Query 037413
Match_columns 530
No_of_seqs 505 out of 2507
Neff 10.9
Searched_HMMs 29240
Date Mon Mar 25 20:34:59 2013
Command hhsearch -i /work/01045/syshi/csienesis_hhblits_a3m/037413.a3m -d /work/01045/syshi/HHdatabase/pdb70.hhm -o /work/01045/syshi/hhsearch_pdb/037413hhsearch_pdb -cpu 12 -v 0
No Hit Prob E-value P-value Score SS Cols Query HMM Template HMM
1 1pw4_A Glycerol-3-phosphate tr 100.0 8.6E-40 2.9E-44 327.6 31.1 379 60-455 25-429 (451)
2 3o7q_A L-fucose-proton symport 100.0 1.1E-37 3.9E-42 310.9 35.6 370 61-445 24-418 (438)
3 2gfp_A EMRD, multidrug resista 100.0 1E-35 3.5E-40 290.4 13.9 342 66-432 3-348 (375)
4 4aps_A DI-OR tripeptide H+ sym 100.0 2.8E-33 9.7E-38 283.3 26.8 377 65-454 15-466 (491)
5 4gc0_A D-xylose-proton symport 100.0 1.4E-32 4.9E-37 278.2 30.1 357 66-432 15-428 (491)
6 2cfq_A Lactose permease; trans 100.0 1.4E-30 4.8E-35 257.3 21.6 364 68-449 12-389 (417)
7 2xut_A Proton/peptide symporte 100.0 5E-28 1.7E-32 246.9 20.3 356 69-434 18-465 (524)
8 1pw4_A Glycerol-3-phosphate tr 99.5 8.8E-14 3E-18 138.5 13.6 173 65-246 254-434 (451)
9 4aps_A DI-OR tripeptide H+ sym 99.4 4.6E-12 1.6E-16 127.6 17.2 169 279-454 13-191 (491)
10 3o7q_A L-fucose-proton symport 99.4 7.6E-12 2.6E-16 123.9 16.2 146 81-238 276-425 (438)
11 2cfq_A Lactose permease; trans 99.4 5.8E-12 2E-16 123.8 14.0 143 97-248 258-402 (417)
12 4gc0_A D-xylose-proton symport 99.3 3E-11 1E-15 121.6 18.8 185 66-253 280-470 (491)
13 2xut_A Proton/peptide symporte 99.3 6.4E-11 2.2E-15 120.2 15.9 163 279-448 12-187 (524)
14 2gfp_A EMRD, multidrug resista 99.2 7.5E-11 2.6E-15 114.2 11.3 141 284-432 5-146 (375)
15 2jln_A MHP1; hydantoin, transp 57.1 62 0.0021 31.7 10.4 57 179-244 20-78 (501)
16 2g9p_A Antimicrobial peptide l 50.4 6.8 0.00023 19.1 1.1 14 117-130 2-15 (26)
17 2knc_A Integrin alpha-IIB; tra 42.7 15 0.00053 23.0 2.1 15 441-455 11-25 (54)
No 1
>1pw4_A Glycerol-3-phosphate transporter; transmembrane, inner membrane, major facilitator superfamily, secondary active membrane transporter; 3.30A {Escherichia coli} SCOP: f.38.1.1
Probab=100.00 E-value=8.6e-40 Score=327.58 Aligned_cols=379 Identities=17% Similarity=0.168 Sum_probs=309.7
Q ss_pred cchHHHHHHHHHHHHhhhhccccccchHHHHHhcCCChhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHhhhhCCchhhHHHHHHHH
Q 037413 60 PHMTTFHLSWLSFFTCFVSTFAAAPLVPIIRDNLNLIKTDIGNAGIASVSGSIFSRLVMGAVCDLLGPRYGCAFLIMLSA 139 (530)
Q Consensus 60 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~Grr~~l~~~~~~~~ 139 (530)
.+++.+..+++..+...++...+.+.+|.+.+++ .+..+.|++.+++.+++.++++++|+++||+|||+++.++.++.+
T Consensus 25 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~G~l~dr~g~r~~l~~~~~~~~ 103 (451)
T 1pw4_A 25 LRWQIFLGIFFGYAAYYLVRKNFALAMPYLVEQG-FSRGDLGFALSGISIAYGFSKFIMGSVSDRSNPRVFLPAGLILAA 103 (451)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSHHHHHHHTTSST-TCSSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh-ccHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHhcCchHHHHHHHHHHH
Confidence 3567777888888889989899999999999999 999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHHh----hhhHHHHHHHHHHHHhhhhh-hhhHHHHHhhhccCCcchhhHhHhhhhhhhhhhhHHhHHHHHHHHHH
Q 037413 140 PTVFSMVF----VSSARGYIAARFMIGFSLAT-FVSCQYWMSTMFNGKIIGLVNGTAAGWGNMGGGITQLLTPFIYELIR 214 (530)
Q Consensus 140 ~~~~~~~~----~~~~~~l~~~r~l~G~~~~~-~~~~~~~i~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~G~~~~~~~~~~l~~~~~ 214 (530)
++.+++++ ++|++.++++|+++|++.+. .+...+++.|++|+++|++++++.+.+.++|..+++.+++.+.+..
T Consensus 104 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~l~G~~~~~~~~~~~~~i~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~g~~~g~~~~~~l~~~~- 182 (451)
T 1pw4_A 104 AVMLFMGFVPWATSSIAVMFVLLFLCGWFQGMGWPPCGRTMVHWWSQKERGGIVSVWNCAHNVGGGIPPLLFLLGMAWF- 182 (451)
T ss_dssp HHHHHHHHCHHHHSSSSHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHTTCTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHTSHHHHHHHHHHHT-
T ss_pred HHHHHHHhhhhccccHHHHHHHHHHHHHHhhhccchHHHHHHHHCCchhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh-
Confidence 99999999 99999999999999999996 7888999999999999999999999999999999998888877655
Q ss_pred hcCCCCCCc-hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccCCCCCCccccccCCCC-----------CCCChhHH-HHHhhhchhH
Q 037413 215 RAGATPFTA-WRIAFFAPGCLHVIMGILVLTLGQDLPDGNLNTLQKKGDV-----------PTDKFPKV-LWYAITNYRT 281 (530)
Q Consensus 215 ~~~~~~~~~-wr~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~p~~~~~~~~~~~~~-----------~~~~~~~~-~~~~~~~~~~ 281 (530)
+ ||++|++.+++.++..++.+++.||.|+..+...+++.++ ++.+..+. .++.+++|.+
T Consensus 183 --------g~w~~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 254 (451)
T 1pw4_A 183 --------NDWHAALYMPAFCAILVALFAFAMMRDTPQSCGLPPIEEYKNDYPDDYNEKAEQELTAKQIFMQYVLPNKLL 254 (451)
T ss_dssp --------CCSTTCTHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCSSTTTCCCSCTTTCCC-------------CCTHHHHHHTSSCHHH
T ss_pred --------ccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccCCHhhcCCCChhhhcccccccchhhhhcccccccchHHHHHcCHHH
Confidence 7 9999999999988888888888887765432111111000 01112222 4677889999
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhHhhhhc--cCCCCCcchhHHHHHHH
Q 037413 282 WIFVLLYGMSLGIELTIDNVIAEYFFDRFNLKLHTAGVIAATFGMANIFARPLGGLMSDMA--ARPFGMRGRLWNLYIVQ 359 (530)
Q Consensus 282 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~--~~r~~~~~~~~~~~~~~ 359 (530)
+...+..++.......+..++|.|+.+.+|++..+.+++.+...++.+++.++.+++.||+ ++|+ ...++.
T Consensus 255 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~~~~~~~~~~-------~~~~~~ 327 (451)
T 1pw4_A 255 WYIAIANVFVYLLRYGILDWSPTYLKEVKHFALDKSSWAYFLYEYAGIPGTLLCGWMSDKVFRGNRG-------ATGVFF 327 (451)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHBTTBSCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSTTCHH-------HHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCch-------hHHHHH
Confidence 9999988888888888899999999988999999999999999999999999999999999 7763 333443
Q ss_pred HHHH-HHHHHhhcC--CcHHHHHHHHHHHHHHhhhhhccccccc-cccccccccchhhhhhhhhhH-HHHhhhhhhhh-c
Q 037413 360 TLGG-IFCICLGRA--STLPLSILSMILFSITTQAACGATFGII-PFISRRSLGVISGLTGAGGNF-GSGLTQLLFFT-S 433 (530)
Q Consensus 360 ~~~~-~~~~~~~~~--~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~g~~~g~~~~~~~~-g~~~~~~~~~~-~ 433 (530)
.+.. ++++++... .+.+......++.|++.+...+....+. +..|++.+|++.|+.+...++ |..++|.+.+. .
