Query psy10468
Match_columns 365
No_of_seqs 252 out of 2372
Neff 10.5
Searched_HMMs 29240
Date Fri Aug 16 18:59:08 2013
Command hhsearch -i /work/01045/syshi/Psyhhblits/psy10468.a3m -d /work/01045/syshi/HHdatabase/pdb70.hhm -o /work/01045/syshi/hhsearch_pdb/10468hhsearch_pdb -cpu 12 -v 0
No Hit Prob E-value P-value Score SS Cols Query HMM Template HMM
1 4f4c_A Multidrug resistance pr 99.9 2.7E-24 9.3E-29 221.7 30.7 189 165-353 795-985 (1321)
2 3qf4_B Uncharacterized ABC tra 99.9 8.6E-22 2.9E-26 188.4 26.1 225 3-358 47-271 (598)
3 3b5x_A Lipid A export ATP-bind 99.9 2.5E-21 8.6E-26 184.9 27.9 227 3-360 35-261 (582)
4 3qf4_A ABC transporter, ATP-bi 99.9 2.2E-21 7.5E-26 185.1 25.7 224 3-357 33-256 (587)
5 3b60_A Lipid A export ATP-bind 99.9 3.5E-21 1.2E-25 183.9 25.7 226 3-359 35-260 (582)
6 2yl4_A ATP-binding cassette SU 99.9 7.5E-21 2.6E-25 182.1 26.3 228 3-358 29-256 (595)
7 4a82_A Cystic fibrosis transme 99.9 2.2E-21 7.4E-26 185.1 21.9 228 3-358 24-255 (578)
8 3g5u_A MCG1178, multidrug resi 99.9 2.5E-20 8.4E-25 192.0 23.8 233 3-358 58-302 (1284)
9 4f4c_A Multidrug resistance pr 99.8 4.4E-19 1.5E-23 183.2 23.3 195 165-359 137-331 (1321)
10 3g5u_A MCG1178, multidrug resi 99.8 2.5E-16 8.5E-21 162.4 26.7 231 3-358 715-945 (1284)
11 3b60_A Lipid A export ATP-bind 98.7 1.2E-06 4.1E-11 83.6 18.6 148 43-198 71-320 (582)
12 3b5x_A Lipid A export ATP-bind 98.7 1.2E-06 4.1E-11 83.6 18.2 153 42-198 70-320 (582)
13 3qf4_B Uncharacterized ABC tra 98.6 1E-06 3.6E-11 84.2 17.4 152 39-198 79-332 (598)
14 3qf4_A ABC transporter, ATP-bi 98.6 2.1E-06 7.1E-11 81.9 19.2 155 40-198 66-318 (587)
15 2yl4_A ATP-binding cassette SU 98.6 2E-06 6.9E-11 82.3 18.8 153 42-198 67-317 (595)
16 4a82_A Cystic fibrosis transme 98.6 1.4E-06 4.9E-11 82.9 17.7 151 40-198 64-316 (578)
No 1
>4f4c_A Multidrug resistance protein PGP-1; ABC transporter, ATPase, multi-drug transporter, exporter, A binding, hydrolase,protein transport; HET: NDG NAG BMA MAN 0SA; 3.40A {Caenorhabditis elegans}
Probab=99.94 E-value=2.7e-24 Score=221.72 Aligned_cols=189 Identities=22% Similarity=0.332 Sum_probs=169.6
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchhcccc--cCccchhhhhhhhHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 165 FLVSTQMIQRSMAQMSLLFGSYIKGLSSGARIFQLRCQLFESILKQDIAFFDS--TRTGELVDRLTTDVQEFKSSFKLVV 242 (365)
Q Consensus 165 ~~~~~~~~~~~l~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~kll~~~~~~~~~--~~~g~l~~~~~~d~~~i~~~~~~~~ 242 (365)
++.+++.++..+..+..++..+.....+.+...++|.++++++++.|++||+. +++|++++|+++|++.++..+...+
T Consensus 795 ~~~~~~~~l~~~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~il~~~~~ffd~~~~~~G~i~~r~s~D~~~i~~~l~~~l 874 (1321)
T 4f4c_A 795 FWALMFLVLAAAQGICSFLMTFFMGIASESLTRDLRNKLFRNVLSQHIGFFDSPQNASGKISTRLATDVPNLRTAIDFRF 874 (1321)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCSSSTTSGGGCHHHHHHHHHTHHHHHHTTTSHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCchhhccCCCChHHHHhcchhhHHHHHHHHHHHH
Confidence 34555666677788889999999999999999999999999999999999986 6789999999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHhhHhHHHHHHHHHHHHhHHHHHhcchHhHhhhcCc
Q psy10468 243 SQGLRNGAQVIGAVSSLLIISPSLTLGMLGIVPIVIISGTFIGSLLRSLSREAQNQAAKAVTIGEEAISNIRTVRAFAME 322 (365)
Q Consensus 243 ~~~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~lv~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~ik~~~~~ 322 (365)
..++..++.+++.++++++.+|+++++++++.|+..+......++.++...+..+..++......|.++|+++||+|+.|
T Consensus 875 ~~~~~~~~~~i~~~~~~~~~~~~l~lv~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~tIra~~~e 954 (1321)
T 4f4c_A 875 STVITTLVSMVAGIGLAFFYGWQMALLIIAILPIVAFGQYLRGRRFTGKNVKSASEFADSGKIAIEAIENVRTVQALARE 954 (1321)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCCSSCSTTTSSHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHTTTH
T ss_pred HHHHHHhhhHHHHeeeehHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHhccch
Confidence 99999999999999999999999999999999999998888888888888888888899999999999999999999999
Q ss_pred hHHHHHhhHHhHHHHHHHhHhhHHhHHHHHH
Q psy10468 323 PYEVRLFTDQVSLSCTLQERLGVGVGMFQAG 353 (365)
Q Consensus 323 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 353 (365)
+.+.++|.+..++..+...+..........+
T Consensus 955 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 985 (1321)
T 4f4c_A 955 DTFYENFCEKLDIPHKEAIKEAFIQGLSYGC 985 (1321)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 9999999999999988888766665544443
No 2
>3qf4_B Uncharacterized ABC transporter ATP-binding prote TM_0288; multidrug transporter, transport protein; HET: ANP; 2.90A {Thermotoga maritima}
Probab=99.90 E-value=8.6e-22 Score=188.44 Aligned_cols=225 Identities=20% Similarity=0.296 Sum_probs=193.4
Q ss_pred hHHHHHHhHHHHHHHHHHHHhhhcccCchhhhhhHhHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 3 LLVAFINIQLPLYLGNIINILAKFTQDSTAQLSFMSEMKEPALKLVGLYVAQSVFTCVYISLLSGLGERIAAKLRCQLFE 82 (365)
Q Consensus 3 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~~~~ 82 (365)
++.+++.+..|++++.++|.+..+. +.+.++.++..+++..++..++.++..++..+.+.++..++|.++++
T Consensus 47 ~~~~~~~~~~p~~~~~~id~~~~~~--------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~ 118 (598)
T 3qf4_B 47 TVSSILGVLSPYLIGKTIDVVFVPR--------RFDLLPRYMLILGTIYALTSLLFWLQGKIMLTLSQDVVFRLRKELFE 118 (598)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTT--------CGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccC--------CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 4566778889999999999987531 33456667777888888899999999999999999999999999999
Q ss_pred HHhcCccccccccccchhhhhhhhhHHhhhhhhHHHHHHHHHhhcccccHHHHHHHHHHHHHHHhhcccccccccchhhH
Q psy10468 83 SILKQDIAFFDSTRTGELVDSAKPNIKNKLNPIHNHVIRMITGAFRSSPLNSIHAESMVLGTLYFGGHLMASNTLTAGDL 162 (365)
Q Consensus 83 ~i~~~~~~~f~~~~~g~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~~~~~~~l 162 (365)
|++++|++||+++
T Consensus 119 ~ll~~~~~~~~~~------------------------------------------------------------------- 131 (598)
T 3qf4_B 119 KLQRVPVGFFDRT------------------------------------------------------------------- 131 (598)
T ss_dssp HHHHSCTHHHHHS-------------------------------------------------------------------
T ss_pred HHHCCCHHHHcCC-------------------------------------------------------------------
Confidence 9666655555554
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchhcccccCccchhhhhhhhHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 163 MSFLVSTQMIQRSMAQMSLLFGSYIKGLSSGARIFQLRCQLFESILKQDIAFFDSTRTGELVDRLTTDVQEFKSSFKLVV 242 (365)
Q Consensus 163 ~~~~~~~~~~~~~l~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~kll~~~~~~~~~~~~g~l~~~~~~d~~~i~~~~~~~~ 242 (365)
++|++++++++|++.+++.+...+
T Consensus 132 --------------------------------------------------------~~G~l~~r~~~D~~~i~~~~~~~~ 155 (598)
T 3qf4_B 132 --------------------------------------------------------PHGDIISRVINDVDNINNVLGNSI 155 (598)
T ss_dssp --------------------------------------------------------CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHH
T ss_pred --------------------------------------------------------CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 556666677778889999888888
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHhhHhHHHHHHHHHHHHhHHHHHhcchHhHhhhcCc
Q psy10468 243 SQGLRNGAQVIGAVSSLLIISPSLTLGMLGIVPIVIISGTFIGSLLRSLSREAQNQAAKAVTIGEEAISNIRTVRAFAME 322 (365)
Q Consensus 243 ~~~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~lv~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~ik~~~~~ 322 (365)
..++.+++.+++.++++++++|++++++++..|+.+++...+.++.++..++.++..++.++.+.|.++|+++||+||.|
T Consensus 156 ~~~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~l~~l~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~Ik~~~~e 235 (598)
T 3qf4_B 156 IQFFSGIVTLAGAVIMMFRVNVILSLVTLSIVPLTVLITQIVSSQTRKYFYENQRVLGQLNGIIEEDISGLTVIKLFTRE 235 (598)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHTTCH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCHHHHHHcCCh
Confidence 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred hHHHHHhhHHhHHHHHHHhHhhHHhHHHHHHHHHHh
Q psy10468 323 PYEVRLFTDQVSLSCTLQERLGVGVGMFQAGTNLFL 358 (365)
Q Consensus 323 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 358 (365)
+.+.++|++..++..+...+..........+.+++.
