T ss_dssp HH-SSSCCCHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred cc-cCcccCHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 22 1233455544444 45555555555544444333333333 334445555655555555555
Q ss_pred HHH
Q 024505 244 HQR 246 (266)
Q Consensus 244 Hqr 246 (266)
+..
T Consensus 250 ~~~ 252 (337)
T 2x3v_A 250 KRH 252 (337)
T ss_dssp HHH
T ss_pred HHH
Confidence 554
No 16
>4a3a_A Amphiphysin; structural genomics, invagination, knobs-IN-holes, curvature membrane, structural genomics consortium; 1.78A {Homo sapiens} PDB: 4atm_A 3sog_A
Probab=64.66 E-value=67 Score=27.44 Aligned_cols=212 Identities=15% Similarity=0.210 Sum_probs=99.0
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCCCCCCCccccchH---HHhHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhccceeeeccchhhh
Q 024505 8 ATKLREQVARQQQAVFKQFGGGGYGGSDNVVTDEA---ELHQHQRLERLYISTRAGKHFQRDIVRGVEGYIVTGSKQVEI 84 (266)
Q Consensus 8 AsklreqVAkQQQAV~Kqfg~~gy~~~d~~v~DE~---Elq~HQ~LekLY~STRaaKhFQrdIVRgvEG~is~gsKq~Ei 84 (266)
|+.+...+.|-.|-|+-.+|.+ .-..|+. +-++.+.|| ..++.+|+|+=.-.+.+-..-.-|+.+
T Consensus 11 ~~~i~K~~~Ra~~~l~qk~G~~------~~T~D~~F~~~e~~F~~le------~~~~kL~k~~k~y~~ai~~~~~~q~~~ 78 (243)
T 4a3a_A 11 AKNVQKRLNRAQEKVLQKLGKA------DETKDEQFEEYVQNFKRQE------AEGTRLQRELRGYLAAIKGMQEASMKL 78 (243)
T ss_dssp ---------CGGGCHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCC------cccccHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 3445566777778888888732 1223442 122333333 356677877744443333322233344
Q ss_pred hhhhhhhhhhhcCCCCCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHhhHHHHHhhhhhhHHHHhhcCCCchhhhhHH-HH-----
Q 024505 85 GTKLSEDSRKYGSDNTCTSGNTLSKAALSYGRARAQMEKERGNLLKALGTQVAEPLRAMVLGAPLDDARHLA-QR----- 158 (266)
Q Consensus 85 ~~KLaeDc~kYG~en~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEre~l~r~L~~QV~ePLRaMv~GaPLEDARhLa-qr----- 158 (266)
+.-|.+= |....+ ..+.+......|.. =..+|..-|-++|..||..+..=- -+-+.+. .|
T Consensus 79 ae~l~~l---y~p~~~--~~~~~~~~~~~~~~-------l~~d~~~~l~d~~l~Pl~~l~~~f--~~i~k~I~KR~~Kll 144 (243)
T 4a3a_A 79 TESLHEV---YEPDWY--GREDVKMVGEKCDV-------LWEDFHQKLVDGSLLTLDTYLGQF--PDIKNRIAKRSRKLV 144 (243)
T ss_dssp HHHHHHH---CCTTST--THHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHTH--HHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHH---cCcccc--CccchHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC--hHHHHHHHHhcchHH
Confidence 3333332 433321 11111111112221 123344445678888988876433 3333333 33
Q ss_pred -HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhcCCCCChhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 159 -YDRMRQEAEAQAIEVSKRQAKVRETPGNPDLALKLDAAEVKLHDLKSNMAILGKEAAAAMAAVESQQQRLTLQRLIAMV 237 (266)
Q Consensus 159 -YdRmRQEaE~qa~eV~rRq~k~re~~gn~e~~~KLq~AE~Kl~Elks~Ma~LGKEA~aAm~aVEaQQQrlTlQRLiaMV 237 (266)
|||.|..++.. ++.+. -...||..||..+..-+..-..|...=-.=|-..-.=-..+=..-|-++|
T Consensus 145 DYD~~~~k~~kL-----------~~K~~--kd~~kl~kae~el~~Ak~~Ye~lN~~L~eELP~l~~~r~~~~~~~~~s~i 211 (243)