T Consensus 328 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~g~l~ 407 (451)
T 1pw4_A 328 MTLVTIATIVYWMNPAGNPTVDMICMIVIGFLIYGPVMLIGLHALELAPKKAAGTAAGFTGLFGYLGGSVAASAIVGYTV 407 (451)
T ss_dssp HHHHHHHHHHTTSCCTTCHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHTSCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHhcccCHHHHHHHHHHHHHHHhchHHHHHHHHHHHhchhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 3333 444444443 3566677777778888777777777774 567778899999999999999 99999999887 5
Q ss_pred cCCCcchhHHHHHHHHHHHHHH
Q 037413 434 SRHSTATGISLMGIMIVCCTFP 455 (530)
Q Consensus 434 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 455 (530)
+..++...+...+++.+++.++
T Consensus 408 ~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 429 (451)
T 1pw4_A 408 DFFGWDGGFMVMIGGSILAVIL 429 (451)
T ss_dssp HSSCSHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HhcCcHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 5566666666665555554443
No 2
>3o7q_A L-fucose-proton symporter; transporter, multi-PASS membrane protei transport protein; HET: BNG; 3.14A {Escherichia coli} PDB: 3o7p_A*
Probab=100.00 E-value=1.1e-37 Score=310.90 Aligned_cols=370 Identities=13% Similarity=0.073 Sum_probs=294.7
Q ss_pred chHHHHHHHHHHHHhhhhccccccchHHHHHhcCCChhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHhhhhCCchhhHHHHHHHHH
Q 037413 61 HMTTFHLSWLSFFTCFVSTFAAAPLVPIIRDNLNLIKTDIGNAGIASVSGSIFSRLVMGAVCDLLGPRYGCAFLIMLSAP 140 (530)
Q Consensus 61 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~Grr~~l~~~~~~~~~ 140 (530)
++..+..+++.++...++....++..|.+.+++|++..+.|++.+++.+++.++.+++|+++||+|||+++.++.++.++
T Consensus 24 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~s~~~~g~~~~~~~~~~~i~~~~~G~l~dr~g~r~~l~~~~~~~~~ 103 (438)
T 3o7q_A 24 YIIPFALLCSLFFLWAVANNLNDILLPQFQQAFTLTNFQAGLIQSAFYFGYFIIPIPAGILMKKLSYKAGIITGLFLYAL 103 (438)
T ss_dssp THHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCCCSHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHhcchHHHHHHHHHHHH
Confidence 56667777788888888888888999999999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred HHHHH---HhhhhHHHHHHHHHHHHhhhhh-hhhHHHHHhhhccCCcchhhHhHhhhhhhhhhhhHHhHHHHHH-HHHHh
Q 037413 141 TVFSM---VFVSSARGYIAARFMIGFSLAT-FVSCQYWMSTMFNGKIIGLVNGTAAGWGNMGGGITQLLTPFIY-ELIRR 215 (530)
Q Consensus 141 ~~~~~---~~~~~~~~l~~~r~l~G~~~~~-~~~~~~~i~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~G~~~~~~~~~~l~-~~~~~ 215 (530)
+.+++ +++++++.++++|+++|++.+. .+...+++.|++|+++|++++++.+.+.++|..+++.+++.+. .....
T Consensus 104 ~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~l~G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~g~~~g~~~~~~l~~~~~~~ 183 (438)
T 3o7q_A 104 GAALFWPAAEIMNYTLFLVGLFIIAAGLGCLETAANPFVTVLGPESSGHFRLNLAQTFNSFGAIIAVVFGQSLILSNVPH 183 (438)
T ss_dssp HHHHHHHHHHTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSCSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHTSSCC
T ss_pred HHHHHHhccccccHHHHHHHHHHHHhhHHHhhhhHHHHHHHHcCchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccccc
Confidence 99999 8889999999999999999996 7888999999999999999999999999999999998877776 22100
Q ss_pred ----------------cCCCCCCchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccCCCCCCccccccCCCCCCCChhHHHHHhhhch
Q 037413 216 ----------------AGATPFTAWRIAFFAPGCLHVIMGILVLTLGQDLPDGNLNTLQKKGDVPTDKFPKVLWYAITNY 279 (530)
Q Consensus 216 ----------------~~~~~~~~wr~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~p~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 279 (530)
.+.....+||+.|++.+++.++..++.++. + .||+++++ ++++++++..+.+++.+++|
T Consensus 184 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~w~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~-~p~~~~~~---~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 258 (438)
T 3o7q_A 184 QSQDVLDKMSPEQLSAYKHSLVLSVQTPYMIIVAIVLLVALLIMLT-K-FPALQSDN---HSDAKQGSFSASLSRLARIR 258 (438)
T ss_dssp CCHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC-C-CCCCTTTC---CCCSSTTSHHHHHHHHTTCS
T ss_pred ccccccccCCcchhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-c-CCcccccc---cccccccchhhhHHHHHhCh
Confidence 000000019999998888777666554443 2 23332211 11223344567788899999
Q ss_pred hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHhcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhHhhhhccCCCCCcchhHHHHHH
Q 037413 280 RTWIFVLLYGMSLGIELTIDNVIAEY-FFDRFNLKLHTAGVIAATFGMANIFARPLGGLMSDMAARPFGMRGRLWNLYIV 358 (530)
Q Consensus 280 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~~r~~~~~~~~~~~~~ 358 (530)
.++...+..++..........++|.| +++.+|++..+++.+.+...++.+++.++.+++.||++||+ .+..+
T Consensus 259 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~~r~~~~~-------~~~~~ 331 (438)
T 3o7q_A 259 HWRWAVLAQFCYVGAQTACWSYLIRYAVEEIPGMTAGFAANYLTGTMVCFFIGRFTGTWLISRFAPHK-------VLAAY 331 (438)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSTTCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCHHH-------HHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhccCCcchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchH-------HHHHH
Confidence 99999998888888888888999999 88878999999999999999999999999999999999883 55555
Q ss_pred HHHHHHHHHHhhcCCcHHHHHHHHHHHHHHhhhhhcccccc-ccccccccccchhhhhhhhhhHHHHhhhhhhhh-ccCC
Q 037413 359 QTLGGIFCICLGRASTLPLSILSMILFSITTQAACGATFGI-IPFISRRSLGVISGLTGAGGNFGSGLTQLLFFT-SSRH 436 (530)
Q Consensus 359 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~g~~~g~~~~~~~~g~~~~~~~~~~-~~~~ 436 (530)
.++..+.++++...++.+. ...+++.+++.+...+..+++ .+..+++ ++.+.++.. ...+|+.++|.+.|. .+..
T Consensus 332 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~-~~~~g~~~~~~~~g~l~~~~ 408 (438)
T 3o7q_A 332 ALIAMALCLISAFAGGHVG-LIALTLCSAFMSIQYPTIFSLGIKNLGQD-TKYGSSFIV-MTIIGGGIVTPVMGFVSDAA 408 (438)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHCCHHHH-HHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHSSCGGG-HHHHHHHHH-HTTHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHcCCcHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhcccc-ccchhhHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHh
Confidence 5666666655555555543 444577788888888888888 5566655 788888777 677999999999887 4444
Q ss_pred C-cchhHHHH
Q 037413 437 S-TATGISLM 445 (530)
Q Consensus 437 ~-~~~~~~~~ 445 (530)
+ +...+...
T Consensus 409 g~~~~~~~~~ 418 (438)
T 3o7q_A 409 GNIPTAELIP 418 (438)
T ss_dssp TSSGGGGHHH
T ss_pred cchHHHHHHH
Confidence 4 55666543
No 3
>2gfp_A EMRD, multidrug resistance protein D; membrane protein, multidrug transporter; 3.50A {Escherichia coli}
Probab=100.00 E-value=1e-35 Score=290.41 Aligned_cols=342 Identities=13% Similarity=0.021 Sum_probs=276.0
Q ss_pred HHHHHHHHHhhhhccccccchHHHHHhcCCChhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHhhhhCCchhhHHHHHHHHHHHHHH
Q 037413 66 HLSWLSFFTCFVSTFAAAPLVPIIRDNLNLIKTDIGNAGIASVSGSIFSRLVMGAVCDLLGPRYGCAFLIMLSAPTVFSM 145 (530)
Q Consensus 66 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~Grr~~l~~~~~~~~~~~~~~ 145 (530)
..+++..+...+....+.+.+|.+.+++|.++++.+++.+++.+++.+++++.|+++||+|||+++.++.++.+++.++.
