Diaphorina citri psyllid: psy14249

Local Sequence Feature Prediction

Prediction and MethodResult
Residue Number Marker
Protein Sequence ?
Secondary Structure (Consensus) ?
Disordered Region (Consensus) ?
Transmembrane Helix (Consensus) ?
Signal Peptide (Consensus) ?
Coiled Coil (COILS) ?
 
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Function Prediction

Annotation transfered from Closely Related SWISS-PROT Entries ?

Annotation ?Function Description ?Confidence Level ?Reference Protein ?
Transcription factor Sox-17-beta.3 Transcription activator. Doesn't appear to bind to the consensus 5'-AACAAT-3' DNA binding site, but binds 5'-ATTGTT-3'. All of the sox17 proteins are required for embryonic endoderm development and gastrulation movements, and show some redundancy in function. In addition, the sox17 proteins have distinct but overlapping roles in later gut development. Acts downstream of vegt-signaling in endoderm differentiation to induce a range of endodermal genes both directly and indirectly. Also represses wnt-responsive genes to inhibit wnt/beta-catenin-mediated signaling.confidentQ6F2F0
Transcription factor Sox-17-beta.2 Transcription activator. Doesn't appear to bind to the consensus 5'-AACAAT-3' DNA binding site, but binds 5'-ATTGTT-3'. All of the sox17 proteins are required for embryonic endoderm development and gastrulation movements, and show some redundancy in function. In addition, the sox17 proteins have distinct but overlapping roles in later gut development. Acts downstream of vegt-signaling in endoderm differentiation to induce a range of endodermal genes both directly and indirectly. Also represses wnt-responsive genes to inhibit wnt/beta-catenin-mediated signaling.confidentQ6GLH8
Putative transcription factor SOX-15 confidentP40657

Prediction of Gene Ontology Terms ?

GO Term ?Description ?Confidence Level ?Parent GO Terms ?
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GO:0001077 [MF]RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding transcription factor activity involved in positive regulation of transcriptionprobableGO:0003700, GO:0001228, GO:0003674, GO:0001071, GO:0000982, GO:0000981
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Prediction of Enzyme Commission Number ?

No EC number assigned to the protein, probably not an enzyme!

Spatial Structural Prediction

Structural Models Based on Templates

Template: 3F27, chain D
Confidence level:very confident
Coverage over the Query: 15-59
View the alignment between query and template
View the model in PyMOL