T Consensus 236 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 271 (598)
T 3qf4_B 236 EKEMEKFDRVNESLRKVGTKAQIFSGVLPPLMNMVN 271 (598)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 999999999999999998888777766665554443
No 3
>3b5x_A Lipid A export ATP-binding/permease protein MSBA; ABC transporter, lipid flippase, hydrolase, inner membrane, lipid transport, membrane; 5.50A {Vibrio cholerae}
Probab=99.90 E-value=2.5e-21 Score=184.91 Aligned_cols=227 Identities=17% Similarity=0.239 Sum_probs=190.0
Q ss_pred hHHHHHHhHHHHHHHHHHHHhhhcccCchhhhhhHhHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 3 LLVAFINIQLPLYLGNIINILAKFTQDSTAQLSFMSEMKEPALKLVGLYVAQSVFTCVYISLLSGLGERIAAKLRCQLFE 82 (365)
Q Consensus 3 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~~~~ 82 (365)
++.++..+..|++++.++|.+.... +...++..+..+++..++..++.++..++..+.+.++..++|.++++
T Consensus 35 ~~~~~~~~~~~~~~~~~id~~~~~~--------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~ 106 (582)
T 3b5x_A 35 VINAAADTYMISLLKPLLDEGFGNA--------ESNFLRILPFMILGLMFVRGLSGFASSYCLSWVSGNVVMQMRRRLFN 106 (582)
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccC--------chHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 4556677888999999999886421 12333444445666778888999999999999999999999999999
Q ss_pred HHhcCccccccccccchhhhhhhhhHHhhhhhhHHHHHHHHHhhcccccHHHHHHHHHHHHHHHhhcccccccccchhhH
Q psy10468 83 SILKQDIAFFDSTRTGELVDSAKPNIKNKLNPIHNHVIRMITGAFRSSPLNSIHAESMVLGTLYFGGHLMASNTLTAGDL 162 (365)
Q Consensus 83 ~i~~~~~~~f~~~~~g~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~~~~~~~l 162 (365)
|++++|++||+
T Consensus 107 ~ll~~~~~~~~--------------------------------------------------------------------- 117 (582)
T 3b5x_A 107 HFMHMPVRFFD--------------------------------------------------------------------- 117 (582)
T ss_pred HHHcCCHHHHC---------------------------------------------------------------------
Confidence 95555555555
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchhcccccCccchhhhhhhhHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 163 MSFLVSTQMIQRSMAQMSLLFGSYIKGLSSGARIFQLRCQLFESILKQDIAFFDSTRTGELVDRLTTDVQEFKSSFKLVV 242 (365)
Q Consensus 163 ~~~~~~~~~~~~~l~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~kll~~~~~~~~~~~~g~l~~~~~~d~~~i~~~~~~~~ 242 (365)
++++|++++++++|++.+++.+...+
T Consensus 118 ------------------------------------------------------~~~~g~l~~rl~~d~~~i~~~~~~~~ 143 (582)
T 3b5x_A 118 ------------------------------------------------------QESTGGLLSRITYDSEQVAGATSRAL 143 (582)
T ss_pred ------------------------------------------------------CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 44556666777778889998888888
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHhhHhHHHHHHHHHHHHhHHHHHhcchHhHhhhcCc
Q psy10468 243 SQGLRNGAQVIGAVSSLLIISPSLTLGMLGIVPIVIISGTFIGSLLRSLSREAQNQAAKAVTIGEEAISNIRTVRAFAME 322 (365)
Q Consensus 243 ~~~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~lv~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~ik~~~~~ 322 (365)
..++.+++.+++.++++++++|++++++++..|+..++...+.++.++..++.++..++..+.+.|.++|+++||+|+.|
T Consensus 144 ~~~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~li~l~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~Ik~~~~e 223 (582)
T 3b5x_A 144 VSIVREGASIIGLLTLMFWNSWQLSLVLIVVAPVVAFAISFVSKRFRKISRNMQTAMGHVTSSAEQMLKGHKVVLSYGGQ 223 (582)
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHcCCc
Confidence 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred hHHHHHhhHHhHHHHHHHhHhhHHhHHHHHHHHHHhcc
Q psy10468 323 PYEVRLFTDQVSLSCTLQERLGVGVGMFQAGTNLFLNG 360 (365)
Q Consensus 323 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 360 (365)
+.+.++|++..++..+...+..+.......+.+++..+
T Consensus 224 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 261 (582)
T 3b5x_A 224 EVERKRFDKVSNSMRQQTMKLVSAQSIADPVIQMIASL 261 (582)
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 99999999999999999999888877777666655443
No 4
>3qf4_A ABC transporter, ATP-binding protein; multidrug transporter, transport protein; HET: ANP; 2.90A {Thermotoga maritima}
Probab=99.89 E-value=2.2e-21 Score=185.09 Aligned_cols=224 Identities=17% Similarity=0.172 Sum_probs=188.9
Q ss_pred hHHHHHHhHHHHHHHHHHHHhhhcccCchhhhhhHhHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 3 LLVAFINIQLPLYLGNIINILAKFTQDSTAQLSFMSEMKEPALKLVGLYVAQSVFTCVYISLLSGLGERIAAKLRCQLFE 82 (365)
Q Consensus 3 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~~~~ 82 (365)
++.+++.+..|++++.++|.+... .+.+.++.+...+++..++..++.++..++..+.++++..++|.++++
T Consensus 33 ~~~~~~~~~~p~~~~~~id~~~~~--------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~ 104 (587)
T 3qf4_A 33 VVEVICDLSQPTLLARIVDEGIAR--------GDFSLVLKTGILMLIVALIGAVGGIGCTVFASYASQNFGADLRRDLFR 104 (587)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTT--------TCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcc--------CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 455667788899999999988653 134556667777777788888999999999999999999999999999
Q ss_pred HHhcCccccccccccchhhhhhhhhHHhhhhhhHHHHHHHHHhhcccccHHHHHHHHHHHHHHHhhcccccccccchhhH
Q psy10468 83 SILKQDIAFFDSTRTGELVDSAKPNIKNKLNPIHNHVIRMITGAFRSSPLNSIHAESMVLGTLYFGGHLMASNTLTAGDL 162 (365)
Q Consensus 83 ~i~~~~~~~f~~~~~g~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~~~~~~~l 162 (365)
|++++|++||+
T Consensus 105 ~ll~~~~~~~~--------------------------------------------------------------------- 115 (587)
T 3qf4_A 105 KVLSFSISNVN--------------------------------------------------------------------- 115 (587)
T ss_dssp HHHHCCHHHHH---------------------------------------------------------------------
T ss_pred HHHCCCHHHHc---------------------------------------------------------------------
Confidence 95555555555
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchhcccccCccchhhhhhhhHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 163 MSFLVSTQMIQRSMAQMSLLFGSYIKGLSSGARIFQLRCQLFESILKQDIAFFDSTRTGELVDRLTTDVQEFKSSFKLVV 242 (365)