T Consensus 3 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~g~r~~~~~~~~~~~~~~~~~ 82 (375)
T 2gfp_A 3 LMLVLLVAVGQMAQTIYIPAIADMARDLNVREGAVQSVMGAYLLTYGVSQLFYGPISDRVGRRPVILVGMSIFMLATLVA 82 (375)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSSSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHTTSCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHHHHcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCCchhHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 44566677777778888889999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred HhhhhHHHHHHHHHHHHhhhhh-hhhHHHHHhhhccCCcchhhHhHhhhhhhhhhhhHHhHHHHHHHHHHhcCCCCCCch
Q 037413 146 VFVSSARGYIAARFMIGFSLAT-FVSCQYWMSTMFNGKIIGLVNGTAAGWGNMGGGITQLLTPFIYELIRRAGATPFTAW 224 (530)
Q Consensus 146 ~~~~~~~~l~~~r~l~G~~~~~-~~~~~~~i~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~G~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~w 224 (530)
+++++++.+++.|+++|++.+. .+...+++.|++|+++|++++++.+...++|..+++.+++.+.+.. +|
T Consensus 83 ~~~~~~~~l~~~~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~l~~~~---------~~ 153 (375)
T 2gfp_A 83 VTTSSLTVLIAASAMQGMGTGVGGVMARTLPRDLYERTQLRHANSLLNMGILVSPLLAPLIGGLLDTMW---------NW 153 (375)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSCCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSCHH---------HH
T ss_pred HHhccHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHhc---------cH
Confidence 9999999999999999999996 7888899999999999999999999999999999998888776655 89
Q ss_pred hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccCCCCCCccccccCCCCCCCChhHHHHHhhhchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 037413 225 RIAFFAPGCLHVIMGILVLTLGQDLPDGNLNTLQKKGDVPTDKFPKVLWYAITNYRTWIFVLLYGMSLGIELTIDNVIAE 304 (530)
Q Consensus 225 r~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~p~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 304 (530)
|+.|++.+++.++..++.++..||.+++++ +++ +.++.+++.+++|+++...+..++.......+..+.|.
T Consensus 154 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-----~~~----~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 224 (375)
T 2gfp_A 154 RACYLFLLVLCAGVTFSMARWMPETRPVDA-----PRT----RLLTSYKTLFGNSGFNCYLLMLIGGLAGIAAFEACSGV 224 (375)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCSSCCCSTTTC-----CCC----CTTTCSTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCSC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCcccCCCCc-----ccc----cHHHHHHHHhcCcchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 999999988877766655555555443211 111 11223456678899998888888888888888889999
Q ss_pred HHHHhcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhHhhhhccCCCCCcchhHHHHHHH-HHHHHHHHHhhc--CCcHHHHHHH
Q 037413 305 YFFDRFNLKLHTAGVIAATFGMANIFARPLGGLMSDMAARPFGMRGRLWNLYIVQ-TLGGIFCICLGR--ASTLPLSILS 381 (530)
Q Consensus 305 ~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~~r~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~--~~~~~~~~~~ 381 (530)
|+++.+|.++.+.+.+.+...++.+++.++.+++.||.+++ ....... ...++.++.... .++.+...+.
T Consensus 225 ~~~~~~g~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~r~~~~-------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 297 (375)
T 2gfp_A 225 LMGAVLGLSSMTVSILFILPIPAAFFGAWFAGRPNKRFSTL-------MWQSVICCLLAGLLMWIPDWFGVMNVWTLLVP 297 (375)
T ss_dssp SSHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHTTTTHHHHH-------HHHHHHHHHHTSSSSSHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHhCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhccccHHHHHHH
Confidence 99888899999999999999999999999999999998763 1111111 111111111111 1245555667
Q ss_pred HHHHHHHhhhhhccccccccccccccccchhhhhhhhhhHHHHhhhhhhhh
Q 037413 382 MILFSITTQAACGATFGIIPFISRRSLGVISGLTGAGGNFGSGLTQLLFFT 432 (530)
Q Consensus 382 ~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~g~~~~~~~~g~~~~~~~~~~ 432 (530)
.++.+++.+...+...++..+..|+++|++.|+.+...++|..++|.+.+.
T Consensus 298 ~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~p~~~g~~~g~~~~~~~~g~~~~~~~~g~ 348 (375)
T 2gfp_A 298 AALFFFGAGMLFPLATSGAMEPFPFLAGTAGALVGGLQNIGSGVLASLSAM 348 (375)
T ss_dssp HHHHHHHHHHTSSTTHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCSTTCTH
T ss_pred HHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHhCCcccchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 777888888888888888654444899999999999999999999999776
No 4
>4aps_A DI-OR tripeptide H+ symporter; transport protein, peptide transport, major facilitator SUPE transporter, MFS; 3.30A {Streptococcus thermophilus}
Probab=100.00 E-value=2.8e-33 Score=283.32 Aligned_cols=377 Identities=11% Similarity=0.021 Sum_probs=266.5
Q ss_pred HHHHHHHHHHhhhhcccc-ccchHHHHHh-----cCCChhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHhhh-hCCchhhHHHHHH
Q 037413 65 FHLSWLSFFTCFVSTFAA-APLVPIIRDN-----LNLIKTDIGNAGIASVSGSIFSRLVMGAVCDL-LGPRYGCAFLIML 137 (530)
Q Consensus 65 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~-----~~~s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr-~Grr~~l~~~~~~ 137 (530)
+..+++..+......+.. ..+.+.+.++ +|++..+.+++.+++.++..++++++|+++|| +|||+++.++.++
T Consensus 15 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~g~r~~~~~~~~~ 94 (491)
T 4aps_A 15 LSTLFMTEMWERFSYYGMRAILLYYMWFLISTGDLHITRATAASIMAIYASMVYLSGTIGGFVADRIIGARPAVFWGGVL 94 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCCSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccchhhcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccccchHHHHHHHHH
Confidence 444444444444444433 3334445555 99999999999999999999999999999999 8999999999999
Q ss_pred HHHHHHHHHhhhhHHHHHHHHHHHHhhhhh-hhhHHHHHhhhccCCc--chhhHhHhhhhhhhhhhhHHhHHHHHHHHHH
Q 037413 138 SAPTVFSMVFVSSARGYIAARFMIGFSLAT-FVSCQYWMSTMFNGKI--IGLVNGTAAGWGNMGGGITQLLTPFIYELIR 214 (530)
Q Consensus 138 ~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~r~l~G~~~~~-~~~~~~~i~~~~~~~~--r~~~~~~~~~~~~~G~~~~~~~~~~l~~~~~ 214 (530)
.+++.+++++++|++.++++|+++|++.+. .+...++++|++|+++ |+.++++++...++|..+++.+++.+.+..
T Consensus 95 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~l~~~~- 173 (491)
T 4aps_A 95 IMLGHIVLALPFGASALFGSIILIIIGTGFLKPNVSTLVGTLYDEHDRRRDAGFSIFVFGINLGAFIAPLIVGAAQEAA- 173 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHSCCSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS-
T ss_pred HHHHHHHHHHhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhccchHHHHHHHHcCcccccceeeehHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhh-
Confidence 999999999999999999999999999996 7888999999999988 777888888999999999998888887765
Q ss_pred hcCCCCCCchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccCCCCCCccccccCCCCCCCChhHHH----------------------
Q 037413 215 RAGATPFTAWRIAFFAPGCLHVIMGILVLTLGQDLPDGNLNTLQKKGDVPTDKFPKVL---------------------- 272 (530)
Q Consensus 215 ~~~~~~~~~wr~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~p~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~---------------------- 272 (530)
|||++|++.++..++..++.++..++..++..++.+. +..+++..+..
T Consensus 174 --------g~~~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~--~~~~~~~~~~~~~~g~~l~~~~~~~~~~~~~~~ 243 (491)
T 4aps_A 174 --------GYHVAFSLAAIGMFIGLLVYYFGGKKTLDPHYLRPTD--PLAPEEVKPLLVKVSLAVAGFIAIIVVMNLVGW 243 (491)
T ss_dssp --------CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCSCCSCCSC--CCSHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHSS
T ss_pred --------hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCcccccccccCCCC--ccccchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccC
Confidence 9999999998877766665555433322111000000 00000000000
Q ss_pred ---------------------------------HHhhhchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCCHHHHHH
Q 037413 273 ---------------------------------WYAITNYRTWIFVLLYGMSLGIELTIDNVIAEYFFDRFNLKLHTAGV 319 (530)
Q Consensus 273 ---------------------------------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~ 319 (530)
....+....+...+..++.+..+.....+++.|+.+..+.+....+.