T 4a3a_A 145 DYDSARHHLEAL-----------QSSKR--KDESRISKAEEEFQKAQKVFEEFNVDLQEELPSLWSRRVGFYVNTFKNVS 211 (243)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHH-----------HTCSS--CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHH-----------Hhccc--ccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 56666655432 22221 13479999998888776665544432221111111100111112355788
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHhhhhh
Q 024505 238 EAERTYHQRVLQILDQLEGEV 258 (266)
Q Consensus 238 eaEr~YHqrv~~ILd~l~~em 258 (266)
..++.||..+..+..+|.+-|
T Consensus 212 ~~Q~~f~~e~~k~~~~l~~~~ 232 (243)
T 4a3a_A 212 SLEAKFHKEIAVLCHKLYEVM 232 (243)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHhHHHHH
Confidence 889999888877777766554
No 17
>3m3w_A Pacsin3, protein kinase C and casein kinase II substrate P; mouse, BAR domain, endocytosis; 2.60A {Mus musculus} PDB: 3syv_A 3qe6_A
Probab=60.21 E-value=86 Score=27.23 Aligned_cols=202 Identities=16% Similarity=0.188 Sum_probs=112.8
Q ss_pred HHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhccceeeeccchhhhhhhhhhhhhhhcC--CCCCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHH
Q 024505 48 QRLERLYISTRAGKHFQRDIVRGVEGYIVTGSKQVEIGTKLSEDSRKYGS--DNTCTSGNTLSKAALSYGRARAQMEKER 125 (266)
Q Consensus 48 Q~LekLY~STRaaKhFQrdIVRgvEG~is~gsKq~Ei~~KLaeDc~kYG~--en~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEr 125 (266)
...+.||.-+..|..|=.||..=+--= ..=--+.+.+|..=|+||-. ++.+.. .+|..|-..+-..-..+=+.+
T Consensus 20 ~g~~~l~~~~~~g~~~~~el~~f~keR---a~iE~~Yak~L~kLakk~~~~~~~~~e~-gsl~~aw~~i~~e~e~~a~~H 95 (320)
T 3m3w_A 20 GNYRRTVQRVEDGHRLCGDLVSCFQER---ARIEKAYAQQLADWARKWRGAVEKGPQY-GTLEKAWHAFFTAAERLSELH 95 (320)
T ss_dssp TTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSCC-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred ccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccCCCCC-ChHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 355667777777777777765322100 00123567788888887732 221223 468888777777777777888
Q ss_pred hhHHHHHhhhhhhHHHHhhc--------CCCchhhhhH---------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 126 GNLLKALGTQVAEPLRAMVL--------GAPLDDARHL---------------------AQRYDRMRQEAEAQAIEVSKR 176 (266)
Q Consensus 126 e~l~r~L~~QV~ePLRaMv~--------GaPLEDARhL---------------------aqrYdRmRQEaE~qa~eV~rR 176 (266)
..+-..|.++|.+||+..+. +.- -+-+.+ ...|+..++|.+..-
T Consensus 96 ~~~a~~l~~~v~~~l~~~~k~~~~k~~~~~~-ke~K~~~~~~~k~qk~~~~~~~~l~kaKk~Y~~~c~e~~~a~------ 168 (320)
T 3m3w_A 96 LEVREKLHGPDSERVRTWQRGAFHRPVLGGF-RASRAAEDGFRKAQKPWLKRLKEVEASKKSYHTARKDEKTAQ------ 168 (320)
T ss_dssp HHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHTC-----CC-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------
Confidence 88999999999999997642 211 111222 345666666533221
Q ss_pred Hhhhc----CCCCChhhhhhHHH----HHHHHHH----HHHHHHHhcH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 177 QAKVR----ETPGNPDLALKLDA----AEVKLHD----LKSNMAILGK---EAAAAMAAVESQQQRLTLQRLIAMVEAER 241 (266)
Q Consensus 177 q~k~r----e~~gn~e~~~KLq~----AE~Kl~E----lks~Ma~LGK---EA~aAm~aVEaQQQrlTlQRLiaMVeaEr 241 (266)
.+.+ ++..++....|++. +...+.+ ...++..+.+ .=-..|-.+=.+-|.+--.||.-|-+.=.