Q Consensus 163 ~~~~~~~~~~~~~l~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~kll~~~~~~~~~~~~g~l~~~~~~d~~~i~~~~~~~~ 242 (365)
+.++|++++++++|++.+++.+...+
T Consensus 116 ------------------------------------------------------~~~~G~l~~r~~~D~~~i~~~~~~~~ 141 (587)
T 3qf4_A 116 ------------------------------------------------------RFHTSSLITRLTNDVTQLQNLVMMLL 141 (587)
T ss_dssp ------------------------------------------------------HSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT
T ss_pred ------------------------------------------------------cCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 44556666667777888888888878
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHhhHhHHHHHHHHHHHHhHHHHHhcchHhHhhhcCc
Q psy10468 243 SQGLRNGAQVIGAVSSLLIISPSLTLGMLGIVPIVIISGTFIGSLLRSLSREAQNQAAKAVTIGEEAISNIRTVRAFAME 322 (365)
Q Consensus 243 ~~~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~lv~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~ik~~~~~ 322 (365)
..++..++.++++++++++++|++++++++..|+..++...+.++.++..++.++..++.++.+.|.++|+++||+|+.|
T Consensus 142 ~~~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~l~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~Ik~~~~e 221 (587)
T 3qf4_A 142 RIVVRAPLLFVGGIVMAVSINVKLSSVLIFLIPPIVLLFVWLTKKGNPLFRKIQESTDEVNRVVRENLLGVRVVRAFRRE 221 (587)
T ss_dssp THHHHHHHHHHHHHHHHHHHCTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHTTCH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHhcch
Confidence 88888888899999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred hHHHHHhhHHhHHHHHHHhHhhHHhHHHHHHHHHH
Q psy10468 323 PYEVRLFTDQVSLSCTLQERLGVGVGMFQAGTNLF 357 (365)
Q Consensus 323 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 357 (365)
+.+.++|++..++..+...+..........+...+
T Consensus 222 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 256 (587)
T 3qf4_A 222 EYENENFRKANESLRRSIISAFSLIVFALPLFIFI 256 (587)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 99999999999999999888777666655554443
No 5
>3b60_A Lipid A export ATP-binding/permease protein MSBA; ABC transporter, lipid flippase, hydrolase, inner membrane, lipid transport, membrane; HET: ANP; 3.70A {Salmonella typhimurium} SCOP: c.37.1.12 f.37.1.1 PDB: 3b5y_A* 3b5z_A* 3b5w_A
Probab=99.89 E-value=3.5e-21 Score=183.88 Aligned_cols=226 Identities=21% Similarity=0.253 Sum_probs=189.3
Q ss_pred hHHHHHHhHHHHHHHHHHHHhhhcccCchhhhhhHhHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 3 LLVAFINIQLPLYLGNIINILAKFTQDSTAQLSFMSEMKEPALKLVGLYVAQSVFTCVYISLLSGLGERIAAKLRCQLFE 82 (365)
Q Consensus 3 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~~~~ 82 (365)
++.+++.+..|++++.++|.+...+ +...++..+..+++..++..++.++..+...+.+.++..++|.++++
T Consensus 35 ~~~~~~~~~~~~~~~~~id~~~~~~--------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~ 106 (582)
T 3b60_A 35 ILNAASDTFMLSLLKPLLDDGFGKT--------DRSVLLWMPLVVIGLMILRGITSYISSYCISWVSGKVVMTMRRRLFG 106 (582)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHTHHHHSSTTST--------THHHHHHSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccC--------chHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 4456667788999999999876421 12333344445666777888999999999999999999999999999
Q ss_pred HHhcCccccccccccchhhhhhhhhHHhhhhhhHHHHHHHHHhhcccccHHHHHHHHHHHHHHHhhcccccccccchhhH
Q psy10468 83 SILKQDIAFFDSTRTGELVDSAKPNIKNKLNPIHNHVIRMITGAFRSSPLNSIHAESMVLGTLYFGGHLMASNTLTAGDL 162 (365)
Q Consensus 83 ~i~~~~~~~f~~~~~g~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~~~~~~~l 162 (365)
|++++|++||+++
T Consensus 107 ~l~~~~~~~~~~~------------------------------------------------------------------- 119 (582)
T 3b60_A 107 HMMGMPVAFFDKQ------------------------------------------------------------------- 119 (582)
T ss_dssp HHHTCCSTHHHHS-------------------------------------------------------------------
T ss_pred HHHcCCHHHHCCC-------------------------------------------------------------------
Confidence 9666666666655
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchhcccccCccchhhhhhhhHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 163 MSFLVSTQMIQRSMAQMSLLFGSYIKGLSSGARIFQLRCQLFESILKQDIAFFDSTRTGELVDRLTTDVQEFKSSFKLVV 242 (365)
Q Consensus 163 ~~~~~~~~~~~~~l~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~kll~~~~~~~~~~~~g~l~~~~~~d~~~i~~~~~~~~ 242 (365)
++|++++++++|++.+++.+...+
T Consensus 120 --------------------------------------------------------~~g~l~~r~~~d~~~i~~~~~~~~ 143 (582)
T 3b60_A 120 --------------------------------------------------------STGTLLSRITYDSEQVASSSSGAL 143 (582)
T ss_dssp --------------------------------------------------------CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred --------------------------------------------------------ChhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 455556666677888988888888
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHhhHhHHHHHHHHHHHHhHHHHHhcchHhHhhhcCc
Q psy10468 243 SQGLRNGAQVIGAVSSLLIISPSLTLGMLGIVPIVIISGTFIGSLLRSLSREAQNQAAKAVTIGEEAISNIRTVRAFAME 322 (365)
Q Consensus 243 ~~~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~lv~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~ik~~~~~ 322 (365)
..++..++.+++.++++++++|++++++++..|+..++...+.++.++..++.++..++..+.+.|.++|+++||+|+.|
T Consensus 144 ~~~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~li~l~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~Ik~~~~e 223 (582)
T 3b60_A 144 ITVVREGASIIGLFIMMFYYSWQLSIILVVLAPIVSIAIRVVSKRFRSISKNMQNTMGQVTTSAEQMLKGHKEVLIFGGQ 223 (582)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHTCH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHhCcC
Confidence 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred hHHHHHhhHHhHHHHHHHhHhhHHhHHHHHHHHHHhc
Q psy10468 323 PYEVRLFTDQVSLSCTLQERLGVGVGMFQAGTNLFLN 359 (365)
Q Consensus 323 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 359 (365)
+.+.++|++..++..+...+..+.......+..++..