T Consensus 244 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 323 (491)
T 4aps_A 244 NSLPAYINLLTIVAIAIPVFYFAWMISSVKVTSTEHLRVVSYIPLFIAAVLFWAIEEQGSVVLATFAAERVDSSWFPVSW 323 (491)
T ss_dssp CCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC------------CTTHHHHHHHHHHHHHHHGGGGTHHHHHHHHSCCCSSSCSGG
T ss_pred cccccchhhhhHHHHHHHHHHHHHHhhcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccHHHHHHHHHHhccCccCHHH
Confidence 00111122344444444445555556667888888877887667777
Q ss_pred HHHHHHHHHHhhhhhhhHhhhhccCCCCCcchhHHHHHHHHHHHHHHHHhhc---------CCcHHHHHHHHHHHHHHhh
Q 037413 320 IAATFGMANIFARPLGGLMSDMAARPFGMRGRLWNLYIVQTLGGIFCICLGR---------ASTLPLSILSMILFSITTQ 390 (530)
Q Consensus 320 ~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~~r~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~---------~~~~~~~~~~~~~~g~~~~ 390 (530)
+.....+..+++.++.+++.||++||+... ...+..+..+.+++++++.. ..+.+...+..++.+++.+
T Consensus 324 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~r~~~r~~~~--~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~g~~~~ 401 (491)
T 4aps_A 324 FQSLNPLFIMLYTPFFAWLWTAWKKNQPSS--PTKFAVGLMFAGLSFLLMAIPGALYGTSGKVSPLWLVGSWALVILGEM 401 (491)
T ss_dssp GTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTC---C--HHHHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHCCCCTTCCTHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HhccchHHHHHHHHHHHHHHHHHhccCCCc--hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCCCCccHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 777888888999999999999999985321 22333444444444433322 1255666677788888888
Q ss_pred hhhccccccc-cccccccccchhhhhhhhhhHHHHhhhhhhhhccCCCcchhHHHHHHHHHHHHH
Q 037413 391 AACGATFGII-PFISRRSLGVISGLTGAGGNFGSGLTQLLFFTSSRHSTATGISLMGIMIVCCTF 454 (530)
Q Consensus 391 ~~~~~~~~~~-~~~~~~~~g~~~g~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 454 (530)
...+..+.++ +..|++.||++.|+.+...++|..++|.+.+...+.+....+...+.+.+++.+
T Consensus 402 ~~~~~~~~~~~~~~p~~~~g~~~g~~~~~~~~g~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 466 (491)
T 4aps_A 402 LISPVGLSVTTKLAPKAFNSQMMSMWFLSSSVGSALNAQLVTLYNAKSEVAYFSYFGLGSVVLGI 466 (491)
T ss_dssp TTTTHHHHHHHHHTTTTCSSSSTHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGGSSTTHHHHHTHHHHHHHHH
T ss_pred HHhHHHHHHHHHhCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcccHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 8788787775 467788899999999999999999999998885555555555555554444433
No 5
>4gc0_A D-xylose-proton symporter; MFS, transport protein; HET: 6BG BNG; 2.60A {Escherichia coli} PDB: 4gbz_A* 4gby_A*
Probab=100.00 E-value=1.4e-32 Score=278.19 Aligned_cols=357 Identities=12% Similarity=0.019 Sum_probs=237.6
Q ss_pred HHHHHHHHHhhhhccccccchHHHHHhcCC--------ChhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHhhhhCCchhhHHHHHH
Q 037413 66 HLSWLSFFTCFVSTFAAAPLVPIIRDNLNL--------IKTDIGNAGIASVSGSIFSRLVMGAVCDLLGPRYGCAFLIML 137 (530)
Q Consensus 66 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~--------s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~Grr~~l~~~~~~ 137 (530)
.+..++.++..+|...++..+|.++++++. +.++.|++.+++.+|..++++++|+++||+|||++++++.++
T Consensus 15 ~~a~lg~~~~Gyd~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~s~~~~G~~iG~~~~G~laDr~GRk~~l~~~~~l 94 (491)
T 4gc0_A 15 LVATLGGLLFGYDTAVISGTVESLNTVFVAPQNLSESAANSLLGFCVASALIGCIIGGALGGYCSNRFGRRDSLKIAAVL 94 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHGGGGTHHHHHHHHTGGGCCCHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCCCCCcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCHHHHHHHHHH
Confidence 344566677777888888889999888743 345678999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHHHH------------------hhhhHHHHHHHHHHHHhhhhh-hhhHHHHHhhhccCCcchhhHhHhhhhhhhh
Q 037413 138 SAPTVFSMV------------------FVSSARGYIAARFMIGFSLAT-FVSCQYWMSTMFNGKIIGLVNGTAAGWGNMG 198 (530)
Q Consensus 138 ~~~~~~~~~------------------~~~~~~~l~~~r~l~G~~~~~-~~~~~~~i~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~G 198 (530)
+.++.++++ +++|+++++++|+++|++.|+ .+.+..+++|+.|+++|++..++.+.+..+|
T Consensus 95 ~~i~~i~~a~~~~~~~~~~~~~~~~~~~a~~~~~l~~~R~l~G~g~G~~~~~~~~~i~E~~p~~~rg~~~~~~~~~~~~g 174 (491)
T 4gc0_A 95 FFISGVGSAWPELGFTSINPDNTVPVYLAGYVPEFVIYRIIGGIGVGLASMLSPMYIAELAPAHIRGKLVSFNQFAIIFG 174 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHCTTTTTSCSSSSSSCCGGGGGCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSCGGGHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHhhhhhhhcchhHHHHHHhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhCCHHhhhhhHHhhhhhhhhh
Confidence 999999998 478999999999999999996 8899999999999999999999998888888
Q ss_pred hhhHHhHHHHHHHHHHhcCCCCCCchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccCCCCCCccccccCC--------------CCC
Q 037413 199 GGITQLLTPFIYELIRRAGATPFTAWRIAFFAPGCLHVIMGILVLTLGQDLPDGNLNTLQKKG--------------DVP 264 (530)
Q Consensus 199 ~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~wr~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~p~~~~~~~~~~~--------------~~~ 264 (530)
..+++.++..+.... ........+||+.+.+..+..++..+. .+..||+|+....+.+.++ .++
T Consensus 175 ~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~peSp~~L~~~~~~~~a~~~l~~~~~~~~~~~~ 252 (491)
T 4gc0_A 175 QLLVYCVNYFIARSG-DASWLNTDGWRYMFASECIPALLFLML-LYTVPESPRWLMSRGKQEQAEGILRKIMGNTLATQA 252 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHTTS-CTTTTTTTHHHHHHHTTHHHHHHHHHH-GGGSCCCHHHHHHTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred hhhhhhcchhhcccc-ccccccchhhHHHhhhhhhhhhhhhhh-hhcCCCChHHHHHcCchhHHHHhHHHhcCCchhHHH
Confidence 877766554443221 111122346888888887766655443 3344555431100000000 000
Q ss_pred CCChh---------HHHHHhhhchhHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHhcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhh
Q 037413 265 TDKFP---------KVLWYAITNYRTWIFVLLYGMSLG-IELTIDNVIAEYFFDRFNLKLHTAGVIAATFGMANIFARPL 334 (530)
Q Consensus 265 ~~~~~---------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 334 (530)
..... ......++.++.........+... ....+..+.+ ++.+..+.+.........+.++..+++.++
T Consensus 253 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 331 (491)
T 4gc0_A 253 VQEIKHSLDHGRKTGGRLLMFGVGVIVIGVMLSIFQQFVGINVVLYYAP-EVFKTLGASTDIALLQTIIVGVINLTFTVL 331 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHTTHHHHSCCTHHHHHHHHHHHHHHTCHHHHHHHHH-HHHHHSSCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHhhhhhhhHHHHhcccHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHhcch-HHHHhcCCCccchhhHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 00000 000112223333333333333333 2333344444 444557888888877778888999999999
Q ss_pred hhHhhhhccCCCCCcchhHHHHHHHHHHHHHHHHh----hcCCcHHHHHHHHHHHHHHhhh-hhccccccc-cccccccc
Q 037413 335 GGLMSDMAARPFGMRGRLWNLYIVQTLGGIFCICL----GRASTLPLSILSMILFSITTQA-ACGATFGII-PFISRRSL 408 (530)
Q Consensus 335 ~g~l~dr~~~r~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~----~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~-~~~~~~~~~-~~~~~~~~ 408 (530)
++++.||+|||+ ....+.....++++.+ ......+...+..+++..+.+. ..+..+.+. +.+|++.|
T Consensus 332 ~~~l~dr~Grr~-------~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~E~fPt~~R 404 (491)
T 4gc0_A 332 AIMTVDKFGRKP-------LQIIGALGMAIGMFSLGTAFYTQAPGIVALLSMLFYVAAFAMSWGPVCWVLLSEIFPNAIR 404 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHCSHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTHHHHHHHHHSSCTTTH
T ss_pred HHHHHHhhcCcc-------hhccchHHHHHHHHHHHHHHhcccchHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHhCCHhHH
Confidence 999999999984 3333333333322222 1222333333333333333333 334556665 46677899
Q ss_pred cchhhhhhhhhhHHHHhhhhhhhh
Q 037413 409 GVISGLTGAGGNFGSGLTQLLFFT 432 (530)
Q Consensus 409 g~~~g~~~~~~~~g~~~~~~~~~~ 432 (530)
+++.|+.+.++++++++++.+++.