T Consensus 169 -~~~~~~~~d~~~s~ke~~K~~~k~~k~~~~~~~a~~~Y~~~l~~~n~~~~~y~~~~~~~~~~~Q~lEe~Ri~~lk~~l~ 247 (320)
T 3m3w_A 169 -TRESHAKADSSMSQEQLRKLQERVGRCTKEAEKMKTQYEQTLAELNRYTPRYMEDMEQAFESCQAAERQRLLFFKDVLL 247 (320)
T ss_dssp -HHTTSCCSSCCC---CCSSSSSTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred -HHHHhcccCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 1211 11233444555542 2222222 2222333322 11234566666677777888888888778
Q ss_pred HHHHHH----HHHHHHhhhhhhhc
Q 024505 242 TYHQRV----LQILDQLEGEVSNC 261 (266)
Q Consensus 242 ~YHqrv----~~ILd~l~~emvse 261 (266)
.|+..+ ...+++++.+|...
T Consensus 248 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~~~~~ 271 (320)
T 3m3w_A 248 TLHQHLDLSSSDKFHELHRDLQQS 271 (320)
T ss_dssp HHHHHHCGGGCHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHccccchhHHHHHHHHHHH
Confidence 888765 25677777777653
No 18
>3abh_A Pacsin2, protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2; helix bundle, coiled-coil, endocytosis; 2.00A {Homo sapiens} PDB: 3q0k_A 3lll_A 3hah_A 3qni_A 3hai_A 3q84_A
Probab=60.15 E-value=78 Score=26.72 Aligned_cols=91 Identities=13% Similarity=0.179 Sum_probs=63.2
Q ss_pred HHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhccceeeeccchhhhhhhhhhhhhhhcC---CCCCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHH
Q 024505 49 RLERLYISTRAGKHFQRDIVRGVEGYIVTGSKQVEIGTKLSEDSRKYGS---DNTCTSGNTLSKAALSYGRARAQMEKER 125 (266)
Q Consensus 49 ~LekLY~STRaaKhFQrdIVRgvEG~is~gsKq~Ei~~KLaeDc~kYG~---en~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEr 125 (266)
.++.|+.-+..|..+=+||..=+-== ..=--|.+.+|..=|+||.. .++ ..| +|..|-..+-+.-..+-+.+
T Consensus 30 g~~~l~~r~~~g~~~~~el~~f~keR---a~iE~eYak~L~kLakk~~~~~~~~~-e~g-tl~~aw~~i~~e~e~~a~~H 104 (312)
T 3abh_A 30 NYKRTVKRIDDGHRLCSDLMNCLHER---ARIEKAYAQQLTEWARRWRQLVEKGP-QYG-TVEKAWMAFMSEAERVSELH 104 (312)
T ss_dssp TTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSS-CCH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred ChHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCC-CCC-hHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 56777777777777766665322000 00013568888888999863 222 234 78888777777777888888
Q ss_pred hhHHHHHhhhhhhHHHHhh
Q 024505 126 GNLLKALGTQVAEPLRAMV 144 (266)
Q Consensus 126 e~l~r~L~~QV~ePLRaMv 144 (266)