T Consensus 224 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 260 (582)
T 3b60_A 224 EVETKRFDKVSNKMRLQGMKMVSASSISDPIIQLIAS 260 (582)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 9999999999999999999988877777766665543
No 6
>2yl4_A ATP-binding cassette SUB-family B member 10, mitochondrial; membrane protein, mitochondrial transport; HET: ACP LMT CDL 14Y; 2.85A {Homo sapiens} PDB: 4aa3_A*
Probab=99.88 E-value=7.5e-21 Score=182.08 Aligned_cols=228 Identities=32% Similarity=0.524 Sum_probs=186.7
Q ss_pred hHHHHHHhHHHHHHHHHHHHhhhcccCchhhhhhHhHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 3 LLVAFINIQLPLYLGNIINILAKFTQDSTAQLSFMSEMKEPALKLVGLYVAQSVFTCVYISLLSGLGERIAAKLRCQLFE 82 (365)
Q Consensus 3 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~~~~ 82 (365)
++.++..+..|++++.++|.+....... ....++.++..+++..++..++.++..+...+.+.++..++|.++++
T Consensus 29 ~~~~~~~~~~p~~~~~~id~~~~~~~~~-----~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~ 103 (595)
T 2yl4_A 29 TMSSVISMSAPFFLGKIIDVIYTNPTVD-----YSDNLTRLCLGLSAVFLCGAAANAIRVYLMQTSGQRIVNRLRTSLFS 103 (595)
T ss_dssp HHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHCTTSC-----CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCchh-----hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 3455667778999999999886532110 11234455555666677778888999999999999999999999999
Q ss_pred HHhcCccccccccccchhhhhhhhhHHhhhhhhHHHHHHHHHhhcccccHHHHHHHHHHHHHHHhhcccccccccchhhH
Q psy10468 83 SILKQDIAFFDSTRTGELVDSAKPNIKNKLNPIHNHVIRMITGAFRSSPLNSIHAESMVLGTLYFGGHLMASNTLTAGDL 162 (365)
Q Consensus 83 ~i~~~~~~~f~~~~~g~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~~~~~~~l 162 (365)
|++++|++||+
T Consensus 104 ~l~~~~~~~~~--------------------------------------------------------------------- 114 (595)
T 2yl4_A 104 SILRQEVAFFD--------------------------------------------------------------------- 114 (595)
T ss_dssp HHHHSCHHHHH---------------------------------------------------------------------
T ss_pred HHHcCCHHHHC---------------------------------------------------------------------
Confidence 95555555555
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchhcccccCccchhhhhhhhHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 163 MSFLVSTQMIQRSMAQMSLLFGSYIKGLSSGARIFQLRCQLFESILKQDIAFFDSTRTGELVDRLTTDVQEFKSSFKLVV 242 (365)
Q Consensus 163 ~~~~~~~~~~~~~l~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~kll~~~~~~~~~~~~g~l~~~~~~d~~~i~~~~~~~~ 242 (365)
++++|++++++++|++.+++.+...+
T Consensus 115 ------------------------------------------------------~~~~g~l~~r~~~d~~~i~~~~~~~~ 140 (595)
T 2yl4_A 115 ------------------------------------------------------KTRTGELINRLSSDTALLGRSVTENL 140 (595)
T ss_dssp ------------------------------------------------------HSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHH
T ss_pred ------------------------------------------------------CCChHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 45556666777778888888888888
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHhhHhHHHHHHHHHHHHhHHHHHhcchHhHhhhcCc
Q psy10468 243 SQGLRNGAQVIGAVSSLLIISPSLTLGMLGIVPIVIISGTFIGSLLRSLSREAQNQAAKAVTIGEEAISNIRTVRAFAME 322 (365)
Q Consensus 243 ~~~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~lv~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~ik~~~~~ 322 (365)
..++..++.+++.++++++++|++++++++..|+..++...+.++.++..++.++..++.++.+.|.++|+++||+|+.|
T Consensus 141 ~~~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~li~l~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~ik~~~~e 220 (595)
T 2yl4_A 141 SDGLRAGAQASVGISMMFFVSPNLATFVLSVVPPVSIIAVIYGRYLRKLTKVTQDSLAQATQLAEERIGNVRTVRAFGKE 220 (595)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHTTCH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHhCcc
Confidence 89999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred hHHHHHhhHHhHHHHHHHhHhhHHhHHHHHHHHHHh
Q psy10468 323 PYEVRLFTDQVSLSCTLQERLGVGVGMFQAGTNLFL 358 (365)
Q Consensus 323 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 358 (365)
+.+.++|++..++..+...+..........+..++.
T Consensus 221 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 256 (595)
T 2yl4_A 221 MTEIEKYASKVDHVMQLARKEAFARAGFFGATGLSG 256 (595)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 999999999999999998888777766665555443
No 7
>4a82_A Cystic fibrosis transmembrane conductance regulat; CFTR, ION channel, transport protein, casse protein; 2.00A {Homo sapiens} PDB: 2onj_A* 2hyd_A
Probab=99.88 E-value=2.2e-21 Score=185.08 Aligned_cols=228 Identities=18% Similarity=0.197 Sum_probs=189.7
Q ss_pred hHHHHHHhHHHHHHHHHHHHhhhcccCchhhhhhHhHh----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 3 LLVAFINIQLPLYLGNIINILAKFTQDSTAQLSFMSEM----KEPALKLVGLYVAQSVFTCVYISLLSGLGERIAAKLRC 78 (365)
Q Consensus 3 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~----~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~ 78 (365)
++.+++.+..|++++.++|.+....... ..+.+ +.++..+++..+++.++.++..+...+.+.++..++|.
T Consensus 24 ~~~~~~~~~~p~~~~~~id~~~~~~~~~-----~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~ 98 (578)
T 4a82_A 24 IIKFGIPMLIPLLIKYAIDGVINNHALT-----TDEKVHHLTIAIGIALFIFVIVRPPIEFIRQYLAQWTSNKILYDIRK 98 (578)
T ss_dssp HTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCSSCC-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCch-----hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 3455677888999999999987643211 12222 45566667777888899999999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHhcCccccccccccchhhhhhhhhHHhhhhhhHHHHHHHHHhhcccccHHHHHHHHHHHHHHHhhcccccccccc
Q psy10468 79 QLFESILKQDIAFFDSTRTGELVDSAKPNIKNKLNPIHNHVIRMITGAFRSSPLNSIHAESMVLGTLYFGGHLMASNTLT 158 (365)
Q Consensus 79 ~~~~~i~~~~~~~f~~~~~g~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~~~~ 158 (365)
++++|++++|++||+++
T Consensus 99 ~l~~~ll~~~~~~~~~~--------------------------------------------------------------- 115 (578)
T 4a82_A 99 KLYNHLQALSARFYANN--------------------------------------------------------------- 115 (578)
T ss_dssp HHHHHHHHSCHHHHHTS---------------------------------------------------------------
T ss_pred HHHHHHHCCCHHHHcCC---------------------------------------------------------------
Confidence 99999665555555554
Q ss_pred hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchhcccccCccchhhhhhhhHHHHHHHH
Q psy10468 159 AGDLMSFLVSTQMIQRSMAQMSLLFGSYIKGLSSGARIFQLRCQLFESILKQDIAFFDSTRTGELVDRLTTDVQEFKSSF 238 (365)
Q Consensus 159 ~~~l~~~~~~~~~~~~~l~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~kll~~~~~~~~~~~~g~l~~~~~~d~~~i~~~~ 238 (365)
++|++++++++|++.+++.+
T Consensus 116 ------------------------------------------------------------~~G~l~~r~~~D~~~i~~~~ 135 (578)
T 4a82_A 116 ------------------------------------------------------------QVGQVISRVINDVEQTKDFI 135 (578)
T ss_dssp ------------------------------------------------------------CHHHHHHHHHHHHHHTHHHH
T ss_pred ------------------------------------------------------------ChHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 55566666667788888877
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHhhHhHHHHHHHHHHHHhHHHHHhcchHhHhh
Q psy10468 239 KLVVSQGLRNGAQVIGAVSSLLIISPSLTLGMLGIVPIVIISGTFIGSLLRSLSREAQNQAAKAVTIGEEAISNIRTVRA 318 (365)
Q Consensus 239 ~~~~~~~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~lv~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~ik~ 318 (365)
...+..++.+++.++++++++++++|++++++++..|+..++...+.++.++..++.++..++..+.+.|.++|+++||+
T Consensus 136 ~~~~~~~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~l~~l~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~ik~ 215 (578)
T 4a82_A 136 LTGLMNIWLDCITIIIALSIMFFLDVKLTLAALFIFPFYILTVYVFFGRLRKLTRERSQALAEVQGFLHERVQGISVVKS 215 (578)
T ss_dssp HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCTTTHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHH
Confidence 77777788888899999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred hcCchHHHHHhhHHhHHHHHHHhHhhHHhHHHHHHHHHHh
Q psy10468 319 FAMEPYEVRLFTDQVSLSCTLQERLGVGVGMFQAGTNLFL 358 (365)
Q Consensus 319 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 358 (365)
|+.|+.+.++|++..++..+...+..++......+...+.