T Consensus 405 ~~~~g~~~~~~~~~~~i~~~~~p~ 428 (491)
T 4gc0_A 405 GKALAIAVAAQWLANYFVSWTFPM 428 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 999999999999999988887654
No 6
>2cfq_A Lactose permease; transport, transport mechanism, lactose/H+ symport, sugar transport, transmembrane, formylation; 2.95A {Escherichia coli} SCOP: f.38.1.2 PDB: 1pv7_A* 1pv6_A 2cfp_A 2v8n_A 2y5y_A*
Probab=99.97 E-value=1.4e-30 Score=257.25 Aligned_cols=364 Identities=15% Similarity=0.121 Sum_probs=237.2
Q ss_pred HHHHHHHhhhhccccccchHH-HHHhcCCChhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHhhhhCCchhhHHHHHHHHHHH---H
Q 037413 68 SWLSFFTCFVSTFAAAPLVPI-IRDNLNLIKTDIGNAGIASVSGSIFSRLVMGAVCDLLGPRYGCAFLIMLSAPTV---F 143 (530)
Q Consensus 68 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~Grr~~l~~~~~~~~~~~---~ 143 (530)
.....+..+.......+.+|. +++++|++..+.|++.+.+.+++.++++++|+++||+|||++++++..+.+++. +
T Consensus 12 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~g~s~~~~g~~~~~~~~~~~i~~~~~G~lsDr~Grr~~l~~~~~~~~~~~~~~~ 91 (417)
T 2cfq_A 12 FGLFFFFYFFIMGAYFPFFPIWLHDINHISKSDTGIIFAAISLFSLLFQPLFGLLSDKLGLRKYLLWIITGMLVMFAPFF 91 (417)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHTTTCCCTTTSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSTTCCHHHHHHHHTTSCHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 333333444444444556666 567799999999999999999999999999999999999999999888776532 2
Q ss_pred HHHhhhhHH-HHHHHHHHHHhhhhh-hhhHHHHHhhhccC--CcchhhHhHhhhhhhhhhhhHHhHHHHHHHHHHhcCCC
Q 037413 144 SMVFVSSAR-GYIAARFMIGFSLAT-FVSCQYWMSTMFNG--KIIGLVNGTAAGWGNMGGGITQLLTPFIYELIRRAGAT 219 (530)
Q Consensus 144 ~~~~~~~~~-~l~~~r~l~G~~~~~-~~~~~~~i~~~~~~--~~r~~~~~~~~~~~~~G~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~ 219 (530)
...+++... .++..+++.|++.+. ++.....+.++.++ ++++...+......++|..+++.+++.+.+.
T Consensus 92 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~g~~~~~~l~~~l~~~------- 164 (417)
T 2cfq_A 92 IFIFGPLLQYNILVGSIVGGIYLGFCFNAGAPAVEAFIEKVSRRSNFEFGRARMFGCVGWALGASIVGIMFTI------- 164 (417)
T ss_dssp HHTHHHHHHTTCCHHHHGGGSSTTHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHTCCHHHHSSSTTTHHHHHHHHHHHHHHH-------
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhHHHHHHHHHHhhhhcccchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh-------
Confidence 222332221 234556666666553 33333444444432 3567778888888899999999888877653
Q ss_pred CCCchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccCCCCCCccccccCCCCCCCChhHHHHHhhhchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 037413 220 PFTAWRIAFFAPGCLHVIMGILVLTLGQDLPDGNLNTLQKKGDVPTDKFPKVLWYAITNYRTWIFVLLYGMSLGIELTID 299 (530)
Q Consensus 220 ~~~~wr~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~p~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 299 (530)
+||+.|++.+++.++..+..++..||+|+..+++ ++++.+.++...+.+++.+++|+++...+..++....+..+.
T Consensus 165 ---~~~~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 240 (417)
T 2cfq_A 165 ---NNQFVFWLGSGCALILAVLLFFAKTDAPSSATVA-NAVGANHSAFSLKLALELFRQPKLWFLSLYVIGVSCTYDVFD 240 (417)
T ss_dssp ---CSHHHHTTTTTTTTTHHHHSCSSCCCCSCSSCSS-SSSSSCCCCCCHHHHHHHTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred ---chhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCcccccccccc-cccccccccccHHHHHHHhcCCchhhHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 8999999887765444433333223322211000 110111111223456778899998877766555555555666
Q ss_pred HHHHHHHHHhcCC---CHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhHhhhhccCCCCCcchhHHHHHHHHHHHHHHHHhhcCCcHH
Q 037413 300 NVIAEYFFDRFNL---KLHTAGVIAATFGMANIFARPLGGLMSDMAARPFGMRGRLWNLYIVQTLGGIFCICLGRASTLP 376 (530)
Q Consensus 300 ~~~~~~~~~~~g~---~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~~r~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 376 (530)
+++|.|+.+.++. +....+++.++..++.+++.++.++++||++||+ .+..+..+.++.++.+...++.+
T Consensus 241 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~g~~~-------~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 313 (417)
T 2cfq_A 241 QQFANFFTSFFATGEQGTRVFGYVTTMGELLNASIMFFAPLIINRIGGKN-------ALLLAGTIMSVRIIGSSFATSAL 313 (417)
T ss_dssp HHHHHHHHHTSSSHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHTTCCSHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHhccCCChhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHhccHH
Confidence 6788888765542 2345567777778888899999999999999883 44455555555555555556666
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHhhhhhcccccccc-ccccccccchhhhh-hhhhhHHHHhhhhhhhh-ccCCCcchhHHHHHHHH
Q 037413 377 LSILSMILFSITTQAACGATFGIIP-FISRRSLGVISGLT-GAGGNFGSGLTQLLFFT-SSRHSTATGISLMGIMI 449 (530)
Q Consensus 377 ~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~g~~~g~~-~~~~~~g~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~~ 449 (530)
...+..++.+++.+...+..+.+++ ..|++.||++.++. +....+|++++|.+.|. .+..++...+...+++.
T Consensus 314 ~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~p~~~~g~~~g~~~~~~~~lg~~~gp~l~G~l~~~~g~~~~f~~~~~~~ 389 (417)
T 2cfq_A 314 EVVILKTLHMFEVPFLLVGCFKYITSQFEVRFSATIYLVCFCFFKQLAMIFMSVLAGNMYESIGFQGAYLVLGLVA 389 (417)
T ss_dssp HHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHHHTHHHHTHHHHSHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHhhhhHHHHHHhcCcHHHHHHHHHHH
Confidence 5555555566665555555566654 66778899999994 88888999999999887 34444444444434333
No 7
>2xut_A Proton/peptide symporter family protein; transport protein, membrane protein, major facilitator super transporter; 3.62A {Shewanella oneidensis}
Probab=99.96 E-value=5e-28 Score=246.87 Aligned_cols=356 Identities=13% Similarity=0.068 Sum_probs=221.9
Q ss_pred HHHHHHhhhhccccccch-HHHHHhcC------CChhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHhhhh-CCchhhHHHHHHHHH
Q 037413 69 WLSFFTCFVSTFAAAPLV-PIIRDNLN------LIKTDIGNAGIASVSGSIFSRLVMGAVCDLL-GPRYGCAFLIMLSAP 140 (530)
Q Consensus 69 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~------~s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~-Grr~~l~~~~~~~~~ 140 (530)
++..+......+...+.+ +.+.+++| ++..+.+++.+++.++..++.+++|+++||+ |||+++.++.++.++
T Consensus 18 ~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~l~~~~~~~~~~~~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~G~l~dr~~g~r~~~~~~~~~~~~ 97 (524)
T 2xut_A 18 IASEACERFSFYGMRNILTPFLMTALLLSIPEELRGAVAKDVFHSFVIGVYFFPLLGGWIADRFFGKYNTILWLSLIYCV 97 (524)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCSSCCSSSTTTTTHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHTTSSCSHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccccccccCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchHHHHHHHHHHHH
Confidence 333333333433333334 45778899 9999999999999999999999999999999 999999999999999
Q ss_pred HHHHHHhhh-hHHHHHHHHHHHHhhhhh-hhhHHHHHhhhccCCcchhhHhH---hhhhhhhhhhhHHhHHHHHHHHHHh
Q 037413 141 TVFSMVFVS-SARGYIAARFMIGFSLAT-FVSCQYWMSTMFNGKIIGLVNGT---AAGWGNMGGGITQLLTPFIYELIRR 215 (530)
Q Consensus 141 ~~~~~~~~~-~~~~l~~~r~l~G~~~~~-~~~~~~~i~~~~~~~~r~~~~~~---~~~~~~~G~~~~~~~~~~l~~~~~~ 215 (530)
+.++.++++ +++.++++|+++|++.+. .+...+++.|++|+++|+++.+. .....++|..+++.+++.+.+..
T Consensus 98 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~g~~~~~~l~~~~-- 175 (524)
T 2xut_A 98 GHAFLAIFEHSVQGFYTGLFLIALGSGGIKPLVSSFMGDQFDQSNKSLAQKAFDMFYFTINFGSFFASLSMPLLLKNF-- 175 (524)
T ss_dssp HHHHHHHTSSCHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHTCSTTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSTHHHHTS--
T ss_pred HHHHHHHhcccHHHHHHHHHHHHHhccccchhHHHHHHHHcCccchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccc--
Confidence 999999999 999999999999999996 78889999999999999876666 88888899988888877776543
Q ss_pred cCCCCCCchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccCCCCCCccccccCCC--------CCCCChhHH----------------
Q 037413 216 AGATPFTAWRIAFFAPGCLHVIMGILVLTLGQDLPDGNLNTLQKKGD--------VPTDKFPKV---------------- 271 (530)
Q Consensus 216 ~~~~~~~~wr~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~p~~~~~~~~~~~~--------~~~~~~~~~---------------- 271 (530)
+||++|++.+++.++..++.++..++.++.+.++....+. +++....+.