..|-..|.++|.+||+..+
T Consensus 105 ~~~a~~L~~~v~~~l~~~~ 123 (312)
T 3abh_A 105 LEVKASLMNDDFEKIKNWQ 123 (312)
T ss_dssp HHHHHHHHHTHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 9999999999999999775
No 19
>2v0o_A FCHO2, FCH domain only protein 2; lipid-binding protein, EFC domain, vesicle trafficking, membrane curvature, endocytosis, exocytosis, F-BAR domain; 2.30A {Homo sapiens}
Probab=56.41 E-value=81 Score=25.73 Aligned_cols=90 Identities=9% Similarity=0.153 Sum_probs=52.9
Q ss_pred HHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhccceeeeccchhhhhhhhhhhhhhhcCCCCCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHhhH
Q 024505 49 RLERLYISTRAGKHFQRDIVRGVEGYIVTGSKQVEIGTKLSEDSRKYGSDNTCTSGNTLSKAALSYGRARAQMEKERGNL 128 (266)
Q Consensus 49 ~LekLY~STRaaKhFQrdIVRgvEG~is~gsKq~Ei~~KLaeDc~kYG~en~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEre~l 128 (266)
.++.|+.-+..|..+=+||..=+.== ..=--|.+.+|..=|++|...+ ..| +|..+-..+-..-..+-+.+..+
T Consensus 19 g~~~l~~~~~~g~~~~~el~~f~~eR---a~iE~eYak~L~kLa~~~~~~~--~~g-s~~~~w~~~~~~~e~~a~~h~~~ 92 (276)
T 2v0o_A 19 GFDVLYHNMKHGQISTKELADFVRER---ATIEEAYSRSMTKLAKSASNYS--QLG-TFAPVWDVFKTSTEKLANCHLDL 92 (276)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSC--CCS-SSGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHhcCCCC--Ccc-hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 45556666666665555554321100 0112356778888888886532 233 45555555555555666777778
Q ss_pred HHHHhhhhhhHHHHhhc
Q 024505 129 LKALGTQVAEPLRAMVL 145 (266)
Q Consensus 129 ~r~L~~QV~ePLRaMv~ 145 (266)
-..| .+|.+||...+.
T Consensus 93 a~~l-~~~~~~l~~~~~ 108 (276)
T 2v0o_A 93 VRKL-QELIKEVQKYGE 108 (276)
T ss_dssp HHHH-HHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHH-HHHHHHHHHHHH
Confidence 8888 488899988764
No 20
>2i7u_A Four-alpha-helix bundle; HOMO dimer, anesthetic binding, de novo protein/ligand binding protein complex; NMR {Synthetic} PDB: 2jst_A
Probab=42.23 E-value=61 Score=23.67 Aligned_cols=42 Identities=31% Similarity=0.446 Sum_probs=26.9
Q ss_pred ChHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCC-CCCCCCccccchH
Q 024505 1 MEAIRKQATKLREQVARQQQAVFKQFGGG-GYGGSDNVVTDEA 42 (266)
Q Consensus 1 Mda~rKqAsklreqVAkQQQAV~Kqfg~~-gy~~~d~~v~DE~ 42 (266)
|.-+|..|.||.|.-.|--....|-+-|| |.|+++.+-+-|.