T Consensus 216 ~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 255 (578)
T 4a82_A 216 FAIEDNEAKNFDKKNTNFLTRALKHTRWNAYSFAAINTVT 255 (578)
T ss_dssp TTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred hcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 9999999999999999999999988888777776665544
No 8
>3g5u_A MCG1178, multidrug resistance protein 1A; P-glycoprotein, PGP, cyclic peptide, membrane protein; 3.80A {Mus musculus} PDB: 3g61_A* 3g60_A*
Probab=99.86 E-value=2.5e-20 Score=191.96 Aligned_cols=233 Identities=21% Similarity=0.289 Sum_probs=194.4
Q ss_pred hHHHHHHhHHHHHHHHHHHHhhhccc------Cch------hhhhhHhHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 3 LLVAFINIQLPLYLGNIINILAKFTQ------DST------AQLSFMSEMKEPALKLVGLYVAQSVFTCVYISLLSGLGE 70 (365)
Q Consensus 3 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~------~~~------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 70 (365)
++.++..+..|++++.++|.+..... ... ......+.+..++..++++.++..++.+++.++..+.++
T Consensus 58 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 137 (1284)
T 3g5u_A 58 IIHGVALPLMMLIFGDMTDSFASVGNVSKNSTNMSEADKRAMFAKLEEEMTTYAYYYTGIGAGVLIVAYIQVSFWCLAAG 137 (1284)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCSSCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhccccccccccccccccccchhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 45566778889999999998764321 000 000123456667788888889999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHhcCccccccccccchhhhhhhhhHHhhhhhhHHHHHHHHHhhcccccHHHHHHHHHHHHHHHhhcc
Q psy10468 71 RIAAKLRCQLFESILKQDIAFFDSTRTGELVDSAKPNIKNKLNPIHNHVIRMITGAFRSSPLNSIHAESMVLGTLYFGGH 150 (365)
Q Consensus 71 ~~~~~lr~~~~~~i~~~~~~~f~~~~~g~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 150 (365)
++.+++|.+++++++++|++|||++++|
T Consensus 138 ~~~~~lr~~l~~~l~~~~~~~f~~~~~G---------------------------------------------------- 165 (1284)
T 3g5u_A 138 RQIHKIRQKFFHAIMNQEIGWFDVHDVG---------------------------------------------------- 165 (1284)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHTTSTTHHHHSCCSH----------------------------------------------------
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHcCCHHHHccCCHH----------------------------------------------------
Confidence 9999999999999777777777766555
Q ss_pred cccccccchhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchhcccccCccchhhhhhhh
Q psy10468 151 LMASNTLTAGDLMSFLVSTQMIQRSMAQMSLLFGSYIKGLSSGARIFQLRCQLFESILKQDIAFFDSTRTGELVDRLTTD 230 (365)
Q Consensus 151 ~v~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~l~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~kll~~~~~~~~~~~~g~l~~~~~~d 230 (365)
++++|+++|
T Consensus 166 -----------------------------------------------------------------------~l~sr~~~D 174 (1284)
T 3g5u_A 166 -----------------------------------------------------------------------ELNTRLTDD 174 (1284)
T ss_dssp -----------------------------------------------------------------------HHHHHHHHH
T ss_pred -----------------------------------------------------------------------HHHHHHHHH
Confidence 555566667
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHhhHhHHHHHHHHHHHHhHHHHHh
Q psy10468 231 VQEFKSSFKLVVSQGLRNGAQVIGAVSSLLIISPSLTLGMLGIVPIVIISGTFIGSLLRSLSREAQNQAAKAVTIGEEAI 310 (365)
Q Consensus 231 ~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~lv~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l 310 (365)
++.+++.+...+..++..++.+++.++++++++|++++++++..|+..++...+.+..++..++.++..++.++.+.|.+
T Consensus 175 ~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~i~~~~~~~~~~~~l~l~~l~~~p~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~E~l 254 (1284)
T 3g5u_A 175 VSKINEGIGDKIGMFFQAMATFFGGFIIGFTRGWKLTLVILAISPVLGLSAGIWAKILSSFTDKELHAYAKAGAVAEEVL 254 (1284)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTCCC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 88888888888999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred cchHhHhhhcCchHHHHHhhHHhHHHHHHHhHhhHHhHHHHHHHHHHh
Q psy10468 311 SNIRTVRAFAMEPYEVRLFTDQVSLSCTLQERLGVGVGMFQAGTNLFL 358 (365)
Q Consensus 311 ~gi~~ik~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 358 (365)
+|+++||+|+.|+.+.++|++..++..+...+.........++..++.
T Consensus 255 ~gi~~ikaf~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 302 (1284)
T 3g5u_A 255 AAIRTVIAFGGQKKELERYNNNLEEAKRLGIKKAITANISMGAAFLLI 302 (1284)
T ss_dssp CCHHHHHTTCCCCSHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HCHHHHHHhcchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 999999999999999999999999999998888777776666555444
No 9
>4f4c_A Multidrug resistance protein PGP-1; ABC transporter, ATPase, multi-drug transporter, exporter, A binding, hydrolase,protein transport; HET: NDG NAG BMA MAN 0SA; 3.40A {Caenorhabditis elegans}
Probab=99.83 E-value=4.4e-19 Score=183.17 Aligned_cols=195 Identities=22% Similarity=0.189 Sum_probs=178.5
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchhcccccCccchhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 165 FLVSTQMIQRSMAQMSLLFGSYIKGLSSGARIFQLRCQLFESILKQDIAFFDSTRTGELVDRLTTDVQEFKSSFKLVVSQ 244 (365)
Q Consensus 165 ~~~~~~~~~~~l~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~kll~~~~~~~~~~~~g~l~~~~~~d~~~i~~~~~~~~~~ 244 (365)
.+.+.+.+..+...+..++..++....+.+...++|.++|+|++++|++||+++++|++++++++|++.+++.+...+..
T Consensus 137 ~~~~~~~~l~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~lR~~~~~~ll~~~~~~fd~~~~G~l~sr~~~D~~~i~~~~~~~l~~ 216 (1321)
T 4f4c_A 137 NVVWSYAAMTVGMWAAGQITVTCYLYVAEQMNNRLRREFVKSILRQEISWFDTNHSGTLATKLFDNLERVKEGTGDKIGM 216 (1321)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSCHHHHHHTCCTTHHHHHHHHHHHHHHTSSHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCChHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 34445555666777888899999999999999999999999999999999999999999999999999999999888999
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHhhHhHHHHHHHHHHHHhHHHHHhcchHhHhhhcCchH
Q psy10468 245 GLRNGAQVIGAVSSLLIISPSLTLGMLGIVPIVIISGTFIGSLLRSLSREAQNQAAKAVTIGEEAISNIRTVRAFAMEPY 324 (365)
Q Consensus 245 ~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~lv~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~ik~~~~~~~ 324 (365)
++..++.++++++++++++|++++++++.+|+..++...+.++.++..++.++..++.++.+.|.++|+++||+|+.|+.
T Consensus 217 ~~~~~~~~i~~~i~~~~~~~~l~lv~l~~~p~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~ik~~~~e~~ 296 (1321)
T 4f4c_A 217 AFQYLSQFITGFIVAFTHSWQLTLVMLAVTPIQALCGFAIAKSMSTFAIRETLRYAKAGKVVEETISSIRTVVSLNGLRY 296 (1321)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHTTCHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHhcccHH
Confidence 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred HHHHhhHHhHHHHHHHhHhhHHhHHHHHHHHHHhc
Q psy10468 325 EVRLFTDQVSLSCTLQERLGVGVGMFQAGTNLFLN 359 (365)
Q Consensus 325 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 359 (365)
+.++|++..++..+...+.........+...++..