T Consensus 176 -------g~~~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 248 (524)
T 2xut_A 176 -------GAAVAFGIPGVLMFVATVFFWLGRKRYIHMPPEPKDPHGFLPVIRSALLTKVEGKGNIGLVLALIGGVSAAYA 248 (524)
T ss_dssp -------CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSSSCCCCC--------------------CTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHT
T ss_pred -------cHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcccccccCCCCccchhHHHHHHHHHhhhhcccCccchhhhhhhhhhhhhh
Confidence 9999999998887766555444333222111100000000 000000000
Q ss_pred -------------------------------HH---------HhhhchhHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 037413 272 -------------------------------LW---------YAITNYRTWIFVLLYGM---SLGIELTIDNVIAEYFFD 308 (530)
Q Consensus 272 -------------------------------~~---------~~~~~~~~~~~~~~~~~---~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 308 (530)
.. .....++.+........ .+..+......++.+..+
T Consensus 249 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 328 (524)
T 2xut_A 249 LVNIPTLGIVAGLCCAMVLVMGFVGAGASLQLERARKSHPDAAVDGVRSVLRILVLFALVTPFWSLFDQKASTWILQAND 328 (524)
T ss_dssp GGGTTTTCSSHHHHHHHHHHHHHHHTGGGTHHHHSCCSCCSSSSTTTTTHHHHHHHHTTSHHHHTTTSSTTTHHHHHHHH
T ss_pred hcccchhhhhhhhhhhhhhhhcccccchhhHHhhhhccccHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccchhhHHhHHh
Confidence 00 00011222212111111 111111111123333222
Q ss_pred hcCCCH-HHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhHhh-hhccCCCCCcchhHHHHHHHHHHHHHHHHhhcC---------CcHHH
Q 037413 309 RFNLKL-HTAGVIAATFGMANIFARPLGGLMS-DMAARPFGMRGRLWNLYIVQTLGGIFCICLGRA---------STLPL 377 (530)
Q Consensus 309 ~~g~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~-dr~~~r~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~---------~~~~~ 377 (530)
.+.+. ...+.+.....++.+++..+.+++. ++.+||.........+.++..+.+++++++... .+.+.
T Consensus 329 -~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 407 (524)
T 2xut_A 329 -MVKPQWFEPAMMQALNPLLVMLLIPFNNFVLYPAIERMGVKLTALRKMGAGIAITGLSWIVVGTIQLMMDGGSALSIFW 407 (524)
T ss_dssp -SCCCSSSCHHHHHTTSGGGHHHHGGGTTTC------------CCHHHHHTHHHHHHHHHHTTTTTTTTTTTTCCCCSHH
T ss_pred -cCCCeeecHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHhhhHHHHHhcCCCCChHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCCCcCHHH
Confidence 23221 1244444444444444455555443 222222100112233445555555555554432 35556
Q ss_pred HHHHHHHHHHHhhhhhccccccc-cccccccccchhhhhhhhhhHHHHhhhhhhhhcc
Q 037413 378 SILSMILFSITTQAACGATFGII-PFISRRSLGVISGLTGAGGNFGSGLTQLLFFTSS 434 (530)
Q Consensus 378 ~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~g~~~g~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~ 434 (530)
..+..++.+++.+...+..+.++ +..|++.||+++|+.+...++|+.++|.+.+...
T Consensus 408 ~~~~~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~p~~~~g~~~g~~~~~~~~g~~~g~~~~g~~~ 465 (524)
T 2xut_A 408 QILPYALLTFGEVLVSATGLEFAYSQAPKAMKGTIMSFWTLSVTVGNLWVLLANVSVK 465 (524)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTHHHHCCTTCCTTTHHHHGGGHHHHHHHHHHHHHHTT
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCcHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhc
Confidence 66777888888888888888875 4677889999999999999999999999988743
No 8
>1pw4_A Glycerol-3-phosphate transporter; transmembrane, inner membrane, major facilitator superfamily, secondary active membrane transporter; 3.30A {Escherichia coli} SCOP: f.38.1.1
Probab=99.51 E-value=8.8e-14 Score=138.52 Aligned_cols=173 Identities=12% Similarity=0.135 Sum_probs=139.8
Q ss_pred HHHHHHHHHHhhhhccccccchHHHHHh-cCCChhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHhhhh--CCchhhHHHHHHHH-H
Q 037413 65 FHLSWLSFFTCFVSTFAAAPLVPIIRDN-LNLIKTDIGNAGIASVSGSIFSRLVMGAVCDLL--GPRYGCAFLIMLSA-P 140 (530)
Q Consensus 65 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~--Grr~~l~~~~~~~~-~ 140 (530)
+....+..+.............|.+.++ +|.+..+.+++.+...++..++.++.|++.||+ |||+.+.++.++.. +
T Consensus 254 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 333 (451)
T 1pw4_A 254 LWYIAIANVFVYLLRYGILDWSPTYLKEVKHFALDKSSWAYFLYEYAGIPGTLLCGWMSDKVFRGNRGATGVFFMTLVTI 333 (451)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHBTTBSCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSTTCHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCchhHHHHHHHHHHH
Confidence 3334444444444444455566665555 899999999999999999999999999999999 99999988887776 6
Q ss_pred HHHHHHhh--hhHHHHHHHHHHHHhhhhh-hhhHHHHHhhhccCCcchhhHhHhhhhhhh-hhhhHHhHHHHHHHHHHhc
Q 037413 141 TVFSMVFV--SSARGYIAARFMIGFSLAT-FVSCQYWMSTMFNGKIIGLVNGTAAGWGNM-GGGITQLLTPFIYELIRRA 216 (530)
Q Consensus 141 ~~~~~~~~--~~~~~l~~~r~l~G~~~~~-~~~~~~~i~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~-G~~~~~~~~~~l~~~~~~~ 216 (530)
+.++..+. .+.+.+++..++.|++.+. .+....++.|.+|+++|++++|+.+....+ |..+++.+.+.+.+..
T Consensus 334 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~g~l~~~~--- 410 (451)
T 1pw4_A 334 ATIVYWMNPAGNPTVDMICMIVIGFLIYGPVMLIGLHALELAPKKAAGTAAGFTGLFGYLGGSVAASAIVGYTVDFF--- 410 (451)
T ss_dssp HHHHTTSCCTTCHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHTSCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSS---
T ss_pred HHHHHHHhcccCHHHHHHHHHHHHHHHhchHHHHHHHHHHHhchhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhc---
Confidence 66666665 4788888888999998885 677789999999999999999999999999 9999998888877654
Q ss_pred CCCCCCchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhc
Q 037413 217 GATPFTAWRIAFFAPGCLHVIMGILVLTLG 246 (530)
Q Consensus 217 ~~~~~~~wr~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 246 (530)
||+..|++.+++.++..++.++..
T Consensus 411 ------g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 434 (451)
T 1pw4_A 411 ------GWDGGFMVMIGGSILAVILLIVVM 434 (451)
T ss_dssp ------CSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred ------CcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 899999999988887777666653
No 9
>4aps_A DI-OR tripeptide H+ symporter; transport protein, peptide transport, major facilitator SUPE transporter, MFS; 3.30A {Streptococcus thermophilus}
Probab=99.40 E-value=4.6e-12 Score=127.58 Aligned_cols=169 Identities=14% Similarity=0.055 Sum_probs=136.6
Q ss_pred hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh-----cCCCHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhHhhhh-ccCCCCCcchh
Q 037413 279 YRTWIFVLLYGMSLGIELTIDNVIAEYFFDR-----FNLKLHTAGVIAATFGMANIFARPLGGLMSDM-AARPFGMRGRL 352 (530)
Q Consensus 279 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-----~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr-~~~r~~~~~~~ 352 (530)
+.++...+..++....++....+++.|+.+. +|.+..+.+++.+...++..++.++.|+++|| +|||
T Consensus 13 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~g~r------- 85 (491)
T 4aps_A 13 LGLSTLFMTEMWERFSYYGMRAILLYYMWFLISTGDLHITRATAASIMAIYASMVYLSGTIGGFVADRIIGAR------- 85 (491)
T ss_dssp THHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCCSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCHH-------
T ss_pred hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccchhhcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccccch-------
Confidence 3566666667777777788888999999988 99999999999999999999999999999999 8998
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHhhcCCcHHHHHHHHHHHHHHhhhhhcccccccc-cccccc--ccchhhhhhhhhhHHHHhhhhh
Q 037413 353 WNLYIVQTLGGIFCICLGRASTLPLSILSMILFSITTQAACGATFGIIP-FISRRS--LGVISGLTGAGGNFGSGLTQLL 429 (530)
Q Consensus 353 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~--~g~~~g~~~~~~~~g~~~~~~~ 429 (530)
..+..+.++.+++.++....++.+.+++..++.|++.+...+...+++. .+++++ |+.+.++.+...++|..++|.+
T Consensus 86 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~ 165 (491)
T 4aps_A 86 PAVFWGGVLIMLGHIVLALPFGASALFGSIILIIIGTGFLKPNVSTLVGTLYDEHDRRRDAGFSIFVFGINLGAFIAPLI 165 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHSCCSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhccchHHHHHHHHcCcccccceeeehHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 3677777777777777777888888888888999999888888888855 566766 7778888999999999999999
Q ss_pred hhh-ccCCCcchhHHHHHHHHHHHHH
Q 037413 430 FFT-SSRHSTATGISLMGIMIVCCTF 454 (530)
Q Consensus 430 ~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 454 (530)
.+. .+..++...+...++..+++.+
T Consensus 166 ~~~l~~~~g~~~~f~~~~~~~~~~~~ 191 (491)
T 4aps_A 166 VGAAQEAAGYHVAFSLAAIGMFIGLL 191 (491)
T ss_dssp HHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 877 4456666666665544444433
No 10
>3o7q_A L-fucose-proton symporter; transporter, multi-PASS membrane protei transport protein; HET: BNG; 3.14A {Escherichia coli} PDB: 3o7p_A*
Probab=99.37 E-value=7.6e-12 Score=123.92 Aligned_cols=146 Identities=11% Similarity=0.066 Sum_probs=119.6
Q ss_pred ccccchHHH--HHhcCCChhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHhhhhCCchhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHHHHHH
Q 037413 81 AAAPLVPII--RDNLNLIKTDIGNAGIASVSGSIFSRLVMGAVCDLLGPRYGCAFLIMLSAPTVFSMVFVSSARGYIAAR 158 (530)
Q Consensus 81 ~~~~~~~~~--~~~~~~s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~Grr~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~r 158 (530)
......|.+ ++.+|.+..+.+++.+.+.++..++.++.|++.||+|||+++.++.++.+++.++..+.++.+.++..