T Consensus 1 mkklreeaaklfeewkklaeeaaklleggggggggelmklcee 43 (62)
T 2i7u_A 1 MKKLREEAAKLFEEWKKLAEEAAKLLEGGGGGGGGELMKLCEE 43 (62)
T ss_dssp CCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCSSCSSSCHHHHHHHH
T ss_pred CchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCCCchHHHHHHHHH
Confidence 66789999999998877755555655443 3344554444443
No 21
>2efk_A CDC42-interacting protein 4; EFC domain, structural genomics, NPPSFA, national project on structural and functional analyses; 2.30A {Homo sapiens} SCOP: a.238.1.4
Probab=41.94 E-value=1.5e+02 Score=24.51 Aligned_cols=117 Identities=15% Similarity=0.143 Sum_probs=71.0
Q ss_pred HHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhccceeeeccchhhhhhhhhhhhhhhcCCC-----CCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHH
Q 024505 49 RLERLYISTRAGKHFQRDIVRGVEGYIVTGSKQVEIGTKLSEDSRKYGSDN-----TCTSGNTLSKAALSYGRARAQMEK 123 (266)
Q Consensus 49 ~LekLY~STRaaKhFQrdIVRgvEG~is~gsKq~Ei~~KLaeDc~kYG~en-----~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEk 123 (266)
.++.|+.-+..|..|=.||..=+.-= ..=--|.+.+|..=|++|..-. +...+ ++..+-..+-..-..+=+
T Consensus 8 g~~~l~~~~~~g~~~~~el~~f~keR---a~iE~eYak~L~kLakk~~~~~~~~~~~~~~~-t~~~~w~~~l~~~e~~a~ 83 (301)
T 2efk_A 8 QFEVLERHTQWGLDLLDRYVKFVKER---TEVEQAYAKQLRSLVKKYLPKRPAKDDPESKF-SQQQSFVQILQEVNDFAG 83 (301)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHSCC-------CTTS-HHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHhccccccccccccc-hHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 45556666666665555553221100 0112356788888888886431 11123 677777777777777777
Q ss_pred HHhhHHHHHhhhhhhHHHHhhcCC----------------Cchh----hhhHHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 124 ERGNLLKALGTQVAEPLRAMVLGA----------------PLDD----ARHLAQRYDRMRQEAEAQ 169 (266)
Q Consensus 124 Ere~l~r~L~~QV~ePLRaMv~Ga----------------PLED----ARhLaqrYdRmRQEaE~q 169 (266)
.+..+-..|.++|.+||...+.-. ++.+ ......+|+...+|+|.-
T Consensus 84 ~h~~~a~~L~~~v~~~l~~~~~~~~~~rK~~~~~~~k~~k~~~~~~~~l~KaKk~Y~~~~~e~e~a 149 (301)
T 2efk_A 84 QRELVAENLSVRVCLELTKYSQEMKQERKMHFQEGRRAQQQLENGFKQLENSKRKFERDCREAEKA 149 (301)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 888899999999999999876431 2222 223455777777777653
No 22
>3i2w_A Syndapin, LD46328P; EFC, FBAR, SH3 domain, endocytosis; 2.67A {Drosophila melanogaster}
Probab=36.43 E-value=1.9e+02 Score=24.11 Aligned_cols=62 Identities=15% Similarity=0.123 Sum_probs=41.8
Q ss_pred hhhhhhhhhhhhhcC--CCCCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHhhHHHHHhhhhhhHHHHhhc
Q 024505 83 EIGTKLSEDSRKYGS--DNTCTSGNTLSKAALSYGRARAQMEKERGNLLKALGTQVAEPLRAMVL 145 (266)
Q Consensus 83 Ei~~KLaeDc~kYG~--en~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEre~l~r~L~~QV~ePLRaMv~ 145 (266)
|.+.+|..=|++|-. ++.+..| +|..|-..+-..-..+=+-+..+-..|.++|.+||+..+.