T Consensus 297 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 331 (1321)
T 4f4c_A 297 ELERYSTAVEEAKKAGVLKGLFLGISFGAMQASNF 331 (1321)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 99999999999999998888777776666555443
No 10
>3g5u_A MCG1178, multidrug resistance protein 1A; P-glycoprotein, PGP, cyclic peptide, membrane protein; 3.80A {Mus musculus} PDB: 3g61_A* 3g60_A*
Probab=99.75 E-value=2.5e-16 Score=162.36 Aligned_cols=231 Identities=20% Similarity=0.251 Sum_probs=189.5
Q ss_pred hHHHHHHhHHHHHHHHHHHHhhhcccCchhhhhhHhHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 3 LLVAFINIQLPLYLGNIINILAKFTQDSTAQLSFMSEMKEPALKLVGLYVAQSVFTCVYISLLSGLGERIAAKLRCQLFE 82 (365)
Q Consensus 3 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~~~~ 82 (365)
++.+...+..|++++.+++.+...+... ........+...+++..++..++.++..++..+.++++..++|.++++
T Consensus 715 ~~~~~~~~~~~~~~~~~i~~~~~~~~~~----~~~~~~~~~~~~~~~l~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~ 790 (1284)
T 3g5u_A 715 IINGGLQPAFSVIFSKVVGVFTNGGPPE----TQRQNSNLFSLLFLILGIISFITFFLQGFTFGKAGEILTKRLRYMVFK 790 (1284)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSCSTT----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccCcch----hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 3455667778888999998876543311 123445566677777888888899999999999999999999999999
Q ss_pred HHhcCccccccccccchhhhhhhhhHHhhhhhhHHHHHHHHHhhcccccHHHHHHHHHHHHHHHhhcccccccccchhhH
Q psy10468 83 SILKQDIAFFDSTRTGELVDSAKPNIKNKLNPIHNHVIRMITGAFRSSPLNSIHAESMVLGTLYFGGHLMASNTLTAGDL 162 (365)
Q Consensus 83 ~i~~~~~~~f~~~~~g~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~~~~~~~l 162 (365)
+++++|++|||+.
T Consensus 791 ~ll~~~~~ff~~~------------------------------------------------------------------- 803 (1284)
T 3g5u_A 791 SMLRQDVSWFDDP------------------------------------------------------------------- 803 (1284)
T ss_dssp HHHHCCSHHHHSC-------------------------------------------------------------------
T ss_pred HHHcCCHHHHcCC-------------------------------------------------------------------
Confidence 9777777777731
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHhcchhcccccCccchhhhhhhhHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 163 MSFLVSTQMIQRSMAQMSLLFGSYIKGLSSGARIFQLRCQLFESILKQDIAFFDSTRTGELVDRLTTDVQEFKSSFKLVV 242 (365)
Q Consensus 163 ~~~~~~~~~~~~~l~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~kll~~~~~~~~~~~~g~l~~~~~~d~~~i~~~~~~~~ 242 (365)
++++|++.+++++|++.++..+...+
T Consensus 804 ------------------------------------------------------~~~~G~l~~rl~~D~~~i~~~~~~~l 829 (1284)
T 3g5u_A 804 ------------------------------------------------------KNTTGALTTRLANDAAQVKGATGSRL 829 (1284)
T ss_dssp ------------------------------------------------------SCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred ------------------------------------------------------CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 23456666677777888888888888
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHhhHhHHHHHHHHHHHHhHHHHHhcchHhHhhhcCc
Q psy10468 243 SQGLRNGAQVIGAVSSLLIISPSLTLGMLGIVPIVIISGTFIGSLLRSLSREAQNQAAKAVTIGEEAISNIRTVRAFAME 322 (365)
Q Consensus 243 ~~~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~lv~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~ik~~~~~ 322 (365)
..++..++.+++.+++++.++|++++++++..|+.++......+..++...+..+..++..+...|.++|+++||+|+.|
T Consensus 830 ~~~~~~~~~~~~~~i~~~~~~~~l~lv~l~~~p~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~ti~a~~~e 909 (1284)
T 3g5u_A 830 AVIFQNIANLGTGIIISLIYGWQLTLLLLAIVPIIAIAGVVEMKMLSGQALKDKKELEGSGKIATEAIENFRTVVSLTRE 909 (1284)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHSSCSSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCTTTTTCSSH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhccH
Confidence 88899999999999999999999999999999999999999999998888899999999999999999999999999999
Q ss_pred hHHHHHhhHHhHHHHHHHhHhhHHhHHHHHHHHHHh
Q psy10468 323 PYEVRLFTDQVSLSCTLQERLGVGVGMFQAGTNLFL 358 (365)
Q Consensus 323 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 358 (365)
+.+.++|++..+...+...+...+......+.+.+.
T Consensus 910 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 945 (1284)
T 3g5u_A 910 QKFETMYAQSLQIPYRNAMKKAHVFGITFSFTQAMM 945 (1284)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 999999999999988888877776666555554443
No 11
>3b60_A Lipid A export ATP-binding/permease protein MSBA; ABC transporter, lipid flippase, hydrolase, inner membrane, lipid transport, membrane; HET: ANP; 3.70A {Salmonella typhimurium} SCOP: c.37.1.12 f.37.1.1 PDB: 3b5y_A* 3b5z_A* 3b5w_A
Probab=98.67 E-value=1.2e-06 Score=83.56 Aligned_cols=148 Identities=14% Similarity=0.179 Sum_probs=108.3
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HhcCccccccccccchhhhhhhhhHHhhhh-----
Q psy10468 43 PALKLVGLYVAQSVFTCVYISLLSGLGERIAAKLRCQLFES----ILKQDIAFFDSTRTGELVDSAKPNIKNKLN----- 113 (365)
Q Consensus 43 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~~~~~----i~~~~~~~f~~~~~g~l~~~~~~~~~~~~~----- 113 (365)
.+++.++..++.++..+..+....++..+++.++-+++.+. ..+.+.| ++++++++|++...+
T Consensus 71 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~l~~~~~~~~~~~~~g--------~l~~r~~~d~~~i~~~~~~~ 142 (582)
T 3b60_A 71 VIGLMILRGITSYISSYCISWVSGKVVMTMRRRLFGHMMGMPVAFFDKQSTG--------TLLSRITYDSEQVASSSSGA 142 (582)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCCSTHHHHSCHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCHHHHCCCChh--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 45556667777888888888888888888888888777642 2334444 577888888773333
Q ss_pred -----------------------------------------------------------hhHHHHHHHHHh-----hcc-
Q psy10468 114 -----------------------------------------------------------PIHNHVIRMITG-----AFR- 128 (365)
Q Consensus 114 -----------------------------------------------------------~~~~~~~~~~~~-----~~~- 128 (365)
+..+.+.|.++| +|.
T Consensus 143 ~~~~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~li~l~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~Ik~~~~ 222 (582)
T 3b60_A 143 LITVVREGASIIGLFIMMFYYSWQLSIILVVLAPIVSIAIRVVSKRFRSISKNMQNTMGQVTTSAEQMLKGHKEVLIFGG 222 (582)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHTC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHhCc
Confidence 344444444444 110
Q ss_pred ----------------------------cccHHHHHHHHHHHHHHHhhcccccccccchhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 129 ----------------------------SSPLNSIHAESMVLGTLYFGGHLMASNTLTAGDLMSFLVSTQMIQRSMAQMS 180 (365)
Q Consensus 129 ----------------------------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~l~~l~ 180 (365)
..+....+......+++++|++.+..|.++.|.++.+..+...+..++..+.