T Consensus 276 ~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~~r~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~- 354 (438)
T 3o7q_A 276 ACWSYLIRYAVEEIPGMTAGFAANYLTGTMVCFFIGRFTGTWLISRFAPHKVLAAYALIAMALCLISAFAGGHVGLIAL- 354 (438)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHSTTCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH-
T ss_pred HHHHHHHHHhhhccCCcchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCcHHHHHH-
Confidence 333344544 45569999999999999999999999999999999999999999999999999998888887765554
Q ss_pred HHHHhhhhh-hhhHHHHHhhhccCCcchhhHhHhhhhhhhhhhhHHhHHHHHHHHHHhcCCCCCCc-hhHHHHHHHHHHH
Q 037413 159 FMIGFSLAT-FVSCQYWMSTMFNGKIIGLVNGTAAGWGNMGGGITQLLTPFIYELIRRAGATPFTA-WRIAFFAPGCLHV 236 (530)
Q Consensus 159 ~l~G~~~~~-~~~~~~~i~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~G~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~-wr~~f~~~~~~~~ 236 (530)
++.|++.+. ++....+..|.+|++ ++.+.++.. ...+|..+++.+.+.+.+.. | ++..|++.++..+
T Consensus 355 ~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~-~~~~g~~~~~~~~g~l~~~~---------g~~~~~~~~~~~~~~ 423 (438)
T 3o7q_A 355 TLCSAFMSIQYPTIFSLGIKNLGQD-TKYGSSFIV-MTIIGGGIVTPVMGFVSDAA---------GNIPTAELIPALCFA 423 (438)
T ss_dssp HHHHHHHTTHHHHHHHHHHSSCGGG-HHHHHHHHH-HTTHHHHHHHHHHHHHHHHH---------TSSGGGGHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhcccc-ccchhhHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHh---------cchHHHHHHHHHHHH
Confidence 888888885 788888889999865 888888776 56689999998888888876 7 8999887765544
Q ss_pred HH
Q 037413 237 IM 238 (530)
Q Consensus 237 ~~ 238 (530)
+.
T Consensus 424 ~~ 425 (438)
T 3o7q_A 424 VI 425 (438)
T ss_dssp HH
T ss_pred HH
Confidence 43
No 11
>2cfq_A Lactose permease; transport, transport mechanism, lactose/H+ symport, sugar transport, transmembrane, formylation; 2.95A {Escherichia coli} SCOP: f.38.1.2 PDB: 1pv7_A* 1pv6_A 2cfp_A 2v8n_A 2y5y_A*
Probab=99.35 E-value=5.8e-12 Score=123.85 Aligned_cols=143 Identities=10% Similarity=0.124 Sum_probs=120.6
Q ss_pred hhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHhhhhCCchhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHHHHHHHHHHhhhhh-hhhHHHHH
Q 037413 97 KTDIGNAGIASVSGSIFSRLVMGAVCDLLGPRYGCAFLIMLSAPTVFSMVFVSSARGYIAARFMIGFSLAT-FVSCQYWM 175 (530)
Q Consensus 97 ~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~Grr~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~r~l~G~~~~~-~~~~~~~i 175 (530)
..+.+++.++..++..++.++.|++.||+|||+++..+.++.+++.++.++.++.+.+++..++.+++.+. .+....++
T Consensus 258 ~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~g~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~ 337 (417)
T 2cfq_A 258 TRVFGYVTTMGELLNASIMFFAPLIINRIGGKNALLLAGTIMSVRIIGSSFATSALEVVILKTLHMFEVPFLLVGCFKYI 337 (417)
T ss_dssp THHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCSHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 44567888888888899999999999999999999999999888888888888888888888888888775 56667899
Q ss_pred hhhccCCcchhhHhH-hhhhhhhhhhhHHhHHHHHHHHHHhcCCCCCCchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccC
Q 037413 176 STMFNGKIIGLVNGT-AAGWGNMGGGITQLLTPFIYELIRRAGATPFTAWRIAFFAPGCLHVIMGILVLTLGQD 248 (530)
Q Consensus 176 ~~~~~~~~r~~~~~~-~~~~~~~G~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~wr~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 248 (530)
.|.+|++.|+.+.++ ++....+|..++|.+++.+.+.. |++..|.+.+++.++..++.++..++
T Consensus 338 ~~~~p~~~~g~~~g~~~~~~~~lg~~~gp~l~G~l~~~~---------g~~~~f~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~ 402 (417)
T 2cfq_A 338 TSQFEVRFSATIYLVCFCFFKQLAMIFMSVLAGNMYESI---------GFQGAYLVLGLVALGFTLISVFTLSG 402 (417)
T ss_dssp HHHSCHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHHHTHHHHTHHHHS---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSSCC
T ss_pred HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHhhhhHHHHHHhc---------CcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhcC
Confidence 999999999999998 47788899999999888887754 78999999888888777766665554
No 12
>4gc0_A D-xylose-proton symporter; MFS, transport protein; HET: 6BG BNG; 2.60A {Escherichia coli} PDB: 4gbz_A* 4gby_A*
Probab=99.34 E-value=3e-11 Score=121.59 Aligned_cols=185 Identities=13% Similarity=0.069 Sum_probs=132.2
Q ss_pred HHHHHHHHHhhhhccccccchHHHHHhcCCChhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHhhhhCCchhhHHHHHHHHHHHHHH
Q 037413 66 HLSWLSFFTCFVSTFAAAPLVPIIRDNLNLIKTDIGNAGIASVSGSIFSRLVMGAVCDLLGPRYGCAFLIMLSAPTVFSM 145 (530)
Q Consensus 66 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~s~~~~~~~~s~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~Grr~~l~~~~~~~~~~~~~~ 145 (530)
.......+........+....+.+.+..+.+..+.........+...++.++.+++.||+|||+.++.+....+++.+..
T Consensus 280 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~dr~Grr~~~~~~~~~~~~~~~~l 359 (491)
T 4gc0_A 280 IGVMLSIFQQFVGINVVLYYAPEVFKTLGASTDIALLQTIIVGVINLTFTVLAIMTVDKFGRKPLQIIGALGMAIGMFSL 359 (491)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHTCHHHHHHHHHHHHHHSSCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCSHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHhhhhHHHhcchHHHHhcCCCccchhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhcCcchhccchHHHHHHHHHH
Confidence 33333333333334444455677888888888888888888888999999999999999999999999998888877766
Q ss_pred Hhh----hhHHHHHHHHHH--HHhhhhhhhhHHHHHhhhccCCcchhhHhHhhhhhhhhhhhHHhHHHHHHHHHHhcCCC
Q 037413 146 VFV----SSARGYIAARFM--IGFSLATFVSCQYWMSTMFNGKIIGLVNGTAAGWGNMGGGITQLLTPFIYELIRRAGAT 219 (530)
Q Consensus 146 ~~~----~~~~~l~~~r~l--~G~~~~~~~~~~~~i~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~G~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~ 219 (530)
+.. .+.+..++.-++ .+.+.+..+....+.+|.+|.+.|+.++|+......+|..+++.+.|.+.......
T Consensus 360 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~E~fPt~~R~~~~g~~~~~~~~~~~i~~~~~p~l~~~~~~~--- 436 (491)
T 4gc0_A 360 GTAFYTQAPGIVALLSMLFYVAAFAMSWGPVCWVLLSEIFPNAIRGKALAIAVAAQWLANYFVSWTFPMMDKNSWLV--- 436 (491)
T ss_dssp HHHHHTTCCHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTHHHHHHHHHSSCTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHCHHHHHH---
T ss_pred HHHHhcccchHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHhCCHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---
Confidence 543 122222222222 23333335667789999999999999999999999999999888877764432100
Q ss_pred CCCchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccCCCCCC
Q 037413 220 PFTAWRIAFFAPGCLHVIMGILVLTLGQDLPDGN 253 (530)
Q Consensus 220 ~~~~wr~~f~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~p~~~ 253 (530)
...++.+.|++.++++++..++.++++||+..+.