T Consensus 40 ~Yak~L~kL~~~~~~~~~~~~~~g-s~~~aw~~~~~~~e~~a~~h~~~a~~l~~~v~~~l~~~~~ 103 (290)
T 3i2w_A 40 GYAKSLRTWSKKWGELIEKGPEYG-TTEAAWKGVLTESERISDVHMKIKDNLCNDVNSQIKTWQK 103 (290)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSCCH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHhhcCCCCCc-hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 456666666666621 1111233 5877766666666666677888888899999999998874
No 23
>1i4d_A Arfaptin 2, partner of RAC1; coiled coil, G-protein, complex, signaling protein; HET: GDP; 2.50A {Homo sapiens} SCOP: a.238.1.2 PDB: 1i49_A* 1i4l_A* 1i4t_A*
Probab=33.59 E-value=2.4e+02 Score=24.58 Aligned_cols=182 Identities=16% Similarity=0.241 Sum_probs=116.7
Q ss_pred HHHHHHhh-hhhhhhhhhhhhhhccceeeeccchhhhhhhhhhhhhhhcCCCCCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHhh
Q 024505 49 RLERLYIS-TRAGKHFQRDIVRGVEGYIVTGSKQVEIGTKLSEDSRKYGSDNTCTSGNTLSKAALSYGRARAQMEKERGN 127 (266)
Q Consensus 49 ~LekLY~S-TRaaKhFQrdIVRgvEG~is~gsKq~Ei~~KLaeDc~kYG~en~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEre~ 127 (266)
..++.|.. .+.++.||+.+-.= .--|=+.|.-|++-.-| .| .|+.+-..||.++..|+|-++.
T Consensus 18 ~~q~~Y~~L~~~~~~l~~~~~~l-------~qtq~~lG~~f~~l~~~----~p-----~l~~~f~~~~~~~r~~~k~g~~ 81 (224)
T 1i4d_A 18 ETKRKYESVLQLGRALTAHLYSL-------LQTQHALGDAFADLSQK----SP-----ELQEEFGYNAETQKLLCKNGET 81 (224)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHT----CG-----GGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHhh----Cc-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHH
Confidence 33344433 35566666655432 22344555555554443 33 3789999999999999999999
Q ss_pred HHHHHhhhhhhHHHHhhcCCCchhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhcCCCCChhhhhhHHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 128 LLKALGTQVAEPLRAMVLGAPLDDARHLAQRYDRMRQEAEAQAIEVSKRQAKVRETPGNPDLALKLDAAEVKLHDLKSNM 207 (266)
Q Consensus 128 l~r~L~~QV~ePLRaMv~GaPLEDARhLaqrYdRmRQEaE~qa~eV~rRq~k~re~~gn~e~~~KLq~AE~Kl~Elks~M 207 (266)
|++.|.-=+.+ |.+.++ --.+|.++--++|..-|=|-.+--.++-.=... |-+++..-|++-+....++.|...
T Consensus 82 Ll~~L~~f~s~-l~T~~~-kaI~DT~lTIk~ye~aR~EY~ay~~~~ee~~~~----~~~~~~l~rve~~q~~~~~ak~kf 155 (224)
T 1i4d_A 82 LLGAVNFFVSS-INTLVT-KTMEDTLMTVKQYEAARLEYDAYRTDLEELSLG----PRDAGTRGRLESAQATFQAHRDKY 155 (224)
T ss_dssp HHHHHHHHHHH-HHHHHH-THHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC----------------CHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHH-HHHHHh-HhccHHHHHHHHHHHHhHhHHHHHhhHHHhhcc----cccccchhhHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 99988643332 333333 347999999999999998877766554432222 213444557778888889999888
Q ss_pred HHhcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 208 AILGKEAAAAMAAVESQQQRLTLQRLIAMVEAERTYHQRVLQILD 252 (266)
Q Consensus 208 a~LGKEA~aAm~aVEaQQQrlTlQRLiaMVeaEr~YHqrv~~ILd 252 (266)