T Consensus 223 e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~v~~g~lt~g~l~~~~~~~~~~~~pl~~l~ 302 (582)
T 3b60_A 223 QEVETKRFDKVSNKMRLQGMKMVSASSISDPIIQLIASLALAFVLYAASFPSVMDSLTAGTITVVFSSMIALMRPLKSLT 302 (582)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSTTSSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 0134445556667778889999999999999999999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHHHHHhHHHHHHH
Q psy10468 181 LLFGSYIKGLSSGARIFQ 198 (365)
Q Consensus 181 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 198 (365)
.....+.....+.++..+
T Consensus 303 ~~~~~~~~~~~a~~ri~~ 320 (582)
T 3b60_A 303 NVNAQFQRGMAACQTLFA 320 (582)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 999999998888888776
No 12
>3b5x_A Lipid A export ATP-binding/permease protein MSBA; ABC transporter, lipid flippase, hydrolase, inner membrane, lipid transport, membrane; 5.50A {Vibrio cholerae}
Probab=98.65 E-value=1.2e-06 Score=83.56 Aligned_cols=153 Identities=10% Similarity=0.130 Sum_probs=111.2
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCccccccccccchhhhhhhhhHHhhhhhh------
Q psy10468 42 EPALKLVGLYVAQSVFTCVYISLLSGLGERIAAKLRCQLFESILKQDIAFFDSTRTGELVDSAKPNIKNKLNPI------ 115 (365)
Q Consensus 42 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~~~~~i~~~~~~~f~~~~~g~l~~~~~~~~~~~~~~~------ 115 (365)
..+++.++..++.++..+.......++..+++.++-+++.+.=. -.....+ +|++++++++|++...+.+
T Consensus 70 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~-~~~~~~~---~g~l~~rl~~d~~~i~~~~~~~~~~ 145 (582)
T 3b5x_A 70 MILGLMFVRGLSGFASSYCLSWVSGNVVMQMRRRLFNHFMHMPV-RFFDQES---TGGLLSRITYDSEQVAGATSRALVS 145 (582)
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCH-HHHCCCC---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 35556666777788888888888888888888888777765211 1111223 5899999999998444433
Q ss_pred ----------------------------------------------------------HHHHHHHHHh-----hcc----
Q psy10468 116 ----------------------------------------------------------HNHVIRMITG-----AFR---- 128 (365)
Q Consensus 116 ----------------------------------------------------------~~~~~~~~~~-----~~~---- 128 (365)
.+.+.|.++| .|.
T Consensus 146 ~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~li~l~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~Ik~~~~e~~ 225 (582)
T 3b5x_A 146 IVREGASIIGLLTLMFWNSWQLSLVLIVVAPVVAFAISFVSKRFRKISRNMQTAMGHVTSSAEQMLKGHKVVLSYGGQEV 225 (582)
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHcCCcHH
Confidence 3333333333 110
Q ss_pred -------------------------cccHHHHHHHHHHHHHHHhhcccccccccchhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 129 -------------------------SSPLNSIHAESMVLGTLYFGGHLMASNTLTAGDLMSFLVSTQMIQRSMAQMSLLF 183 (365)
Q Consensus 129 -------------------------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~l~~l~~~~ 183 (365)
..+....+......+++++|++.+..|.++.|.++.+..+...+..++..+....
T Consensus 226 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~i~~~g~~~v~~g~lt~g~l~~~~~~~~~~~~pl~~l~~~~ 305 (582)
T 3b5x_A 226 ERKRFDKVSNSMRQQTMKLVSAQSIADPVIQMIASLALFAVLFLASVDSIRAELTPGTFTVVFSAMFGLMRPLKALTSVT 305 (582)
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 0134455556677778889999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHHhHHHHHHH
Q psy10468 184 GSYIKGLSSGARIFQ 198 (365)
Q Consensus 184 ~~~~~~~~~~~~~~~ 198 (365)
..+.....+.+...+
T Consensus 306 ~~~~~~~~a~~ri~~ 320 (582)
T 3b5x_A 306 SEFQRGMAACQTLFG 320 (582)
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 999998888888776
No 13
>3qf4_B Uncharacterized ABC transporter ATP-binding prote TM_0288; multidrug transporter, transport protein; HET: ANP; 2.90A {Thermotoga maritima}
Probab=98.64 E-value=1e-06 Score=84.20 Aligned_cols=152 Identities=17% Similarity=0.189 Sum_probs=112.6
Q ss_pred HhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHhcCccccccccccchhhhhhhhhHHhhh--
Q psy10468 39 EMKEPALKLVGLYVAQSVFTCVYISLLSGLGERIAAKLRCQLFE----SILKQDIAFFDSTRTGELVDSAKPNIKNKL-- 112 (365)
Q Consensus 39 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~~~~----~i~~~~~~~f~~~~~g~l~~~~~~~~~~~~-- 112 (365)
....++++.++..++.++..+.......++..+++.++-+++.+ ...+.+.| ++++|+++|++...
T Consensus 79 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~~~~~~~~G--------~l~~r~~~D~~~i~~~ 150 (598)
T 3qf4_B 79 YMLILGTIYALTSLLFWLQGKIMLTLSQDVVFRLRKELFEKLQRVPVGFFDRTPHG--------DIISRVINDVDNINNV 150 (598)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCTHHHHHSCHH--------HHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHcCCCHH--------HHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 35556666777778888888888888888888888888877765 23344555 57888888887333
Q ss_pred --------------------------------------------------------------hhhHHHHHHHHHh-----
Q psy10468 113 --------------------------------------------------------------NPIHNHVIRMITG----- 125 (365)
Q Consensus 113 --------------------------------------------------------------~~~~~~~~~~~~~----- 125 (365)
++..+.+.|.++|
T Consensus 151 ~~~~~~~~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~l~~l~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~Ik 230 (598)
T 3qf4_B 151 LGNSIIQFFSGIVTLAGAVIMMFRVNVILSLVTLSIVPLTVLITQIVSSQTRKYFYENQRVLGQLNGIIEEDISGLTVIK 230 (598)
T ss_dssp HHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCHHHHH
Confidence 3444445555555
Q ss_pred hcc-----------------------------cccHHHHHHHHHHHHHHHhhcccccccccchhhHHHHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 126 AFR-----------------------------SSPLNSIHAESMVLGTLYFGGHLMASNTLTAGDLMSFLVSTQMIQRSM 176 (365)
Q Consensus 126 ~~~-----------------------------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~l 176 (365)
.|. ..++...+..+...+++++|++.+..+.++.|.++.+..+...+..++
T Consensus 231 ~~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~l~~~g~ls~g~~~~~~~~~~~~~~~l 310 (598)
T 3qf4_B 231 LFTREEKEMEKFDRVNESLRKVGTKAQIFSGVLPPLMNMVNNLGFALISGFGGWLALKDIITVGTIATFIGYSRQFTRPL 310 (598)
T ss_dssp HTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGTSSCHHHHHHHHTTTTSSHHHH
T ss_pred HcCChHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 111 013445555667778889999999999999999999999988899999
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHH
Q psy10468 177 AQMSLLFGSYIKGLSSGARIFQ 198 (365)
Q Consensus 177 ~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 198 (365)
..+...+..+.....+.++..+
T Consensus 311 ~~l~~~~~~~~~~~~s~~ri~~ 332 (598)
T 3qf4_B 311 NELSNQFNMIQMALASAERIFE 332 (598)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 9999999999988888888777
No 14
>3qf4_A ABC transporter, ATP-binding protein; multidrug transporter, transport protein; HET: ANP; 2.90A {Thermotoga maritima}
Probab=98.64 E-value=2.1e-06 Score=81.92 Aligned_cols=155 Identities=17% Similarity=0.223 Sum_probs=110.2
Q ss_pred hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCccccccccccchhhhhhhhhHHh---------
Q psy10468 40 MKEPALKLVGLYVAQSVFTCVYISLLSGLGERIAAKLRCQLFESILKQDIAFFDSTRTGELVDSAKPNIKN--------- 110 (365)
Q Consensus 40 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~~~~~i~~~~~~~f~~~~~g~l~~~~~~~~~~--------- 110 (365)
...++++.++..++.++..+...+...+...+++.++-+++.+. .-......+ +|++++|+++|++.
T Consensus 66 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~-~~~~~~~~~---~G~l~~r~~~D~~~i~~~~~~~~ 141 (587)
T 3qf4_A 66 GILMLIVALIGAVGGIGCTVFASYASQNFGADLRRDLFRKVLSF-SISNVNRFH---TSSLITRLTNDVTQLQNLVMMLL 141 (587)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC-CHHHHHHSC---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC-CHHHHccCC---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 34455555666677777778888888888888888888777542 111112222 68999999999982
Q ss_pred -------------------------------------------------------hhhhhHHHHHHHHHh-----hccc-
Q psy10468 111 -------------------------------------------------------KLNPIHNHVIRMITG-----AFRS- 129 (365)
Q Consensus 111 -------------------------------------------------------~~~~~~~~~~~~~~~-----~~~~- 129 (365)
..++..+.+.|.++| +|..