T Consensus 437 ~~~~~~~~~~i~~~~~~~~~i~~~~~~PETkg~t 470 (491)
T 4gc0_A 437 AHFHNGFSYWIYGCMGVLAALFMWKFVPETKGKT 470 (491)
T ss_dssp HHHTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCTTCC
T ss_pred hhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHheecCCCCCC
Confidence 0115678899999999999998888887765543
No 13
>2xut_A Proton/peptide symporter family protein; transport protein, membrane protein, major facilitator super transporter; 3.62A {Shewanella oneidensis}
Probab=99.26 E-value=6.4e-11 Score=120.21 Aligned_cols=163 Identities=11% Similarity=0.065 Sum_probs=128.9
Q ss_pred hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcC------CCHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhHhhhhc-cCCCCCcch
Q 037413 279 YRTWIFVLLYGMSLGIELTIDNVIAEYFFDRFN------LKLHTAGVIAATFGMANIFARPLGGLMSDMA-ARPFGMRGR 351 (530)
Q Consensus 279 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~-~~r~~~~~~ 351 (530)
+.+|.+.+..++....++....+++.|+.+.+| .+..+.+++.+...++..++.++.|+++||+ |||+
T Consensus 12 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~l~~~~~~~~~~~~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~G~l~dr~~g~r~----- 86 (524)
T 2xut_A 12 RQIPYIIASEACERFSFYGMRNILTPFLMTALLLSIPEELRGAVAKDVFHSFVIGVYFFPLLGGWIADRFFGKYN----- 86 (524)
T ss_dssp -CCTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCSSCCSSSTTTTTHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHTTSSCSHH-----
T ss_pred cHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccccccccCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchH-----
Confidence 456666677777777777888899999998889 9999999999999999999999999999999 9983
Q ss_pred hHHHHHHHHHHHHHHHHhhcCC-cHHHHHHHHHHHHHHhhhhhcccccccc-ccccccccchhhh---hhhhhhHHHHhh
Q 037413 352 LWNLYIVQTLGGIFCICLGRAS-TLPLSILSMILFSITTQAACGATFGIIP-FISRRSLGVISGL---TGAGGNFGSGLT 426 (530)
Q Consensus 352 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~g~~~g~---~~~~~~~g~~~~ 426 (530)
.+.++.++.+++.++....+ +.+..++..++.|++.+...+...+++. .+++++|++..+. .+...++|..++
T Consensus 87 --~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~g 164 (524)
T 2xut_A 87 --TILWLSLIYCVGHAFLAIFEHSVQGFYTGLFLIALGSGGIKPLVSSFMGDQFDQSNKSLAQKAFDMFYFTINFGSFFA 164 (524)
T ss_dssp --HHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSCHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHTCSTTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred --HHHHHHHHHHHHHHHHHHhcccHHHHHHHHHHHHHhccccchhHHHHHHHHcCccchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 56666666667666666666 8888888888899999888888888854 6677888766666 888889999999
Q ss_pred hhhhhh-ccCCCcchhHHHHHHH
Q 037413 427 QLLFFT-SSRHSTATGISLMGIM 448 (530)
Q Consensus 427 ~~~~~~-~~~~~~~~~~~~~~~~ 448 (530)
|.+.+. .+..++...+...+++
T Consensus 165 ~~~~~~l~~~~g~~~~f~~~~~~ 187 (524)
T 2xut_A 165 SLSMPLLLKNFGAAVAFGIPGVL 187 (524)
T ss_dssp HHTSTHHHHTSCHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHhccccHHHHHHHHHHH
Confidence 999776 4445555555544444
No 14
>2gfp_A EMRD, multidrug resistance protein D; membrane protein, multidrug transporter; 3.50A {Escherichia coli}
Probab=99.18 E-value=7.5e-11 Score=114.16 Aligned_cols=141 Identities=14% Similarity=0.070 Sum_probs=109.5
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhHhhhhccCCCCCcchhHHHHHHHHHHH
Q 037413 284 FVLLYGMSLGIELTIDNVIAEYFFDRFNLKLHTAGVIAATFGMANIFARPLGGLMSDMAARPFGMRGRLWNLYIVQTLGG 363 (530)
Q Consensus 284 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~~~r~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 363 (530)
+.+..++.......+...+|.+ .+.+|.+..+.+++.+...++..++.++.|+++||+|||+ .+..+..+..
T Consensus 5 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~g~s~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~~~g~l~dr~g~r~-------~~~~~~~~~~ 76 (375)
T 2gfp_A 5 LVLLVAVGQMAQTIYIPAIADM-ARDLNVREGAVQSVMGAYLLTYGVSQLFYGPISDRVGRRP-------VILVGMSIFM 76 (375)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HTTSSSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHTTSCCCC-------CCHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHH-HHHcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCCch-------hHHHHHHHHH
Confidence 3444444444555555566654 4558999999999999999999999999999999999986 3334455555
Q ss_pred HHHHHhhcCCcHHHHHHHHHHHHHHhhhhhcccccccc-ccccccccchhhhhhhhhhHHHHhhhhhhhh
Q 037413 364 IFCICLGRASTLPLSILSMILFSITTQAACGATFGIIP-FISRRSLGVISGLTGAGGNFGSGLTQLLFFT 432 (530)
Q Consensus 364 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~~~~g~~~g~~~~~~~~g~~~~~~~~~~ 432 (530)
+..++....++.+..++..++.|++.+...+...+++. ..++++|+++.++.+....+|..++|.+.+.
T Consensus 77 ~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~l~g~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~~~~~~~~ 146 (375)
T 2gfp_A 77 LATLVAVTTSSLTVLIAASAMQGMGTGVGGVMARTLPRDLYERTQLRHANSLLNMGILVSPLLAPLIGGL 146 (375)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSCCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHhccHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHH
Confidence 55555555567777888888889998888888888755 5677899999999999999999999999877
No 15
>2jln_A MHP1; hydantoin, transporter, membrane protein, nucleobase-cation-symport-1 family; 2.85A {Microbacterium liquefaciens} PDB: 2jlo_A* 2x79_A
Probab=57.09 E-value=62 Score=31.66 Aligned_cols=57 Identities=16% Similarity=-0.055 Sum_probs=26.8
Q ss_pred ccCCcc-hhhHhHhhhhhhhhhhhHHh-HHHHHHHHHHhcCCCCCCchhHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q 037413 179 FNGKII-GLVNGTAAGWGNMGGGITQL-LTPFIYELIRRAGATPFTAWRIAFFAPGCLHVIMGILVLT 244 (530)
Q Consensus 179 ~~~~~r-~~~~~~~~~~~~~G~~~~~~-~~~~l~~~~~~~~~~~~~~wr~~f~~~~~~~~~~~~~~~~ 244 (530)
.|+++| .....+...+.+....++.+ +++.+.. +. +|...++...+-.++..++..+
T Consensus 20 vp~~~R~~~~~~~~~~W~g~~~~i~~~~~Ga~~~~--------GL-s~~~a~lai~lG~li~~~~~~l 78 (501)
T 2jln_A 20 TRYAERSVGPFSLAAIWFAMAIQVAIFIAAGQMTS--------SF-QVWQVIVAIAAGCTIAVILLFF 78 (501)
T ss_dssp CCGGGCCBCHHHHHHHHHHHHCSTHHHHHHHHHTT--------TS-CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred CChhhCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhc--------Cc-CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 455566 44555554444444444443 2222211 11 6777776555555554444433
No 16
>2g9p_A Antimicrobial peptide latarcin 2A; helix-hinge-helix, antimicrobial protein; NMR {Synthetic}
Probab=50.37 E-value=6.8 Score=19.13 Aligned_cols=14 Identities=14% Similarity=0.297 Sum_probs=11.1
Q ss_pred hhHHHhhhhCCchh
Q 037413 117 VMGAVCDLLGPRYG 130 (530)
Q Consensus 117 ~~g~l~dr~Grr~~ 130 (530)
+.|.+..+||||.+
T Consensus 2 lfgklikkfgrkai 15 (26)
T 2g9p_A 2 LFGKLIKKFGRKAI 15 (26)
T ss_dssp HHHHHHHHHTSHHH
T ss_pred cHHHHHHHHhHHHH
Confidence 36889999999854
No 17
>2knc_A Integrin alpha-IIB; transmembrane signaling, protein structure, cell A cleavage on PAIR of basic residues, disease mutation, disul bond, glycoprotein; NMR {Homo sapiens}
Probab=42.67 E-value=15 Score=23.01 Aligned_cols=15 Identities=7% Similarity=-0.119 Sum_probs=5.7
Q ss_pred hHHHHHHHHHHHHHH
Q 037413 441 GISLMGIMIVCCTFP 455 (530)
Q Consensus 441 ~~~~~~~~~~~~~~~ 455 (530)
.++......+.+.++
T Consensus 11 p~wiIi~svl~GLll 25 (54)
T 2knc_A 11 PIWWVLVGVLGGLLL 25 (54)
T ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred chHHHHHHHHHHHHH
Confidence 344333333333333
Done!