.-|-....--|--.++-.=++=-.=|+..+.+=-+||---.++|+
T Consensus 156 ~kLR~DV~~KleLLd~~r~kv~~~qL~~~~~al~~y~~~~~~~l~ 200 (224)
T 1i4d_A 156 EKLRGDVAIKLKFLEENKIKVMHKQLLLFHNAVSAYFAGNQKQLE 200 (224)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHH
Confidence 888888888888887766555555566666666677776666664
No 24
>6rlx_A Relaxin, A-chain; hormone(muscle relaxant); 1.50A {Homo sapiens} SCOP: g.1.1.1
Probab=25.03 E-value=25 Score=21.62 Aligned_cols=12 Identities=17% Similarity=0.213 Sum_probs=10.0
Q ss_pred hhhhhhhhhhhc
Q 024505 85 GTKLSEDSRKYG 96 (266)
Q Consensus 85 ~~KLaeDc~kYG 96 (266)
..-||+-||+||
T Consensus 3 ~~~ls~kCC~~G 14 (24)
T 6rlx_A 3 YSALANKCCHVG 14 (26)
T ss_dssp HHHHHHHHHHTC
T ss_pred cccHHHHHhccC
Confidence 345899999999
No 25
>2fhw_A Relaxin 3 (prorelaxin H3) (insulin-like peptide INSL7) (insulin-like peptide 7); insulin/relaxin super-family fold, signaling protein; NMR {Synthetic}
Probab=24.10 E-value=26 Score=21.79 Aligned_cols=13 Identities=31% Similarity=0.434 Sum_probs=10.7
Q ss_pred hhhhhhhhhhhhc
Q 024505 84 IGTKLSEDSRKYG 96 (266)
Q Consensus 84 i~~KLaeDc~kYG 96 (266)
+..-|++-||+||
T Consensus 2 ~~~~ls~~CC~~G 14 (26)
T 2fhw_A 2 VLAGLSSSCCKWG 14 (26)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHTC
T ss_pred cchhhhHHHhhCC
Confidence 4556899999999
No 26
>3o0z_A RHO-associated protein kinase 1; coiled-coil, transferase; HET: MSE; 2.33A {Homo sapiens}
Probab=22.90 E-value=3.5e+02 Score=22.96 Aligned_cols=81 Identities=19% Similarity=0.350 Sum_probs=57.2
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhcCCCCChhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 159 YDRMRQEAEAQAIEVSKRQAKVRETPGNPDLALKLDAAEVKLHDLKSNMAILGKEAAAAMAAVESQQQRLTLQRLIAMVE 238 (266)
Q Consensus 159 YdRmRQEaE~qa~eV~rRq~k~re~~gn~e~~~KLq~AE~Kl~Elks~Ma~LGKEA~aAm~aVEaQQQrlTlQRLiaMVe 238 (266)
=+.+|.|.|+-+ |.|-. ++|....++.+|.++.||..-...|++.= ..-|++-.+| -+-++
T Consensus 19 n~kLk~EsE~~~--------rlkK~--~tEl~k~~~~~E~~~rELq~~~~~L~~~k------~~Leke~~~L---Qa~L~ 79 (168)
T 3o0z_A 19 NDLLRTESDTAV--------RLRKS--HTEMSKSISQLESLNRELQERNRILENSK------SQTDKDYYQL---QAILE 79 (168)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHH--------HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH---HHHHH
T ss_pred HHHHHHhHHHHH--------HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH---HHHHH
Confidence 456788877654 33322 78889999999999999999999888643 2334444444 46778
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHhhhhh
Q 024505 239 AERTYHQRVLQILDQLEGEV 258 (266)
Q Consensus 239 aEr~YHqrv~~ILd~l~~em 258 (266)
.||.-..+-.++...|+.-|
T Consensus 80 qEr~~r~q~se~~~elq~ri 99 (168)
T 3o0z_A 80 AERRDRGHDSEMIGDLQARI 99 (168)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 88888877777776665543
No 27