T Consensus 142 ~~~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~l~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~Ik~~~~e 221 (587)
T 3qf4_A 142 RIVVRAPLLFVGGIVMAVSINVKLSSVLIFLIPPIVLLFVWLTKKGNPLFRKIQESTDEVNRVVRENLLGVRVVRAFRRE 221 (587)
T ss_dssp THHHHHHHHHHHHHHHHHHHCTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHTTCH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHhcch
Confidence 333444555555555 1110
Q ss_pred ----------------------------ccHHHHHHHHHHHHHHHhhcccccccccchhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 130 ----------------------------SPLNSIHAESMVLGTLYFGGHLMASNTLTAGDLMSFLVSTQMIQRSMAQMSL 181 (365)
Q Consensus 130 ----------------------------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~l~~l~~ 181 (365)
.++...+......+++++|++.+..+.++.|.++.+..+...+..++..+..
T Consensus 222 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~vl~~g~~~v~~g~lt~g~~~~~~~~~~~~~~~l~~l~~ 301 (587)
T 3qf4_A 222 EYENENFRKANESLRRSIISAFSLIVFALPLFIFIVNMGMIAVLWFGGVLVRNNQMEIGSIMAYTNYLMQIMFSLMMIGN 301 (587)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCcCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 1234445556677888999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHHHHhHHHHHHH
Q psy10468 182 LFGSYIKGLSSGARIFQ 198 (365)
Q Consensus 182 ~~~~~~~~~~~~~~~~~ 198 (365)
.+..+.....+.++..+
T Consensus 302 ~~~~~~~~~~s~~ri~~ 318 (587)
T 3qf4_A 302 ILNFIVRASASAKRVLE 318 (587)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 99888888877777766
No 15
>2yl4_A ATP-binding cassette SUB-family B member 10, mitochondrial; membrane protein, mitochondrial transport; HET: ACP LMT CDL 14Y; 2.85A {Homo sapiens} PDB: 4aa3_A*
Probab=98.62 E-value=2e-06 Score=82.27 Aligned_cols=153 Identities=21% Similarity=0.279 Sum_probs=106.4
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCccccccccccchhhhhhhhhHHhhhh--------
Q psy10468 42 EPALKLVGLYVAQSVFTCVYISLLSGLGERIAAKLRCQLFESILKQDIAFFDSTRTGELVDSAKPNIKNKLN-------- 113 (365)
Q Consensus 42 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~~~~~i~~~~~~~f~~~~~g~l~~~~~~~~~~~~~-------- 113 (365)
..+++.++..++.++..+.......++..+++.++-+++.+.=. -.....+ +|++++++++|++...+
T Consensus 67 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~l~~~~~-~~~~~~~---~g~l~~r~~~d~~~i~~~~~~~~~~ 142 (595)
T 2yl4_A 67 GLSAVFLCGAAANAIRVYLMQTSGQRIVNRLRTSLFSSILRQEV-AFFDKTR---TGELINRLSSDTALLGRSVTENLSD 142 (595)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCH-HHHHHSC---HHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCH-HHHCCCC---hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 34455555566677777777778888888888777776654211 1111122 58999999999883333
Q ss_pred --------------------------------------------------------hhHHHHHHHHHh-----hccc---
Q psy10468 114 --------------------------------------------------------PIHNHVIRMITG-----AFRS--- 129 (365)
Q Consensus 114 --------------------------------------------------------~~~~~~~~~~~~-----~~~~--- 129 (365)
+..+.+.|.++| .|..
T Consensus 143 ~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~li~l~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~ik~~~~e~~ 222 (595)
T 2yl4_A 143 GLRAGAQASVGISMMFFVSPNLATFVLSVVPPVSIIAVIYGRYLRKLTKVTQDSLAQATQLAEERIGNVRTVRAFGKEMT 222 (595)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHTTCHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHhCccHH
Confidence 344444444444 1110
Q ss_pred --------------------------ccHHHHHHHHHHHHHHHhhcccccccccchhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 130 --------------------------SPLNSIHAESMVLGTLYFGGHLMASNTLTAGDLMSFLVSTQMIQRSMAQMSLLF 183 (365)
Q Consensus 130 --------------------------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~l~~l~~~~ 183 (365)
.+....+......+++++|++.+..|.++.|.++.+..+...+..++..+...+
T Consensus 223 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~v~~g~lt~g~l~~~~~~~~~~~~pl~~l~~~~ 302 (595)
T 2yl4_A 223 EIEKYASKVDHVMQLARKEAFARAGFFGATGLSGNLIVLSVLYKGGLLMGSAHMTVGELSSFLMYAFWVGISIGGLSSFY 302 (595)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 123344455566777889999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHHhHHHHHHH
Q psy10468 184 GSYIKGLSSGARIFQ 198 (365)
Q Consensus 184 ~~~~~~~~~~~~~~~ 198 (365)
..+.....+.+...+
T Consensus 303 ~~~~~~~~s~~ri~~ 317 (595)
T 2yl4_A 303 SELMKGLGAGGRLWE 317 (595)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 999888888877766
No 16
>4a82_A Cystic fibrosis transmembrane conductance regulat; CFTR, ION channel, transport protein, casse protein; 2.00A {Homo sapiens} PDB: 2onj_A* 2hyd_A
Probab=98.62 E-value=1.4e-06 Score=82.94 Aligned_cols=151 Identities=13% Similarity=0.134 Sum_probs=112.3
Q ss_pred hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHhcCccccccccccchhhhhhhhhHH------
Q psy10468 40 MKEPALKLVGLYVAQSVFTCVYISLLSGLGERIAAKLRCQLFE----SILKQDIAFFDSTRTGELVDSAKPNIK------ 109 (365)
Q Consensus 40 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~~~~----~i~~~~~~~f~~~~~g~l~~~~~~~~~------ 109 (365)
....+++.++..++.++..+..+....++..+++.++-+++.+ ...+.+.| ++++|+++|++
T Consensus 64 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~~~~~~~~G--------~l~~r~~~D~~~i~~~~ 135 (578)
T 4a82_A 64 GIALFIFVIVRPPIEFIRQYLAQWTSNKILYDIRKKLYNHLQALSARFYANNQVG--------QVISRVINDVEQTKDFI 135 (578)
T ss_dssp HHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCHHHHHTSCHH--------HHHHHHHHHHHHTHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHcCCChH--------HHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 3445555666777778888888888888888888887777654 23445555 57888888877
Q ss_pred ----------------------------------------------------------hhhhhhHHHHHHHHHh-----h
Q psy10468 110 ----------------------------------------------------------NKLNPIHNHVIRMITG-----A 126 (365)
Q Consensus 110 ----------------------------------------------------------~~~~~~~~~~~~~~~~-----~ 126 (365)
+..++..+.+.|.++| .
T Consensus 136 ~~~~~~~~~~~~~~i~~~~~l~~~~~~l~l~~l~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~~ik~ 215 (578)
T 4a82_A 136 LTGLMNIWLDCITIIIALSIMFFLDVKLTLAALFIFPFYILTVYVFFGRLRKLTRERSQALAEVQGFLHERVQGISVVKS 215 (578)
T ss_dssp HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCTTTHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHH
Confidence 3444566666666666 1
Q ss_pred ccc-----------------------------ccHHHHHHHHHHHHHHHhhcccccccccchhhHHHHHHHHHHHHHHHH
Q psy10468 127 FRS-----------------------------SPLNSIHAESMVLGTLYFGGHLMASNTLTAGDLMSFLVSTQMIQRSMA 177 (365)
Q Consensus 127 ~~~-----------------------------~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~l~ 177 (365)
|.. .+....+......+++++|++.+..+.++.|.++.+..+...+..++.
T Consensus 216 ~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~g~~~v~~g~lt~g~l~~~~~~~~~~~~~l~ 295 (578)
T 4a82_A 216 FAIEDNEAKNFDKKNTNFLTRALKHTRWNAYSFAAINTVTDIGPIIVIGVGAYLAISGSITVGTLAAFVGYLELLFGPLR 295 (578)
T ss_dssp TTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCCHHHHHHHHHTHHHHTTHHH
T ss_pred hcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCcCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 110 134444555667788899999999999999999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHhHHHHHHH
Q psy10468 178 QMSLLFGSYIKGLSSGARIFQ 198 (365)
Q Consensus 178 ~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 198 (365)
.+......+.....+.++..+
T Consensus 296 ~l~~~~~~~~~~~~s~~ri~~ 316 (578)
T 4a82_A 296 RLVASFTTLTQSFASMDRVFQ 316 (578)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 999999999988888888776
Done!