>3vjz_A DMP19, putative uncharacterized protein; helix bundle, DNA mimic, gene regulation; 1.80A {Neisseria meningitidis}
Probab=22.22 E-value=47 Score=28.30 Aligned_cols=51 Identities=18% Similarity=0.245 Sum_probs=42.2
Q ss_pred eeeeccchhhhhhhhhhhhhhhcCCCCCCcchHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHhh
Q 024505 74 YIVTGSKQVEIGTKLSEDSRKYGSDNTCTSGNTLSKAALSYGRARAQMEKERGN 127 (266)
Q Consensus 74 ~is~gsKq~Ei~~KLaeDc~kYG~en~~~~~~~LarAa~~yg~a~~~mEkEre~ 127 (266)
+|..|+--.=.-+-+++.++.+|.... ...|-||-..|...+..+|+++.+
T Consensus 67 LI~NGyG~~if~Np~akalr~wG~~~l---~kli~kA~klY~~~~~~ie~e~~~ 117 (166)
T 3vjz_A 67 LIASGYGEYIFRNPLADSLRRWKIKAV---PKVLDKAKALYEQHGKTIETLADG 117 (166)
T ss_dssp HHHHSCHHHHHTSSHHHHHHTTTCCHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred hhhcCchhHHHhChHHHHHHHhCchhH---HHHHHHHHHHHHHhhhHHHHHhhc
Confidence 466777655556779999999999854 468999999999999999999974
No 28
>1uur_A Stata protein, STAT protein; transcription activator, SH2, signal transduction, transducer, transcription factor; HET: PTR; 2.7A {Dictyostelium discoideum} SCOP: a.47.1.1 b.2.5.5 d.93.1.1 PDB: 1uus_A*
Probab=20.54 E-value=2.3e+02 Score=27.53 Aligned_cols=88 Identities=19% Similarity=0.128 Sum_probs=60.6
Q ss_pred CccccchH---HHhHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhccceeeeccchhhhhhhhhhhhhhhcCCCCCCcchHHHH--
Q 024505 35 DNVVTDEA---ELHQHQRLERLYISTRAGKHFQRDIVRGVEGYIVTGSKQVEIGTKLSEDSRKYGSDNTCTSGNTLSK-- 109 (266)
Q Consensus 35 d~~v~DE~---Elq~HQ~LekLY~STRaaKhFQrdIVRgvEG~is~gsKq~Ei~~KLaeDc~kYG~en~~~~~~~Lar-- 109 (266)
.--|+||- -+++|+.|||.+. -|+-+. ....+..+.++++-
T Consensus 10 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-------~~~~~~---------------------------~~~~~~~~~~~~~~~~ 55 (473)
T 1uur_A 10 PQPILDTIYKLLSEQEQTLVQMIH-------EQSLLL---------------------------NRLPPTLDENSLAPLK 55 (473)
T ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHH---------------------------HTSCSSCSHHHHHHHH
T ss_pred chHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHH---------------------------hcCCCCccHHHHHHHH
Confidence 33456774 4678999999874 455544 11122233445444
Q ss_pred -HHHHhhHHHHHHHHHHhhHHHHHhhhhhhHHHHhhcCCCchhhhhHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 024505 110 -AALSYGRARAQMEKERGNLLKALGTQVAEPLRAMVLGAPLDDARHLAQRYDRMRQEAEAQA 170 (266)
Q Consensus 110 -Aa~~yg~a~~~mEkEre~l~r~L~~QV~ePLRaMv~GaPLEDARhLaqrYdRmRQEaE~qa 170 (266)
-...|-+-.++|+.|--.|...++.+|.||.- |. +-+-|+|+.+.|.
T Consensus 56 ~l~~~~~~~~~~~~~e~~~l~~~~~~~il~p~~-------------l~-~l~~l~q~L~~~~ 103 (473)
T 1uur_A 56 SLSQKQITLSGQMNTEMSALDATKKGMILEPTD-------------LA-KLFALKQDLQIQF 103 (473)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCCCHHH-------------HH-HHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhcccCChHH-------------Hh-HHHHHHHHhHhhh
Confidence 67789999999999999999999999999973 22 4556666666665
Done!